Gene

KWMTBOMO16826

Annotation

UPF0439_protein_C9orf30-like_protein?_partial_[Camponotus_floridanus]

Location

Bomo_Scaf349(-):8283-9055      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.281 Nuclear   Reliability : 1.794

CDS

ATGTCCGTCGAAAATAAAACACGCGTTCCCAATTTTTCAAAATCGGAAACAGAATTGCTCACAAGCTTGGTGAGACAATATAGCCATATATTGGAAAATAAAAAAAGTGATATGACAAATAATCAGCTGAAGGAGCAAACTTGGTCAAAGCTGGCCAAAGAATTCAACAGTTTGTCGTCATTTGTGTTCAGAAGTGACAAGACTCTTCGCGCAAAGTATGACAATATAAAAAAGAGGGCCAAGACCAAATATAGTACGTTTCGGAGAAGTTTGTATGGAACAGGGGTGGACCATCCGCTGAAATTAATTTCAGTCAAGAAGAGGAAGTGGTAA

Protein

MSVENKTRVPNFSKSETELLTSLVRQYSHILENKKSDMTNNQLKEQTWSKLAKEFNSLSSFVFRSDKTLRAKYDNIKKRAKTKYSTFRRSLYGTGVDHPLKLISVKKRKW

Uniprot

A0A1Y1KNP5   A0A1Y1KR65   A0A2P8Y9Q8   A0A1Y1KVU5   A0A1Y1KNC7   A0A1Y1KNH9   + More
E2A5V5   A0A1Y1MF52   A0A151J7U4   A0A2P8Y9W7   A0A0L0BU16   E1ZZ26   A0A034WVI1   A0A437B4B2   A0A151WIR4   U4TYE9   A0A1Y1KEI1   A0A1Y1KF23   A0A437ATJ2   A0A437BNK9   A0A151IG11   A0A1Y1KC08   A0A2P8ZB53   A0A151IF42   E9IY92   J9L524   A0A151ICL3   A0A2S2P4J3   A0A437AQR3   A0A0J7K461   A0A2W1BYX7   X1X5R7   X1X4K4   A0A3S2ND07   J9LUA2   A0A1Y1M9S1   A0A151IJ96   A0A151IJF3   X1XD79   A0A151WJ26   A0A2S2NQ37   A0A146LEA5   A0A0A9X2W7   A0A146LYD6   A0A437BDP2   E2B4J6   W8BQ59   A0A151WIX5   E2AZH6   A0A2S2PBT2   A0A2H1VD05   N6UWE6   A0A0K8WIX5   A0A2P8Z2G3   A0A2P8ZCD3   A0A2A4ISV6   A0A151I920   J9M2S8   E9IVR5   J9KQ93   A0A1B6KKS9   A0A1Y1K3J6   A0A3S2PJN2   A0A0A1WFL6   A0A2P8XY57   N6TW77   E2ASN3   X1WKB7   U4UNX4   E9I9K0   A0A1Y1MWY5   A0A1Y1K0T4   A0A0L0CNX9   A0A1Y1K0Z0   A0A2S2P755   A0A1Y1N1K7   A0A2P8Z816   A0A2W1B7P5   H9JW71   A0A1Y1K3J7   A0A151IAZ6   A0A3Q0D5R0   A0A437ASH2   F7H0E9   S9WZF9   A0A384AAD8   A0A091PYR5   A0A2J8LPS3   A0A2J8WSE1   X6RL08   J9KQ47   A0A2K5CU16   A0A2K6H012   U6D190   A0A2A4KAY8   L8YD67   A0A2K6AS94  

Pubmed

28004739    29403074    20798317    26108605    25348373    23537049    + More
21282665    28756777    26823975    25401762    24495485    25830018    19121390    17431167    23149746    15164053    17081983    18669648    20068231    21406692    23186163    23385571   

EMBL

GEZM01078170    GEZM01078168    GEZM01078167    GEZM01078164    GEZM01078163    GEZM01078160    + More
GEZM01078159    GEZM01078157    GEZM01078154    GEZM01078153    GEZM01078152    GEZM01078151    GEZM01078146    GEZM01078144    GEZM01078143    GEZM01078140    GEZM01078139    GEZM01078138    GEZM01078136    JAV62924.1    GEZM01078172    GEZM01078169    GEZM01078166    GEZM01078165    GEZM01078158    GEZM01078155    GEZM01078149    GEZM01078145    GEZM01078141    GEZM01078135    GEZM01078133    JAV62911.1    PYGN01000772    PSN40997.1    GEZM01078173    GEZM01078171    GEZM01078156    GEZM01078137    GEZM01078134    JAV62987.1    GEZM01078162    GEZM01078161    GEZM01078148    GEZM01078142    JAV62919.1    GEZM01078150    GEZM01078147    JAV62953.1    GL437064    EFN71184.1    GEZM01035466    JAV83210.1    KQ979672    KYN19878.1    PYGN01000767    PSN41060.1    JRES01001461    KNC22709.1    GL435281    EFN73545.1    GAKP01000767    JAC58185.1    RSAL01000172    RVE45124.1    KQ983082    KYQ47716.1    KB631844    ERL86664.1    GEZM01088688    JAV58015.1    GEZM01088687    JAV58016.1    RSAL01000535    RVE41428.1    RSAL01000027    RVE51976.1    KQ977745    KYN00156.1    GEZM01088685    JAV58018.1    PYGN01000118    PSN53733.1    KQ977810    KYM99516.1    GL766927    EFZ14460.1    ABLF02035722    KQ978039    KYM97815.1    GGMR01011721    MBY24340.1    RSAL01006701    RVE39893.1    LBMM01014289    KMQ85243.1    KZ149914    PZC78030.1    ABLF02033619    ABLF02033610    ABLF02059298    RSAL01000093    RVE47946.1    ABLF02018378    GEZM01036744    JAV82403.1    KQ977392    KYN03087.1    KQ977342    KYN03425.1    ABLF02011428    KQ983057    KYQ47800.1    GGMR01006257    MBY18876.1    GDHC01013789    JAQ04840.1    GBHO01029598    JAG14006.1    GDHC01007259    JAQ11370.1    RSAL01000082    RVE48495.1    GL445571    EFN89383.1    GAMC01003165    JAC03391.1    KYQ47798.1    GL444220    EFN61163.1    GGMR01014246    MBY26865.1    ODYU01001704    SOQ38282.1    APGK01005471    KB736254    ENN83232.1    GDHF01001206    JAI51108.1    PYGN01000225    PSN50687.1    PYGN01000106    PSN54158.1    NWSH01007929    PCG62749.1    KQ978321    KYM95145.1    ABLF02011053    GL766359    EFZ15338.1    ABLF02036739    GEBQ01027927    JAT12050.1    GEZM01096182    JAV55078.1    RSAL01000013    RVE53390.1    GBXI01016806    JAC97485.1    PYGN01001175    PSN36916.1    APGK01014223    KB739237    ENN82328.1    GL442335    EFN63559.1    ABLF02063305    KB632299    ERL91730.1    GL761828    EFZ22752.1    GEZM01018616    JAV90143.1    GEZM01096181    JAV55079.1    JRES01000127    KNC33976.1    GEZM01096179    JAV55083.1    GGMR01012583    MBY25202.1    GEZM01018627    GEZM01018626    GEZM01018615    GEZM01018608    JAV90146.1    PYGN01000153    PSN52640.1    KZ150242    PZC71899.1    BABH01025370    GEZM01096180    JAV55081.1    KQ978150    KYM96690.1    RSAL01000903    RVE41060.1    JSUE03014604    JSUE03014605    KB017052    EPY80849.1    KK682194    KFQ13062.1    NBAG03000281    PNI49276.1    NDHI03003380    PNJ72697.1    AL353805    ABLF02016037    ABLF02016039    ABLF02016042    ABLF02016045    ABLF02016048    ABLF02028150    ABLF02028154    ABLF02035674    ABLF02048192    ABLF02051718    HAAF01003838    CCP75663.1    NWSH01000015    PCG80822.1    KB364592    ELV12316.1   

Proteomes

UP000245037    UP000000311    UP000078492    UP000037069    UP000283053    UP000075809    + More
UP000030742    UP000078542    UP000007819    UP000036403    UP000008237    UP000019118    UP000218220    UP000005204    UP000189706    UP000006718    UP000261681    UP000005640    UP000233020    UP000233160    UP000011518    UP000233120   

PRIDE

H9JW71    X6RL08   

Pfam

PF13873   Myb_DNA-bind_5        + More
PF10551   MULE

Interpro

IPR028002   Myb_DNA-bind_5        + More
IPR026753   NAIF1       
IPR001005   SANT/Myb       
IPR017877   Myb-like_dom       
IPR026709   Msantd3       
IPR013083   Znf_RING/FYVE/PHD       
IPR001841   Znf_RING       
IPR018289   MULE_transposase_dom       

Gene 3D

3.30.40.10    

CDD

cd00167  SANT

ProteinModelPortal

A0A1Y1KNP5   A0A1Y1KR65   A0A2P8Y9Q8   A0A1Y1KVU5   A0A1Y1KNC7   A0A1Y1KNH9   + More
E2A5V5   A0A1Y1MF52   A0A151J7U4   A0A2P8Y9W7   A0A0L0BU16   E1ZZ26   A0A034WVI1   A0A437B4B2   A0A151WIR4   U4TYE9   A0A1Y1KEI1   A0A1Y1KF23   A0A437ATJ2   A0A437BNK9   A0A151IG11   A0A1Y1KC08   A0A2P8ZB53   A0A151IF42   E9IY92   J9L524   A0A151ICL3   A0A2S2P4J3   A0A437AQR3   A0A0J7K461   A0A2W1BYX7   X1X5R7   X1X4K4   A0A3S2ND07   J9LUA2   A0A1Y1M9S1   A0A151IJ96   A0A151IJF3   X1XD79   A0A151WJ26   A0A2S2NQ37   A0A146LEA5   A0A0A9X2W7   A0A146LYD6   A0A437BDP2   E2B4J6   W8BQ59   A0A151WIX5   E2AZH6   A0A2S2PBT2   A0A2H1VD05   N6UWE6   A0A0K8WIX5   A0A2P8Z2G3   A0A2P8ZCD3   A0A2A4ISV6   A0A151I920   J9M2S8   E9IVR5   J9KQ93   A0A1B6KKS9   A0A1Y1K3J6   A0A3S2PJN2   A0A0A1WFL6   A0A2P8XY57   N6TW77   E2ASN3   X1WKB7   U4UNX4   E9I9K0   A0A1Y1MWY5   A0A1Y1K0T4   A0A0L0CNX9   A0A1Y1K0Z0   A0A2S2P755   A0A1Y1N1K7   A0A2P8Z816   A0A2W1B7P5   H9JW71   A0A1Y1K3J7   A0A151IAZ6   A0A3Q0D5R0   A0A437ASH2   F7H0E9   S9WZF9   A0A384AAD8   A0A091PYR5   A0A2J8LPS3   A0A2J8WSE1   X6RL08   J9KQ47   A0A2K5CU16   A0A2K6H012   U6D190   A0A2A4KAY8   L8YD67   A0A2K6AS94  

KEGG

NA   

GO

GO:0006915   GO:0005634   GO:0016021   GO:0003677   GO:0006869   GO:0016020   GO:0004888   GO:0007166   GO:0016773   GO:0006096   GO:0006281   GO:0006259  

PANTHER

PTHR23098   PTHR21632  

Length:

110

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00201

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.56793

inside

1  -  110

 

 

Pi

0

Theta

0

Tajima's D

0

CLR

0

CSRT

0

Interpretation

Uncertain