SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO16826
Annotation
UPF0439_protein_C9orf30-like_protein?_partial_[Camponotus_floridanus]
Location in the cell
Mitochondrial   Reliability : 2.281 Nuclear   Reliability : 1.794
 

Sequence

CDS
ATGTCCGTCGAAAATAAAACACGCGTTCCCAATTTTTCAAAATCGGAAACAGAATTGCTCACAAGCTTGGTGAGACAATATAGCCATATATTGGAAAATAAAAAAAGTGATATGACAAATAATCAGCTGAAGGAGCAAACTTGGTCAAAGCTGGCCAAAGAATTCAACAGTTTGTCGTCATTTGTGTTCAGAAGTGACAAGACTCTTCGCGCAAAGTATGACAATATAAAAAAGAGGGCCAAGACCAAATATAGTACGTTTCGGAGAAGTTTGTATGGAACAGGGGTGGACCATCCGCTGAAATTAATTTCAGTCAAGAAGAGGAAGTGGTAA
Protein
MSVENKTRVPNFSKSETELLTSLVRQYSHILENKKSDMTNNQLKEQTWSKLAKEFNSLSSFVFRSDKTLRAKYDNIKKRAKTKYSTFRRSLYGTGVDHPLKLISVKKRKW

Summary

EMBL
GEZM01078170    GEZM01078168    GEZM01078167    GEZM01078164    GEZM01078163    GEZM01078160    + More
GEZM01078159    GEZM01078157    GEZM01078154    GEZM01078153    GEZM01078152    GEZM01078151    GEZM01078146    GEZM01078144    GEZM01078143    GEZM01078140    GEZM01078139    GEZM01078138    GEZM01078136    JAV62924.1    GEZM01078172    GEZM01078169    GEZM01078166    GEZM01078165    GEZM01078158    GEZM01078155    GEZM01078149    GEZM01078145    GEZM01078141    GEZM01078135    GEZM01078133    JAV62911.1    PYGN01000772    PSN40997.1    GEZM01078173    GEZM01078171    GEZM01078156    GEZM01078137    GEZM01078134    JAV62987.1    GEZM01078162    GEZM01078161    GEZM01078148    GEZM01078142    JAV62919.1    GEZM01078150    GEZM01078147    JAV62953.1    GL437064    EFN71184.1    GEZM01035466    JAV83210.1    KQ979672    KYN19878.1    PYGN01000767    PSN41060.1    JRES01001461    KNC22709.1    GL435281    EFN73545.1    GAKP01000767    JAC58185.1    RSAL01000172    RVE45124.1    KQ983082    KYQ47716.1    KB631844    ERL86664.1    GEZM01088688    JAV58015.1    GEZM01088687    JAV58016.1    RSAL01000535    RVE41428.1    RSAL01000027    RVE51976.1    KQ977745    KYN00156.1    GEZM01088685    JAV58018.1    PYGN01000118    PSN53733.1    KQ977810    KYM99516.1    GL766927    EFZ14460.1    ABLF02035722    KQ978039    KYM97815.1    GGMR01011721    MBY24340.1    RSAL01006701    RVE39893.1    LBMM01014289    KMQ85243.1    KZ149914    PZC78030.1    ABLF02033619    ABLF02033610    ABLF02059298    RSAL01000093    RVE47946.1    ABLF02018378    GEZM01036744    JAV82403.1    KQ977392    KYN03087.1    KQ977342    KYN03425.1    ABLF02011428    KQ983057    KYQ47800.1    GGMR01006257    MBY18876.1    GDHC01013789    JAQ04840.1    GBHO01029598    JAG14006.1    GDHC01007259    JAQ11370.1    RSAL01000082    RVE48495.1    GL445571    EFN89383.1    GAMC01003165    JAC03391.1    KYQ47798.1    GL444220    EFN61163.1    GGMR01014246    MBY26865.1    ODYU01001704    SOQ38282.1    APGK01005471    KB736254    ENN83232.1    GDHF01001206    JAI51108.1    PYGN01000225    PSN50687.1    PYGN01000106    PSN54158.1    NWSH01007929    PCG62749.1    KQ978321    KYM95145.1    ABLF02011053    GL766359    EFZ15338.1    ABLF02036739    GEBQ01027927    JAT12050.1    GEZM01096182    JAV55078.1    RSAL01000013    RVE53390.1    GBXI01016806    JAC97485.1    PYGN01001175    PSN36916.1    APGK01014223    KB739237    ENN82328.1    GL442335    EFN63559.1    ABLF02063305    KB632299    ERL91730.1    GL761828    EFZ22752.1    GEZM01018616    JAV90143.1    GEZM01096181    JAV55079.1    JRES01000127    KNC33976.1    GEZM01096179    JAV55083.1    GGMR01012583    MBY25202.1    GEZM01018627    GEZM01018626    GEZM01018615    GEZM01018608    JAV90146.1    PYGN01000153    PSN52640.1    KZ150242    PZC71899.1    BABH01025370    GEZM01096180    JAV55081.1    KQ978150    KYM96690.1    RSAL01000903    RVE41060.1    JSUE03014604    JSUE03014605    KB017052    EPY80849.1    KK682194    KFQ13062.1    NBAG03000281    PNI49276.1    NDHI03003380    PNJ72697.1    AL353805    ABLF02016037    ABLF02016039    ABLF02016042    ABLF02016045    ABLF02016048    ABLF02028150    ABLF02028154    ABLF02035674    ABLF02048192    ABLF02051718    HAAF01003838    CCP75663.1    NWSH01000015    PCG80822.1    KB364592    ELV12316.1   
Pfam
PF13873   Myb_DNA-bind_5        + More
PF10551   MULE
Interpro
IPR028002   Myb_DNA-bind_5        + More
IPR026753   NAIF1       
IPR001005   SANT/Myb       
IPR017877   Myb-like_dom       
IPR026709   Msantd3       
IPR013083   Znf_RING/FYVE/PHD       
IPR001841   Znf_RING       
IPR018289   MULE_transposase_dom       
Gene 3D

Ontologies

Topology

Length:
110
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
0.00201
Exp number, first 60 AAs:
0
Total prob of N-in:
0.56793
inside
1  -  110
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
0
Theta
0
Tajima's D
0
CLR
0
CSRT
0
Interpretation
Uncertain

Multiple alignment of Orthologues

 
 

Gene Tree

 
 
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号