Gene

KWMTBOMO16784

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Scaf229(+):17966-18260      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.709 Nuclear   Reliability : 1.605

CDS

ATGCGATCGGCCATGGATAAACTCAGAAAAGTATGGAAGGACCGGAATATCACCAAGACTACCAAAGTCCGACTGGTAAGGGCACTGGTGTTCCCCATCTTTTTATATGGGGTTGAGACCTCGACTGTGAAAGAAAGAGAAAAAAGAAGGATCGATGCATTAGAAATGTGTTGCTGGAGAAGGATGCTCCGTATATCTTAA

Protein

MRSAMDKLRKVWKDRNITKTTKVRLVRALVFPIFLYGVETSTVKEREKRRIDALEMCCWRRMLRIS

Uniprot

D7F167   A0A437AU38   D7F175   A0A437B044   D7F162   D7F168   + More
D7F172   D7F161   A0A0J7K8H8   A0A2W1BGD9   A0A2H1V742   A0A402F7U2   D7F163   A0A3S2L0R7   A0A3Q1LT63   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1LIK6   A0A1J5WD64   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1NJH7   A0A061BKT1   A0A3Q1M4J9   A0A2H6KKM9   A0A3Q1ML90   A0A3S3NR17   A0A2H1VNK5   A0A3Q1LK56   A0A3S3RLW1   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LX40   A0A3Q1MUP9   A0A3Q1MSP2   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1LN91   A0A443QKU0   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MTQ8   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MLV4   A0A402FN42   A0A3Q1LX64   A0A3Q1MIT2   A0A402F9L9   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1LXQ5   A0A402EKM6   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MA23   A0A3Q1LRK1   A0A3Q1MMS2   A0A402EPU5   A0A402EF30   A0A3Q1LJC5   A0A3Q1ML42   A0A402EJH4   A0A3Q1MN00   A0A402FJD0   A0A402EL74   A0A3Q1MHE1   A0A443QYR6   A0A3Q1MZJ0   A0A402F7M6   A0A3Q1LLH3   A0A402F8G0   A0A402F6A8   A0A3Q1M8D1   A0A452DVK2   A0A3Q1NE48   A0A402EUI3   A0A402EKT5   A0A402ET82   A0A3Q1ML12   A0A3Q1MFU8   A0A402ET46   A0A402EBC0   A0A3Q1LK98   A0A402EIX3   A0A402F1V1   A0A3Q1M0T3   A0A402FNH0   A0A402EWU1   A0A402FAD6   A0A402G059   A0A402F360   A0A402F8I2   A0A402EW05   A0A3Q1LRK8   A0A402ECE7  

Pubmed

20470440    28756777    19393038    27694476    29078748   

EMBL

FJ265552    ADI61820.1    RSAL01000427    RVE41762.1    FJ265560    ADI61828.1    + More
RSAL01000235    RVE43733.1    FJ265547    ADI61815.1    FJ265553    ADI61821.1    FJ265557    ADI61825.1    FJ265546    ADI61814.1    LBMM01011957    KMQ86521.1    KZ150203    PZC72267.1    ODYU01001007    SOQ36619.1    BDOT01000134    GCF52480.1    FJ265548    ADI61816.1    RSAL01000289    RVE42931.1    MKPU01000878    OIR55924.1    LK054988    CDR71535.1    BDSA01000081    GBE63537.1    NCKU01012182    RWS00163.1    ODYU01003523    SOQ42419.1    NCKU01008836    RWS01655.1    NCKU01006316    RWS03634.1    BDOT01000373    GCF57844.1    BDOT01000153    GCF53143.1    BDOT01000018    GCF44776.1    BDOT01000029    GCF46232.1    BDOT01000008    GCF42803.1    BDOT01000015    GCF44366.1    BDOT01000282    GCF56465.1    BDOT01000020    GCF44950.1    NCKU01003098    RWS08177.1    GCF52511.1    BDOT01000141    GCF52733.1    BDOT01000123    GCF52043.1    LWLT01000003    BDOT01000045    GCF47862.1    GCF44758.1    BDOT01000039    GCF47390.1    GCF47350.1    BDOT01000005    GCF41529.1    GCF44165.1    BDOT01000082    GCF50401.1    BDOT01000385    GCF57999.1    BDOT01000055    GCF48663.1    BDOT01000163    GCF53401.1    BDOT01001107    GCF61669.1    BDOT01000090    GCF50896.1    GCF52736.1    BDOT01000051    GCF48398.1    BDOT01000006    GCF41929.1   

Proteomes

UP000283053    UP000036403    UP000288954    UP000009136    UP000285301    UP000291000    + More

PRIDE

D7F167    D7F175    D7F162    D7F168    D7F172    D7F161    + More
D7F163   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2
PF02146   SIR2
PF03392   OS-D
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR029035   DHS-like_NAD/FAD-binding_dom       
IPR003000   Sirtuin       
IPR026590   Ssirtuin_cat_dom       
IPR005055   A10/PebIII       
IPR036682   OS_D_A10/PebIII_sf       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219        + More
SSF52467   SSF52467       
SSF100910   SSF100910       

Gene 3D

3.60.10.10     1.10.2080.10    

ProteinModelPortal

D7F167   A0A437AU38   D7F175   A0A437B044   D7F162   D7F168   + More
D7F172   D7F161   A0A0J7K8H8   A0A2W1BGD9   A0A2H1V742   A0A402F7U2   D7F163   A0A3S2L0R7   A0A3Q1LT63   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1LIK6   A0A1J5WD64   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1NJH7   A0A061BKT1   A0A3Q1M4J9   A0A2H6KKM9   A0A3Q1ML90   A0A3S3NR17   A0A2H1VNK5   A0A3Q1LK56   A0A3S3RLW1   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LX40   A0A3Q1MUP9   A0A3Q1MSP2   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1LN91   A0A443QKU0   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MTQ8   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MLV4   A0A402FN42   A0A3Q1LX64   A0A3Q1MIT2   A0A402F9L9   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1LXQ5   A0A402EKM6   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MA23   A0A3Q1LRK1   A0A3Q1MMS2   A0A402EPU5   A0A402EF30   A0A3Q1LJC5   A0A3Q1ML42   A0A402EJH4   A0A3Q1MN00   A0A402FJD0   A0A402EL74   A0A3Q1MHE1   A0A443QYR6   A0A3Q1MZJ0   A0A402F7M6   A0A3Q1LLH3   A0A402F8G0   A0A402F6A8   A0A3Q1M8D1   A0A452DVK2   A0A3Q1NE48   A0A402EUI3   A0A402EKT5   A0A402ET82   A0A3Q1ML12   A0A3Q1MFU8   A0A402ET46   A0A402EBC0   A0A3Q1LK98   A0A402EIX3   A0A402F1V1   A0A3Q1M0T3   A0A402FNH0   A0A402EWU1   A0A402FAD6   A0A402G059   A0A402F360   A0A402F8I2   A0A402EW05   A0A3Q1LRK8   A0A402ECE7  

KEGG

101744939    no KO assigned | (RefSeq) MOG interacting and ectopic P-granules protein 1-like

GO

GO:0004519   GO:0003964   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

66

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

7.90208

Exp number, first 60 AAs:

7.90208

Total prob of N-in:

0.87782

inside

1  -  66

 

 

Pi

0

Theta

0

Tajima's D

0

CLR

0

CSRT

0

Interpretation

Uncertain