Gene

KWMTBOMO16687

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Scaf093(-):17465-19555      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.765 Nuclear   Reliability : 1.331

CDS

ATGCGATCGGCCATGGATAAACTCAGAAAAGTATGGAAGGACCGGAATATCACCAAGACTACCAAAGTCCGACTGGTAAGGGCACTGGTGTTCCCCATCTTTTTATATGGGGTTGAGACCTCGACTGTGAAAGAAAGAGAAAAAAGAAGGATCGATGCATTAGAAATGTGTTGCTGGAGAAGGATGCTCCCTGTTTTGAGGATTAATCCAGATTTTTCAAAGATTTATTGA

Protein

MRSAMDKLRKVWKDRNITKTTKVRLVRALVFPIFLYGVETSTVKEREKRRIDALEMCCWRRMLPVLRINPDFSKIY

Uniprot

D7F167   D7F175   D7F162   D7F168   D7F172   A0A3Q1LK56   + More
A0A3Q1LX40   A0A3Q1LRK1   A0A3Q1LK98   A0A2H1V742   D7F161   A0A3Q1NFT8   A0A3Q1M7L6   A0A3S2L0R7   A0A2H1VNK5   A0A0J7K8H8   A0A2W1BGD9   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MUP9   D7F163   A0A1J5WD64   A0A3Q1NH41   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1LIW6   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1ML12   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1MSP2   A0A2H6KKM9   A0A061BKT1   A0A3Q1ML90   A0A3Q1M6I4   A0A3Q1LT63   A0A3Q1N1P1   A0A3Q1MTQ8   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LN91   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1LJC5   A0A3S3NR17   A0A3Q1MLV4   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1LX64   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MA23   A0A3Q1ML42   A0A2G8KTM7   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1NJH7   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1LLH3   A0A3Q1M8D1   A0A3Q1MN00   A0A3Q1NE48   A0A3Q1M0T3   A0A3Q1LGI2   A0A3S3P648   A0A3Q1NE26   W5NGM3   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1LR18   A0A3Q1MVF7   W5PVE2   A0A3Q1LI58   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1LT03   A0A2G8JE23   A0A3Q1MN71   A0A3Q1MV64   A0A3Q1M6F1   A0A3Q1MVG9   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1MSR0   W5NMM5   W5PYP3   A0A3Q1MNQ2   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1MB43   W5PUC3   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1MNS1  

Pubmed

20470440    19393038    28756777    27694476    29078748    29023486    + More
20809919   

EMBL

FJ265552    ADI61820.1    FJ265560    ADI61828.1    FJ265547    ADI61815.1    + More
FJ265553    ADI61821.1    FJ265557    ADI61825.1    ODYU01001007    SOQ36619.1    FJ265546    ADI61814.1    RSAL01000289    RVE42931.1    ODYU01003523    SOQ42419.1    LBMM01011957    KMQ86521.1    KZ150203    PZC72267.1    FJ265548    ADI61816.1    MKPU01000878    OIR55924.1    BDSA01000081    GBE63537.1    LK054988    CDR71535.1    NCKU01012182    RWS00163.1    NCKU01008836    RWS01655.1    MRZV01000377    PIK51356.1    NCKU01004395    RWS06003.1    AHAT01008485    AMGL01085089    AMGL01085090    AMGL01085091    MRZV01002322    PIK33998.1    AHAT01022938    AMGL01118292    AMGL01118293    AMGL01091659    AMGL01091660    AMGL01091661    AMGL01091662    AMGL01091663    AMGL01091664    AMGL01091665    AMGL01091666    AMGL01091667    AMGL01091668   

Proteomes

UP000009136    UP000283053    UP000036403    UP000285301    UP000230750    UP000018468    + More
UP000002356   

PRIDE

D7F167    D7F175    D7F162    D7F168    D7F172    D7F161    + More
D7F163   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F167   D7F175   D7F162   D7F168   D7F172   A0A3Q1LK56   + More
A0A3Q1LX40   A0A3Q1LRK1   A0A3Q1LK98   A0A2H1V742   D7F161   A0A3Q1NFT8   A0A3Q1M7L6   A0A3S2L0R7   A0A2H1VNK5   A0A0J7K8H8   A0A2W1BGD9   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MUP9   D7F163   A0A1J5WD64   A0A3Q1NH41   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1LIW6   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1ML12   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1MSP2   A0A2H6KKM9   A0A061BKT1   A0A3Q1ML90   A0A3Q1M6I4   A0A3Q1LT63   A0A3Q1N1P1   A0A3Q1MTQ8   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LN91   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1LJC5   A0A3S3NR17   A0A3Q1MLV4   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1LX64   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MA23   A0A3Q1ML42   A0A2G8KTM7   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1NJH7   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1LLH3   A0A3Q1M8D1   A0A3Q1MN00   A0A3Q1NE48   A0A3Q1M0T3   A0A3Q1LGI2   A0A3S3P648   A0A3Q1NE26   W5NGM3   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1LR18   A0A3Q1MVF7   W5PVE2   A0A3Q1LI58   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1LT03   A0A2G8JE23   A0A3Q1MN71   A0A3Q1MV64   A0A3Q1M6F1   A0A3Q1MVG9   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1MSR0   W5NMM5   W5PYP3   A0A3Q1MNQ2   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1MB43   W5PUC3   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1MNS1  

KEGG

101744939    no KO assigned | (RefSeq) MOG interacting and ectopic P-granules protein 1-like

GO

GO:0004519   GO:0003964   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

76

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

9.67688

Exp number, first 60 AAs:

9.67688

Total prob of N-in:

0.84408

inside

1  -  76

 

 

Pi

0

Theta

0

Tajima's D

0

CLR

0

CSRT

0

Interpretation

Uncertain