Gene

KWMTBOMO16024

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr27(-):6491046-6491947      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.482

CDS

ATGGAACGTATCAGCAACAGCCTAGGCCTCTCCATAAATAGATCAAAAACGAAATTAATGGTGGTGGATCGTGCAAATGTTCTAAAATTGAGTAGGGCGCTTGGATTAGAGGTTGTAGACGAATTCGTGTATCTCGGGTCCTGCATCAGCAACAAAGGCTCATGTGAAACTGACGTGCGCCGACGTATCGGAATGGCTAAAAGTGCGATGTCTCAGCTACAGAAGATCTGGAAGAATAGAGGGATAGGCCTGAAAACTAAAACCAGACTGGTGCAGACTCTTGTTTTCTCTATCTTCTTGTATGGAGCTGAGACATGGACGTTGAAAGCAGCAGACCGAATGCGCATCGATGCTTTCGAAATGTGGTGTTGGAGACGCATGCTAAGAATTCCGTGGACAGCCTTCCGGACTAACGTGTCGATATTGAAGCAACTGGGCATCAAAATCAGACTGTGTCTACTGTCTAGAGGCCGCAGCCATACTCGTTGGTCCGATCAGATCCGCACCGCTTTGGACAGTACAGTGTACAGCGCGCTGCATGACGCCATGGACAGGGGAAAGTGGAAAAAGATCTTAAGATTGAAGCTCATGGGTGATGGTGGTCACGACCCTCAGACATGA

Protein

MERISNSLGLSINRSKTKLMVVDRANVLKLSRALGLEVVDEFVYLGSCISNKGSCETDVRRRIGMAKSAMSQLQKIWKNRGIGLKTKTRLVQTLVFSIFLYGAETWTLKAADRMRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNVSILKQLGIKIRLCLLSRGRSHTRWSDQIRTALDSTVYSALHDAMDRGKWKKILRLKLMGDGGHDPQT

Uniprot

D7F163   D7F172   A0A2H1VU13   D7F168   D7F161   D7F162   + More
A0A2W1BGD9   D7F175   D7F167   A0A3S2L0R7   D5LB39   A0A2H1V742   A0A2H1VNK5   A0A1J5WD64   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A2G8JE23   W5MM77   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1MFW2   W5NMM5   A0A3Q1MDY8   A0A2G8JG39   A0A2H6KKM9   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MA23   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1LLH3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MMW6   A0A3S3RLW1   A0A3S3NR17   A0A3Q1ML12   W5MXL2   A0A3S3P648   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1LT03   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1ML90   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1MB43   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1MN71   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MI63   A0A3Q1NE26   A0A3Q1LKL4   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1LR18   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MVG9   W5NGM3   A0A3Q1LR52   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1M8N5  

Pubmed

20470440    28756777    27694476    29023486    19393038    29078748    + More

EMBL

FJ265548    ADI61816.1    FJ265557    ADI61825.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    + More
FJ265553    ADI61821.1    FJ265546    ADI61814.1    FJ265547    ADI61815.1    KZ150203    PZC72267.1    FJ265560    ADI61828.1    FJ265552    ADI61820.1    RSAL01000289    RVE42931.1    GU815090    ADF18553.1    ODYU01001007    SOQ36619.1    ODYU01003523    SOQ42419.1    MKPU01000878    OIR55924.1    MRZV01001207    PIK39730.1    MRZV01000196    PIK55924.1    MRZV01002322    PIK33998.1    AHAT01015286    AHAT01022938    MRZV01002096    PIK34710.1    BDSA01000081    GBE63537.1    NCKU01008836    RWS01655.1    NCKU01012182    RWS00163.1    AHAT01017596    NCKU01004395    RWS06003.1    AHAT01008485   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000018468    UP000009136    UP000285301   

PRIDE

D7F163    D7F172    D7F168    D7F161    D7F162    D7F175    + More
D7F167    D5LB39   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F163   D7F172   A0A2H1VU13   D7F168   D7F161   D7F162   + More
A0A2W1BGD9   D7F175   D7F167   A0A3S2L0R7   D5LB39   A0A2H1V742   A0A2H1VNK5   A0A1J5WD64   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A2G8JE23   W5MM77   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1MFW2   W5NMM5   A0A3Q1MDY8   A0A2G8JG39   A0A2H6KKM9   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MA23   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1LLH3   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MMW6   A0A3S3RLW1   A0A3S3NR17   A0A3Q1ML12   W5MXL2   A0A3S3P648   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1LT03   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1ML90   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1MB43   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1MN71   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MI63   A0A3Q1NE26   A0A3Q1LKL4   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1LR18   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MVG9   W5NGM3   A0A3Q1LR52   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1M8N5  

KEGG

105842916    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC105842916

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

206

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

1.38429

Exp number, first 60 AAs:

0.0016

Total prob of N-in:

0.06625

outside

1  -  206

 

 

Pi

8.353038

Theta

18.222724

Tajima's D

-1.609034

CLR

1.842344

CSRT

0.0470976451177441

Interpretation

Uncertain