Gene

KWMTBOMO15837

Pre Gene Modal

BGIBMGA000056

Annotation

Cytochrome_P450?_family_4?_subfamily_V?_polypeptide_2_[Operophtera_brumata]

Location

Bomo_Chr26(+):11217573-11219559      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.641 Mitochondrial   Reliability : 1.894

CDS

ATGTTCAGGATATTAGCCGAAGTAGGTGACAACAAAGATGTCACGAAAGATGTCCTACCAAAACTCGTTTATTTGGAGGCGGTGATCAAGGAGACTCTGAGGATGTACAGTGTTGTACCTGCGATAGCAAGAAAAACTGATATTGACTTAAAACTCAAAAATTATACAATACCTAAAGGAAGCTCTATAGGTATTATGTTGGGGACCCTGCACCAGCATCCGCAGTGGGGACCGGACGCTCATCAATTCAGGCCCGAACGATGGTTCACTGAAAACCTTAATGTCTTTGCTCCCTTCAGCATGGGGAAACGAAATTGCATTGGTTAG

Protein

MFRILAEVGDNKDVTKDVLPKLVYLEAVIKETLRMYSVVPAIARKTDIDLKLKNYTIPKGSSIGIMLGTLHQHPQWGPDAHQFRPERWFTENLNVFAPFSMGKRNCIG

Similarity

Belongs to the cytochrome P450 family.

Uniprot

H9IS30   A0A2A4J337   A0A2H1VXL2   A0A2H1W7A0   A0A0L7L3E4   A0A2H1WGV6   + More
A0A2A4JDH2   A0A2H1VJB0   A0A0L7LNQ6   A0A2A4IZJ1   A0A2H1VJR0   A0A2W1BBE6   A0A2H1W6L5   J7FJF7   A0A212F2M6   A0A2W1BKF4   A0A2A4JSD1   A0A2W1BHI7   A0A194QDJ4   A0A212FAV8   A0A2W1BFX5   A0A248QFF2   A0A212FCU1   H9IYD7   L0N5J5   A0A2W1BG06   A0A2W1BE48   A0A2W1BLQ8   A0A2W1BG21   A0A2H1V5V3   H9IYD8   A0A212FAV7   H9IYD4   A0A2H1WBJ6   H9IYD6   A0A2H1VM27   A0A2W1BIU6   A0A068EU33   H9IYH3   A0A2H1WVR0   L0N760   L0N5K7   A0A2H1V6H8   H9IRY4   A0A2H1VZD3   A0A2H1VPS3   A0A0N1INH0   A0A2W1BHH2   I4DNC9   A0A2W1BNA0   A0A194QDS7   A0A248QED3   L0N4R8   A0A2H1VSW3   A0A194QF94   J7FJ28   A0A068F0U7   A0A0N1PH37   A0A0N1IFB8   A0A0K8TV47   A0A2W1BJZ6   A0A0N0PAZ7   A0A212EIT7   A0A2H1VBV8   A0A2W1BIG9   A0A068EWM9   A0A248QEI2   A0A2H1WG87   A0A0L7KL22   A0A194QJJ0   A0A212EX74   A0A2H1VHY3   A0A2H1VI25   A0A2A4J141   A0A0K8TVT3   A0A212F7C8   A0A142JYQ2   A0A2H1VDN9   A0A2A4K8W4   A0A2A4JRL5   A0A2W1BD42   A0A0K8TUI0   A0A2H1VTK1   A0A248QE83   S4VAR8   A0A2H1VJL3   H9IYD9   A0A0L7KSI3   A0A068EVI5   A0A2H1V0L7   A0A2W1C018   A0A212EQP7   V5HTA2   S4PCF4   A0A1I7S3A7   A0A248QEG1   A0A068EU45   A0A1V0D9H0   A0A131XIE4   A0A164J9T7  

Pubmed

19121390    26227816    28756777    22984814    22118469    26354079    + More
28881445    22651552    26017144    26999122    25315858    25765539    23622113    21909270    28049606   

EMBL

BABH01035657    BABH01035658    BABH01035659    BABH01035660    BABH01035661    BABH01035662    + More
NWSH01003441    PCG66289.1    ODYU01005067    SOQ45579.1    ODYU01006792    SOQ48969.1    JTDY01003208    KOB69940.1    ODYU01008580    SOQ52300.1    NWSH01001946    PCG69604.1    ODYU01002870    SOQ40886.1    JTDY01000461    KOB77065.1    NWSH01004577    PCG64906.1    ODYU01002936    SOQ41058.1    KZ150169    PZC72622.1    ODYU01006645    SOQ48673.1    JX310093    AFP20604.1    AGBW02010707    OWR47998.1    KZ150119    PZC73210.1    NWSH01000705    PCG74676.1    KZ150122    PZC73154.1    KQ459144    KPJ03618.1    AGBW02009416    OWR50860.1    PZC72625.1    KX443457    ASO98032.1    AGBW02009145    OWR51565.1    BABH01020596    BABH01020597    BABH01020598    BABH01020599    AK289341    BAM73868.1    PZC73211.1    PZC72621.1    PZC72623.1    PZC72624.1    ODYU01000849    SOQ36230.1    BABH01020588    BABH01020589    OWR50859.1    BABH01020614    BABH01020615    BABH01020616    BABH01020617    BABH01020618    ODYU01007558    SOQ50433.1    BABH01020606    ODYU01003287    SOQ41846.1    PZC73157.1    KM016712    AID54864.1    BABH01020619    ODYU01011425    SOQ57155.1    AK343192    AK343193    BAM73881.1    AK343194    BAM73883.1    ODYU01000929    SOQ36438.1    BABH01035663    ODYU01005073    SOQ45594.1    ODYU01003711    SOQ42820.1    KQ461111    KPJ08952.1    PZC73155.1    AK402852    BAM19419.1    PZC73153.1    KPJ03617.1    KX425015    ASN63842.1    AK343195    BAM73884.1    ODYU01004077    SOQ43572.1    KPJ03615.1    JX310096    AFP20607.1    KM016713    AID54865.1    KPJ08953.1    KPJ08955.1    GCVX01000094    JAI18136.1    PZC73156.1    KPJ08951.1    AGBW02014568    OWR41395.1    ODYU01001698    SOQ38276.1    PZC72626.1    KM016714    AID54866.1    KX443458    ASO98033.1    ODYU01008459    SOQ52088.1    JTDY01009171    KOB64027.1    KPJ03616.1    AGBW02011819    OWR46096.1    ODYU01002657    SOQ40445.1    SOQ40446.1    NWSH01004299    PCG65244.1    GCVX01000055    JAI18175.1    AGBW02009886    OWR49643.1    KU550085    AMR93993.1    ODYU01001992    SOQ38945.1    NWSH01000019    PCG80725.1    PCG74677.1    PZC73152.1    GCVX01000093    JAI18137.1    SOQ43574.1    KX425014    ASN63841.1    KC789755    AGO62010.1    SOQ40444.1    BABH01020579    BABH01020580    BABH01020581    JTDY01006414    KOB66031.1    KM016711    AID54863.1    ODYU01000131    SOQ34388.1    KZ149905    PZC78316.1    AGBW02013250    OWR43823.1    GANP01002884    JAB81584.1    GAIX01004216    JAA88344.1    KX425017    ASN63844.1    KM016722    AID54874.1    KY212086    ARA91650.1    GEFH01002701    JAP65880.1    LRGB01005243    KZS02129.1   

Proteomes

UP000005204    UP000218220    UP000037510    UP000007151    UP000053268    UP000053240    + More
UP000095284    UP000076858   

PRIDE

H9IS30    H9IYD7    L0N5J5    H9IYD8    H9IYD4    H9IYD6    + More
H9IYH3    L0N760    L0N5K7    H9IRY4    L0N4R8    H9IYD9   

Pfam

PF00067   p450

Interpro

IPR001128   Cyt_P450        + More
IPR017972   Cyt_P450_CS       
IPR002401   Cyt_P450_E_grp-I       
IPR036396   Cyt_P450_sf       
IPR002403   Cyt_P450_E_grp-IV       

SUPFAM

SSF48264   SSF48264       

Gene 3D

1.10.630.10    

ProteinModelPortal

H9IS30   A0A2A4J337   A0A2H1VXL2   A0A2H1W7A0   A0A0L7L3E4   A0A2H1WGV6   + More
A0A2A4JDH2   A0A2H1VJB0   A0A0L7LNQ6   A0A2A4IZJ1   A0A2H1VJR0   A0A2W1BBE6   A0A2H1W6L5   J7FJF7   A0A212F2M6   A0A2W1BKF4   A0A2A4JSD1   A0A2W1BHI7   A0A194QDJ4   A0A212FAV8   A0A2W1BFX5   A0A248QFF2   A0A212FCU1   H9IYD7   L0N5J5   A0A2W1BG06   A0A2W1BE48   A0A2W1BLQ8   A0A2W1BG21   A0A2H1V5V3   H9IYD8   A0A212FAV7   H9IYD4   A0A2H1WBJ6   H9IYD6   A0A2H1VM27   A0A2W1BIU6   A0A068EU33   H9IYH3   A0A2H1WVR0   L0N760   L0N5K7   A0A2H1V6H8   H9IRY4   A0A2H1VZD3   A0A2H1VPS3   A0A0N1INH0   A0A2W1BHH2   I4DNC9   A0A2W1BNA0   A0A194QDS7   A0A248QED3   L0N4R8   A0A2H1VSW3   A0A194QF94   J7FJ28   A0A068F0U7   A0A0N1PH37   A0A0N1IFB8   A0A0K8TV47   A0A2W1BJZ6   A0A0N0PAZ7   A0A212EIT7   A0A2H1VBV8   A0A2W1BIG9   A0A068EWM9   A0A248QEI2   A0A2H1WG87   A0A0L7KL22   A0A194QJJ0   A0A212EX74   A0A2H1VHY3   A0A2H1VI25   A0A2A4J141   A0A0K8TVT3   A0A212F7C8   A0A142JYQ2   A0A2H1VDN9   A0A2A4K8W4   A0A2A4JRL5   A0A2W1BD42   A0A0K8TUI0   A0A2H1VTK1   A0A248QE83   S4VAR8   A0A2H1VJL3   H9IYD9   A0A0L7KSI3   A0A068EVI5   A0A2H1V0L7   A0A2W1C018   A0A212EQP7   V5HTA2   S4PCF4   A0A1I7S3A7   A0A248QEG1   A0A068EU45   A0A1V0D9H0   A0A131XIE4   A0A164J9T7  

PDB

6N6Q     E-value=1.20461e-13,     Score=179

KEGG

101744935    K07427 docosahexaenoic acid omega-hydroxylase [EC:1.14.14.79] | (RefSeq) cytochrome P450 4d8-like

GO

GO:0005506   GO:0016705   GO:0020037   GO:0004497   GO:0016021   GO:0004983   GO:0005215   GO:0006270   GO:0042555   GO:0003707   GO:0006281   GO:0006259   GO:0055114  

Length:

108

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.01058

Exp number, first 60 AAs:

0.00669

Total prob of N-in:

0.11575

outside

1  -  108

 

 

Pi

176.30846

Theta

137.793312

Tajima's D

1.258815

CLR

0.109708

CSRT

0.727813609319534

Interpretation

Uncertain