Gene

KWMTBOMO15756

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr26(+):9248583-9249219      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.968

CDS

ATGGCTAAAAGTTCGATGTCTCAGCTACAGAAGATCTGGAAGAATAGAGGGATAGGCCTGAAAACTAAAACCAGACTGGTGCGGACTCTTGTTTTCTCTATCTTCTTGTATGGAGCTGCGACATGGACGTTGAAAGCAGCAGACCGAATGCGCATCGATGCTTTCGAAATGTGGTGCTGGAGACGCATGCTAAGAATTCCGTGGACAGCCTTCCGGACTAACGTGTCGATATTGAAGCAACTGGGCATCAAAATCAGACTGTCTACTGTATGTCTGAAGCGGATCCTCGAATATTTTGGTTACATTGCGAGGAAAGACGGCGATAACCTGGAAAAACTTATGATCACAGGGAAAGTTGAAGGCAACAGATCTAGAGGCCGCAGCCAGACTCGTTGGTCCGATCAGATCCGCACCGCTTTGGACAGTACAGTGTACAGCACGCTGCATGACGCCGTGGACAGGGGACAGTGGAAAAAAATCCTAAGATTGAAGCTCATGGTGATGGTGGTCACGACCCTCAGACATGAGGAACACGACTCGAGGAGGAGGAGGAGGTAG

Protein

MAKSSMSQLQKIWKNRGIGLKTKTRLVRTLVFSIFLYGAATWTLKAADRMRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNVSILKQLGIKIRLSTVCLKRILEYFGYIARKDGDNLEKLMITGKVEGNRSRGRSQTRWSDQIRTALDSTVYSTLHDAVDRGQWKKILRLKLMVMVVTTLRHEEHDSRRRRR

Uniprot

D7F163   A0A2H1V742   D7F172   A0A2H1VNK5   D7F161   A0A2H1VU13   + More
D7F168   A0A3S2L0R7   D7F162   D7F167   D7F175   D5LB39   A0A2W1BGD9   A0A2G8LJK7   A0A2G8JE23   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8K796   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVI4   A0A3Q1LT03   A0A3Q1LLH3   A0A2G8KTJ4   A0A2G8K327   A0A3S3NR17   A0A3S3RLW1   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1LR75   H2YWZ6   W5NMM5   A0A3Q1M4E7   O97916   W5NIE2   H2YWZ5   A0A3Q1M2T8   A0A3Q1MJZ2   W5MM77   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1NE26   A0A3Q1MMS2   F6R5D0   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1M4J9   A0A2H6KKM9   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1MN71   A0A3Q1NB85   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MDY8   W4YPU3   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1MZC9   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1MLV4   A0A3Q1M6Y4   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1ML90   X1D4L4   A0A3Q1MB43   A0A3Q1MJR3   A0A061BKJ9   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1MI63   A0A3Q1N8A1   A0A3S3P648   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1LT63   W5N9W4   A0A3Q1LRK7   A0A3Q1M8I7   A0A3Q1NE48   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LNZ2   A0A3Q1MVF7   A0A3Q1LNR9   F6RFH2   A0A3Q1MNS1   A0A3Q1LKL4  

Pubmed

20470440    28756777    29023486    19393038    10555285    29078748    + More
24624126   

EMBL

FJ265548    ADI61816.1    ODYU01001007    SOQ36619.1    FJ265557    ADI61825.1    + More
ODYU01003523    SOQ42419.1    FJ265546    ADI61814.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    FJ265553    ADI61821.1    RSAL01000289    RVE42931.1    FJ265547    ADI61815.1    FJ265552    ADI61820.1    FJ265560    ADI61828.1    GU815090    ADF18553.1    KZ150203    PZC72267.1    MRZV01000056    PIK60437.1    MRZV01002322    PIK33998.1    MRZV01001216    PIK39650.1    MRZV01000994    PIK41715.1    MRZV01000817    PIK43880.1    MRZV01000196    PIK55924.1    MRZV01001207    PIK39730.1    MRZV01000378    PIK51329.1    MRZV01000940    PIK42365.1    NCKU01012182    RWS00163.1    NCKU01008836    RWS01655.1    AHAT01022938    AJ132772    CAA10770.1    AHAT01009145    AHAT01015286    BDSA01000081    GBE63537.1    AAGJ04055194    BART01031562    GAH15691.1    LK055282    CDR71995.1    NCKU01004395    RWS06003.1    AHAT01022314   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000009136    UP000285301    UP000007875    UP000018468    + More
UP000007110   

PRIDE

D7F163    D7F172    D7F161    D7F168    D7F162    D7F167    + More
D7F175    D5LB39   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F163   A0A2H1V742   D7F172   A0A2H1VNK5   D7F161   A0A2H1VU13   + More
D7F168   A0A3S2L0R7   D7F162   D7F167   D7F175   D5LB39   A0A2W1BGD9   A0A2G8LJK7   A0A2G8JE23   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8K796   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVI4   A0A3Q1LT03   A0A3Q1LLH3   A0A2G8KTJ4   A0A2G8K327   A0A3S3NR17   A0A3S3RLW1   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1LR75   H2YWZ6   W5NMM5   A0A3Q1M4E7   O97916   W5NIE2   H2YWZ5   A0A3Q1M2T8   A0A3Q1MJZ2   W5MM77   A0A3Q1LFQ0   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1NE26   A0A3Q1MMS2   F6R5D0   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1M4J9   A0A2H6KKM9   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1MN71   A0A3Q1NB85   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MDY8   W4YPU3   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1MZC9   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1MLV4   A0A3Q1M6Y4   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1ML90   X1D4L4   A0A3Q1MB43   A0A3Q1MJR3   A0A061BKJ9   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1MI63   A0A3Q1N8A1   A0A3S3P648   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1LT63   W5N9W4   A0A3Q1LRK7   A0A3Q1M8I7   A0A3Q1NE48   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LNZ2   A0A3Q1MVF7   A0A3Q1LNR9   F6RFH2   A0A3Q1MNS1   A0A3Q1LKL4  

KEGG

101746242    no KO assigned | (RefSeq) facilitated trehalose transporter Tret1-like

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

185

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

18.06983

Exp number, first 60 AAs:

17.93437

Total prob of N-in:

0.69094

POSSIBLE N-term signal

sequence

inside

1  -  25

TMhelix

26  -  44

outside

45  -  185

 

 

Pi

283.935601

Theta

165.082359

Tajima's D

2.264319

CLR

0.256321

CSRT

0.915504224788761

Interpretation

Uncertain