Gene

KWMTBOMO15704

Pre Gene Modal

BGIBMGA002267

Annotation

PREDICTED:_cytochrome_P450_4c21-like_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr26(-):6926362-6929359      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 2.411

CDS

ATGTCAGACCTGCTCTTGAAAGGCTTGGATGACGAGGCCTTCACGGACAAAGAGATCAGGAATGAAGTCGATACCCTTATATTTACGGGGTCTGATACATCGTCACAGATCATGACGGTGGTCGTGATGTTATTGGGCTCGTACCCTGAGATCCAGGATAAAGTTTACCAGGAAATTAAATCGGTGTGTGGAGATTCGGATGCCGATGTCGATAAACTTCAACATCCACGATTAGTTTACACGGAAGCTGTTTTGAAGGAAACATTAAGACTATACCCGATCACTCCGGTGGTTTTGAGAAAAACAGAAAATGAAATAAAACTGAAGAGCTACACGATACCGGCCAACAGTAACTGTATGTTGGGTATTTATGGTCTGAACCGCCACCCAGTGTGGGGCCCTGACGCGCACACGTTCCGACCAGAGCGCTGGTTGGAGCTCGGAGGTGTGCCCGACGACCCTAATGCATTCGCAGGATTCAGCGTCGGGAAACGGAATTGTATCGGTAAAACCTACGCTCTTATATCGATGAAGACCACGCTGGTACATTTATTACGACGATACAAAGTTACTGCAGATATATCTAAGATTGAATTCAAATTGGATGCGCTCATGGTGCCTTCAGACAACTGCTACGCCAAATTTGAGTCAAGAAAATGA

Protein

MSDLLLKGLDDEAFTDKEIRNEVDTLIFTGSDTSSQIMTVVVMLLGSYPEIQDKVYQEIKSVCGDSDADVDKLQHPRLVYTEAVLKETLRLYPITPVVLRKTENEIKLKSYTIPANSNCMLGIYGLNRHPVWGPDAHTFRPERWLELGGVPDDPNAFAGFSVGKRNCIGKTYALISMKTTLVHLLRRYKVTADISKIEFKLDALMVPSDNCYAKFESRK

Similarity

Belongs to the cytochrome P450 family.

Uniprot

H9IYD4   L0N5J5   H9IYD8   H9IYH3   L0N5K7   L0N760   + More
H9IYD6   H9IYD7   H9IRY4   A0A212F7C8   A0A2W1BG06   L0N4R8   A0A2A4JSD1   H9IYD9   A0A0K8TVT3   A0A2W1BKF4   A0A2A4K8W4   J7FJF7   A0A194QDJ4   A0A0N1PH37   A0A194QF94   A0A2W1BD42   A0A2H1VZD3   A0A0N0PAZ7   A0A2A4JRL5   A0A0L7LNQ6   A0A2W1BNA0   A0A2H1WG87   A0A0N1INH0   A0A2W1BHH2   A0A0N1IFB8   I4DNC9   A0A194QDS7   A0A248QFF2   A0A2H1V0L7   A0A068F0U7   A0A142JYQ2   A0A2W1BBE6   A0A0K8TV47   A0A2A4J337   A0A2H1VPS3   A0A2W1BFX5   A0A2A4IZJ1   A0A2W1BE48   A0A2W1BHI7   A0A2W1BLQ8   A0A2A4J141   A0A2W1BG21   A0A2H1VHY3   A0A212FCU1   A0A2H1VI25   A0A2H1WGV6   H9IS30   A0A2A4JDH2   A0A2W1C018   A0A2H1VXL2   A0A2H1V6H8   A0A068EVI5   A0A068EU33   J7FJ28   A0A2H1V5V3   A0A2H1VM27   A0A248QED3   S4VAR8   A0A2H1VJL3   A0A0L7KZM1   A0A248QE83   A0A0K8TUI0   A0A212F2M6   J7FJ27   A0A212EX74   A0A0L7L3E4   S4PCF4   A0A0L7L9I5   A0A248QEI2   A0A2H1VBV8   A0A2W1BJZ6   A0A2H1VFA5   A0A2W1BIG9   A0A194QJJ0   A0A2H1VKT6   A0A2W1BIU6   A0A2A4JAS2   A0A2W1BN87   A0A212FAV8   A0A1V0D9H3   A0A2H1VDN9   A0A2H1W6L5   A0A2W1BYK2   A0A2A4J1I4   A0A2A4IV96   A0A068EWM9   A0A2W1C027   A0A3S2NC20   A0A2W1BTE0   A0A1V0D9I4   A0A2H1VJB0   A0A1V0D9H0   A0A212EQP7  

Pubmed

19121390    22118469    28756777    26017144    22984814    26354079    + More
26227816    22651552    28881445    26999122    25315858    23622113   

EMBL

BABH01020614    BABH01020615    BABH01020616    BABH01020617    BABH01020618    AK289341    + More
BAM73868.1    BABH01020588    BABH01020589    BABH01020619    AK343194    BAM73883.1    AK343192    AK343193    BAM73881.1    BABH01020606    BABH01020596    BABH01020597    BABH01020598    BABH01020599    BABH01035662    BABH01035663    AGBW02009886    OWR49643.1    KZ150119    PZC73211.1    AK343195    BAM73884.1    NWSH01000705    PCG74676.1    BABH01020579    BABH01020580    BABH01020581    GCVX01000055    JAI18175.1    PZC73210.1    NWSH01000019    PCG80725.1    JX310093    AFP20604.1    KQ459144    KPJ03618.1    KQ461111    KPJ08953.1    KPJ03615.1    KZ150122    PZC73152.1    ODYU01005073    SOQ45594.1    KPJ08951.1    PCG74677.1    JTDY01000461    KOB77065.1    PZC73153.1    ODYU01008459    SOQ52088.1    KPJ08952.1    PZC73155.1    KPJ08955.1    AK402852    BAM19419.1    KPJ03617.1    KX443457    ASO98032.1    ODYU01000131    SOQ34388.1    KM016713    AID54865.1    KU550085    AMR93993.1    KZ150169    PZC72622.1    GCVX01000094    JAI18136.1    NWSH01003441    PCG66289.1    ODYU01003711    SOQ42820.1    PZC72625.1    NWSH01004577    PCG64906.1    PZC72621.1    PZC73154.1    PZC72623.1    NWSH01004299    PCG65244.1    PZC72624.1    ODYU01002657    SOQ40445.1    AGBW02009145    OWR51565.1    SOQ40446.1    ODYU01008580    SOQ52300.1    BABH01035657    BABH01035658    BABH01035659    BABH01035660    BABH01035661    NWSH01001946    PCG69604.1    KZ149905    PZC78316.1    ODYU01005067    SOQ45579.1    ODYU01000929    SOQ36438.1    KM016711    AID54863.1    KM016712    AID54864.1    JX310096    AFP20607.1    ODYU01000849    SOQ36230.1    ODYU01003287    SOQ41846.1    KX425015    ASN63842.1    KC789755    AGO62010.1    SOQ40444.1    JTDY01004189    KOB68479.1    KX425014    ASN63841.1    GCVX01000093    JAI18137.1    AGBW02010707    OWR47998.1    JX310091    AFP20602.1    AGBW02011819    OWR46096.1    JTDY01003208    KOB69940.1    GAIX01004216    JAA88344.1    JTDY01002193    KOB71906.1    KX443458    ASO98033.1    ODYU01001698    SOQ38276.1    PZC73156.1    ODYU01001992    SOQ38944.1    PZC72626.1    KPJ03616.1    ODYU01003095    SOQ41416.1    PZC73157.1    NWSH01002233    PCG68866.1    KZ150062    PZC74190.1    AGBW02009416    OWR50860.1    KY212085    ARA91649.1    SOQ38945.1    ODYU01006645    SOQ48673.1    PZC78317.1    PCG65243.1    NWSH01006058    PCG63705.1    KM016714    AID54866.1    PZC78326.1    RSAL01000110    RVE47143.1    PZC78319.1    KY212087    ARA91651.1    ODYU01002870    SOQ40886.1    KY212086    ARA91650.1    AGBW02013250    OWR43823.1   

Proteomes

UP000005204    UP000007151    UP000218220    UP000053268    UP000053240    UP000037510    + More
UP000283053   

PRIDE

H9IYD4    L0N5J5    H9IYD8    H9IYH3    L0N5K7    L0N760    + More
H9IYD6    H9IYD7    H9IRY4    L0N4R8    H9IYD9    H9IS30   

Pfam

PF00067   p450

Interpro

IPR036396   Cyt_P450_sf        + More
IPR002401   Cyt_P450_E_grp-I       
IPR001128   Cyt_P450       
IPR017972   Cyt_P450_CS       
IPR002403   Cyt_P450_E_grp-IV       

SUPFAM

SSF48264   SSF48264       

Gene 3D

1.10.630.10    

ProteinModelPortal

H9IYD4   L0N5J5   H9IYD8   H9IYH3   L0N5K7   L0N760   + More
H9IYD6   H9IYD7   H9IRY4   A0A212F7C8   A0A2W1BG06   L0N4R8   A0A2A4JSD1   H9IYD9   A0A0K8TVT3   A0A2W1BKF4   A0A2A4K8W4   J7FJF7   A0A194QDJ4   A0A0N1PH37   A0A194QF94   A0A2W1BD42   A0A2H1VZD3   A0A0N0PAZ7   A0A2A4JRL5   A0A0L7LNQ6   A0A2W1BNA0   A0A2H1WG87   A0A0N1INH0   A0A2W1BHH2   A0A0N1IFB8   I4DNC9   A0A194QDS7   A0A248QFF2   A0A2H1V0L7   A0A068F0U7   A0A142JYQ2   A0A2W1BBE6   A0A0K8TV47   A0A2A4J337   A0A2H1VPS3   A0A2W1BFX5   A0A2A4IZJ1   A0A2W1BE48   A0A2W1BHI7   A0A2W1BLQ8   A0A2A4J141   A0A2W1BG21   A0A2H1VHY3   A0A212FCU1   A0A2H1VI25   A0A2H1WGV6   H9IS30   A0A2A4JDH2   A0A2W1C018   A0A2H1VXL2   A0A2H1V6H8   A0A068EVI5   A0A068EU33   J7FJ28   A0A2H1V5V3   A0A2H1VM27   A0A248QED3   S4VAR8   A0A2H1VJL3   A0A0L7KZM1   A0A248QE83   A0A0K8TUI0   A0A212F2M6   J7FJ27   A0A212EX74   A0A0L7L3E4   S4PCF4   A0A0L7L9I5   A0A248QEI2   A0A2H1VBV8   A0A2W1BJZ6   A0A2H1VFA5   A0A2W1BIG9   A0A194QJJ0   A0A2H1VKT6   A0A2W1BIU6   A0A2A4JAS2   A0A2W1BN87   A0A212FAV8   A0A1V0D9H3   A0A2H1VDN9   A0A2H1W6L5   A0A2W1BYK2   A0A2A4J1I4   A0A2A4IV96   A0A068EWM9   A0A2W1C027   A0A3S2NC20   A0A2W1BTE0   A0A1V0D9I4   A0A2H1VJB0   A0A1V0D9H0   A0A212EQP7  

PDB

6C93     E-value=3.54164e-25,     Score=282

KEGG

101738326    no KO assigned | (RefSeq) cytochrome P450 4c21-like

GO

GO:0020037   GO:0005506   GO:0016705   GO:0004497   GO:0016021   GO:0004983   GO:0005634   GO:0006270   GO:0042555   GO:0003707   GO:0006281   GO:0006259   GO:0055114  

Length:

219

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.13253

Exp number, first 60 AAs:

0.11803

Total prob of N-in:

0.01423

outside

1  -  219

 

 

Pi

169.537686

Theta

145.54594

Tajima's D

-1.119466

CLR

1.643538

CSRT

0.11834408279586

Interpretation

Uncertain