Gene

KWMTBOMO15638

Annotation

PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC105842659_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr26(+):5015947-5017015      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.089

CDS

ATGCGCAAGACCCTAGAAAACTGGGATGGAGGCATAACCATAGGTGGTGTCAAAGTGACGAACCTGCGCTACGCAGATGACACCACTCTGCTTGCCACAACAGAAGCAGAGATGACAGAGCTTCTGAACAGGATGGAGCAGATAGGGTTGGAGATGGGACTCGCCATCAACAGATCCAAAACTAAGATCATGGTCATTGATCGCACAAAAAAGTTGGAGCTTAGTGGAACACTAAACCTTGAGCTTGTTGACAACTTTATTTACCTAGGCTCCAACATTAACAATACTGGATCCAGCGAACTTGAAGTACGACGGCGTATTGGAATGGCAAAGGGAGCCATGACCCAGCTCGGTAAAATCTGGAAGGACCATAACATTACCCAGAAAACAAAGACAAAACTGGTGCTCACTCTGGTCTTTTCCATTTTTATATACGGAACGGAGACCTGGACCCTTAAAGCAGCTGATCGCAAACGCGTGGATGCTTTTGAGATGTGGTGCTAG

Protein

MRKTLENWDGGITIGGVKVTNLRYADDTTLLATTEAEMTELLNRMEQIGLEMGLAINRSKTKIMVIDRTKKLELSGTLNLELVDNFIYLGSNINNTGSSELEVRRRIGMAKGAMTQLGKIWKDHNITQKTKTKLVLTLVFSIFIYGTETWTLKAADRKRVDAFEMWC

Uniprot

D7F168   D7F163   A0A2W1BGD9   D7F172   D7F161   D7F162   + More
A0A2H1VU13   D7F167   D7F175   A0A3S2L0R7   A0A2W1BNH4   A0A1J5WD64   A0A2W1B3T2   A0A2G8JE23   D5LB39   A0A2G8JG39   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVI4   W5NMM5   H2YWZ5   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1LVS6   F6R5D0   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1MTQ8   A0A3S3P648   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1LXF5   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1LNR9   W4Z0F5   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1MP18   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1LK56   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1MIT2   A0A2H6KKM9   A0A3Q1ML12   A0A3Q1NJH7   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MWB3   A0A146L0Z1   A0A3Q1LT63   A0A061BKT1   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1LWH0   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1ML90   A0A0A9XXL9   A0A3Q1LSI8   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MSR0   A0A3S3NR17   A0A2G8KEY9   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LQF3   A0A3Q1MVG9   A0A3Q1NGZ5   A0A3Q1LN91   A0A3Q1LX64   A0A3Q1LGI2   W5MXL2   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1M427   W5PYP3   A0A3Q1LGI4   A0A3Q1M4E7   W5NGM3   W4YPU3   A0A3Q1MJR3   A0A3Q1MBV2   A0A3Q1LKL4   A0A0J7NYI3   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1M6I4   A0A3Q1MLZ9   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MN71   A0A3Q1M3R4   A0A3Q1M1T7   A0A2G8KGL8   A0A3Q1MNQ2   A0A3Q1LR18   A0A3Q1MCA0   D5LB38   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1NL67   A0A3Q1LIJ6  

Pubmed

20470440    28756777    27694476    29023486    19393038    29078748    + More
26823975    25401762    20809919   

EMBL

FJ265553    ADI61821.1    FJ265548    ADI61816.1    KZ150203    PZC72267.1    + More
FJ265557    ADI61825.1    FJ265546    ADI61814.1    FJ265547    ADI61815.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    FJ265552    ADI61820.1    FJ265560    ADI61828.1    RSAL01000289    RVE42931.1    KZ150025    PZC74827.1    MKPU01000878    OIR55924.1    KZ150363    PZC71182.1    MRZV01002322    PIK33998.1    GU815090    ADF18553.1    MRZV01002096    PIK34710.1    MRZV01000196    PIK55924.1    MRZV01001207    PIK39730.1    AHAT01022938    NCKU01004395    RWS06003.1    AAGJ04089624    BDSA01000081    GBE63537.1    GDHC01017214    JAQ01415.1    LK054988    CDR71535.1    GBHO01020011    GDHC01013600    JAG23593.1    JAQ05029.1    NCKU01012182    RWS00163.1    MRZV01000636    PIK46566.1    NCKU01008836    RWS01655.1    AHAT01017596    AMGL01118292    AMGL01118293    AHAT01008485    AAGJ04055194    LBMM01000801    KMQ97460.1    MRZV01000599    PIK47151.1    GU815089    ADF18552.1   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000018468    UP000007875    UP000009136    UP000285301    + More
UP000007110    UP000002356    UP000036403   

PRIDE

D7F168    D7F163    D7F172    D7F161    D7F162    D7F167    + More
D7F175    D5LB39    D5LB38   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F168   D7F163   A0A2W1BGD9   D7F172   D7F161   D7F162   + More
A0A2H1VU13   D7F167   D7F175   A0A3S2L0R7   A0A2W1BNH4   A0A1J5WD64   A0A2W1B3T2   A0A2G8JE23   D5LB39   A0A2G8JG39   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVI4   W5NMM5   H2YWZ5   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1LVS6   F6R5D0   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1MTQ8   A0A3S3P648   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1LXF5   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1LNR9   W4Z0F5   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1MP18   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1LK56   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1MIT2   A0A2H6KKM9   A0A3Q1ML12   A0A3Q1NJH7   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1MWB3   A0A146L0Z1   A0A3Q1LT63   A0A061BKT1   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1LWH0   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1ML90   A0A0A9XXL9   A0A3Q1LSI8   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MSR0   A0A3S3NR17   A0A2G8KEY9   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LQF3   A0A3Q1MVG9   A0A3Q1NGZ5   A0A3Q1LN91   A0A3Q1LX64   A0A3Q1LGI2   W5MXL2   A0A3Q1MBA9   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1M427   W5PYP3   A0A3Q1LGI4   A0A3Q1M4E7   W5NGM3   W4YPU3   A0A3Q1MJR3   A0A3Q1MBV2   A0A3Q1LKL4   A0A0J7NYI3   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1M6I4   A0A3Q1MLZ9   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1MN71   A0A3Q1M3R4   A0A3Q1M1T7   A0A2G8KGL8   A0A3Q1MNQ2   A0A3Q1LR18   A0A3Q1MCA0   D5LB38   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1NL67   A0A3Q1LIJ6  

KEGG

105842659    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC105842659

GO

GO:0004519   GO:0003964   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

167

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

15.56111

Exp number, first 60 AAs:

0.00308

Total prob of N-in:

0.84277

inside

1  -  133

TMhelix

134  -  152

outside

153  -  167

 

 

Pi

270.858541

Theta

139.69194

Tajima's D

2.950554

CLR

0

CSRT

0.977001149942503

Interpretation

Uncertain