Gene

KWMTBOMO15379

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr25(+):10862026-10862828      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.293

CDS

ATGGAACGTATCAGCAACAGCCTAGGCCTCTCCATAAATAGATCAAAAACGAAATTAATGGTGGTAGATCGTGCAAATGTTCTAAGATTGAGTGGGGCGCTTGGATTAGAGGTTGCAGATGAATTCGTGTATCTCGGGTCCTGCATCAGCAACAAAGGCTCATGTGAAACTGACGTGCGCCAACGTATCGGAATGGCTAAAAGTGCGATGTCTCAGCTACAGAAGATCTGGAAGAATAGAGGGATAGGCCTGAAAACTAAAACCAGACTGGTGCGGACTCTTGTTTTCTCTATCTTCTTGTATGGAGCTGAGACATGGACGTTGAAAGCAGCAGACCGAATGCGCATCGATGCTTTCGAAATGTGGTGTTGGAGACGCATGCTAAGAATTCCGTGGACAGCCTTCCGGACTAACGTGTCGATATTGAAGCAACTGGGCATCAAAATCAGACTGTCTACTGTATGTCTGAAGCGGATCCTCGAATATTTTGGTCACATTGCGAGGAAAGACGGCGATAACCTGGAAAAAGTTATGATTACAGAGAAAGTTGAAGGCAACAGATCTAGAGGCCGCAGCCATACTCGTTGGTCCGATCAGATCCGCACCGCTTTGGACAGTACAGTGTACAGCGCGCTGCATGACGCCGTGTACAGGGGAAAGAGGAAAAAGATCTTAAGATTGAAGCTCGTGGGTGATGGTGGTCACGACCCTCAGACATGA

Protein

MERISNSLGLSINRSKTKLMVVDRANVLRLSGALGLEVADEFVYLGSCISNKGSCETDVRQRIGMAKSAMSQLQKIWKNRGIGLKTKTRLVRTLVFSIFLYGAETWTLKAADRMRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNVSILKQLGIKIRLSTVCLKRILEYFGHIARKDGDNLEKVMITEKVEGNRSRGRSHTRWSDQIRTALDSTVYSALHDAVYRGKRKKILRLKLVGDGGHDPQT

Uniprot

D7F163   A0A2H1VU13   D7F168   D7F172   D7F161   A0A3S2L0R7   + More
A0A2W1BGD9   D7F162   D7F175   D7F167   D5LB39   A0A2H1VNK5   A0A2G8JE23   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8K796   W5NMM5   A0A3Q1LLH3   A0A3S3NR17   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LR75   A0A3Q1LT03   O97916   A0A3Q1M2T8   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1MGA3   A0A2H6KKM9   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1MN71   A0A3Q1MB43   A0A3Q1ML90   F6R5D0   A0A3Q1MJR3   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1LT63   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1NE26   A0A3Q1LFQ0   A0A061BKJ9   A0A3Q1NB85   A0A3S3P648   A0A3Q1N8A1   A0A3Q1MBA9   A0A023G885   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1LR18   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1LKL4   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MNS1   X1D4L4   A0A3Q1MI63   A0A3Q1M6Y4   A0A3Q1M1T7   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MVF7   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1LNR9   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1NBK7   H2YWZ5   W4YPU3   A0A3Q1LNX3   W5MXL2   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1MNB9   A0A0B7BVD9   F6RFH2   A0A3Q1M8I7   W5PUC3   A0A3Q1NBD6   A0A3S1HJZ0  

Pubmed

20470440    28756777    29023486    19393038    10555285    29078748    + More
24624126    20809919   

EMBL

FJ265548    ADI61816.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    FJ265553    ADI61821.1    + More
FJ265557    ADI61825.1    FJ265546    ADI61814.1    RSAL01000289    RVE42931.1    KZ150203    PZC72267.1    FJ265547    ADI61815.1    FJ265560    ADI61828.1    FJ265552    ADI61820.1    GU815090    ADF18553.1    ODYU01003523    SOQ42419.1    MRZV01002322    PIK33998.1    MRZV01001207    PIK39730.1    MRZV01000196    PIK55924.1    MRZV01001216    PIK39650.1    MRZV01000994    PIK41715.1    MRZV01000817    PIK43880.1    AHAT01022938    NCKU01012182    RWS00163.1    NCKU01008836    RWS01655.1    AJ132772    CAA10770.1    BDSA01000081    GBE63537.1    LK055282    CDR71995.1    NCKU01004395    RWS06003.1    GBBM01006298    JAC29120.1    BART01031562    GAH15691.1    AAGJ04055194    AHAT01017596    HACG01049255    CEK96120.1    AMGL01091659    AMGL01091660    AMGL01091661    AMGL01091662    AMGL01091663    AMGL01091664    AMGL01091665    AMGL01091666    AMGL01091667    AMGL01091668    RQTK01000360    RUS81011.1   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000018468    UP000009136    UP000285301    UP000007875    + More
UP000007110    UP000002356    UP000271974   

PRIDE

D7F163    D7F168    D7F172    D7F161    D7F162    D7F175    + More
D7F167    D5LB39   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F163   A0A2H1VU13   D7F168   D7F172   D7F161   A0A3S2L0R7   + More
A0A2W1BGD9   D7F162   D7F175   D7F167   D5LB39   A0A2H1VNK5   A0A2G8JE23   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8K796   W5NMM5   A0A3Q1LLH3   A0A3S3NR17   A0A3S3RLW1   A0A3Q1LR75   A0A3Q1LT03   O97916   A0A3Q1M2T8   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1MGA3   A0A2H6KKM9   A0A3Q1MJK8   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MMS2   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1N9K5   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1MN71   A0A3Q1MB43   A0A3Q1ML90   F6R5D0   A0A3Q1MJR3   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1LT63   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1MVY4   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1NE26   A0A3Q1LFQ0   A0A061BKJ9   A0A3Q1NB85   A0A3S3P648   A0A3Q1N8A1   A0A3Q1MBA9   A0A023G885   A0A3Q1MDZ3   A0A3Q1LR18   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1LKL4   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MNS1   X1D4L4   A0A3Q1MI63   A0A3Q1M6Y4   A0A3Q1M1T7   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1MVF7   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1LRK8   A0A3Q1LNR9   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1NBK7   H2YWZ5   W4YPU3   A0A3Q1LNX3   W5MXL2   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1LGI2   A0A3Q1MNB9   A0A0B7BVD9   F6RFH2   A0A3Q1M8I7   W5PUC3   A0A3Q1NBD6   A0A3S1HJZ0  

KEGG

101740875    K19199 histone-lysine N-methyltransferase SETD3 [EC:2.1.1.43] | (RefSeq) histone-lysine N-methyltran

PATHWAY

00310    Lysine degradation - Bombyx mori (domestic silkworm)

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

239

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

1.82409

Exp number, first 60 AAs:

0.01019

Total prob of N-in:

0.10022

outside

1  -  239

 

 

Pi

201.317871

Theta

152.669801

Tajima's D

1.001778

CLR

213.517272

CSRT

0.655667216639168

Interpretation

Uncertain