SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO14510
Annotation
PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC107073003_[Polistes_dominula]
Location in the cell
Nuclear   Reliability : 4.057
 

Sequence

CDS
ATGGGTATTAACGAAAGCAAAGATAATAATACTACTATTGCCCAAGCGCAAGTTGTCACCGGACATCTGGCTAACAAGATCAATAATTTTGGTATAGTGCTTATAGTTATCGCGGTACTATTATCAGTAATTCTGTGCTACGGAATGCGGATTCACTGCCATCGGAAAATCAGAAACTGGCTAAAAAAGGAAATGACGGTGGGGCACGTCAATCCACCTGTAGTCAGGATACAAATTGTGCAACAGCAGCCCGCCACCAACGCAGCTGATACGGCTGATACAGCTGCGTCTCAATCTACTGGAATCATTGATTCTTTAACGTCTGCTGAAAATGTAGAACCGGACCCATTGCCAGGCACTTCACGAAATATTGACCAGAGTTCGATATTAATTAATGATGAAACCAGTAATATTGAAGATTTGGAGAATACTGTTGAGGAGGACAATGTAGATTGTGAAACGGAAGTACAAAGTTTTGGAGATGATGAGTTAGCAAAGAAATGCTTTTTTTGTCAAAAAGTCAATAAAAAACAACTGGGCGATATAGAAATGTTACGGAAAATTCAAGAAGAAAATAACTCTGTTAACGATACTTTTTTGGCGTATCATAATATATGTAATGTCAATTATTTTGCCAAATACCAAAGGAAAATGAATCCACCTCCAACTAATGATTGGGCCACGAAACGAGATGGCCATAAAATTGCCAGAGAACGCTTGATTAATTATATTCAGCAAGAAGTTATTACAAATCGACGAGTGATGTCATTAGCTCACTTGAAATATTGTTATGCTGAATTTGTAAAAGAAATTTATGAACACGCAAATTTAGAAGCTACCACATTTAGCAATCAAGCTCTCAAGGACTATATACAAACTCAATTAAAACACAAAATATCATTGGTCAATATTTCAAATCAACAATTTTTTATATCATCTGAAATCGATATTGAAACAATCGATGATGAAGAAATTAATGATATATTATTTGAACAAGAAGCAAAAGATTTCGCCTTGAAATATCGAAAAAATATATTGGGAATAAAAAAAAAACCTTTAACAGATTTCATCGACAGTGAAGTATTAAATGAAGGAGAGTGCGATGTTCCAAAATGGTTAGATATATTTTGGACTACTGCTTTAAGCGGTATTGGCAAAGAAAGCTGCGATCGGGTTCGGAGATTGTCTTCATCTTTTTCGCAGGACTCTATCTACAGCATTACAAGAGGTTATATTAAACCGCGAAAGCATATTTTATTGGGTATAACCATAAAAAGTCTCACAGGAAGCAAAAAAGTCGTGGATATATTAAGCAGGCAAGGATACTGCATCACCTATCCAAGTATACTGGAATTGGAGACGTCTGCTGCATACTGTTGTGTTTCTAATAATCAATTATGTCCAACAAGCATTCAACGAACTTCTATATTATCATCTGGAGTAGCGTGGGATAATTACGACAGATATGTAGAGACAAGCTCTGGTAAAAATACCTTACATGATACAGTGGGTATCATTTATCAAAATATCCCTACAGAAGAAGAATTGAACATCATCAAAAGGAACGATGCATCTACAGAAGCTGAACGGAATTCTTCAAGTAATGTTCGTGATTTGGCTGGCCGTAGAAAACGTTCGTTTGAGGAACAGTCATTTGAAAATATACTGTACGCGAAGCAACGACGTCCAGAATTTTGGCGTAGTAGTGTAGCGTCACCTGAAGAACCACAAAATTTAATTAATTTTCAACATAGGCATTTTACATGGGTACTTTCCCATAACTTAAAAATTTCAAACACGCCAATGTGGGTAGGATATAATGCCAAAATTTTAAAAGATGACAGTAGAATTCAAAAGATTGAGTATTTAACGCAAATTAATAATTCACCCACGGATCCAGCTGTTGTAAAAGAGACGATGCGTAGAAGTTTGCAAATCGCTTCAGAATGTCAAAAAGATTTCTTCAGCGTTACTTACGATTTAGCCATGGCCAAGATTGCTTTACGGATACAGAGTGCGGAGGATGAATTCGAAAAACTTTTTATTAATTTTGGACCTTTCCACATAATGTTATCATTCATGAAAGCTATCGGGAAATTTATAAGTGGATCTGGGTTAACAAATATTCTTATAGATAGCGAAATTTTGGCCAGTGGTTCTATCAGTTCGTTTTTAAGTGGAAAACACTTTAATCGATGCAGAAAAATTCATCCTTTACTCTCTCTTGCTTTGCAGAATTTACATTTGGAAAGGTTTTTACAGCAGCATGATCAGGACCTGGAAAATATTAAAGAATACTTAAAAATATTTAATGAACAACAGAATGATGACCCACAAATAACCAATGAGAATTTAAAAAAATTATTTAACAAATATGAAGAATATAAAAATGAAACTTTAAATGGAAGGCATGGTAAAACACCTCAAATTTATTTAATGTACACAAGATTAGTTGAATATTATCTTCAATTAGAATATAGTATTCGTATAGGTGACTTCAATTTGTTTGTAGACACTTTACCGAAAATAACAAATGTTTTTTTTTCAATGAATCACCATAATTATGCAAGGTATATGTCTATTTATTGGGATAAGTTGATAAATATTGAAACTACACATCCCGGATTGCTTGATGATTGTCAAAAGAGTTTTATGGGCATTCGAAGAACAATAAAACCGTTTTCAAGAATCCCAGTTGATTTAACACTTGAACAAACAATCAATGCTGATGCTGCTTCTAAAGCTTCTGGAATTGTAAACATTACAAACTCGTTCTCTGCAAGACAAAAATGGTCAATTACTCACTCACTACGTACAAGTGTTATATCTAAAGTGATGGAATTTTGTAATATGAAATCAACAGATGATATTACGAAAGATTTAAAGAAATCAACAATTAATAAATCTACCAAAAACTTACAAGTACTAATGCAACTAATAAAGCAGTACACCAACCCTTTTGGATTAGAACTGTCAGAAGATCATCTTTACAATATATCGAAAGGTCAGTCGGTGAACGATGAAGTATATAACTTTTTATCATCAGTTGAAATTGAGGGCGAAAAACAAAATAAGAATTTCATTGCTGAGTCTCGAGTAACACCAGATAGGTTTGATAAAGCCATTACCAGAAATAAAATAATTAATTTTGAGTACAAGAATACGCAAAAAGTCAAAATTAATGGAAAAGTGAAAGAAGTTCAAATGCAAAGAGATGTTTTTGGTCGTCTACTTTATGTGTCACTAAAAAATAAAATTGATTTAGAAAAAGCATTAAGTTATCCTCTAGCTCCTATTCCATTTTCACTCTGTCATACTAATGGAACAATTTGCAAGACCCCAAAATCTGTAATTATTAATGAATTACTAGAATATCAAACTGAAATAGTAAATCCTCCAGAAGCAGATATTCACTTAGTTGATGGATTTTATTTATTACATACATTGAAGAACCTTCCAAACAGATATGGTAAAATCTCAATGCATATATTAAAAATACTTACATATAATAGAAAAGAAGTACATATTATATTTGACAAATACAAAAATCCCAGTATTAAAGATTTTGAACATAATCTGAGAGGTGAAGATGACATACAATATGACGTAATACGTAAAGACAATAATCGTCCTTCAGATTTCTGCAAATTATTGAGGAGCAACAATTTTAAAGAAAAATTTGTAAAATTTTTAATTGAAGATTGGACAAGGGACGAATTTATTACTTTGATCACAGGAAAGACTATTAAACTTAATTATGATCAATGTTACATTTATGAGGTGTCTAGTGAAAATAAAATAAAAAGAGTCATTGACTATAATTTCTCTTGTTATCATGAAGAAGCTGATACCAAAATAGTATACCACATTTGTCAATTTAATACTAACTATCGTGTGGAGATACATTGTACAGATTCTGATATACCAATAATAATGTTGGCAAATTTTAAGCATTTAAAAGATAAAATTCAAATAATAATTAATTTAAGCACGAATAAAAAAAAAATGTACTTAAACATAAATGAAATTTATGCCAAGCTTGGAGATCAATTATCTTGTTCACTCGCCATATGCCATATTTTTACAGGGAATGATTACAATCCTGCTTTCTTTCGTAAAGGAAAAAAGAAACCTTTCAGTATTTTAAAGAAAAATGAAAATTTTCAAGAGGCATTTATTCAACTTCTACGAATTAAAAATACGGAATTAACAACATCGAATGAGGTAGTTCAAATTATTGAAGAGTATGTATGCAGAATGTATTCATTAAAAACAAAAAATGATCTGAATAAAGGACGGTATGAGTTATTTGAAAAAGGGTATAAATCAAAAAATGACAATGAAAAAATTTTAAAACAAAAAATCGTAGGATATGATCCTTCCAGTTTGCCACCAACAAAACAAGAATTGTTGCAACAAATTAAACGAACTGTATTCATCTGCAATATATGGTGTAATGCACACATGCGGTGCCCCACGGAAAAATTGCCAGAAAATTTTGGATGGACAATAATTGATGGTAAATATGAATATTATTGGTTTGATGGTCCCCAAAGTCCATCATTTGAAGAATTATCTTCTGACTTACAAGAGTCAGATATCACGAGTGAAGAAAGTGAAACAGATGAAGATGATAACGATGTTAGTAGCGAACATTTATCAGATGAATCTGATGAAGATTAA
Protein
MGINESKDNNTTIAQAQVVTGHLANKINNFGIVLIVIAVLLSVILCYGMRIHCHRKIRNWLKKEMTVGHVNPPVVRIQIVQQQPATNAADTADTAASQSTGIIDSLTSAENVEPDPLPGTSRNIDQSSILINDETSNIEDLENTVEEDNVDCETEVQSFGDDELAKKCFFCQKVNKKQLGDIEMLRKIQEENNSVNDTFLAYHNICNVNYFAKYQRKMNPPPTNDWATKRDGHKIARERLINYIQQEVITNRRVMSLAHLKYCYAEFVKEIYEHANLEATTFSNQALKDYIQTQLKHKISLVNISNQQFFISSEIDIETIDDEEINDILFEQEAKDFALKYRKNILGIKKKPLTDFIDSEVLNEGECDVPKWLDIFWTTALSGIGKESCDRVRRLSSSFSQDSIYSITRGYIKPRKHILLGITIKSLTGSKKVVDILSRQGYCITYPSILELETSAAYCCVSNNQLCPTSIQRTSILSSGVAWDNYDRYVETSSGKNTLHDTVGIIYQNIPTEEELNIIKRNDASTEAERNSSSNVRDLAGRRKRSFEEQSFENILYAKQRRPEFWRSSVASPEEPQNLINFQHRHFTWVLSHNLKISNTPMWVGYNAKILKDDSRIQKIEYLTQINNSPTDPAVVKETMRRSLQIASECQKDFFSVTYDLAMAKIALRIQSAEDEFEKLFINFGPFHIMLSFMKAIGKFISGSGLTNILIDSEILASGSISSFLSGKHFNRCRKIHPLLSLALQNLHLERFLQQHDQDLENIKEYLKIFNEQQNDDPQITNENLKKLFNKYEEYKNETLNGRHGKTPQIYLMYTRLVEYYLQLEYSIRIGDFNLFVDTLPKITNVFFSMNHHNYARYMSIYWDKLINIETTHPGLLDDCQKSFMGIRRTIKPFSRIPVDLTLEQTINADAASKASGIVNITNSFSARQKWSITHSLRTSVISKVMEFCNMKSTDDITKDLKKSTINKSTKNLQVLMQLIKQYTNPFGLELSEDHLYNISKGQSVNDEVYNFLSSVEIEGEKQNKNFIAESRVTPDRFDKAITRNKIINFEYKNTQKVKINGKVKEVQMQRDVFGRLLYVSLKNKIDLEKALSYPLAPIPFSLCHTNGTICKTPKSVIINELLEYQTEIVNPPEADIHLVDGFYLLHTLKNLPNRYGKISMHILKILTYNRKEVHIIFDKYKNPSIKDFEHNLRGEDDIQYDVIRKDNNRPSDFCKLLRSNNFKEKFVKFLIEDWTRDEFITLITGKTIKLNYDQCYIYEVSSENKIKRVIDYNFSCYHEEADTKIVYHICQFNTNYRVEIHCTDSDIPIIMLANFKHLKDKIQIIINLSTNKKKMYLNINEIYAKLGDQLSCSLAICHIFTGNDYNPAFFRKGKKKPFSILKKNENFQEAFIQLLRIKNTELTTSNEVVQIIEEYVCRMYSLKTKNDLNKGRYELFEKGYKSKNDNEKILKQKIVGYDPSSLPPTKQELLQQIKRTVFICNIWCNAHMRCPTEKLPENFGWTIIDGKYEYYWFDGPQSPSFEELSSDLQESDITSEESETDEDDNDVSSEHLSDESDED

Summary

Pfam
PF03184   DDE_1        + More
PF03564   DUF1759
PF05585   DUF1758
Interpro
IPR004875   DDE_SF_endonuclease_dom        + More
IPR033467   Tesmin/TSO1-like_CXC       
IPR029060   PIN-like_dom_sf       
IPR005312   DUF1759       
IPR008737   Peptidase_asp_put       
SUPFAM
SSF88723   SSF88723       

Ontologies

Topology

Length:
1560
Number of predicted TMHs:
1
Exp number of AAs in TMHs:
22.3470299999999
Exp number, first 60 AAs:
22.33439
Total prob of N-in:
0.99920
POSSIBLE N-term signal
sequence
inside
1  -  29
TMhelix
30  -  52
outside
53  -  1560
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
196.958112
Theta
166.452814
Tajima's D
0.35797
CLR
0.347664
CSRT
0.469026548672566
Interpretation
Uncertain
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号