Gene

KWMTBOMO14389

Pre Gene Modal

BGIBMGA012157

Annotation

hypothetical_protein_RR46_02347_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr24(-):5030353-5030823      View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear   Reliability : 2.372

CDS

ATGGATAGAATACGGAATGAATATGTTAGAGGAAGTCTGAAAGTAGCTCCTGTGACAGAGAAGCTGAGGAGTGCGCGTTTGGGATGGTATGGACATGTGATGAGACGAAATGAAAATGAGGTTGGTAAGAAAATGTTAACTACGAATGTGGAAGGATATAGAGGAAGAGGTAGACCTAAGAAGAAATGGATGGATTGTGTGAAAGACGATATGGGTAAGAGGGGAGTGAGCGAAGAAATGATATGTGATAGAAGAGTATGGAAGGAGAAAAGATGTTGCGCCGACCCCAGGTGA

Protein

MDRIRNEYVRGSLKVAPVTEKLRSARLGWYGHVMRRNENEVGKKMLTTNVEGYRGRGRPKKKWMDCVKDDMGKRGVSEEMICDRRVWKEKRCCADPR

Uniprot

A0A2A4JJS9   A0A2A4IZ11   A0A2W1BR99   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A0C2FK24   A0A016SZZ3   A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A3Q0ISK7   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A016SDN2   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A016UE98   A0A016WFX2   A0A3B3BCY6   A0A016VQL7   A0A183GFE8   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016VYQ7   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   A0A016UG54   A0A016VNT7   A0A016VD78   A0A016TQG5   A0A016U5Z2   A0A016VLS9   A0A183GTC3   A0A3P8DT03   A0A016VFS4   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A183GT84   A0A3P8DS65   H3A9W7   A0A016WMJ7   A0A3B3HPR4   A0A3B3CTC7   A0A3B3B9G5   A0A3P9IMA9   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3B3CPF5   A0A3B3CCF8   A0A3B3BTI6   A0A3B3BT53   A0A3B3CQH3   A0A3B3E183   A0A3B3C7H7   A0A3B3BP31   A0A3B3BC11   A0A3B3BH81   A0A183FJ84   A0A3P7YDN4   A0A183G528   A0A3P8E2T0   A0A3P9IVQ2   A0A3P9MAU2   A0A3P9K1J1   A0A3B3HB06   A0A3B3HQU7   A0A3P9K4Q4   A0A3P9I3Z4   A0A3B3IP13   A0A3P9JDN6   A0A3B3HJS0   A0A3P9K727   A0A3P9JAC7   A0A3P9IV37   H2MG20   A0A3B3I636   A0A3B3IM16   A0A3P9K097   A0A3B3H692   A0A3P9IJG8   A0A3P9HQ45   A0A3B3I8S7   A0A3B3HFD6   A0A3P9MDZ4   A0A3P9H8W7   A0A3B3IFI4   A0A3B3HF03   A0A3B3H6E8   A0A3B3HUR5   A0A3B3ILR3   A0A3P9H8X2   A0A3B3HVS1   A0A3P9KEZ0   A0A3B3I2L1  

Pubmed

28756777    26354079    25730766    29451363    9215903    17554307    + More

EMBL

NWSH01001232    PCG72026.1    NWSH01004369    PCG65177.1    KZ150002    PZC75290.1    + More
KZ150034    PZC74657.1    KZ150032    PZC74715.1    KQ459581    KPI99130.1    KN768094    KIH47114.1    JARK01001491    EYB95904.1    KZ150166    PZC72650.1    UZAH01036764    VDP46995.1    JARK01001582    EYB88451.1    UZAH01001522    VDO19785.1    UZAH01027307    VDO90480.1    UZAH01004968    VDO28364.1    UZAH01031516    VDP15986.1    JARK01001380    EYC13251.1    JARK01000336    EYC38182.1    JARK01001342    EYC29596.1    UZAH01029847    VDP08183.1    JARK01001339    EYC31903.1    UZAH01041723    VDP60601.1    JARK01001379    EYC13548.1    JARK01001343    EYC28702.1    JARK01001347    EYC25574.1    JARK01001481    JARK01001420    EYB96960.1    EYC04966.1    JARK01001507    JARK01001392    JARK01001372    EYB94492.1    EYC10272.1    EYC15469.1    EYC28385.1    UZAH01038885    VDP54822.1    EYC25573.1    UZAH01031410    VDP15327.1    UZAH01038793    VDP54537.1    AFYH01208402    JARK01000211    EYC40482.1    UZAH01037041    VDP47936.1    UZAH01025803    VDO70747.1    UZAH01029552    VDP06679.1   

Proteomes

UP000218220    UP000053268    UP000024635    UP000079169    UP000050761    UP000261560    + More
UP000008672    UP000001038    UP000265200    UP000265180   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

A0A2A4JJS9   A0A2A4IZ11   A0A2W1BR99   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A0C2FK24   A0A016SZZ3   A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A3Q0ISK7   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A016SDN2   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A016UE98   A0A016WFX2   A0A3B3BCY6   A0A016VQL7   A0A183GFE8   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016VYQ7   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   A0A016UG54   A0A016VNT7   A0A016VD78   A0A016TQG5   A0A016U5Z2   A0A016VLS9   A0A183GTC3   A0A3P8DT03   A0A016VFS4   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A183GT84   A0A3P8DS65   H3A9W7   A0A016WMJ7   A0A3B3HPR4   A0A3B3CTC7   A0A3B3B9G5   A0A3P9IMA9   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3B3CPF5   A0A3B3CCF8   A0A3B3BTI6   A0A3B3BT53   A0A3B3CQH3   A0A3B3E183   A0A3B3C7H7   A0A3B3BP31   A0A3B3BC11   A0A3B3BH81   A0A183FJ84   A0A3P7YDN4   A0A183G528   A0A3P8E2T0   A0A3P9IVQ2   A0A3P9MAU2   A0A3P9K1J1   A0A3B3HB06   A0A3B3HQU7   A0A3P9K4Q4   A0A3P9I3Z4   A0A3B3IP13   A0A3P9JDN6   A0A3B3HJS0   A0A3P9K727   A0A3P9JAC7   A0A3P9IV37   H2MG20   A0A3B3I636   A0A3B3IM16   A0A3P9K097   A0A3B3H692   A0A3P9IJG8   A0A3P9HQ45   A0A3B3I8S7   A0A3B3HFD6   A0A3P9MDZ4   A0A3P9H8W7   A0A3B3IFI4   A0A3B3HF03   A0A3B3H6E8   A0A3B3HUR5   A0A3B3ILR3   A0A3P9H8X2   A0A3B3HVS1   A0A3P9KEZ0   A0A3B3I2L1  

KEGG

101740536    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101740536

GO

GO:0016021  

Length:

97

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.74296

inside

1  -  97

 

 

Pi

249.005141

Theta

162.709565

Tajima's D

1.667909

CLR

49.697677

CSRT

0.816259187040648

Interpretation

Uncertain