Gene

KWMTBOMO14053

Pre Gene Modal

BGIBMGA011233

Annotation

PREDICTED:_zinc_finger_protein_845-like_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr23(-):16964764-16966212      View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear   Reliability : 4.545

CDS

ATGATAGTCGAGCATAAATGTACGGAGACTGGAGAGAAAATAATTACCCCCCTCAAATGTGCTTTGTGCGATTACACAACACTTTTCAAGGACAATCTGAACGCTCACAAGCGAAAACACAAGTCCGAAAAGCGTTACCAATGTGAGAATTGTACATATTCAACTTCGTACATCAACAATTATAAGAAACACAAAAAGAAGCATTCGAAAGAAATTGTCGAATTTAAATGTGACAAATGTTCGTTTGTAACAAAACATTCAGGTCACATACACAGGCATCTGTCTCAGATACATAACGAGATAACGGAGAAAGCAAAGAAATGTGAATTTTGTGATTTTACAACAATAGTTGGATGGAGATTGAACATACACAAGCAAAGGAGTCGCCAGAATGAAGTCATAAAGTGCGTTTACTGTGAATACCAAACTTTTTATAAATGCGAAAGCAAGAAACACAGTAATACACATTTCAAGGAAATCTACACGAAAAACTCACATAGAAATAAACATAATAATATTCAAGAACAAAATGTAGACGAAACTTTGAGTTTGAATCTCGGTGAGCAAAACCTTCCTTCAATCACGAATCAAACGAACCACAGCTCATACAATATCAACTCCTATACGAATACCAGTAATTACAGTCAAAACTATTCGAACGCTGAAGATTTTTTACCGAAAGAACTGTTAAATTACACGGAGATATCAAATGAATTACCGTTGACTTACAGCACCCCATATTCAGATAAAATCGACAAGAAAACCATTCAAGTATTGGACTCTAATGACAGAGAAAGACCATTTGGTTGTTCTCATTGCAATTACATATCGAAATTCAAGGCAACGGTGCAGAGGCACTATCAAAGACACCACACTGACGACAAGCGCCCGTACCACTGCTCCAACTGCGACTTCAAAACGAAGACCAAAGATCAGATAGCGTTGCACAACAAACGCAGCGCCTCATCCCTAGAAATGAGATGTCAGAATTGTGATTTCACAACGAATTTCAAATGCCAATTCGTTATGCATCAGCGCTCCCACTACACGTTCAAATGTGAACTGTGTAATTACACGTGTAAGCATAAGCATGAGATCGAGAAGCACGTGAGGACGATTCACATGGGCACAAAGCACCTGTGCAAGTATTGCGACTTCAAAACTCCTAAATTGGAAGCGCTGCTGTGTCACGAAGCATTGCACACCGGCAACAAACCGTTTAAATGCAAGTTGTGTGACTACCAGACTGTGAGGCTCTCCCTTTTGGACATACACGTCAGGAGGTACCACAGTGATTTGAAGGTAGTCAAACTTATTAGCGAGAGTAAAGTGCAATCCCTAAAGGTATCCGTTCCACCTGATGAATGTTCGTGA

Protein

MIVEHKCTETGEKIITPLKCALCDYTTLFKDNLNAHKRKHKSEKRYQCENCTYSTSYINNYKKHKKKHSKEIVEFKCDKCSFVTKHSGHIHRHLSQIHNEITEKAKKCEFCDFTTIVGWRLNIHKQRSRQNEVIKCVYCEYQTFYKCESKKHSNTHFKEIYTKNSHRNKHNNIQEQNVDETLSLNLGEQNLPSITNQTNHSSYNINSYTNTSNYSQNYSNAEDFLPKELLNYTEISNELPLTYSTPYSDKIDKKTIQVLDSNDRERPFGCSHCNYISKFKATVQRHYQRHHTDDKRPYHCSNCDFKTKTKDQIALHNKRSASSLEMRCQNCDFTTNFKCQFVMHQRSHYTFKCELCNYTCKHKHEIEKHVRTIHMGTKHLCKYCDFKTPKLEALLCHEALHTGNKPFKCKLCDYQTVRLSLLDIHVRRYHSDLKVVKLISESKVQSLKVSVPPDECS

Uniprot

H9JNX9   A0A212FGI1   A0A2A4IYE9   A0A2H1VP67   A0A3S2NXL0   A0A0L7KM65   + More
A0A1E1WNY7   C4A0A2   C3YHM6   C3YHQ7   C3ZRC8   C3ZSM4   C3Z3I8   C4A0A1   C3YMF4   C3YZZ2   C3ZXA9   C3XX14   C3Y7F9   C3ZY73   C3Z011   C3YU42   C3YXW0   A0A2R7X7B9   C3YWR8   C3ZYL3   C3YHJ7   A0A0V0G4M8   C3ZRC6   C3XX02   C3YNB1   C3YHK1   C3YWR0   C3XXB0   C3Z309   C3ZXA8   C3YHM7   C3XSV2   A0A023F6Z3   C3YXV5   C3YXW3   C3ZR95   A0A1B6DQK6   C3YP61   C3XWZ0   A0A1B6DVS6   C3YHR4   C3Z6C9   C3YHY0   C3YKM0   C3Z007   C3YBB2   C3YKT3   C3ZRA1   C3Z658   C3Z3H3   C3YQG4   C3YU40   C3YGC5   C3YHN3   A0A1B6CRV2   C4A0Z6   C3XSP6   C3ZR99   C3ZZW5   C3YU97   C3Z009   C3YQQ3   C3YPH0   C3XWY0   C3XQN9   A0A069DVZ9   C3ZWS5   C4A0F8   C3YMG4   C3YCB1   A0A0P4VSQ8   A0A023F0S8   C3XX19   C3ZRB5   C3ZE44   C4A0A4   C3ZGY2   A0A224XS64   A0A224XNK1   C3XXA8  

Pubmed

19121390    22118469    26227816    18563158    25474469    26334808    + More
27129103   

EMBL

BABH01009777    BABH01009778    AGBW02008661    OWR52844.1    NWSH01005461    PCG64200.1    + More
ODYU01003613    SOQ42596.1    RSAL01000031    RVE51577.1    JTDY01008776    KOB64407.1    GDQN01002334    JAT88720.1    GG666795    EEN41783.1    GG666514    EEN60013.1    EEN60044.1    GG666664    EEN45001.1    GG666674    EEN44426.1    GG666576    EEN53032.1    EEN41782.1    GG666529    EEN58748.1    GG666567    EEN54051.1    GG666710    EEN42789.1    GG666471    EEN67274.1    GG666489    EEN63787.1    GG666722    EEN42504.1    EEN54070.1    GG666552    EEN56319.1    GG666563    EEN54919.1    KK858243    PTY27688.1    GG666561    EEN55312.1    GG666732    EEN42360.1    EEN59984.1    GECL01003123    JAP03001.1    EEN44999.1    EEN67262.1    GG666533    EEN58217.1    EEN59988.1    EEN55304.1    EEN67370.1    GG666575    EEN53048.1    EEN42788.1    EEN60014.1    GG666459    EEN69023.1    GBBI01001743    JAC16969.1    EEN54914.1    EEN54922.1    EEN44968.1    GEDC01009332    JAS27966.1    GG666537    EEN57952.1    EEN67250.1    GEDC01007526    JAS29772.1    EEN60051.1    GG666586    EEN51904.1    EEN60117.1    GG666523    EEN59088.1    EEN54066.1    GG666497    EEN62269.1    EEN59151.1    EEN44974.1    GG666584    EEN51984.1    EEN53017.1    GG666542    EEN57494.1    EEN56317.1    GG666511    EEN60646.1    EEN60020.1    GEDC01021201    JAS16097.1    GG666840    EEN41537.1    EEN68967.1    EEN44972.1    GG666770    EEN41918.1    EEN56374.1    EEN54068.1    GG666543    EEN57409.1    GG666538    EEN57754.1    EEN67240.1    GG666455    EEN69615.1    GBGD01000878    JAC88011.1    GG666703    EEN42994.1    GG666803    EEN41719.1    EEN58758.1    GG666500    EEN62143.1    GDKW01003599    JAI52996.1    GBBI01003632    JAC15080.1    EEN67279.1    EEN44988.1    GG666612    EEN49000.1    EEN41785.1    GG666621    EEN48129.1    GFTR01005585    JAW10841.1    GFTR01006264    JAW10162.1    EEN67368.1   

Proteomes

UP000005204    UP000007151    UP000218220    UP000283053    UP000037510    UP000001554    + More

PRIDE

H9JNX9   

Pfam

PF00096   zf-C2H2

Interpro

IPR013087   Znf_C2H2_type        + More
IPR036236   Znf_C2H2_sf       
IPR017125   Znf_PRDM5-like       
IPR017114   YY-1-like       

SUPFAM

SSF57667   SSF57667       

ProteinModelPortal

H9JNX9   A0A212FGI1   A0A2A4IYE9   A0A2H1VP67   A0A3S2NXL0   A0A0L7KM65   + More
A0A1E1WNY7   C4A0A2   C3YHM6   C3YHQ7   C3ZRC8   C3ZSM4   C3Z3I8   C4A0A1   C3YMF4   C3YZZ2   C3ZXA9   C3XX14   C3Y7F9   C3ZY73   C3Z011   C3YU42   C3YXW0   A0A2R7X7B9   C3YWR8   C3ZYL3   C3YHJ7   A0A0V0G4M8   C3ZRC6   C3XX02   C3YNB1   C3YHK1   C3YWR0   C3XXB0   C3Z309   C3ZXA8   C3YHM7   C3XSV2   A0A023F6Z3   C3YXV5   C3YXW3   C3ZR95   A0A1B6DQK6   C3YP61   C3XWZ0   A0A1B6DVS6   C3YHR4   C3Z6C9   C3YHY0   C3YKM0   C3Z007   C3YBB2   C3YKT3   C3ZRA1   C3Z658   C3Z3H3   C3YQG4   C3YU40   C3YGC5   C3YHN3   A0A1B6CRV2   C4A0Z6   C3XSP6   C3ZR99   C3ZZW5   C3YU97   C3Z009   C3YQQ3   C3YPH0   C3XWY0   C3XQN9   A0A069DVZ9   C3ZWS5   C4A0F8   C3YMG4   C3YCB1   A0A0P4VSQ8   A0A023F0S8   C3XX19   C3ZRB5   C3ZE44   C4A0A4   C3ZGY2   A0A224XS64   A0A224XNK1   C3XXA8  

PDB

5UND     E-value=1.49238e-12,     Score=177

KEGG

101738585    no KO assigned | (RefSeq) zinc finger protein 845-like

GO

GO:0003676   GO:0000981   GO:0005634   GO:0040034   GO:0000976   GO:0046872   GO:0006468   GO:0000166   GO:0006812   GO:0019829   GO:0005507   GO:0004713   GO:0016491   GO:0015930  

Length:

457

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00018

Exp number, first 60 AAs:

0.00018

Total prob of N-in:

0.01038

outside

1  -  457

 

 

Pi

170.841425

Theta

194.435952

Tajima's D

-0.446178

CLR

0.941599

CSRT

0.255687215639218

Interpretation

Uncertain