SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO13807
Annotation
PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC106131466_[Amyelois_transitella]
Location in the cell
Nuclear   Reliability : 1.592 PlasmaMembrane   Reliability : 2.172
 

Sequence

CDS
ATGCCGCCTAAATCTAATAAATCCGAGAACGATTTGAAGCTTTTGTACGCTAAGAGGGATATGATTTATTCACGCGTGCAAACAATTTGTGATAATGCACTTAAGATATCCGACTTAGCAATACGAGACTCATTTCTTTGTTCTATTGAAAACATAGACGATTTGCGCGCGGATTTCGAAAGTATCGTTCATAATATCAACGCATTGCAATTAGAACTAGATCCTGATTACGCCGTCAGTTACTCTGTTATGTCGTCGTTTGATGATCTATATTGCCGTATAAAACGTGTCGCTAAATCTTTAGGAAAAATACCTAGCGCCGGGTATTCGCAAACGGAACCTAAGTTCACCCGCGATAGACCTAGACTACCGCCTATCCACATACCCGAATTTAATGGGGACATCCGTAATTGGGGTTTATTTATAGATAGTTTTGAAAATACAGTAAATCAAAATGATCACTTAACCGATCACGAAAAATTACACTACTTAGTAGAAAAACTTACCGGCAAAGCCCGTGCGGCTTGCGCGGGAATTACGTTTAGTGCCGAAAACTATTCTTTGATTTTGAACACACTCAAAGCCAAATATGAAGATAAACGGTTGATAGCTACCGCGTACCTGGATCAGTTGTTCGAATTAAAACCTATTTTATCGTGTACCGAACAGAATTTGGAGAAATTCTTAGACATATTTGCATCATCTGTTCGGGCTATTAGAAATCTCAACGTCAATGACCTCAGCGACTTTTTATTTTTGTACATTGGCTTAAAAAAGTTAGATTTCGAAACTGTTCGCTTATTTGAAACGAATCAGGGTACTAAGGGTATTGAATTGCCGAAATTTAATGAATTGGAATCATTTTTACGTAATCACATAAGAATACTTCAGCGTACTACGCGACCTCACGAGGTCCCGAAAAGACAACCAGAAAGGCATTTAGAAACGTCTTCAAGACCGCTTAGAACGACTCATAGCTATGTAAATACCGCGGCGTTGCCTGCGTCCGTGCCCGCCAAGTCGACTTGTTTTCTGTGCAAATCTTATCATACACAGTTGTATCAGTGTGCTGAGTTTTTGAAATTGTCGCCTAAAAATCGTTATGATTTTGTTCGCACAAATAACTTGTGTTTAAACTGCCTTAGTGATAAACATCGCGTTGATAAAGTAACGGAGCAACTTCCTACTGTTTCTGTAGATACCTCGTTGTTAGCTAACTTTGATAGTTTGCCGTTAGCCGATGATACTTACGCCGTTCCAGGAGCCGTCGATATTTTGATTGGCGCTTCGATTTTCCCGCACCTCCTGCTGCCACGTAAGGTTCAAGGTCATTCGGCGAACCCCGCACCGCACGCTTTGGAAACTGTTCTCGGTTTTGTTATAGTTGGATCCGCACCCGCTCTTATAAATAGTTACTCGACCGTATCATACTGCTGCGCCGTCGAGCCGCCACTGGACTCCACCGTCCGCCGCTTTTGGGAAATTGAAGAAGTAAATGTTCCGCTGGTTATGAGTCCTGATGATAAGACCGCTGAGGATATTTATTGTAGCACGACCACCCGCGATGAAAGTGGTCGTTATATTGTTGCACTCCCGTTTAAGGGTGATACCTTTTCGCTTGGTGATTCGCGCCTAATGGCCGAAAAACGCTTTTTTTGTTTAGAACGTAAGATGATGGCATCTCCGAAGTTGAAAAAGGCCTACGACGATGTCGTGAATGAATATGTAGATAAGGGTATCATCTCACCTGCTCCCGCTGTACTTGATGAGACGCAAAATGGTCCCTCTTATGTCATCCCGCATCATGGTGTCATTAGGGAGGATAAACTCACCACAAAATTGCGTGTTGTTCTGGATGGCAGTGCTAAGACTAGTACTTCTGTTTCTCTAAACGACATCTTGTATTGTGGTAAAAATCTTCAAGGTAACTTGTTTGATATTATCGTCAATTTTCGTTTATTTATTGTAGCGCTATCTGCAGACATTAGACAAATGTTTCTTTGTATTGGCATTCGGGAATCGGATCGTAGATTCCAAAGATTTTTATATAGGTTTTCCCCACACGAACCATTAAAGGTTTACCAGTTTAACCGCGTTTGTTTCGGACTTAAGTCAAGTCCGTTTCACGCGCTTCGCACTGTGAAGCAGTTAGTTCTTGATGAGGGTGATTCCTACCCCAAGGCAAAAGCTACCATCAATACTGGTCTGTATATGGATGACTTTGCTTATAGTGTAGATAGCGAGCCTGAAGCCATCGAAACAGCTACTCAAGTGATAAGCCTAATGAAGACTGGGCAATTTGACCTTGTTAAGTGGACGAGCAACTCTCAACGTGTTTTGGACTGGATTCCGCCATCGCATCGTCTATCGACGGTTAAGGATTTTGATGTCAATGATACACATAAGATTCTCGGCTTGAGCTGGTCTCCCACATCCGATACATTCAGTCTCAAAATTAGCTCGACCCCGCCAACTTGTACCAAACGCACCATATTGTCTTGTGTCGCTCGCATATGGGACATTATGGGTTTTGTAGCACCTGTAGTGTTATACGCAAAGCTTCTTATTAAAGAGCTTTGGCTTTCTCAGTGTGACTGGGATGACATCGCACCGGACAACGTGGCCAGATTATGGGCTCGCTTCAGGGAAGAGCTTCCTATGCTCGAACATATAGAAATCCCACGTCATGTAGGTATCTCTCGAGATAGTGTAGTCACAATAGTGGGGTTCGCAGATGCTAGTGAGAAGGCTTATGGAGGAGTGGTGTATTTTCACGTTTGCAATGGCGACAATATTACAGTTAGCCTTATTAGTGCGAAATCTAAGGTCTCCCCTCGAAAGGTCGTCTCTCTCGCGCGCCTTGAGCTTTGCGCTTTACTACTATTGACGCGGCTCATTGGTGCCATAGTCAAGGGTTGTAACAACCGCATTAATATTGATAGAATTGCTGGCTTTTCTGACTCAACCGTAGCTTTGTGTTGGGCTCACTCTTCTCCCCACCGTTGGGACACATTTGTTGCTAATAGAGTAGCAAAAATTCAATCTGAATTATCACCTCAAAATCTATATCACGTCGCTGGAACAGACAATCCTGCCGATTGTCTTTCACGGGGTTTAAACCCCGCTCAAATATTAGATCATCCGCTCTGCTCGAATGTTTCATTCGAAATAAACTCGCTGGTTGTAGATAAAGTAACGGAGCAACTTCCTACTGTTTCTGTAGATACCTCGTTGTTAGCTAACTTTGATAGTTTGCCGTTAGCCGATGATACTTACGCCGTTCCAGGAGCCGTCGATATTTTGATTGGCGCTTCGATTTTCCCGCACCTCCTGCTGCCACGTAAGGTTCAAGGTCATTCGGCGAACCCCGCACCGCACGCTTTGGAAACTGTTCTCGGTTTTGTTATAGTTGGATCCGCACCCGCTCTTATAAATAGTTACTCGACCGTATCATACTGCTGCGCCGTCGAGCCGCCACTGGACTCCACCGTCCGCCGCTTTTGGGAAATTGAAGAAGTAAATGTTCCGCTGGTTATGAGTCCTGATGATAAGACCGCTGAGGATATTTATTGTAGCACGACCACCCGCGATGAAAGTGGTCGTTATATTGTTGCACTCCCGTTTAAGGGTGATACCTTTTCGCTTGGTGATTCGCGCCTAATGGCCGAAAAACGCTTTTTTTGTTTAGAACGTAAGATGATGGCATCTCCGAAGTTGAAAAAGGCCTACGACGATGTCGTGAATGAATATGTAGATAAGGGTATCATCTCACCTGCTCCCGCTGTACTTGATGAGACGCAAAATGGTCCCTCTTATGTCATCCCGCATCATGGTGTCATTAGGGAGGATAAACTCACCACAAAATTGCGTGTTGTTCTGGATGGCAGTGCTAAGACTAGTACTTCTGTTTCTCTAAACGACATCTTGTATTGTGGTAAAAATCTTCAAGGTAACTTGTTTGATATTATCGTCAATTTTCGTTTATTTATTGTAGCGCTATCTGCAGACATTAGACAAATGTTTCTTTGTATTGGCATTCGGGAATCGGATCGTAGATTCCAAAGATTTTTATATAGGTTTTCCCCACACGAACCATTAAAGGTTTACCAGTTTAACCGCGTTTGTTTCGGACTTAAGTCAAGTCCGTTTCACGCGCTTCGCACTGTGAAGCAGTTAGTTCTTGATGAGGGTGATTCCTACCCCAAGGCAAAAGCTACCATCAATACTGGTCTGTATATGGATGACTTTGCTTATAGTGTAGATAGCGAGCCTGAAGCCATCGAAACAGCTACTCAAGTGATAAGCCTAATGAAGACTGGGCAATTTGACCTTGTTAAGTGGACGAGCAACTCTCAACGTGTTTTGGACTGGATTCCGCCATCGCATCGTCTATCGACGGTTAAGGATTTTGATGTCAATGATACACATAAGATTCTCGGCTTGAGCTGGTCTCCCACATCCGATACATTCAGTCTCAAAATTAGCTCGACCCCGCCAACTTGTACCAAACGCACCATATTGTCTTGTGTCGCTCGCATATGGGACATTATGGGTTTTGTAGCACCTGTAGTGTTATACGCAAAGCTTCTTATTAAAGAGCTTTGGCTTTCTCAGTGTGACTGGGATGACATCGCACCGGACAACGTGGCCAGATTATGGGCTCGCTTCAGGGAAGAGCTTCCTATGCTCGAACATATAGAAATCCCACGTCATGTAGGTATCTCTCGAGATAGTGTAGTCACAATAGTGGGGTTCGCAGATGCTAGTGAGAAGGCTTATGGAGGAGTGGTGTATTTTCACGTTTGCAATGGCGACAATATTACAGTTAGCCTTATTAGTGCGAAATCTAAGGTCTCCCCTCGAAAGGTCGTCTCTCTCGCGCGCCTTGAGCTTTGCGCTTTACTACTATTGACGCGGCTCATTGGTGCCATAGTCAAGGGTTGTAACAACCGCATTAATATTGATAGAATTGCTGGCTTTTCTGACTCAACCGTAGCTTTGTGTTGGGCTCACTCTTCTCCCCACCGTTGGGACACATTTGTTGCTAATAGAGTAGCAAAAATTCAATCTGAATTATCACCTCAAAATCTATATCACGTCGCTGGAACAGACAATCCTGCCGATTGTCTTTCACGGGGTTTAACCCCCGCTCAAATATTAGATCATCCGCTCTGGACCGCAACCGGATCGTATCTACGCCCGGTTATTCGCCTCTGCCCTTTACCTAATTCACAATAG
Protein
MPPKSNKSENDLKLLYAKRDMIYSRVQTICDNALKISDLAIRDSFLCSIENIDDLRADFESIVHNINALQLELDPDYAVSYSVMSSFDDLYCRIKRVAKSLGKIPSAGYSQTEPKFTRDRPRLPPIHIPEFNGDIRNWGLFIDSFENTVNQNDHLTDHEKLHYLVEKLTGKARAACAGITFSAENYSLILNTLKAKYEDKRLIATAYLDQLFELKPILSCTEQNLEKFLDIFASSVRAIRNLNVNDLSDFLFLYIGLKKLDFETVRLFETNQGTKGIELPKFNELESFLRNHIRILQRTTRPHEVPKRQPERHLETSSRPLRTTHSYVNTAALPASVPAKSTCFLCKSYHTQLYQCAEFLKLSPKNRYDFVRTNNLCLNCLSDKHRVDKVTEQLPTVSVDTSLLANFDSLPLADDTYAVPGAVDILIGASIFPHLLLPRKVQGHSANPAPHALETVLGFVIVGSAPALINSYSTVSYCCAVEPPLDSTVRRFWEIEEVNVPLVMSPDDKTAEDIYCSTTTRDESGRYIVALPFKGDTFSLGDSRLMAEKRFFCLERKMMASPKLKKAYDDVVNEYVDKGIISPAPAVLDETQNGPSYVIPHHGVIREDKLTTKLRVVLDGSAKTSTSVSLNDILYCGKNLQGNLFDIIVNFRLFIVALSADIRQMFLCIGIRESDRRFQRFLYRFSPHEPLKVYQFNRVCFGLKSSPFHALRTVKQLVLDEGDSYPKAKATINTGLYMDDFAYSVDSEPEAIETATQVISLMKTGQFDLVKWTSNSQRVLDWIPPSHRLSTVKDFDVNDTHKILGLSWSPTSDTFSLKISSTPPTCTKRTILSCVARIWDIMGFVAPVVLYAKLLIKELWLSQCDWDDIAPDNVARLWARFREELPMLEHIEIPRHVGISRDSVVTIVGFADASEKAYGGVVYFHVCNGDNITVSLISAKSKVSPRKVVSLARLELCALLLLTRLIGAIVKGCNNRINIDRIAGFSDSTVALCWAHSSPHRWDTFVANRVAKIQSELSPQNLYHVAGTDNPADCLSRGLNPAQILDHPLCSNVSFEINSLVVDKVTEQLPTVSVDTSLLANFDSLPLADDTYAVPGAVDILIGASIFPHLLLPRKVQGHSANPAPHALETVLGFVIVGSAPALINSYSTVSYCCAVEPPLDSTVRRFWEIEEVNVPLVMSPDDKTAEDIYCSTTTRDESGRYIVALPFKGDTFSLGDSRLMAEKRFFCLERKMMASPKLKKAYDDVVNEYVDKGIISPAPAVLDETQNGPSYVIPHHGVIREDKLTTKLRVVLDGSAKTSTSVSLNDILYCGKNLQGNLFDIIVNFRLFIVALSADIRQMFLCIGIRESDRRFQRFLYRFSPHEPLKVYQFNRVCFGLKSSPFHALRTVKQLVLDEGDSYPKAKATINTGLYMDDFAYSVDSEPEAIETATQVISLMKTGQFDLVKWTSNSQRVLDWIPPSHRLSTVKDFDVNDTHKILGLSWSPTSDTFSLKISSTPPTCTKRTILSCVARIWDIMGFVAPVVLYAKLLIKELWLSQCDWDDIAPDNVARLWARFREELPMLEHIEIPRHVGISRDSVVTIVGFADASEKAYGGVVYFHVCNGDNITVSLISAKSKVSPRKVVSLARLELCALLLLTRLIGAIVKGCNNRINIDRIAGFSDSTVALCWAHSSPHRWDTFVANRVAKIQSELSPQNLYHVAGTDNPADCLSRGLTPAQILDHPLWTATGSYLRPVIRLCPLPNSQ

Summary

Uniprot
ProteinModelPortal

Ontologies

GO

Topology

Length:
1745
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
0.611669999999999
Exp number, first 60 AAs:
0.0004
Total prob of N-in:
0.00026
outside
1  -  1745
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
4.654326
Theta
158.093758
Tajima's D
-1.122355
CLR
0.860021
CSRT
0.116694165291735
Interpretation
Uncertain
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