Gene

KWMTBOMO13508

Pre Gene Modal

BGIBMGA009197

Annotation

PREDICTED:_organic_cation_transporter_protein-like_isoform_X1_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr23(-):385800-388080      View in EpiBrowser

Location in the cell

Extracellular   Reliability : 0.885

CDS

ATGTTCAGCATGACCGTGGTAGCTATGGAAGTATTCCCTACTAAGTCAAGAAACTCTCTCACTAATGTCGCCAACACCATCGGCAGGATTGGATCTATTTTAGCACCACAAGCACCATTACTGGAAAAATACATGAGTGGTCTCTCGAGCATCATTTTTGGAATAGTATCTTTGGGACCAGCTTTACTAGCATTCCTACTACCCGACACGAGTAAGGTTTCTCTACCAGACGACATCACAGAAGCAGAAAACTTAGACGTACGGCCGGAAGAATCTGACCCTACATGTAGTGTTCCTGCAAGTGGGGAATACAGGGAACGGTTTTGA

Protein

MFSMTVVAMEVFPTKSRNSLTNVANTIGRIGSILAPQAPLLEKYMSGLSSIIFGIVSLGPALLAFLLPDTSKVSLPDDITEAENLDVRPEESDPTCSVPASGEYRERF

Uniprot

H9JI49   A0A2H1W8C3   A0A2A4K7D4   A0A2W1BUD3   A0A194RER3   A0A194PXP4   + More
H9JVZ7   A0A2W1BM98   H9JI51   A0A212F141   A0A2A4J3F4   A0A3S2L7U6   A0A2H1VQS6   A0A0L7LVB7   A0A0N0P9G0   A0A0N1I6I7   A0A0L7KUG4   A0A2A4JPL4   A0A212F2F2   A0A2H1W2A4   S4P1Y2   A0A2H1VDM1   A0A212EH35   A0A194RHT1   A0A194RH24   A0A194PCQ2   A0A212F072   A0A034UXN1   A0A2A4K6M9   A0A212EWR7   A0A212ERF4   A0A2A4K4I8   A0A194RI60   A0A0L7LSA4   A0A2H1V9B3   A0A2H1WTZ6   A0A2A4JU15   A0A2A4K3J3   A0A2A4K592   A0A3S2N7K6   A0A2R7VUS9   A0A2P8YSW5   A0A194RE15   A0A0N1PI45   A0A194QI00   A0A1B0DJC6   H9IWG9   A0A3S2L3J0   A0A3S2NA23   A0A194QC91   A0A212F2Q3   A0A2H1VA76   V9ICM7   A0A088AAF9   A0A2A3E3H4   A0A0L7RIG1   A0A2R7WSH8   A0A067RGL9   S4NXS3   W8BY90   A0A2J7RPZ6   H9IWG8   A0A194PCX0   A0A0J7KGE3   A0A154PCE9   A0A067RSY2   A0A2A4K5P1   A0A2J7RPZ7   B2DBH3   A0A182IUF7   A0A0L0C9F0   A0A1B6ML33   A0A194RIS2   A0A182SH91   A0A026W5E8   A0A182JXE2   A0A2J7RPY4   A0A195E462   A0A3L8D7U5   A0A2J7RPY2   A0A2H1V9G0   E2A7K4   H9IVN2   R4UKP6   E2BPX2   A0A0K8UFN6   A0A195FIT4   A0A2J7RPY0   A0A2J7RPY7   A0A0K8VEY5   A0A2A4K7E5   F4WUN7   A0A2J7RPY5   A0A0T6B887   B4L008   A0A067RDE7   A0A2A4K5R4   A0A2A4K7E3  

Pubmed

19121390    28756777    26354079    22118469    26227816    23622113    + More
25348373    29403074    24845553    24495485    18712529    26108605    24508170    30249741    20798317    21719571    17994087   

EMBL

BABH01041119    BABH01041120    ODYU01006920    SOQ49196.1    NWSH01000100    PCG79560.1    + More
KZ149964    PZC76256.1    KQ460313    KPJ16067.1    KQ459595    KPI95920.1    BABH01036481    KZ149965    PZC76202.1    BABH01041111    AGBW02010973    OWR47447.1    NWSH01003619    PCG66044.1    RSAL01000097    RVE47697.1    ODYU01003881    SOQ43193.1    JTDY01000022    KOB79380.1    KQ459449    KPJ00906.1    KQ461184    KPJ07510.1    JTDY01005496    KOB66937.1    NWSH01000834    PCG73941.1    AGBW02010753    OWR47904.1    ODYU01005874    SOQ47209.1    GAIX01012265    JAA80295.1    ODYU01001802    SOQ38502.1    AGBW02014973    OWR40799.1    KQ460205    KPJ17122.1    KPJ17123.1    KQ459606    KPI91071.1    AGBW02011137    OWR47156.1    GAKP01023245    JAC35711.1    PCG79564.1    AGBW02011950    OWR45874.1    AGBW02013021    OWR44080.1    NWSH01000168    PCG78824.1    KPJ17124.1    JTDY01000245    KOB78076.1    ODYU01001366    SOQ37440.1    ODYU01010990    SOQ56446.1    NWSH01000587    PCG75491.1    PCG78831.1    PCG78830.1    RSAL01002816    RVE40410.1    KK854099    PTY11252.1    PYGN01000379    PSN47342.1    KPJ16073.1    KQ459762    KPJ20130.1    KQ459193    KPJ03081.1    AJVK01064829    BABH01006656    RSAL01000186    RVE44802.1    RSAL01000360    RVE42197.1    KPJ03082.1    AGBW02010692    OWR48028.1    ODYU01001220    SOQ37134.1    JR038305    AEY58206.1    KZ288444    PBC25689.1    KQ414585    KOC70516.1    KK855422    PTY22512.1    KK852482    KDR22927.1    GAIX01010611    JAA81949.1    GAMC01012331    JAB94224.1    NEVH01001354    PNF42899.1    BABH01006651    BABH01006652    BABH01006653    KPI91072.1    LBMM01007950    KMQ89276.1    KQ434870    KZC09576.1    KDR22929.1    PCG79565.1    PNF42898.1    AB264653    BAG30732.1    JRES01000704    KNC29063.1    GEBQ01003309    JAT36668.1    KQ460325    KPJ15841.1    KK107403    EZA51300.1    PNF42897.1    KQ979657    KYN19975.1    QOIP01000011    RLU16525.1    PNF42895.1    SOQ37441.1    GL437348    EFN70576.1    BABH01039623    KC740880    AGM32704.1    GL449663    EFN82259.1    GDHF01026931    GDHF01013660    GDHF01009296    JAI25383.1    JAI38654.1    JAI43018.1    KQ981523    KYN40281.1    PNF42891.1    PNF42889.1    GDHF01014878    JAI37436.1    PCG79572.1    GL888375    EGI62034.1    PNF42894.1    LJIG01009268    KRT83419.1    CH933809    EDW19043.1    KK852530    KDR21906.1    PCG79571.1    PCG79570.1   

Proteomes

UP000005204    UP000218220    UP000053240    UP000053268    UP000007151    UP000283053    + More
UP000037510    UP000245037    UP000092462    UP000005203    UP000242457    UP000053825    UP000027135    UP000235965    UP000036403    UP000076502    UP000075880    UP000037069    UP000075901    UP000053097    UP000075881    UP000078492    UP000279307    UP000000311    UP000008237    UP000078541    UP000007755    UP000009192   

PRIDE

H9JI49    H9JVZ7    H9JI51    H9IWG9    H9IWG8    H9IVN2    + More

Pfam

PF07690   MFS_1        + More
PF00083   Sugar_tr
PF00078   RVT_1

Interpro

IPR011701   MFS        + More
IPR036259   MFS_trans_sf       
IPR020846   MFS_dom       
IPR005829   Sugar_transporter_CS       
IPR005828   MFS_sugar_transport-like       
IPR000477   RT_dom       

SUPFAM

SSF103473   SSF103473       

CDD

cd06174  MFS

ProteinModelPortal

H9JI49   A0A2H1W8C3   A0A2A4K7D4   A0A2W1BUD3   A0A194RER3   A0A194PXP4   + More
H9JVZ7   A0A2W1BM98   H9JI51   A0A212F141   A0A2A4J3F4   A0A3S2L7U6   A0A2H1VQS6   A0A0L7LVB7   A0A0N0P9G0   A0A0N1I6I7   A0A0L7KUG4   A0A2A4JPL4   A0A212F2F2   A0A2H1W2A4   S4P1Y2   A0A2H1VDM1   A0A212EH35   A0A194RHT1   A0A194RH24   A0A194PCQ2   A0A212F072   A0A034UXN1   A0A2A4K6M9   A0A212EWR7   A0A212ERF4   A0A2A4K4I8   A0A194RI60   A0A0L7LSA4   A0A2H1V9B3   A0A2H1WTZ6   A0A2A4JU15   A0A2A4K3J3   A0A2A4K592   A0A3S2N7K6   A0A2R7VUS9   A0A2P8YSW5   A0A194RE15   A0A0N1PI45   A0A194QI00   A0A1B0DJC6   H9IWG9   A0A3S2L3J0   A0A3S2NA23   A0A194QC91   A0A212F2Q3   A0A2H1VA76   V9ICM7   A0A088AAF9   A0A2A3E3H4   A0A0L7RIG1   A0A2R7WSH8   A0A067RGL9   S4NXS3   W8BY90   A0A2J7RPZ6   H9IWG8   A0A194PCX0   A0A0J7KGE3   A0A154PCE9   A0A067RSY2   A0A2A4K5P1   A0A2J7RPZ7   B2DBH3   A0A182IUF7   A0A0L0C9F0   A0A1B6ML33   A0A194RIS2   A0A182SH91   A0A026W5E8   A0A182JXE2   A0A2J7RPY4   A0A195E462   A0A3L8D7U5   A0A2J7RPY2   A0A2H1V9G0   E2A7K4   H9IVN2   R4UKP6   E2BPX2   A0A0K8UFN6   A0A195FIT4   A0A2J7RPY0   A0A2J7RPY7   A0A0K8VEY5   A0A2A4K7E5   F4WUN7   A0A2J7RPY5   A0A0T6B887   B4L008   A0A067RDE7   A0A2A4K5R4   A0A2A4K7E3  

KEGG

101742835    no KO assigned | (RefSeq) organic cation transporter protein-like

GO

GO:0055085   GO:0016021   GO:0005215   GO:0022857  

Length:

108

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

21.59951

Exp number, first 60 AAs:

14.95524

Total prob of N-in:

0.53142

POSSIBLE N-term signal

sequence

outside

1  -  44

TMhelix

45  -  67

inside

68  -  108

 

 

Pi

213.624433

Theta

178.799344

Tajima's D

0.952433

CLR

0

CSRT

0.645817709114544

Interpretation

Uncertain