Gene

KWMTBOMO13182

Pre Gene Modal

BGIBMGA000353

Annotation

beta-1?3-glucan_recognition_protein_4_precursor_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr22(+):9630787-9636527      View in EpiBrowser

Location in the cell

Extracellular   Reliability : 2.733

CDS

ATGTGGCTGTTAACTCTGGGCGTAGTTGCCCTAATATCGGCGAGTAAAGCTTGCACACCCAGCGTAACTACGGTGAGCGGTACTCACGCCCCTGTGACCGTGTGTTCCGGACAACTCATTTTTGCTGATGACTTCGTCGACTTCGACCTTGAGAAATGGCAGCACGAAAACACCTTAGCCGGAGGTGGTAACTGGGAGTTCCAGTACTACAACAACAATAGAACTAACTCATTCACGAACAACGGTCTACTGTACATTCGGCCGTCCCTTACGTCCGACCAGTTCGGATCCGCATTTTTACATAGCGGTCGCTTGAACATTGAAGGAGGCGCACCCGCCGACAGATGCACTAACCCTCAATGGTACGGTTGCGAGCGTGTTGGTACCCCCACTAATATTTTGAACCCCATTAAAAGTGCACGTATTCGCACCGTTCATTCCTTCAGCTTCCAGTATGGTAAAGTAGAAGTTAGAGCGAAAATGCCTTCCGGAGATTGGCTCTGGCCCGCAATTTGGTTGATGCCTGCATACAACAAATACGGCACCTGGCCAGCTTCTGGGGAAATCGACCTTGTCGAATCCAGAGGCAACAAAAACATGTTCCTCAACGGTCTACACATTGGTACACAGGAAGCTGGTTCGACACTGCACTACGGACCTTTCCCCGGACTAAGCGGATGGGAAAAAGCGCACTGGGTCAGAAGGAACAGCGCCGGATACGACACTAATTTCCATCGTTACCAACTGGAATGGACACCAGATTTCATAAGCTTTAGAATTGACGACTCTGAGATCGGTCGTGTCACTCCTGGAAATGGTGGCTTTTGGGAATACGGCGGCTTCAACAATAGACCCGGTATTCATAACCCGTGGAGATATGGAAGTAAGATGGCGCCATTCGACCAAAAATTCTATCTCATAATCAACTTAGCTGTCGGAGGCACCAATGGTTTCTTCCCTGATGGTGTCAAGAACCCTATTCCTAAGCCTTGGTGGAACAATTCCCCAATGGCAGCCACAGATTTCTGGAATGGCCAAGGCGGTTGGCTTCCGACGTGGAATTTGAACGTTAACGATGGTCAAGACGCTTCCCTCCAAGTAGACTACGTTCGAGTTTGGGCGTTATAA

Protein

MWLLTLGVVALISASKACTPSVTTVSGTHAPVTVCSGQLIFADDFVDFDLEKWQHENTLAGGGNWEFQYYNNNRTNSFTNNGLLYIRPSLTSDQFGSAFLHSGRLNIEGGAPADRCTNPQWYGCERVGTPTNILNPIKSARIRTVHSFSFQYGKVEVRAKMPSGDWLWPAIWLMPAYNKYGTWPASGEIDLVESRGNKNMFLNGLHIGTQEAGSTLHYGPFPGLSGWEKAHWVRRNSAGYDTNFHRYQLEWTPDFISFRIDDSEIGRVTPGNGGFWEYGGFNNRPGIHNPWRYGSKMAPFDQKFYLIINLAVGGTNGFFPDGVKNPIPKPWWNNSPMAATDFWNGQGGWLPTWNLNVNDGQDASLQVDYVRVWAL

Uniprot

H9ISX5   C8C9T4   G9G7R0   G9G7R2   A0A194R0W3   A0A194PY35   + More
G9G7R1   B6CMG2   B1NLE1   B7SVK5   A0A2H1W0K3   B7SVM3   B7SVL8   A6YQV6   A0A3S2NK35   A6YQV7   B7SVK7   B7SVL9   A0A212EV85   B7SVL1   G1BJ40   Q2N3Z7   Q2N3X7   Q2N3Y1   Q2N3Y4   J9RVF6   Q2N3Y3   Q2N3Z3   Q2N3Z4   Q2N3Y8   Q2N3Z5   Q2N3Y7   Q2N3X6   Q2N3Y9   H8YU82   Q2N3Z1   J9RDQ2   Q2N3Y0   Q2N3Z0   Q2N3Z6   Q2N3X8   Q2N3X4   Q2N3Z2   A0A067RDX6   A0A2J7QLK6   Q2N3X5   G1BJ39   A0A1V1G500   Q2N3X9   Q2N3Y2   J9S505   G1BJ37   D9D797   L0CMF6   A0A067RBH9   A0A336MV15   A0A1B0D0K8   Q2N3X2   Q2N3X3   A0A2J7QLL7   D9D798   D9D7A2   D9D7C3   A0A3G4ZJN2   D9D7A7   D9D7A0   D9D7B4   D9D7A6   D9D799   D9D7B7   J9S7T1   D9D7D0   D9D7B8   D9D7B2   D9D7A8   G1BJ35   D9D7D1   D9D7C0   D9D7D2   D9D7B6   Q2N3Y5   A0A182N794   A0A084VE22   A0A182HFF2   Q2N3Y6   A0A182G107   A0A1D8MC22   Q7QCT6   A0A1D8MC28   A0A1D8MC25   A0A1D8MC33   A0A1D8MC41   A0A1D8MC54   A0A1D8MC67   A0A1D8MC31   A0A1D8MC42   A0A1D8MC30   A0A1D8MBZ7   A0A1D8MC44  

Pubmed

19121390    19033442    26354079    18760362    18314941    20816775    + More
22118469    21708164    16221893    24845553    28410430    20561089    24438588    26483478    27658383    12364791    14747013    17210077   

EMBL

BABH01013028    GQ372969    ACU57045.1    JN248786    AEV66276.1    JN248788    + More
AEV66278.1    KQ460883    KPJ11342.1    KQ459586    KPI97938.1    JN248787    AEV66277.1    EU325562    ACB54952.1    EF600056    ABU98621.1    EU770374    ACI32818.1    ODYU01005529    SOQ46466.1    EU770392    ACI32836.1    EU770387    ACI32831.1    EF641300    ABR28478.2    RSAL01000387    RVE42024.1    EF641301    ABR28479.1    EU770376    ACI32820.1    EU770388    ACI32832.1    AGBW02012225    OWR45410.1    EU770380    ACI32824.1    JF683378    AEK64801.1    DQ058910    AAZ08480.1    DQ058930    AAZ08500.1    DQ058926    AAZ08496.1    DQ058923    AAZ08493.1    JQ435783    AFR46661.1    DQ058924    AAZ08494.1    DQ058914    AAZ08484.1    DQ058913    AAZ08483.1    DQ058919    AAZ08489.1    DQ058912    AAZ08482.1    DQ058920    AAZ08490.1    DQ058931    AAZ08501.1    DQ058918    AAZ08488.1    JF915524    AFD54026.1    DQ058916    AAZ08486.1    JQ435784    AFR46662.1    DQ058927    AAZ08497.1    DQ058917    AAZ08487.1    DQ058911    AAZ08481.1    DQ058929    AAZ08499.1    DQ058933    AAZ08503.1    DQ058915    AAZ08485.1    KK852567    KDR21213.1    NEVH01013243    PNF29475.1    DQ058932    AAZ08502.1    JF683377    AEK64800.1    FX985263    BAX07276.1    DQ058928    AAZ08498.1    DQ058925    AAZ08495.1    JQ435786    AFR46664.1    JF683375    AEK64798.1    GU906821    ADJ19004.1    JX876645    AGA16572.1    KDR21211.1    UFQT01002820    SSX34106.1    AJVK01021487    AJVK01021488    AJVK01021489    AJVK01021490    AJVK01021491    DQ058935    AAZ08505.1    DQ058934    AAZ08504.1    PNF29473.1    GU906822    GU906833    GU906834    GU906837    ADJ19005.1    ADJ19016.1    ADJ19017.1    ADJ19020.1    GU906826    GU906835    GU906839    ADJ19009.1    ADJ19018.1    ADJ19022.1    GU906847    GU906848    GU906851    GU906852    GU906853    ADJ19030.1    ADJ19031.1    ADJ19034.1    ADJ19035.1    ADJ19036.1    MH669347    AYV75052.1    GU906831    ADJ19014.1    GU906824    GU906825    GU906827    GU906828    GU906829    ADJ19007.1    ADJ19008.1    ADJ19010.1    ADJ19011.1    ADJ19012.1    GU906838    ADJ19021.1    GU906830    ADJ19013.1    GU906823    ADJ19006.1    GU906841    ADJ19024.1    JQ435785    AFR46663.1    GU906854    ADJ19037.1    GU906842    GU906843    ADJ19025.1    ADJ19026.1    GU906836    ADJ19019.1    GU906832    ADJ19015.1    JF683373    AEK64796.1    GU906855    ADJ19038.1    GU906844    GU906845    GU906846    GU906849    GU906850    ADJ19027.1    ADJ19028.1    ADJ19029.1    ADJ19032.1    ADJ19033.1    GU906856    JF683376    ADJ19039.1    AEK64799.1    GU906840    ADJ19023.1    DQ058922    AAZ08492.1    ATLV01012167    KE524768    KFB36216.1    JXUM01037026    KQ561114    KXJ79663.1    DQ058921    AAZ08491.1    JXUM01037825    KQ561143    KXJ79574.1    KX620813    AOV81819.1    AAAB01008859    EAA07705.4    KX620810    AOV81816.1    KX620814    AOV81820.1    KX620825    AOV81831.1    KX620808    AOV81814.1    KX620827    AOV81833.1    KX620836    AOV81842.1    KX620822    AOV81828.1    KX620828    KX620830    KX620833    AOV81834.1    AOV81836.1    AOV81839.1    KX620798    KX620807    KX620819    KX620820    KX620829    KX620835    KX620838    KX620856    AOV81804.1    AOV81813.1    AOV81825.1    AOV81826.1    AOV81835.1    AOV81841.1    AOV81844.1    AOV81862.1    KX620787    KX620790    KX620792    KX620811    KX620834    AOV81793.1    AOV81796.1    AOV81798.1    AOV81817.1    AOV81840.1    KX620806    KX620826    KX620839    AOV81812.1    AOV81832.1    AOV81845.1   

Proteomes

UP000005204    UP000053240    UP000053268    UP000283053    UP000007151    UP000027135    + More
UP000235965    UP000092462    UP000075884    UP000030765    UP000069940    UP000249989    UP000007062   

PRIDE

H9ISX5    C8C9T4   

Pfam

PF00722   Glyco_hydro_16

Interpro

IPR013320   ConA-like_dom_sf        + More
IPR000757   GH16       

SUPFAM

SSF49899   SSF49899       

ProteinModelPortal

H9ISX5   C8C9T4   G9G7R0   G9G7R2   A0A194R0W3   A0A194PY35   + More
G9G7R1   B6CMG2   B1NLE1   B7SVK5   A0A2H1W0K3   B7SVM3   B7SVL8   A6YQV6   A0A3S2NK35   A6YQV7   B7SVK7   B7SVL9   A0A212EV85   B7SVL1   G1BJ40   Q2N3Z7   Q2N3X7   Q2N3Y1   Q2N3Y4   J9RVF6   Q2N3Y3   Q2N3Z3   Q2N3Z4   Q2N3Y8   Q2N3Z5   Q2N3Y7   Q2N3X6   Q2N3Y9   H8YU82   Q2N3Z1   J9RDQ2   Q2N3Y0   Q2N3Z0   Q2N3Z6   Q2N3X8   Q2N3X4   Q2N3Z2   A0A067RDX6   A0A2J7QLK6   Q2N3X5   G1BJ39   A0A1V1G500   Q2N3X9   Q2N3Y2   J9S505   G1BJ37   D9D797   L0CMF6   A0A067RBH9   A0A336MV15   A0A1B0D0K8   Q2N3X2   Q2N3X3   A0A2J7QLL7   D9D798   D9D7A2   D9D7C3   A0A3G4ZJN2   D9D7A7   D9D7A0   D9D7B4   D9D7A6   D9D799   D9D7B7   J9S7T1   D9D7D0   D9D7B8   D9D7B2   D9D7A8   G1BJ35   D9D7D1   D9D7C0   D9D7D2   D9D7B6   Q2N3Y5   A0A182N794   A0A084VE22   A0A182HFF2   Q2N3Y6   A0A182G107   A0A1D8MC22   Q7QCT6   A0A1D8MC28   A0A1D8MC25   A0A1D8MC33   A0A1D8MC41   A0A1D8MC54   A0A1D8MC67   A0A1D8MC31   A0A1D8MC42   A0A1D8MC30   A0A1D8MBZ7   A0A1D8MC44  

PDB

3ILN     E-value=1.8833e-18,     Score=227

KEGG

100307005    no KO assigned | (RefSeq) BGRP4; beta-1,3-glucan recognition protein 4

GO

GO:0005975   GO:0004553   GO:0016021   GO:0001530   GO:0001872   GO:0009986   GO:0006812   GO:0016887   GO:0005737   GO:0048869   GO:0003676   GO:0016491   GO:0015930  

SignalP

Position:   1 - 17,         Likelihood:  0.996315

 

 

Length:

375

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.10613

Exp number, first 60 AAs:

0.0649

Total prob of N-in:

0.00529

outside

1  -  375

 

 

Pi

200.615551

Theta

188.788345

Tajima's D

0.196418

CLR

0.09103

CSRT

0.426778661066947

Interpretation

Uncertain