Gene

KWMTBOMO13016

Pre Gene Modal

BGIBMGA000279

Annotation

PREDICTED:_cuticular_protein_RR-2_motif_85_isoform_X1_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr22(+):6537650-6539276      View in EpiBrowser

Location in the cell

Extracellular   Reliability : 2.346

CDS

ATGATCGCAAAAATCGTAATAATCGGCGTCTTCATGAGCGCTGCTAAGGCCGGTCTTTACCATGGTCACGGTCAAGCCGTCTCCTCTCAGAGCATAATACGTCACGACGGAGGCTACGCTCCCTCAGCTCATTACGCTCCTGATACCTATGTTGTTCCTCTCGAACAATACGCCACCCCTCTGGAATACGCCGGCCAATATGACGGTCACGATGAATATGCGCACCCCAAGTACGACTTCGCGTACTCAGTAGCTGACCCCCACACCGGCGACCACAAGTCCCAGCATGAGTCCCGCGACGGTGACTCCGTACATGGCTACTATTCTCTTGTCCAACCAGATGGCTCTGTCCGCAAAGTCGAGTACACTGCAGACGACCATAATGGATTTAACGCGGTAGTTCACAACTCAGCCCCGTCTATCCACCCCTACTATCACAATTATTAA

Protein

MIAKIVIIGVFMSAAKAGLYHGHGQAVSSQSIIRHDGGYAPSAHYAPDTYVVPLEQYATPLEYAGQYDGHDEYAHPKYDFAYSVADPHTGDHKSQHESRDGDSVHGYYSLVQPDGSVRKVEYTADDHNGFNAVVHNSAPSIHPYYHNY

Uniprot

C0H6S7   H9ISQ2   C0H6S8   C0H6S9   A0A194PXP1   A0A212F8A2   + More
A0A194QWA3   A0A212F897   C0H6T1   H9ISP8   A0A2W1BZW6   C0H6T0   I4DMH3   A0A2W1C1Z6   A0A194PWU5   A0A2H1VD38   A0A194QW46   A0A2H1VDB1   A0A194PWQ0   I4DMR3   A0A3S2NJA9   A0A194QWS6   I4DMR2   I4DJZ8   C0H6S5   A0A2W1BZH7   O77057   A0A212EXA7   A0A2A4IW58   A0A2W1BVH0   A0A2W1C1K0   A0A2W1BVI9   A0A212F899   A0A2W1C1K9   A0A2A4IXQ6   A0A2W1BXD4   A0A2H1VP46   A0A212F8C7   A0A3S2NYR2   Q9BPR4   A0A2W1BV80   A0A2W1BVB9   C0H6T3   C0H6U5   A0A194QXS4   A0A194QWA8   C0H6S6   C0H6T4   H9IT50   C0H6U4   Q9BPR9   C0H6U6   Q9BPR8   A0A194R1N5   A0A194PWU0   A0A194PXN7   A0A2H1V2X3   C0H6U2   I4DP68   C0H6U7   A0A194PWP0   A0A194PYG2   I4DMH4   A0A3S2LF77   C0H6T8   A0A194R1N0   C0H6U3   A0A194PWP3   A0A2H1VQS4   Q9BPR5   I4DRA2   A0A212F8A9   I4DRA3   B2DBJ3   I4DKM4   A0A194PXN3   A0A194Q312   I4DK03   A0A194QWB4   A0A0A9WFH7   C0H6T9   H9ISN7   I4DJP1   A0A194QXT3   B2DBK0   A0A212F7I6   I4DKM5   A0A3S2LRS0   A0A194QW55   I4DK02   A0A194PYF6   A0A212F891   A0A194PYF2   A0A194PYG9   I4DP67  

Pubmed

19280704    19121390    26354079    22118469    28756777    22651552    + More
11483438    18712529    25401762    26823975   

EMBL

BR000586    FAA00588.1    BABH01013339    BR000587    FAA00589.1    BR000588    + More
FAA00590.1    KQ459586    KPI97793.1    AGBW02009770    OWR49967.1    KQ461073    KPJ09757.1    OWR49966.1    BR000590    FAA00592.1    BABH01013341    KZ149892    PZC78995.1    BABH01013340    BR000589    FAA00591.1    AK402491    BAM19113.1    PZC78996.1    KPI97792.1    ODYU01001904    SOQ38763.1    KPJ09758.1    SOQ38766.1    KPI97791.1    AK402581    BAM19203.1    RSAL01000021    RVE52429.1    KPJ09759.1    AK402580    BAM19202.1    AK401616    BAM18238.1    KPI97790.1    BR000584    FAA00586.1    PZC78994.1    AB017550    BAA33195.1    AGBW02011787    OWR46130.1    NWSH01005693    PCG64045.1    PZC78978.1    PZC78979.1    PZC78990.1    PZC78999.1    OWR49965.1    PZC79000.1    PCG64044.1    PZC78991.1    ODYU01003605    SOQ42578.1    OWR49968.1    RVE52431.1    AB047483    BAB32480.1    PZC78992.1    PZC78998.1    BR000592    FAA00594.1    BR000604    FAA00606.1    KPJ09760.1    KPJ09762.1    BR000585    FAA00587.1    BABH01013343    BR000593    FAA00595.1    BR000603    FAA00605.1    AB047477    BAB32475.1    BABH01013344    BR000605    FAA00607.1    AB047478    BAB32476.1    KPJ09766.1    KPI97787.1    KPI97788.1    ODYU01000432    SOQ35188.1    BR000601    FAA00603.1    AK403446    BAM19708.1    BR000606    FAA00608.1    KPI97781.1    KPI97789.1    AK402492    BAM19114.1    RVE52432.1    BR000597    FAA00599.1    KPJ09761.1    BR000602    FAA00604.1    KPI97786.1    ODYU01003855    SOQ43136.1    AB047482    BR000594    BAB32479.1    FAA00596.1    AK405035    BAM20442.1    OWR49961.1    AK405036    BAM20443.1    AB264676    BAG30752.1    AK401842    BAM18464.1    KPI97783.1    KPI97795.1    AK401621    BAM18243.1    KPJ09767.1    GBHO01037060    GBRD01009137    GDHC01003700    JAG06544.1    JAG56684.1    JAQ14929.1    BR000598    FAA00600.1    AK401509    BAM18131.1    KPJ09770.1    AB264683    BAG30759.1    AGBW02009868    OWR49703.1    AK401843    BAM18465.1    RVE52446.1    KPJ09768.1    AK401620    BAM18242.1    KPI97784.1    OWR49962.1    KPI97779.1    KPI97794.1    AK403445    BAM19707.1   

Proteomes

UP000005204    UP000053268    UP000007151    UP000053240    UP000283053    UP000218220    + More

PRIDE

C0H6S7    H9ISQ2    C0H6S8    C0H6S9    C0H6T1    H9ISP8    + More
C0H6T0    O77057    Q9BPR4    C0H6T3    C0H6S6    C0H6T4    C0H6U2    Q9BPR5    H9ISN7   

Pfam

PF00379   Chitin_bind_4

Interpro

IPR000618   Insect_cuticle        + More
IPR031311   CHIT_BIND_RR_consensus       

ProteinModelPortal

C0H6S7   H9ISQ2   C0H6S8   C0H6S9   A0A194PXP1   A0A212F8A2   + More
A0A194QWA3   A0A212F897   C0H6T1   H9ISP8   A0A2W1BZW6   C0H6T0   I4DMH3   A0A2W1C1Z6   A0A194PWU5   A0A2H1VD38   A0A194QW46   A0A2H1VDB1   A0A194PWQ0   I4DMR3   A0A3S2NJA9   A0A194QWS6   I4DMR2   I4DJZ8   C0H6S5   A0A2W1BZH7   O77057   A0A212EXA7   A0A2A4IW58   A0A2W1BVH0   A0A2W1C1K0   A0A2W1BVI9   A0A212F899   A0A2W1C1K9   A0A2A4IXQ6   A0A2W1BXD4   A0A2H1VP46   A0A212F8C7   A0A3S2NYR2   Q9BPR4   A0A2W1BV80   A0A2W1BVB9   C0H6T3   C0H6U5   A0A194QXS4   A0A194QWA8   C0H6S6   C0H6T4   H9IT50   C0H6U4   Q9BPR9   C0H6U6   Q9BPR8   A0A194R1N5   A0A194PWU0   A0A194PXN7   A0A2H1V2X3   C0H6U2   I4DP68   C0H6U7   A0A194PWP0   A0A194PYG2   I4DMH4   A0A3S2LF77   C0H6T8   A0A194R1N0   C0H6U3   A0A194PWP3   A0A2H1VQS4   Q9BPR5   I4DRA2   A0A212F8A9   I4DRA3   B2DBJ3   I4DKM4   A0A194PXN3   A0A194Q312   I4DK03   A0A194QWB4   A0A0A9WFH7   C0H6T9   H9ISN7   I4DJP1   A0A194QXT3   B2DBK0   A0A212F7I6   I4DKM5   A0A3S2LRS0   A0A194QW55   I4DK02   A0A194PYF6   A0A212F891   A0A194PYF2   A0A194PYG9   I4DP67  

KEGG

100379389    no KO assigned | (RefSeq) CPR85, BmorCPR85; cuticular protein RR-2 motif 85

GO

GO:0042302   GO:0016021   GO:0008270   GO:0006412   GO:0043565   GO:0007155   GO:0005515   GO:0008237   GO:0008152   GO:0016491   GO:0015930  

SignalP

Position:   1 - 17,         Likelihood:  0.905069

 

 

Length:

148

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

2.40112

Exp number, first 60 AAs:

2.4002

Total prob of N-in:

0.20899

outside

1  -  148

 

 

Pi

243.240043

Theta

220.053823

Tajima's D

0.344182

CLR

4.289161

CSRT

0.473726313684316

Interpretation

Uncertain