Gene

KWMTBOMO12992

Pre Gene Modal

BGIBMGA000260

Annotation

cuticular_protein_RR-2_motif_107_precursor_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr22(+):6381730-6382793      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.457 Mitochondrial   Reliability : 1.022 Nuclear   Reliability : 1.403

CDS

ATGTATTCCAAGGCTCATCCTAAATACGCCTTTGAGTACAAAGTAGAGGATCCTCACACCGGCGACAACAAGTACCAGCACGAGACCCGTGACGGTGACGTCGTGAAGGGCGTGTACAGTCTGCACGAGGCTGATGGTACCATCAGGACTGTTGAGTACAGCGCCGATAAACACAGCGGATTCAACGCAGTTGTGAGACGCGAGGGTCATGCTCACCATGCTGTACCTGAACATCATCATCATCACTAA

Protein

MYSKAHPKYAFEYKVEDPHTGDNKYQHETRDGDVVKGVYSLHEADGTIRTVEYSADKHSGFNAVVRREGHAHHAVPEHHHHH

Uniprot

C0H6U9   C0H6V1   C0H6V3   H9IT54   A0A3S2LRS0   A0A3S2TQL4   + More
A0A3S2PIL6   C0H6W6   Q9BH30   A0A212FKA8   H9IT58   Q9BPR2   C0H6W4   A0A2H1WAB8   A0A2H1VRQ2   A0A2H1VPL7   I4DID6   A0A194PWM9   A0A194QWC3   C0H6W5   A0A2H1VFG1   H9IT59   A0A2W1BXC1   A0A2H1VFK7   A0A2W1C1G9   A0A2H1WWL0   A0A067RMC7   A0A2H1VH24   A0A2H1VQ88   A0A2H1WE29   A0A2H1WJC4   A0A0L7KHQ9   A0A2H1V127   D6WJ00   A0A194QWU2   A0A194PXM4   A0A194PYE7   A0A1Y1KZI1   D6WJ01   A0A2H1V4C4   A0A194QXT8   A0A2P8Y145   A0A2W1BV53   A0A2H1VQS4   A0A194R1P3   A0A2P8Y151   A0A2H1VQR4   A0A3S2NYR7   D6WIZ9   I4DKM3   C0H6W8   A0A2R7VRX6   A0A2H1VPL0   Q16R88   B2DBJ3   A0A1J1IKJ9   A0A2H1WU56   G8FVP8   A0A2W1BZF1   A0A2H1WF17   A0A2H1VPE0   A0A194PWP3   A0A2W1BXB1   I4DJP1   I4DRA3   A0A2H1W9R4   A0A2W1BZU7   A0A069DNE3   R4G2R9   A0A2A3ESS6   A0A194QWT1   T1HRQ0   A0A1S3DBS1   A0A194Q302   U4TRW7   A0A2A4J906   A0A2H1VPH0   A0A182TZH3   A0A182X2B9   A7URY7   A0A182I6I1   A0A182N9I2   A0A2S1ZS96   A0A182Q5D4   A0A182MBA2   A0A182WBA9   A0A2P8Y134   A0A2S1ZS95   W5JT23   R4FNZ4   T1I2B8   A0A2H1WDQ1   I4DKM1   A0A2H1WXM0   T1DSN0   A0A194PYE3  

Pubmed

19121390    19280704    11483438    22118469    22651552    26354079    + More
28756777    24845553    26227816    18362917    19820115    28004739    29403074    17510324    18712529    26334808    23537049    12364791    14747013    17210077    29712872    20920257    23761445   

EMBL

BABH01013348    BR000608    FAA00610.1    BR000610    FAA00612.1    BR000612    + More
FAA00614.1    RSAL01000021    RVE52446.1    RVE52443.1    RVE52447.1    BR000625    FAA00627.1    AB047485    AB047486    BAB32482.1    BAB32483.1    AGBW02008093    OWR54166.1    BABH01013354    AB047487    BAB32484.1    BR000623    FAA00625.1    ODYU01007211    SOQ49792.1    ODYU01004033    SOQ43499.1    ODYU01003691    SOQ42770.1    AK401054    BAM17676.1    KQ459586    KPI97771.1    KQ461073    KPJ09777.1    BR000624    FAA00626.1    ODYU01002284    SOQ39565.1    BABH01013355    KZ149892    PZC78971.1    SOQ39566.1    PZC78970.1    ODYU01011607    SOQ57450.1    KK852584    KDR20834.1    SOQ39564.1    ODYU01003629    SOQ42622.1    ODYU01007979    SOQ51206.1    ODYU01009022    SOQ53117.1    JTDY01009813    KOB62611.1    ODYU01000177    SOQ34521.1    KQ971342    EFA03719.1    KPJ09774.1    KPI97773.1    KPI97774.1    GEZM01068802    JAV66764.1    EFA03718.1    ODYU01000605    SOQ35681.1    KPJ09775.1    PYGN01001062    PSN37960.1    PZC78962.1    ODYU01003855    SOQ43136.1    KPJ09776.1    PSN37969.1    SOQ43137.1    RVE52458.1    EFA03720.1    AK401841    BAM18463.1    BABH01013358    BR000627    FAA00629.1    KK854044    PTY10186.1    SOQ42769.1    CH477721    EAT36915.1    AB264676    BAG30752.1    CVRI01000054    CRL00060.1    ODYU01011083    SOQ56599.1    JN082718    AER27815.1    PZC78964.1    ODYU01008253    SOQ51680.1    ODYU01003654    SOQ42695.1    KPI97786.1    PZC78961.1    AK401509    BAM18131.1    AK405036    BAM20443.1    SOQ49793.1    PZC78975.1    GBGD01003554    JAC85335.1    ACPB03012170    GAHY01002361    JAA75149.1    KZ288186    PBC34778.1    KPJ09764.1    ACPB03012169    KPI97785.1    KB631296    ERL84224.1    NWSH01002544    PCG68014.1    SOQ42696.1    AAAB01008807    EDO64780.1    APCN01003642    MF942810    AWK28333.1    AXCN02000565    AXCM01020208    PSN37956.1    MF942812    AWK28335.1    ADMH02000233    ETN67291.1    GAHY01000373    JAA77137.1    ACPB03022691    SOQ51205.1    AK401839    BAM18461.1    ODYU01011838    SOQ57809.1    GAMD01001404    JAB00187.1    KPI97769.1   

Proteomes

UP000005204    UP000283053    UP000007151    UP000053268    UP000053240    UP000027135    + More
UP000037510    UP000007266    UP000245037    UP000008820    UP000183832    UP000015103    UP000242457    UP000079169    UP000030742    UP000218220    UP000075902    UP000076407    UP000007062    UP000075840    UP000075884    UP000075886    UP000075883    UP000075920    UP000000673   

PRIDE

C0H6U9    C0H6V1    C0H6V3    H9IT54    C0H6W6    Q9BH30    + More
H9IT58    Q9BPR2    C0H6W4    C0H6W5    H9IT59    C0H6W8   

Pfam

PF00379   Chitin_bind_4        + More
PF04091   Sec15

Interpro

IPR031311   CHIT_BIND_RR_consensus        + More
IPR000618   Insect_cuticle       
IPR007225   EXOC6/Sec15       
IPR042045   EXOC6/Sec15_C_dom1       

Gene 3D

1.10.357.30    

ProteinModelPortal

C0H6U9   C0H6V1   C0H6V3   H9IT54   A0A3S2LRS0   A0A3S2TQL4   + More
A0A3S2PIL6   C0H6W6   Q9BH30   A0A212FKA8   H9IT58   Q9BPR2   C0H6W4   A0A2H1WAB8   A0A2H1VRQ2   A0A2H1VPL7   I4DID6   A0A194PWM9   A0A194QWC3   C0H6W5   A0A2H1VFG1   H9IT59   A0A2W1BXC1   A0A2H1VFK7   A0A2W1C1G9   A0A2H1WWL0   A0A067RMC7   A0A2H1VH24   A0A2H1VQ88   A0A2H1WE29   A0A2H1WJC4   A0A0L7KHQ9   A0A2H1V127   D6WJ00   A0A194QWU2   A0A194PXM4   A0A194PYE7   A0A1Y1KZI1   D6WJ01   A0A2H1V4C4   A0A194QXT8   A0A2P8Y145   A0A2W1BV53   A0A2H1VQS4   A0A194R1P3   A0A2P8Y151   A0A2H1VQR4   A0A3S2NYR7   D6WIZ9   I4DKM3   C0H6W8   A0A2R7VRX6   A0A2H1VPL0   Q16R88   B2DBJ3   A0A1J1IKJ9   A0A2H1WU56   G8FVP8   A0A2W1BZF1   A0A2H1WF17   A0A2H1VPE0   A0A194PWP3   A0A2W1BXB1   I4DJP1   I4DRA3   A0A2H1W9R4   A0A2W1BZU7   A0A069DNE3   R4G2R9   A0A2A3ESS6   A0A194QWT1   T1HRQ0   A0A1S3DBS1   A0A194Q302   U4TRW7   A0A2A4J906   A0A2H1VPH0   A0A182TZH3   A0A182X2B9   A7URY7   A0A182I6I1   A0A182N9I2   A0A2S1ZS96   A0A182Q5D4   A0A182MBA2   A0A182WBA9   A0A2P8Y134   A0A2S1ZS95   W5JT23   R4FNZ4   T1I2B8   A0A2H1WDQ1   I4DKM1   A0A2H1WXM0   T1DSN0   A0A194PYE3  

KEGG

100379371    no KO assigned | (RefSeq) CPR107, BmorCPR107; cuticular protein RR-2 motif 107

GO

GO:0042302   GO:0016021   GO:0031012   GO:0006904   GO:0000145   GO:0005761   GO:0006412   GO:0043565   GO:0007155   GO:0005515   GO:0008237   GO:0008152   GO:0016491   GO:0015930  

Length:

82

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.51850

inside

1  -  82

 

 

Pi

406.825549

Theta

202.08869

Tajima's D

3.264851

CLR

0.349366

CSRT

0.988900554972251

Interpretation

Uncertain