Gene

KWMTBOMO12991

Pre Gene Modal

BGIBMGA000259

Annotation

cuticular_protein_RR-2_motif_109_precursor_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr22(+):6375260-6376303      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.545 Mitochondrial   Reliability : 1.026 Nuclear   Reliability : 1.415

CDS

ATGTATTCCAAGGCTCATCCTAAATACGCCTTTGAGTACAAAGTAGAGGATCCTCACACCGGCGACAACAAGTACCAGCACGAGACCCGTGACGGTGACGTCGTGAAGGGCGTGTACAGTCTGCACGAGGCCGATGGTACCATCAGGACTGTTGAGTACAGCGCCGATAAACACAGCGGATTCAACGCAGTTGTGAGACGCGAGGGTCATGCTCGCCATGTTGTACCTGAACATCATCATCATCACTAA

Protein

MYSKAHPKYAFEYKVEDPHTGDNKYQHETRDGDVVKGVYSLHEADGTIRTVEYSADKHSGFNAVVRREGHARHVVPEHHHHH

Uniprot

C0H6V1   C0H6V3   A0A3S2LRS0   C0H6U9   A0A3S2TQL4   A0A3S2PIL6   + More
H9IT54   A0A2H1WAB8   A0A2H1VFG1   A0A2H1VPL7   A0A2W1BXC1   A0A2H1VFK7   A0A2W1C1G9   A0A2H1VH24   A0A2H1WWL0   A0A2H1WE29   A0A2H1WJC4   C0H6W6   Q9BH30   A0A2H1V4C4   A0A2H1VPL0   A0A2W1BV53   A0A067RMC7   A0A212FKA8   A0A2H1VPE0   A0A2H1W9R4   H9IT58   C0H6W4   Q9BPR2   A0A2W1BZF1   A0A194QWU2   C0H6W5   I4DID6   A0A2H1V127   A0A2W1BXB1   A0A194PYE7   A0A194QXT8   A0A194PWM9   H9IT59   A0A194QWC3   A0A2H1VPH0   A0A2W1BZU7   A0A2W1C1F8   I4DKM3   A0A2H1VRQ2   A0A2H1WXM0   A0A2H1VQS4   A0A2H1VQR4   A0A2H1WRF0   D6WJ00   A0A2P8Y145   A0A1Y1KZI1   D6WJ01   G8FVP8   A0A3S2NYR7   A0A2A4J906   A0A2H1VQ88   D6WIZ9   A0A0L7KHQ9   A0A2P8Y151   A0A2R7VRX6   A0A194Q2Z3   A0A2H1VP60   A0A2H1WDQ1   A0A194PXM4   A0A194R1P3   C0H6W8   D6WJ06   A0A182Q5D4   A0A182N9I2   A0A182TZH3   A0A182X2B9   A7URY7   A0A182I6I1   A0A069DNE3   A0A182MBA2   A0A182WBA9   A0A194PYE3   R4G2R9   R4FNZ4   T1HRQ0   W5JT23   I4DKM1   A0A1B6FE93   T1DSN0   T1I2B8   R4G3A1   N6US01   U4U9R5   A0A1B6LQ31   T1HRF8   H9ISM5   E0VBD4   A0A182RUH5   A0A194R1Q6   D6WJ08   D6WJ09   A0A3Q8HPY1  

Pubmed

19121390    19280704    28756777    11483438    24845553    22118469    + More
26354079    22651552    18362917    19820115    29403074    28004739    26227816    12364791    14747013    17210077    26334808    20920257    23761445    23537049    20566863   

EMBL

BABH01013348    BR000610    FAA00612.1    BR000612    FAA00614.1    RSAL01000021    + More
RVE52446.1    BR000608    FAA00610.1    RVE52443.1    RVE52447.1    ODYU01007211    SOQ49792.1    ODYU01002284    SOQ39565.1    ODYU01003691    SOQ42770.1    KZ149892    PZC78971.1    SOQ39566.1    PZC78970.1    SOQ39564.1    ODYU01011607    SOQ57450.1    ODYU01007979    SOQ51206.1    ODYU01009022    SOQ53117.1    BR000625    FAA00627.1    AB047485    AB047486    BAB32482.1    BAB32483.1    ODYU01000605    SOQ35681.1    SOQ42769.1    PZC78962.1    KK852584    KDR20834.1    AGBW02008093    OWR54166.1    ODYU01003654    SOQ42695.1    SOQ49793.1    BABH01013354    BR000623    FAA00625.1    AB047487    BAB32484.1    PZC78964.1    KQ461073    KPJ09774.1    BR000624    FAA00626.1    AK401054    BAM17676.1    ODYU01000177    SOQ34521.1    PZC78961.1    KQ459586    KPI97774.1    KPJ09775.1    KPI97771.1    BABH01013355    KPJ09777.1    SOQ42696.1    PZC78975.1    PZC78960.1    AK401841    BAM18463.1    ODYU01004033    SOQ43499.1    ODYU01011838    SOQ57809.1    ODYU01003855    SOQ43136.1    SOQ43137.1    ODYU01010460    SOQ55587.1    KQ971342    EFA03719.1    PYGN01001062    PSN37960.1    GEZM01068802    JAV66764.1    EFA03718.1    JN082718    AER27815.1    RVE52458.1    NWSH01002544    PCG68014.1    ODYU01003629    SOQ42622.1    EFA03720.1    JTDY01009813    KOB62611.1    PSN37969.1    KK854044    PTY10186.1    KPI97775.1    SOQ42621.1    SOQ51205.1    KPI97773.1    KPJ09776.1    BABH01013358    BR000627    FAA00629.1    EFA03714.1    AXCN02000565    AAAB01008807    EDO64780.1    APCN01003642    GBGD01003554    JAC85335.1    AXCM01020208    KPI97769.1    ACPB03012170    GAHY01002361    JAA75149.1    GAHY01000373    JAA77137.1    ACPB03012169    ADMH02000233    ETN67291.1    AK401839    BAM18461.1    GECZ01021254    JAS48515.1    GAMD01001404    JAB00187.1    ACPB03022691    GAHY01002380    JAA75130.1    APGK01018855    KB740085    ENN81507.1    KB631844    ERL86680.1    GEBQ01014146    JAT25831.1    ACPB03026392    BABH01013356    BABH01013357    DS235028    EEB10690.1    KPJ09786.1    EFA03712.1    EFA04643.2    MG601606    AYA49931.1   

Proteomes

UP000005204    UP000283053    UP000027135    UP000007151    UP000053240    UP000053268    + More
UP000007266    UP000245037    UP000218220    UP000037510    UP000075886    UP000075884    UP000075902    UP000076407    UP000007062    UP000075840    UP000075883    UP000075920    UP000015103    UP000000673    UP000019118    UP000030742    UP000009046    UP000075900   

PRIDE

C0H6V1    C0H6V3    C0H6U9    H9IT54    C0H6W6    Q9BH30    + More
H9IT58    C0H6W4    Q9BPR2    C0H6W5    H9IT59    C0H6W8    H9ISM5   

Pfam

PF00379   Chitin_bind_4

Interpro

IPR000618   Insect_cuticle        + More
IPR031311   CHIT_BIND_RR_consensus       

ProteinModelPortal

C0H6V1   C0H6V3   A0A3S2LRS0   C0H6U9   A0A3S2TQL4   A0A3S2PIL6   + More
H9IT54   A0A2H1WAB8   A0A2H1VFG1   A0A2H1VPL7   A0A2W1BXC1   A0A2H1VFK7   A0A2W1C1G9   A0A2H1VH24   A0A2H1WWL0   A0A2H1WE29   A0A2H1WJC4   C0H6W6   Q9BH30   A0A2H1V4C4   A0A2H1VPL0   A0A2W1BV53   A0A067RMC7   A0A212FKA8   A0A2H1VPE0   A0A2H1W9R4   H9IT58   C0H6W4   Q9BPR2   A0A2W1BZF1   A0A194QWU2   C0H6W5   I4DID6   A0A2H1V127   A0A2W1BXB1   A0A194PYE7   A0A194QXT8   A0A194PWM9   H9IT59   A0A194QWC3   A0A2H1VPH0   A0A2W1BZU7   A0A2W1C1F8   I4DKM3   A0A2H1VRQ2   A0A2H1WXM0   A0A2H1VQS4   A0A2H1VQR4   A0A2H1WRF0   D6WJ00   A0A2P8Y145   A0A1Y1KZI1   D6WJ01   G8FVP8   A0A3S2NYR7   A0A2A4J906   A0A2H1VQ88   D6WIZ9   A0A0L7KHQ9   A0A2P8Y151   A0A2R7VRX6   A0A194Q2Z3   A0A2H1VP60   A0A2H1WDQ1   A0A194PXM4   A0A194R1P3   C0H6W8   D6WJ06   A0A182Q5D4   A0A182N9I2   A0A182TZH3   A0A182X2B9   A7URY7   A0A182I6I1   A0A069DNE3   A0A182MBA2   A0A182WBA9   A0A194PYE3   R4G2R9   R4FNZ4   T1HRQ0   W5JT23   I4DKM1   A0A1B6FE93   T1DSN0   T1I2B8   R4G3A1   N6US01   U4U9R5   A0A1B6LQ31   T1HRF8   H9ISM5   E0VBD4   A0A182RUH5   A0A194R1Q6   D6WJ08   D6WJ09   A0A3Q8HPY1  

KEGG

100379369    no KO assigned | (RefSeq) CPR109, BmorCPR109; cuticular protein RR-2 motif 109

GO

GO:0042302   GO:0016021   GO:0031012   GO:0005761   GO:0006412   GO:0043565   GO:0007155   GO:0005515   GO:0008237   GO:0008152   GO:0016491   GO:0015930  

Length:

82

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.51832

inside

1  -  82

 

 

Pi

401.941737

Theta

208.845854

Tajima's D

2.910771

CLR

0.123394

CSRT

0.975051247437628

Interpretation

Uncertain