Silkworm Genome Informatics Database

Gene

KWMTBOMO12494

Pre Gene Modal

BGIBMGA001468

Annotation

PREDICTED:_protein_pygopus_[Amyelois_transitella]

Location

Bomo_Chr21(-):5000036-5005134 View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear Reliability : 3.186

CDS

ATGAGTCACAATCTGGCGGGAATGCCATCTTACAGGCTACCAGGGCCAGGGTTAGGACCTCCAGACTTCAAGCCTCCAATGGATACACCTACTCCACAAGCTTCAGCCCCAAGTAATCCTAAGAAGCGGAGAAAGACGTCTAATGCTAGTAATGCCCTGACACCACAGCCTCCACCAACAGCTCAAGATTTGCTTCCACCTCCTCTCACAGGATATGGAGATACCATTGTAGCATCCAATCCTTTTGATGATTCTCCTTCTACAGTGTCCCACAATGGACCAATGATGAATCAAAATGGACCTATGATGAGTCAGAACAATTCAATGGGAATGATGGGTCCCATGCATGGTATGGGAGGCCCTCCAATGAGACACATGAGCCCTCTGCCACACAGCATGAGCCCTATGAATCAGCAAATGCCACCTAGAGGAGGAATAAGTCCAATGGGCAATATGAGCCCTATGGGACATATGGGAGGCATGTCGCCAATGGGAGGCCCAAGTATGGGAATGAGTAATCATAGTATGGGACCTGGCATGGGACCAACATCAAGATCAATGGGTAGCCCTATGAGCCCAATGAATTCTATGCCTATGGGATCTCCTATGTCTTCTGGTCCTATGGGTAGTCCTATGAATATGGGTTCAATGTCAGGTAGTCACATGAGCAATAGTCCAATGGGTCCACCCATGCACAGTCCACTAGGGGCAGGATCTATGAATGGGCCAATGAATGGACCTATGGGGGGAGGTGGCCCGAGTATGAGTGTTCCAAGAATGAATGGACCAATGGGTCCCAGCTGTTCCAATGGTTCAATGGGACCAAACAATTCAATTATGTCTTCAAATCCTATGCAAAACTCTGTTATGGGTCCTGGTCATTGTGGGCCAATGAGACATGGAAGTCCTATGACCTCTGGAATGGGTAGTGGTCCAATGGGAGGCAATGGACCAATGACATCTATGGGTCCAGGCCCTCCATACAATACCAGTCATATGGGGCATGGTGGACCTATGGGCATGGGAGGAAATGGCTCAATGGGAATGGGTCCTGGTCCAGGCAACATGGGAAATTGTGGACCACTGGCTGGAATGAGTGGAATGGCTATGGGAGGACCAGGAGGTCAAGGTGTGGGGCCAATGGGACAAGGAATGGGTATGTTTGGTCCTAAACCTATGCCAGTCAGTGCAGGGAAAGTCTATCCCCCAGATCAACCTATGGTGTTCAACCCACAGAATCCAAATGCACCCCCAATATATCCTTGTGGAGTATGTCACAAAGAGGTGCATGATAATGATCAAGCTATACTGTGCGAGTCGGGATGTAACTTTTGGTTTCACAGGGGATGTACAGGACTATCGGAGCCTGCATTCCAGCTGTTGACAGCTGAAGTATACGCCGAGTGGGTGTGTGATAAGTGCCTATCTTCTAAGAACATACCGCTGGTAAAGTTTAAGCCATAG

Protein

MSHNLAGMPSYRLPGPGLGPPDFKPPMDTPTPQASAPSNPKKRRKTSNASNALTPQPPPTAQDLLPPPLTGYGDTIVASNPFDDSPSTVSHNGPMMNQNGPMMSQNNSMGMMGPMHGMGGPPMRHMSPLPHSMSPMNQQMPPRGGISPMGNMSPMGHMGGMSPMGGPSMGMSNHSMGPGMGPTSRSMGSPMSPMNSMPMGSPMSSGPMGSPMNMGSMSGSHMSNSPMGPPMHSPLGAGSMNGPMNGPMGGGGPSMSVPRMNGPMGPSCSNGSMGPNNSIMSSNPMQNSVMGPGHCGPMRHGSPMTSGMGSGPMGGNGPMTSMGPGPPYNTSHMGHGGPMGMGGNGSMGMGPGPGNMGNCGPLAGMSGMAMGGPGGQGVGPMGQGMGMFGPKPMPVSAGKVYPPDQPMVFNPQNPNAPPIYPCGVCHKEVHDNDQAILCESGCNFWFHRGCTGLSEPAFQLLTAEVYAEWVCDKCLSSKNIPLVKFKP

Uniprot

NA

ProteinModelPortal

NA

PDB

3ZPV E-value=1.78728e-23, Score=271

KEGG

101737549 no KO assigned | (RefSeq) protein pygopus-like

GO

GO:0005515 GO:0008270 GO:0003682 GO:0016021 GO:0045211 GO:0005975 GO:0004553

Length:

487

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00571999999999999

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.00104

outside

1 - 487

Pi

140.866669

Theta

152.963722

Tajima's D

0.166643

CLR

0.285069

CSRT

0.414879256037198

Interpretation

Uncertain

Sequence

Summary

Ontologies

Topology

Population Genetic Test Statistics