SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO11538
Pre Gene Modal
BGIBMGA004070
Annotation
chemosensory_protein_16_[Spodoptera_exigua]
Location in the cell
Cytoplasmic   Reliability : 1.303 Nuclear   Reliability : 1.264
 

Sequence

CDS
ATGTTAGATAAAGGACCCTGTGAAGTCGAGTATTCTTCGGAATTCAAAGAACTGCTGCCCGAAGTGATAGCAACATCGTGTGCCAAATGTACACCAATACAGAAAACAGGTTTAAGGAAAACCGTCAAAGCGCTGAGCGTCAAGAGACCCGATGATTTTAGTCAATTCAGAGCTAAGTATGACCCTAAAGGGGAATATGAAAAGCAATTCGCCGCTTTTGTTGTGGCAACAGATTAA
Protein
MLDKGPCEVEYSSEFKELLPEVIATSCAKCTPIQKTGLRKTVKALSVKRPDDFSQFRAKYDPKGEYEKQFAAFVVATD

Summary

EMBL
BABH01021430    MG518400    AYC12350.1    KY810191    ASA40083.1    KP729033    + More
AKT26491.1    NWSH01000827    PCG73974.1    ODYU01001383    SOQ37484.1    KY810186    KZ149917    ASA40078.1    PZC77876.1    KX585435    ARO70328.1    KT282983    ALS03840.1    MG788194    AXF48712.1    RSAL01000019    RVE52700.1    KX252766    APY22695.1    JTDY01000771    KOB75934.1    AB430777    KQ458575    BAG71920.1    KPJ05763.1    AGBW02009828    OWR49807.1    KQ461073    KPJ09667.1    RVE52701.1    BABH01021434    DQ855514    AJ973409    ABH88201.1    CAJ01456.1    GECZ01026171    JAS43598.1    MG788186    AXF48704.1    MG788188    AXF48706.1    MF509602    AWC68022.1    KX655941    AOG12890.1    JQ678985    AFJ54036.1    JQ678983    AFJ54034.1    JQ678976    AFJ54027.1    KM078684    AIT38552.1    GU250808    JQ655150    JQ678974    JQ678975    JQ678979    JQ678980    JQ678984    JQ678987    JQ678988    JQ678990    JQ678991    JQ678992    JQ678994    JQ678995    JQ678996    KM078680    KM078681    KM078682    KM078683    KT694344    ADG56568.1    AFJ42498.1    AFJ54025.1    AIT38548.1    ANJ43346.1    KQ434777    KZC04256.1    MF770646    AXG21599.1    KM078685    AIT38553.1    KQ414578    KOC71174.1    JQ678993    AFJ54044.1    MG788187    AXF48705.1    JQ678977    AFJ54028.1    MH230211    AXY87870.1    KF026051    AHX37220.1    GFXV01004716    MBW16521.1    KF487630    AII01028.1    KX954372    ATD12156.1    KR003781    ALC79595.1    HQ649755    ADV36661.1    AGBW02011101    OWR47215.1    JQ678989    AFJ54040.1    DQ855487    AJ973402    ABH88174.1    CAJ01449.1    JQ979434    AFQ07771.1    KZ288253    PBC30987.1    KQ435888    KOX69505.1    MG546594    AYD42217.1    JQ678981    AFJ54032.1    KF487614    AII01012.1    GANO01003228    JAB56643.1    GDQN01008076    JAT82978.1    KT357402    AND82450.1    KF984164    AIX97047.1    ACPB03019482    GAHY01002032    JAA75478.1    GL439621    EFN66918.1    GAIX01008045    JAA84515.1    MF975429    AUF73005.1    GCVX01000012    JAI18218.1    KK107078    QOIP01000011    EZA60473.1    RLU16520.1    PCG73975.1    EZ407157    ACX53719.1    DS235878    EEB19859.1    JQ678986    AFJ54037.1    GL440425    EFN65878.1    KT381691    AMA98182.1    JX863703    AGR39578.1    NNAY01003487    OXU19343.1    AAZX01001011    ABLF02029116    AK341152    AJ973439    BAH71609.1    CAJ01486.1    KT965293    ANW10208.1    LC028286    BAS29779.1    AJ870489    AJ888910    CAI34907.1    CAI64032.1    KY130477    APG32545.1    KP963708    ALG36156.1    JX305305    AFR92094.1    PZC77877.1    GDQN01007391    GDQN01007068    JAT83663.1    JAT83986.1    KT381515    ALR72521.1    KX585429    ARO70322.1    MF598728    AXB87340.1    MG546593    AYD42216.1    OWR47214.1    KC507180    AGI37363.1    KC017751    AGG38799.1    KP645391    AJP61953.1    KQ797156    OAD46976.1    KC161565    AGE97642.1    KK856499    PTY25912.1    MG719246    AYN07330.1    KY826445    AVI04873.1    GGMR01003743    MBY16362.1    KP082925    AKW47217.1    KP975095    ALT31614.1    KOB75936.1    KT357404    AND82452.1    KT261672    ALJ30212.1    KP729029    AKT26487.1    MG356464    AJ870491    AJ888911    AWV63291.1    CAI34909.1    CAI64033.1   
Pfam
PF03392   OS-D        + More
PF18701   DUF5641
Interpro
IPR036682   OS_D_A10/PebIII_sf        + More
IPR005055   A10/PebIII       
IPR040676   DUF5641       
SUPFAM
SSF100910   SSF100910       
Gene 3D
PDB
2GVS     E-value=4.03735e-08,     Score=131

Ontologies

Topology

Length:
78
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
0.00024
Exp number, first 60 AAs:
0.00024
Total prob of N-in:
0.15599
outside
1  -  78
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
116.430884
Theta
126.061858
Tajima's D
-0.29901
CLR
37.535112
CSRT
0.286285685715714
Interpretation
Uncertain
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号