Gene

KWMTBOMO11534

Pre Gene Modal

BGIBMGA004068

Annotation

PREDICTED:_chemosensory_protein_10_isoform_X1_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr19(+):7833215-7836099      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 2.2

CDS

ATGAAAATACTGATCATAGTAGTGATGGCATGTGTGGCGGTCACTTGGGCGCGTCCGGAATCGACCTATACTGATAAATGGGATAACATAAACGTCGATGAGATCCTCGAGTCCAACCGACTCCTCAAAGGTTACGTCGACTGTCTCCTAGGCAAAGGTCGTTGCACTCCAGACGGTAAAGCCTTAAAGGAAACTCTTCCTGATGCTCTTGAACATGAGTGTGTTAAGTGTACTGGGAAACAGAAGTCGGGAGCTGACAAAGTCATTAGACATTTGGTAAATAAACGGCCGGACTTATGGAAGGAGTTGGCTGTTAAATATGATCCCGACAACATCTACCAAGCGAGATACAAAGACAAAATCGATGCCGTCAAAGGCTCCGCTTAG

Protein

MKILIIVVMACVAVTWARPESTYTDKWDNINVDEILESNRLLKGYVDCLLGKGRCTPDGKALKETLPDALEHECVKCTGKQKSGADKVIRHLVNKRPDLWKELAVKYDPDNIYQARYKDKIDAVKGSA

Uniprot

H9J3I1   Q0MRJ3   Q3LBA1   H9C8R7   S5MIH6   S5M4K4   + More
H9C8U1   S5M6N1   H9C8W6   H9C8X1   H9C8U8   S5MNW4   S5MNV8   H9C8S9   H9C8V3   H9C8Q6   S5M6P5   H9C8T7   S5MNV2   H9C8R9   S5M186   S5M4Q8   H9C8S7   H9C8S5   S5MIK1   H9C8S0   S5M6I8   H9C8V5   S5MIQ1   H9C8T0   S5M6M8   S5MIN7   S5MNX1   S5M4J5   H9C8U7   S5MIJ4   H9C8V4   S5M4L3   S5M6I2   H9C8T6   H9C8U2   S5M4P6   S5MP05   H9C8W4   H9C8U0   S5MP09   S5M157   S5M4I5   H9C8W2   S5MIP7   S5M6H9   H9C8U5   H9C8R4   H9C8Q8   H9C8W5   H9C8S2   H9C8R8   H9C8X4   S5M4L0   H9C8R3   H9C8Q7   S5M130   H9C8R2   H9C8X2   H9C8V0   H9C8W0   H9C8X5   S5MNX7   S5MIK7   S5MP00   S5M177   S5M6M0   S5M4I8   S5M145   H9C8T5   H9C8W9   H9C8T9   H9C8V9   H9C8V8   H9C8W3   H9C8W8   A0A0P0EGH1   A0A385XQV9   A0A2K8GL15   Q9U4Y9   U5KD72   A0A2H1V9G4   A0A1V1WC09   A0A076ED99   A0A346RVI1   A0A0A0V9F9   A0A1Z2R8P7   A0A0C4K8H1   A0A386H9M7   A8QWQ2   A0A0A1CN82   U5PZ70   A0A194R1E5   A0A194QJQ0   A0A0L7LDQ3  

Pubmed

19121390    17175443    24551045    26445454    28736530    10620045    + More
24053512    24998398    28756777    28594956    18771731    23894529    26354079    26227816   

EMBL

BABH01021426    DQ855516    ABH88203.1    JQ253715    JQ253716    JQ253717    + More
JQ253721    JQ253722    JQ253727    JQ253729    JQ253730    JQ253732    JQ253737    JQ253738    JQ253740    JQ253744    JQ253749    JQ253752    JQ253757    JQ253762    JQ253767    JQ253773    KC879984    KC879987    KC879988    KC879993    KC879995    KC879998    KC880006    KC880007    KC880015    KC880017    KC880019    KC880020    KC880024    KC880025    KC880026    AB243746    AJ973405    AFF18118.1    AFF18119.1    AGR44896.1    AGR44899.1    AGR44900.1    AGR44905.1    AGR44907.1    AGR44910.1    AGR44918.1    AGR44919.1    AGR44927.1    AGR44929.1    AGR44931.1    AGR44932.1    AGR44936.1    AGR44937.1    AGR44938.1    BAF34351.1    CAJ01452.1    JQ253723    AFF18126.1    KC879974    AGR44886.1    KC879992    AGR44904.1    JQ253747    AFF18150.1    KC880013    AGR44925.1    JQ253772    AFF18175.1    JQ253777    KC879979    AFF18180.1    AGR44891.1    JQ253754    JQ253779    AFF18157.1    KC879991    AGR44903.1    KC879986    AGR44898.1    JQ253735    AFF18138.1    JQ253758    JQ253759    AFF18162.1    JQ253712    AFF18115.1    KC880023    AGR44935.1    JQ253743    AFF18146.1    KC879981    AGR44893.1    JQ253725    AFF18128.1    KC880010    AGR44922.1    KC880022    AGR44934.1    JQ253733    AFF18136.1    JQ253731    AFF18134.1    KC879994    AGR44906.1    JQ253726    AFF18129.1    KC879983    AGR44895.1    JQ253761    KC880018    AFF18164.1    AGR44930.1    KC880014    AGR44926.1    JQ253736    AFF18139.1    KC880008    AGR44920.1    KC880004    AGR44916.1    KC879996    AGR44908.1    KC879982    AGR44894.1    JQ253753    AFF18156.1    KC879989    AGR44901.1    JQ253750    JQ253760    AFF18163.1    KC880002    AGR44914.1    KC879978    AGR44890.1    JQ253742    AFF18145.1    JQ253748    AFF18151.1    KC880012    AGR44924.1    KC879980    KC880016    AGR44892.1    AGR44928.1    JQ253770    AFF18173.1    JQ253746    AFF18149.1    KC880021    AGR44933.1    KC880000    AGR44912.1    KC879972    KC879985    AGR44884.1    AGR44897.1    JQ253768    AFF18171.1    KC880009    AGR44921.1    KC879973    AGR44885.1    JQ253751    AFF18154.1    JQ253720    AFF18123.1    JQ253714    AFF18117.1    JQ253771    AFF18174.1    JQ253728    JQ253776    AFF18131.1    JQ253724    AFF18127.1    JQ253780    AFF18183.1    KC879997    AGR44909.1    JQ253719    AFF18122.1    JQ253713    AFF18116.1    KC879975    AGR44887.1    JQ253718    AFF18121.1    JQ253778    AFF18181.1    JQ253755    JQ253756    AFF18159.1    JQ253766    AFF18169.1    JQ253781    AFF18184.1    KC880001    AGR44913.1    KC879999    AGR44911.1    KC880011    AGR44923.1    KC880005    AGR44917.1    KC879976    KC880003    AGR44888.1    AGR44915.1    KC879977    AGR44889.1    KC879990    AGR44902.1    JQ253741    AFF18144.1    JQ253775    AFF18178.1    JQ253745    AFF18148.1    JQ253765    AFF18168.1    JQ253764    AFF18167.1    JQ253769    AFF18172.1    JQ253774    AFF18177.1    KT261681    ALJ30221.1    MG518399    AYC12349.1    KX585428    ARO70321.1    AF117599    AJ973453    AAF16721.1    CAJ01500.1    JX863701    AGR39576.1    ODYU01001383    SOQ37490.1    GENK01000039    JAV45874.1    KF487632    AII01030.1    MG191338    AXS78221.1    KM236062    KZ149917    AIW65099.1    PZC77871.1    KY810193    ASA40085.1    KF026050    AHX37219.1    MG546586    AYD42209.1    AB260117    BAF91712.1    KM365190    AIX97825.1    KC907759    AGY49272.1    KQ461073    KPJ09671.1    KQ458575    KPJ05757.1    JTDY01001559    KOB73529.1   

Proteomes

UP000005204    UP000053240    UP000053268    UP000037510   

PRIDE

H9J3I1    Q0MRJ3    Q3LBA1    H9C8R7    S5MIH6    S5M4K4    + More
H9C8U1    S5M6N1    H9C8W6    H9C8X1    H9C8U8    S5MNW4    S5MNV8    H9C8S9    H9C8V3    H9C8Q6    S5M6P5    H9C8T7    S5MNV2    H9C8R9    S5M186    S5M4Q8    H9C8S7    H9C8S5    S5MIK1    H9C8S0    S5M6I8    H9C8V5    S5MIQ1    H9C8T0    S5M6M8    S5MIN7    S5MNX1    S5M4J5    H9C8U7    S5MIJ4    H9C8V4    S5M4L3    S5M6I2    H9C8T6    H9C8U2    S5M4P6    S5MP05    H9C8W4    H9C8U0    S5MP09    S5M157    S5M4I5    H9C8W2    S5MIP7    S5M6H9    H9C8U5    H9C8R4    H9C8Q8    H9C8W5    H9C8S2    H9C8R8    H9C8X4    S5M4L0    H9C8R3    H9C8Q7    S5M130    H9C8R2    H9C8X2    H9C8V0    H9C8W0    H9C8X5    S5MNX7    S5MIK7    S5MP00    S5M177    S5M6M0    S5M4I8    S5M145    H9C8T5    H9C8W9    H9C8T9    H9C8V9    H9C8V8    H9C8W3    H9C8W8   

Pfam

PF03392   OS-D

Interpro

IPR005055   A10/PebIII        + More
IPR036682   OS_D_A10/PebIII_sf       

SUPFAM

SSF100910   SSF100910       

Gene 3D

1.10.2080.10    

ProteinModelPortal

H9J3I1   Q0MRJ3   Q3LBA1   H9C8R7   S5MIH6   S5M4K4   + More
H9C8U1   S5M6N1   H9C8W6   H9C8X1   H9C8U8   S5MNW4   S5MNV8   H9C8S9   H9C8V3   H9C8Q6   S5M6P5   H9C8T7   S5MNV2   H9C8R9   S5M186   S5M4Q8   H9C8S7   H9C8S5   S5MIK1   H9C8S0   S5M6I8   H9C8V5   S5MIQ1   H9C8T0   S5M6M8   S5MIN7   S5MNX1   S5M4J5   H9C8U7   S5MIJ4   H9C8V4   S5M4L3   S5M6I2   H9C8T6   H9C8U2   S5M4P6   S5MP05   H9C8W4   H9C8U0   S5MP09   S5M157   S5M4I5   H9C8W2   S5MIP7   S5M6H9   H9C8U5   H9C8R4   H9C8Q8   H9C8W5   H9C8S2   H9C8R8   H9C8X4   S5M4L0   H9C8R3   H9C8Q7   S5M130   H9C8R2   H9C8X2   H9C8V0   H9C8W0   H9C8X5   S5MNX7   S5MIK7   S5MP00   S5M177   S5M6M0   S5M4I8   S5M145   H9C8T5   H9C8W9   H9C8T9   H9C8V9   H9C8V8   H9C8W3   H9C8W8   A0A0P0EGH1   A0A385XQV9   A0A2K8GL15   Q9U4Y9   U5KD72   A0A2H1V9G4   A0A1V1WC09   A0A076ED99   A0A346RVI1   A0A0A0V9F9   A0A1Z2R8P7   A0A0C4K8H1   A0A386H9M7   A8QWQ2   A0A0A1CN82   U5PZ70   A0A194R1E5   A0A194QJQ0   A0A0L7LDQ3  

PDB

2GVS     E-value=5.37476e-26,     Score=285

KEGG

692617    no KO assigned | (RefSeq) CSP10, Csp3; chemosensory protein 10

GO

GO:0016021  

PANTHER

PTHR11257  

SignalP

Position:   1 - 17,         Likelihood:  0.998404

 

 

Length:

128

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.12009

Exp number, first 60 AAs:

0.12009

Total prob of N-in:

0.13997

outside

1  -  128

 

 

Pi

188.148892

Theta

136.047582

Tajima's D

-0.632962

CLR

236.237954

CSRT

0.216539173041348

Interpretation

Uncertain