Gene

KWMTBOMO11533  Validated by peptides from experiments

Pre Gene Modal

BGIBMGA004045

Annotation

chemosensory_protein_4_precursor_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr19(-):7818572-7820904      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.998 Extracellular   Reliability : 1.66

CDS

ATGAAGGTCCTTATAGTTTTGAGCTGTGTACTCGTGGCCGTACTTGCTGATGATAAGTACACTGACAAATATGACAAAATTAACTTGCAAGAAATTTTGGAGAACAAGAGGCTCCTGGAGTCGTATATGGATTGCGTGCTCGGCAAGGGCAAGTGTACTCCCGAAGGGAAGGAACTGAAAGATCATCTTCAAGAAGCTCTAGAGACTGGTTGCGAGAAATGCACTGAAGCCCAAGAAAAGGGCGCTGAAACTAGTATTGATTATTTAATCAAGAATGAACTGGAAATTTGGAAGGAGCTGACAGCCCATTTCGACCCCGACGGCAAATGGAGGAAGAAGTACGAAGACCGCGCTAAGGCCAAGGGCATCGTCATCCCTGAATAA

Protein

MKVLIVLSCVLVAVLADDKYTDKYDKINLQEILENKRLLESYMDCVLGKGKCTPEGKELKDHLQEALETGCEKCTEAQEKGAETSIDYLIKNELEIWKELTAHFDPDGKWRKKYEDRAKAKGIVIPE

Uniprot

Q8MMK7   Q5UB00   H9C8H4   H9C8F2   H9C8G0   H9C8H3   + More
H9C8H0   H9BXA4   H9C8E0   H9C8E2   H9C8E8   H9C8E1   H9C8E9   H9C8G9   H9C8G7   H9C8G4   H9BXA6   H9BXA9   H9C8D9   H9C8F4   H9C8E7   H9BXB2   H9BXA5   H9C8D7   H9BXA7   H9C8E3   H9C8G1   H9C8F9   H9C8F3   H9C8G5   A0A0C4K6E0   A0A0A1CNK0   A0A1B4ZBL3   H9C8F8   A0A0U3BLK7   A0A1W5LAS8   O18639   A0A1L2BLA1   Q2V8U9   D2SNW3   A0A3G6V6L8   Q9NG96   A0A1E1WSQ3   A0A0P0ISF4   A0A386H9F8   H9C8F5   U5Q2Q5   H9C8H1   A0A1B3P5K9   A0A1V1WBZ6   A0A0K8TUT0   A0A0M3R8G6   H9C8D8   A0A345BEM9   A0A0K1DCX4   D0E9M6   Q9U4Z6   A0A3B0E6L3   Q95PD3   Q9U3X8   A0A2W1BYH2   Q9U3Y0   A0A0L7LE98   A0A212F7U3   Q8ITL3   A8UKE3   B4XT63   U5KD26   A0A212FG05   Q9U3Y2   J9VCV4   A0A194QVW3   A0A097QQU2   Q9U3X9   A0A2H1VWU2   Q9U3Y1   A0A0P0EUM0   A0A194QLE4   A8QWQ9   I4DJ16   A8QWQ8   A0A194QJK5   Q5MGD4   Q8MMI6   Q7YT55   B5U9W9   A0A194QJP5   A0A194QW19   A0A194QWJ0   A0A2K8GL03   A0A076E5S9   A0A1B3P5L0   A0A346TI07   A0A076E5U7   A0A2K8GL04   A0A2P9JZD6   A0A2H1WBZ5   A0A2H1VT85   A0A2K8GL02   Q3LBA2  

Pubmed

10897093    11583930    17966128    17175443    19121390    24551045    + More
26657286    9427543    20074338    30465940    11555479    12068017    12217077    12697900    23894529    27538507    26017144    29727827    19789654    10620045    11015326    28756777    26227816    22118469    24053512    26354079    26445454    18771731    22651552    16023793    28736530    24998398    30154418   

EMBL

BABH01021425    AF509239    DQ855510    FJ425876    AJ973410    AAM34276.1    + More
ABH88197.1    ACJ66920.1    CAJ01457.1    AY766376    AAV34688.1    JQ253600    JQ253601    JQ253602    JQ253606    JQ253607    JQ253612    JQ253613    JQ253618    JQ253619    JQ253622    JQ253630    AFF18033.1    JQ253608    AFF18011.1    JQ253616    AFF18019.1    JQ253629    AFF18032.1    JQ253626    AFF18029.1    JQ085850    AFD97750.1    JQ253596    AFF17999.1    JQ253598    AFF18001.1    JQ253604    AFF18007.1    JQ253597    AFF18000.1    JQ253605    AFF18008.1    JQ253625    JQ253628    AFF18028.1    JQ253623    AFF18026.1    JQ253620    AFF18023.1    JQ085852    AFD97752.1    JQ085855    AFD97755.1    JQ253595    AFF17998.1    JQ253610    AFF18013.1    JQ253603    AFF18006.1    JQ085858    JQ253592    AFD97758.1    AFF17995.1    JQ085851    AFD97751.1    JQ253593    AFF17996.1    JQ085853    JQ085854    AFD97753.1    JQ253599    AFF18002.1    JQ253617    AFF18020.1    JQ253615    AFF18018.1    JQ253609    AFF18012.1    JQ253621    AFF18024.1    KF026049    AHX37218.1    KM365188    AIX97823.1    LC027702    BAV56805.1    JQ253614    AFF18017.1    KP975087    ALT31606.1    KT991354    ANA75020.1    U95046    AAC47827.1    KT282985    ALS03842.1    DQ285667    ABB91378.1    EZ407247    NWSH01000827    ACX53804.1    PCG73985.1    MH027975    AZB49393.1    AF255918    AAF71289.1    GDQN01001062    JAT89992.1    KR780031    ALJ93810.1    MG546588    AYD42211.1    JQ253611    AFF18014.1    KC907756    AGY49269.1    JQ253627    AFF18030.1    KX655949    AOG12898.1    GENK01000046    JAV45867.1    GCVX01000013    JAI18217.1    KR003780    ALC79594.1    JQ253594    AFF17997.1    MG788185    AXF48703.1    KP729026    AKT26484.1    GQ433369    ACX47895.1    AF117592    AJ973452    AAF16714.1    CAJ01499.1    RBVL01000175    RKO11126.1    AF368375    AAK53762.1    AF211181    AAF19651.1    KZ149917    PZC77870.1    AF211179    AAF19649.1    JTDY01001559    KOB73531.1    AGBW02009828    OWR49800.1    AF448448    AAN63675.1    EU136569    ABW34383.1    EU091478    ABW87765.1    JX863702    AGR39577.1    AGBW02008742    OWR52664.1    AF211177    AAF19647.1    JX305308    AFR92097.1    KQ461073    KPJ09673.1    KM233717    AIU68827.1    AF211180    AAF19650.1    ODYU01004930    SOQ45311.1    AF211178    AAF19648.1    KT261679    ALJ30219.1    KQ458575    KPJ05755.1    AB260124    BAF91719.1    AK401284    BAM17906.1    AB260123    BAF91718.1    KPJ05753.1    AY829852    AAV91466.1    AY101513    AAM77042.1    AY301978    AAP57460.1    AB430774    AK401934    BAG71917.1    BAM18556.1    KPJ05756.1    KPJ05752.1    KPJ09672.1    KPJ09674.1    KX585416    ARO70309.1    KF487618    AII01016.1    KX655951    AOG12900.1    MG751822    AXU25090.1    KF487633    AII01031.1    KX585424    ARO70317.1    KY826448    AVI04876.1    ODYU01007633    SOQ50583.1    ODYU01004316    SOQ44061.1    KX585417    ARO70310.1    BABH01021424    DQ855509    EF514895    AJ973404    ABH88196.1    ABP93832.1    CAJ01451.1   

Proteomes

UP000005204    UP000218220    UP000276569    UP000037510    UP000007151    UP000053240    + More
UP000053268   

PRIDE

Q8MMK7    Q5UB00    H9C8H4    H9C8F2    H9C8G0    H9C8H3    + More
H9C8H0    H9BXA4    H9C8E0    H9C8E2    H9C8E8    H9C8E1    H9C8E9    H9C8G9    H9C8G7    H9C8G4    H9BXA6    H9BXA9    H9C8D9    H9C8F4    H9C8E7    H9BXB2    H9BXA5    H9C8D7    H9BXA7    H9C8E3    H9C8G1    H9C8F9    H9C8F3    H9C8G5    H9C8F8    H9C8F5    H9C8H1    H9C8D8    Q3LBA2   

Pfam

PF03392   OS-D

Interpro

IPR036682   OS_D_A10/PebIII_sf        + More
IPR005055   A10/PebIII       

SUPFAM

SSF100910   SSF100910       

Gene 3D

1.10.2080.10    

ProteinModelPortal

Q8MMK7   Q5UB00   H9C8H4   H9C8F2   H9C8G0   H9C8H3   + More
H9C8H0   H9BXA4   H9C8E0   H9C8E2   H9C8E8   H9C8E1   H9C8E9   H9C8G9   H9C8G7   H9C8G4   H9BXA6   H9BXA9   H9C8D9   H9C8F4   H9C8E7   H9BXB2   H9BXA5   H9C8D7   H9BXA7   H9C8E3   H9C8G1   H9C8F9   H9C8F3   H9C8G5   A0A0C4K6E0   A0A0A1CNK0   A0A1B4ZBL3   H9C8F8   A0A0U3BLK7   A0A1W5LAS8   O18639   A0A1L2BLA1   Q2V8U9   D2SNW3   A0A3G6V6L8   Q9NG96   A0A1E1WSQ3   A0A0P0ISF4   A0A386H9F8   H9C8F5   U5Q2Q5   H9C8H1   A0A1B3P5K9   A0A1V1WBZ6   A0A0K8TUT0   A0A0M3R8G6   H9C8D8   A0A345BEM9   A0A0K1DCX4   D0E9M6   Q9U4Z6   A0A3B0E6L3   Q95PD3   Q9U3X8   A0A2W1BYH2   Q9U3Y0   A0A0L7LE98   A0A212F7U3   Q8ITL3   A8UKE3   B4XT63   U5KD26   A0A212FG05   Q9U3Y2   J9VCV4   A0A194QVW3   A0A097QQU2   Q9U3X9   A0A2H1VWU2   Q9U3Y1   A0A0P0EUM0   A0A194QLE4   A8QWQ9   I4DJ16   A8QWQ8   A0A194QJK5   Q5MGD4   Q8MMI6   Q7YT55   B5U9W9   A0A194QJP5   A0A194QW19   A0A194QWJ0   A0A2K8GL03   A0A076E5S9   A0A1B3P5L0   A0A346TI07   A0A076E5U7   A0A2K8GL04   A0A2P9JZD6   A0A2H1WBZ5   A0A2H1VT85   A0A2K8GL02   Q3LBA2  

PDB

2JNT     E-value=2.66787e-50,     Score=495

KEGG

692606    no KO assigned | (RefSeq) CSP4, Csp1, PebIII; chemosensory protein 4

GO

GO:0016021  

PANTHER

PTHR11257  

SignalP

Position:   1 - 16,         Likelihood:  0.998826

 

 

Length:

127

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.02299

Exp number, first 60 AAs:

0.02299

Total prob of N-in:

0.10293

outside

1  -  127

 

 

Pi

166.536913

Theta

178.118556

Tajima's D

-0.402182

CLR

0

CSRT

0.266986650667467

Interpretation

Uncertain