Gene

KWMTBOMO11532

Pre Gene Modal

BGIBMGA004046

Annotation

chemosensory_protein_1_precursor_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr19(-):7804934-7808014      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 2.441

CDS

ATGAAGTGTCTAACAATTGCTGCACTTTTATTCGTGGCGGGCTTATCGATTGCCGAGAAGTACACTGACAAGTATGACAACATAGATGTTGATGAAATTCTTGAGAACCGAAAGCTACTGGTTCCTTACATAAAATGCGTATTGGACGAAGGCCGCTGCACTCCCGATGGGAAGGAACTTAAAGCTCATATCAAAGACGGAATGCAGACAGCGTGTGCGAAGTGTACAGATAAACAGAAGGTGTCAGCCAGAAAGATCGTTAAACACATTAAGCAGCACGAAGCTGATTACTGGGAGCAGATGAAGGCCAAATATGATCCCAAAGATGAATTCAAAGAAATCTACGAGGGATTCCTCGCTGGTCAAAACTAA

Protein

MKCLTIAALLFVAGLSIAEKYTDKYDNIDVDEILENRKLLVPYIKCVLDEGRCTPDGKELKAHIKDGMQTACAKCTDKQKVSARKIVKHIKQHEADYWEQMKAKYDPKDEFKEIYEGFLAGQN

Uniprot

Q3LBA0   D2SNW5   A0A2A4JQV2   A0A076EDA3   A0A2H1VXU6   A0A076E962   + More
A0A2K8GL12   A0A3G1NI96   A0A342D209   A0A0N7I632   A0A0A0VB58   U5KCX2   A0A172QDP4   U5PZE3   A0A0U3C1C9   A0A385XRH7   A0A0K8TUS5   A0A194QK51   A0A0A1CP63   A8QWQ1   A0A1B4ZBL8   A0A2W1BS24   A0A386H9D2   A0A345BEN9   A0A1B3P5K0   A0A1W5LAT6   A0A194QWJ0   A0A3G2YV01   U5Q2R2   A0A172QDP2   D0E9M7   A0A345BEP0   Q3LB51   A0A1V1WC64   A0A3Q9N7H8   A0A1V1WC60   H6TDY1   J9VDJ0   A8QWQ4   A0A1V1WBX5   A0A2A4J5K3   A0A0A0VDH1   A0A1L2BL84   U5KCX1   A0A2A4JRD4   A0A172QDQ3   A0A345BEP1   A0A0U3BJT0   F5ANH3   A0A2H4G2R7   A0A194R1F0   A0A1B4ZBJ8   A0A2A4JPQ2   A2IBC4   U5PZ65   Q9NG94   A0A1E1WIS8   A0A1B3P5L0   A0A2H4FXZ5   A0A2H1WBZ5   A2IBC5   A0A342D208   A0A2W1C191   A0A0A1CTE9   A0A2A4J5F1   A0A194QW24   A0A2H1WIS5   A0A0P0EL93   Q9U503   A0A1Z2R8R1   A0A1W5LDL1   Q3LBA3   A0A0K8TVF1   A0A2A4J7E9   A0A2H1W9A3   A0A2A4J6R2   A0A2A4JQI6   D2SNK9   A0A2H1VUA1   D2SNU7   Q9NG95   A0A2A4JQ89   A0A2A4J657   Q9U3X6   V9PY40   A0A2W1BW73   A0A2H1VT85   A0A2A4J6K0   A2IBC3   A0A0K8TVE6   A0A0P0E5D9   A0A346RVI0   B5U9W7   A0A1Z2R8P2   A0A1Z2R8P3   J9VK67   Q9U3X7   A0A2W1BS40   B1ABS7   B6VB98  

Pubmed

17175443    19121390    20074338    24998398    28736530    26445454    + More
24053512    23894529    26657286    26017144    26354079    18771731    28756777    29727827    27538507    19789654    21396914    11555479    10620045    28594956    11015326    20495011   

EMBL

BABH01021424    DQ855507    AB243749    AJ973406    ABH88194.1    BAF34354.1    + More
CAJ01453.1    EZ407249    ACX53806.1    NWSH01000827    PCG73984.1    KF487637    AII01035.1    ODYU01004930    SOQ45312.1    KF487621    AII01019.1    KX585419    ARO70312.1    KY419209    AVC68635.1    KM275345    AKF42444.1    KT261674    ALJ30214.1    KM236060    AIW65097.1    JX863703    AGR39578.1    KT357402    AND82450.1    KC907758    AGY49271.1    KP975093    ALT31612.1    MG518396    AYC12346.1    GCVX01000011    JAI18219.1    KQ458575    KPJ05754.1    KM365201    AIX97836.1    AB260116    BAF91711.1    LC027712    BAV56815.1    KZ149917    PZC77869.1    MG546591    AYD42214.1    MG788195    AXF48713.1    KX655938    AOG12887.1    KT991365    ANA75031.1    KQ461073    KPJ09674.1    MG820747    AYP30839.1    KC907742    AGY49255.1    KT357395    AND82443.1    GQ433370    ACX47896.1    MG788196    AXF48714.1    AJ973455    CAJ01502.1    GENK01000037    JAV45876.1    MH050645    AZT78914.1    GENK01000047    JAV45866.1    HQ874664    AEX07269.1    PZC77867.1    JX305304    AFR92093.1    AB260119    BAF91714.1    GENK01000034    JAV45879.1    NWSH01002886    PCG67365.1    KM236061    AIW65098.1    KT282989    ALS03846.1    JX863698    AGR39573.1    PCG73982.1    KT357403    AND82451.1    MG788197    AXF48715.1    KP975086    ALT31605.1    HQ874661    AEB54579.1    PZC77860.1    KY130482    APG32550.1    KPJ09676.1    LC027708    BAV56811.1    PCG73981.1    EF186793    ABM67688.1    KC907754    AGY49267.1    AF255920    AAF71291.1    GDQN01004159    JAT86895.1    KX655951    AOG12900.1    KY130481    APG32549.1    ODYU01007633    SOQ50583.1    EF186794    ABM67689.1    KM275346    AKF42443.1    PZC77863.1    KM365199    AIX97834.1    PCG67367.1    KPJ09677.1    ODYU01008953    SOQ52980.1    KT261676    ALJ30216.1    AF117585    AJ973454    AAF16707.1    CAJ01501.1    KY815026    ASA40087.1    KT991356    ANA75022.1    BABH01021423    DQ855511    AB243747    AJ973403    ABH88198.1    BAF34352.1    CAJ01450.1    GCVX01000009    JAI18221.1    PCG67370.1    ODYU01007127    SOQ49627.1    PCG67368.1    PCG73968.1    EZ407137    ACX53700.1    ODYU01004317    SOQ44062.1    EZ407231    ACX53788.1    AF255919    AAF71290.2    PCG73979.1    PCG67369.1    AF211183    AAF19653.1    KC579437    AHC05675.1    PZC77864.1    ODYU01004316    SOQ44061.1    PCG67366.1    EF186792    ABM67687.1    GCVX01000014    JAI18216.1    KT261673    ALJ30213.1    MG191337    AXS78220.1    AB430772    BAG71915.1    KY810194    ASA40086.1    KY810190    ASA40082.1    JX305306    AFR92095.1    PZC77865.1    PZC77866.1    AF211182    AAF19652.1    PZC77868.1    EU439267    ACA24124.1    FJ361903    ACJ04672.1   

Proteomes

UP000005204    UP000218220    UP000053268    UP000053240   

PRIDE

Q3LBA0    Q3LBA3   

Pfam

PF03392   OS-D

Interpro

IPR005055   A10/PebIII        + More
IPR036682   OS_D_A10/PebIII_sf       

SUPFAM

SSF100910   SSF100910       

Gene 3D

1.10.2080.10    

ProteinModelPortal

Q3LBA0   D2SNW5   A0A2A4JQV2   A0A076EDA3   A0A2H1VXU6   A0A076E962   + More
A0A2K8GL12   A0A3G1NI96   A0A342D209   A0A0N7I632   A0A0A0VB58   U5KCX2   A0A172QDP4   U5PZE3   A0A0U3C1C9   A0A385XRH7   A0A0K8TUS5   A0A194QK51   A0A0A1CP63   A8QWQ1   A0A1B4ZBL8   A0A2W1BS24   A0A386H9D2   A0A345BEN9   A0A1B3P5K0   A0A1W5LAT6   A0A194QWJ0   A0A3G2YV01   U5Q2R2   A0A172QDP2   D0E9M7   A0A345BEP0   Q3LB51   A0A1V1WC64   A0A3Q9N7H8   A0A1V1WC60   H6TDY1   J9VDJ0   A8QWQ4   A0A1V1WBX5   A0A2A4J5K3   A0A0A0VDH1   A0A1L2BL84   U5KCX1   A0A2A4JRD4   A0A172QDQ3   A0A345BEP1   A0A0U3BJT0   F5ANH3   A0A2H4G2R7   A0A194R1F0   A0A1B4ZBJ8   A0A2A4JPQ2   A2IBC4   U5PZ65   Q9NG94   A0A1E1WIS8   A0A1B3P5L0   A0A2H4FXZ5   A0A2H1WBZ5   A2IBC5   A0A342D208   A0A2W1C191   A0A0A1CTE9   A0A2A4J5F1   A0A194QW24   A0A2H1WIS5   A0A0P0EL93   Q9U503   A0A1Z2R8R1   A0A1W5LDL1   Q3LBA3   A0A0K8TVF1   A0A2A4J7E9   A0A2H1W9A3   A0A2A4J6R2   A0A2A4JQI6   D2SNK9   A0A2H1VUA1   D2SNU7   Q9NG95   A0A2A4JQ89   A0A2A4J657   Q9U3X6   V9PY40   A0A2W1BW73   A0A2H1VT85   A0A2A4J6K0   A2IBC3   A0A0K8TVE6   A0A0P0E5D9   A0A346RVI0   B5U9W7   A0A1Z2R8P2   A0A1Z2R8P3   J9VK67   Q9U3X7   A0A2W1BS40   B1ABS7   B6VB98  

PDB

1N8V     E-value=1.57483e-24,     Score=273

KEGG

692618    no KO assigned | (RefSeq) CSP1, Csp6; chemosensory protein 1

GO

GO:0016021  

PANTHER

PTHR11257  

SignalP

Position:   1 - 18,         Likelihood:  0.996653

 

 

Length:

123

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.41543

Exp number, first 60 AAs:

0.41543

Total prob of N-in:

0.11376

outside

1  -  123

 

 

Pi

142.979172

Theta

162.494465

Tajima's D

-0.371511

CLR

0.447337

CSRT

0.271986400679966

Interpretation

Uncertain