Gene

KWMTBOMO11503

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr19(-):7425818-7427124      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.072 PlasmaMembrane   Reliability : 1.484

CDS

ATGTGTTTCATCGACTACAGCAAGGCTTTTGATTGTGTCAACTGGAGTTCCTTGTGGAAGGTATTGAATGTTCTTGGTGTACCCAATCATCTGATAGTGCTGGTACAGAGCCTGTATATCTACAGTCAGGGAGTTGTCAGAATCGATGAAGCTGTGTCCCAACCGTTCTGTTTTGGAAAAGGTGTCCGGCAGGGTTGCATACTGTCACCTATACTTTTTAATGCATATGGAGAGTACATCATGCGGCAGACTTGTGAAGATTGGTCGGGAGGTGTGCGCATTGGTGGAGCTCATATTACAAATCTCCGATATGCCGATGACACGACCCTGCTAGCTGCAGACGAACCTGAAATGTCTCTTTTCTTCAGCAAAATGGAACGTATCAGCAACAGCCTAGGCCTCTCCATAAATAGATCAAAAACGAAATTAATGGTGGTGGATCGAGCAAATGTTCTAAGATTGAATGGGGCGCTTGGATTAGAGGTTGTAGACGAATTCGTGTATCTCGGGTCCTGCATCAGCAACAAAGGCTCATGTGAAACTGACGTGCGCCGACGTATCGGAATGGCTAAAAGTGCGATGTCTCAGCTACAGAAGATCTGGAAGAATAGAGGGATAGGCCTGAAAACTAAAACCAGACTGGTGCGGACTCTTGTTTTCTCTATCTTCTTGTATGGAGCTGAGACATGGACGTTGAAAGCAGCAGACCGAATGCGCATCGATGCTTTCGAAATGTGGTGTTGGAGACGCATGCTAAGAATTCCGTGGACAGCCTTTCGGACTAACGTGTCGATATTGAAGCAACTGGGCATCAAAATCAGACTGTCTACTGTATGTCTGAAGCGGATCCTCGAATATTTTGGTCACATTGCGAGGAAAGACGGCGATAACCTGGAAAAACTTATGATCACAGGGAAAGTTGAAGGCAACAGATCTAGAGGCCGCAGCCATACTCGTTGGTCCGATCAGATCCGCACCGCTTTGGACAGTACAGTGTACAGCGCGCTGCATGACGCCGTGGACAGGGGAAAGTGGAAAAAGATCCTAAAATTGAAGCTCATGGGTGATGGTGGTCACGACCCTCAGACATGA

Protein

MCFIDYSKAFDCVNWSSLWKVLNVLGVPNHLIVLVQSLYIYSQGVVRIDEAVSQPFCFGKGVRQGCILSPILFNAYGEYIMRQTCEDWSGGVRIGGAHITNLRYADDTTLLAADEPEMSLFFSKMERISNSLGLSINRSKTKLMVVDRANVLRLNGALGLEVVDEFVYLGSCISNKGSCETDVRRRIGMAKSAMSQLQKIWKNRGIGLKTKTRLVRTLVFSIFLYGAETWTLKAADRMRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNVSILKQLGIKIRLSTVCLKRILEYFGHIARKDGDNLEKLMITGKVEGNRSRGRSHTRWSDQIRTALDSTVYSALHDAVDRGKWKKILKLKLMGDGGHDPQT

Uniprot

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Pubmed

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EMBL

FJ265548    ADI61816.1    FJ265553    ADI61821.1    FJ265557    ADI61825.1    + More
FJ265546    ADI61814.1    FJ265547    ADI61815.1    RSAL01000289    RVE42931.1    GU815090    ADF18553.1    FJ265560    ADI61828.1    FJ265552    ADI61820.1    KZ150203    PZC72267.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    BDSA01000081    GBE63537.1    AHAT01022938    MRZV01002322    PIK33998.1    NCKU01004395    RWS06003.1   

Proteomes

UP000283053    UP000009136    UP000018468    UP000230750    UP000285301   

PRIDE

D7F163    D7F168    D7F172    D7F161    D7F162    D5LB39    + More
D7F175    D7F167   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F163   D7F168   D7F172   D7F161   D7F162   A0A3S2L0R7   + More
D5LB39   D7F175   D7F167   A0A2W1BGD9   A0A2H1VU13   A0A3Q1MCX3   A0A3Q1LQN1   A0A3Q1M7G0   A0A3Q1MFU8   A0A3Q1M4J9   A0A3Q1MJK8   A0A2H6KKM9   W5NMM5   A0A3Q1M4E7   A0A3Q1MJZ2   A0A3Q1LKL4   A0A3Q1MQ02   A0A3Q1ML90   A0A3Q1MDY8   A0A3Q1NE26   A0A3Q1NB85   A0A3Q1MN71   A0A3Q1MWB3   A0A3Q1MVF7   A0A3Q1LUA6   A0A3Q1LKN4   A0A3Q1MSR0   A0A3Q1MIT2   A0A3Q1MMW6   A0A3Q1N3Y9   A0A3Q1LT63   A0A3Q1MXT5   A0A3Q1MGA3   A0A3Q1M1T7   A0A3Q1LNR9   A0A3Q1LWU3   A0A3Q1LR18   A0A3Q1LSI8   A0A3Q1M8I7   A0A3Q1NE48   F6RFH2   A0A3Q1NBD6   A0A3Q1MI63   A0A3Q1MGV6   A0A3Q1LIK6   A0A3Q1MCA0   A0A3Q1NDI4   A0A3Q1NJH7   A0A3Q1N1P1   A0A2G8JE23   A0A3Q1N2X2   A0A3Q1MRV0   A0A3Q1MHE1   A0A3Q1LGE8   A0A3Q1MZJ0   A0A3Q1LNZ2   A0A3Q1NFA5   A0A3Q1LRK7   A0A3Q1LQF3   A0A3Q1MZC9   A0A3Q1M321   A0A3S3P648   A0A3Q1MFW2   A0A3Q1MP18   A0A3Q1MLI2   A0A3Q1LIJ6   A0A3Q1MLV4   A0A3Q1MNB9   A0A3Q1LX40   A0A3Q1ML12   A0A3Q1M3R4   A0A3Q1LXQ5   A0A3Q1NI39   A0A3Q1LQW1   A0A3Q1LRD2   A0A3Q1M5E7   A0A3Q1MLZ9   A0A3Q1LWH0   A0A3Q1MA23   A0A3Q1LLH3   A0A3Q1NH41   A0A3Q1LGW2   A0A3Q1LRK1   A0A3Q1LXF5   A0A3Q1LK98   A0A3Q1MJ53   A0A3Q1M5A3   A0A3Q1LYT3   A0A3Q1N1H7   A0A3Q1MV64   A0A3Q1MTQ8   A0A3Q1LR52   A0A3Q1MT66   A0A3Q1M8N5  

KEGG

105841419    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC105841419

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

Length:

363

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

3.52013

Exp number, first 60 AAs:

2.41546

Total prob of N-in:

0.14685

outside

1  -  363

 

 

Pi

219.766841

Theta

147.826615

Tajima's D

1.405624

CLR

5.187837

CSRT

0.768561571921404

Interpretation

Uncertain