Gene

KWMTBOMO11281  Validated by peptides from experiments

Pre Gene Modal

BGIBMGA002755

Annotation

SUMO-1_activating_enzyme_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr19(-):2394923-2396045      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 2.286

CDS

ATGGTTGGAAATAATGAAGTCGAACTTTCTGAGGCAGAAGCCGAACAGTACGACCGACAAATCCGCCTGTGGGGCTTAGACTCGCAGAAGAGACTACGTGCAGCGAAAGTATTAATCATCGGCTTGTCCGGACTCGGCGCTGAAATTGCAAAAAACGTAATCCTCACCGGTGTAAAAAGTGTGTGTTTGTTAGACAATGAGAAACTGAAACAAATCGATCTGTACTCCCAATTTCTGTGTCCTCCTGACAAGATCGGCGTAAATCGAGCAGAGGGTTCGTTGGAAAGAGCTCGAGGCTTGAATCCGATGGTCGATGTCACAAGTCATACTAAGGGCGTAGATGAGCTACCTGACAGCTTCTTCACGGAATTTGACGTCGTATGTGCAACAGGTCTCAAACAAGAGCAATTCGAACGAATCAACAATGCTTGTCGCGACAGCAACAAAAAGTTTATCTGCGGCGACGTCTGGGGTACGTACGGTTACATGTTCTCTGATCTAGTTGATCACGAGTACTCCGAGGAGATTGTACAACACAAAGCCACCAAACGTGGGCCCGATGATGAAGAAAAAAATGCCCGAGAAACAGTTTCTATAACAGTAAAACGTCGAGCTATATATGTCCCGCTTCAGAATGCTTTATCAGCTGATTGGAATTCACCAGAGATGCGTTCTAGGCTACGTCGTGGTGATTGTGGCTATTTTGCTATGAAGCTCCTGTTACGCTTCAGAGATGAATATAACAGGAATCCTGACCCGGCTCGAAGAAAAGACGACATTAATTTACTACTGAAAATGCGTGATGAAATAGTTCGTGAATTGTCACTTCCAGCGAGTTTCATCAAAGATTCGTTGTTTTATGATGTGTTTGGAGTTGTGGCAGCAGCTGCTGCTGTTATCGGTGGTGTTATTGGCCAGGAGGTGGTCAAAGCTGTCAGTCAGAGGGAACCACCACATAACAATATGTTCTTCTTCAATCCAATTAAATGCTTAGGTTATACTGAACTGTATGGTCAATGA

Protein

MVGNNEVELSEAEAEQYDRQIRLWGLDSQKRLRAAKVLIIGLSGLGAEIAKNVILTGVKSVCLLDNEKLKQIDLYSQFLCPPDKIGVNRAEGSLERARGLNPMVDVTSHTKGVDELPDSFFTEFDVVCATGLKQEQFERINNACRDSNKKFICGDVWGTYGYMFSDLVDHEYSEEIVQHKATKRGPDDEEKNARETVSITVKRRAIYVPLQNALSADWNSPEMRSRLRRGDCGYFAMKLLLRFRDEYNRNPDPARRKDDINLLLKMRDEIVRELSLPASFIKDSLFYDVFGVVAAAAAVIGGVIGQEVVKAVSQREPPHNNMFFFNPIKCLGYTELYGQ

Uniprot

Q1HPK7   A0A0L7LCH9   A0A2A4K0K2   A0A2H1WYD2   A0A194QEZ3   A0A2Z5U813   + More
A0A194QVR4   S4P5E5   A0A212FNP5   D8VH47   D8VH16   D8VH30   D8VGZ0   D8VH14   D8VGZ2   D8VGZ9   D8VH10   G9JR83   G9JR82   D8VGZ1   G9JR97   G9JRA5   G9JR92   G9JR67   G9JR68   G9JQ18   D8VH31   G9JQ39   G9JQ66   G9JRA2   G9JR71   G9JR76   G9JRA7   G9JRB0   G9JRC0   G9JR80   G9JR62   G9JRB3   G9JQ28   G9JQ57   G9JQ03   G9JQ47   G9JR84   G9JQ51   G9JQ49   G9JQ30   G9JQ24   G9JQ36   G9JQ68   G9JQ43   G9JQ17   G9JQ16   G9JQ12   G9JQ40   G9JQ65   G9JRA1   G9JQ46   G9JQ19   G9JQ08   G9JQ37   G9JQ38   G9JR85   D8VH19   G9JQ35   G9JQ33   G9JPZ2   G9JR79   G9JR88   G9JR94   G9JR63   G9JRB4   D8VH22   D8VH40   D8VH06   D8VH04   G9JR70   G9JRB7   G9JR74   G9JRB1   G9JR69   G9JR75   D8VH08   G9JRB5   G9JRA9   D8VH12   G9JRC1   G9JQ50   G9JR91   G9JQ10   G9JQ05   G9JQ34   G9JQ54   G9JQ58   G9JQ25   G9JQ64   G9JPZ3   G9JQ67   G9JQ44   G9JQ23   G9JQ20  

Pubmed

19121390    26227816    26354079    23622113    22118469    20442862    + More
22084094   

EMBL

BABH01039963    DQ443395    ABF51484.1    JTDY01001778    KOB72901.1    NWSH01000348    + More
PCG77172.1    ODYU01012011    SOQ58079.1    KQ459053    KPJ04047.1    AP017484    BBB06740.1    KQ461073    KPJ09562.1    GAIX01005594    JAA86966.1    AGBW02004849    OWR55364.1    GQ986284    ADI82471.1    GQ986253    GQ986263    ADI82440.1    GQ986267    GQ986269    GQ986270    GQ986271    GQ986273    GQ986274    GQ986275    GQ986281    GQ986283    GQ986285    GQ986286    ADI82454.1    GQ986227    GQ986230    GQ986231    GQ986232    GQ986233    GQ986235    GQ986237    GQ986238    GQ986239    GQ986240    ADI82414.1    GQ986251    GQ986255    ADI82438.1    GQ986229    GQ986234    ADI82416.1    GQ986236    ADI82423.1    GQ986247    GQ986248    GQ986252    GQ986254    GQ986257    GQ986258    GQ986261    GQ986262    GQ986264    ADI82434.1    JN898214    AET96867.1    JN898213    AET96866.1    GQ986228    ADI82415.1    JN898228    AET96881.1    JN898236    AET96889.1    JN898223    AET96876.1    JN898198    JN898224    AET96851.1    JN898199    JN898208    AET96852.1    JN897799    AET96452.1    GQ986268    GQ986272    GQ986276    GQ986282    ADI82455.1    JN897820    AET96473.1    JN897847    AET96500.1    JN898233    AET96886.1    JN898202    AET96855.1    JN898207    JN898250    AET96860.1    JN898235    JN898238    AET96891.1    JN898239    JN898241    JN898243    AET96894.1    JN898251    AET96904.1    JN898211    JN898249    AET96864.1    JN898192    JN898193    AET96846.1    JN898244    JN898247    AET96897.1    JN897809    AET96462.1    JN897838    AET96491.1    JN897784    AET96437.1    JN897828    AET96481.1    JN898215    AET96868.1    JN897832    AET96485.1    JN897830    AET96483.1    JN897811    AET96464.1    JN897805    AET96458.1    JN897817    AET96470.1    JN897849    AET96502.1    JN897823    JN897824    AET96477.1    JN897798    JN897802    AET96451.1    JN897783    JN897795    JN897796    JN897797    AET96450.1    JN897785    JN897787    JN897788    JN897792    JN897793    JN897794    JN897810    JN897840    JN897842    AET96446.1    JN897821    JN897822    AET96474.1    JN897775    JN897846    AET96499.1    JN898232    AET96885.1    JN897827    AET96480.1    JN897800    AET96453.1    JN897789    AET96442.1    JN897818    AET96471.1    JN897819    AET96472.1    JN898216    AET96869.1    GQ986256    GQ986265    GQ986266    ADI82443.1    JN897816    AET96469.1    JN897814    AET96467.1    JN897773    AET96426.1    JN898210    AET96863.1    JN898217    JN898218    JN898219    JN898220    JN898221    AET96872.1    JN898225    JN898226    JN898227    AET96878.1    JN898191    JN898194    AET96847.1    JN898245    AET96898.1    GQ986259    ADI82446.1    GQ986277    GQ986278    GQ986279    GQ986280    ADI82464.1    GQ986243    GQ986244    ADI82430.1    GQ986241    GQ986242    ADI82428.1    JN898201    AET96854.1    JN898248    AET96901.1    JN898205    AET96858.1    JN898242    AET96895.1    JN898200    AET96853.1    JN898197    JN898206    AET96859.1    GQ986245    GQ986246    ADI82432.1    JN898246    AET96899.1    JN898240    AET96893.1    GQ986249    GQ986250    GQ986260    ADI82436.1    JN898252    AET96905.1    JN897829    JN897831    AET96484.1    JN898222    AET96875.1    JN897791    AET96444.1    JN897786    AET96439.1    JN897815    AET96468.1    JN897835    AET96488.1    JN897836    JN897839    AET96492.1    JN897806    AET96459.1    JN897845    AET96498.1    JN897774    AET96427.1    JN897848    AET96501.1    JN897825    JN897826    AET96478.1    JN897804    AET96457.1    JN897801    AET96454.1   

Proteomes

UP000005204    UP000037510    UP000218220    UP000053268    UP000053240    UP000007151    + More

PRIDE

Q1HPK7   

Pfam

PF00899   ThiF        + More
PF14782   BBS2_C

Interpro

IPR035985   Ubiquitin-activating_enz        + More
IPR000594   ThiF_NAD_FAD-bd       
IPR000011   UBQ/SUMO-activ_enz_E1-like       
IPR029333   BBS2_C       

SUPFAM

SSF69572   SSF69572       

ProteinModelPortal

Q1HPK7   A0A0L7LCH9   A0A2A4K0K2   A0A2H1WYD2   A0A194QEZ3   A0A2Z5U813   + More
A0A194QVR4   S4P5E5   A0A212FNP5   D8VH47   D8VH16   D8VH30   D8VGZ0   D8VH14   D8VGZ2   D8VGZ9   D8VH10   G9JR83   G9JR82   D8VGZ1   G9JR97   G9JRA5   G9JR92   G9JR67   G9JR68   G9JQ18   D8VH31   G9JQ39   G9JQ66   G9JRA2   G9JR71   G9JR76   G9JRA7   G9JRB0   G9JRC0   G9JR80   G9JR62   G9JRB3   G9JQ28   G9JQ57   G9JQ03   G9JQ47   G9JR84   G9JQ51   G9JQ49   G9JQ30   G9JQ24   G9JQ36   G9JQ68   G9JQ43   G9JQ17   G9JQ16   G9JQ12   G9JQ40   G9JQ65   G9JRA1   G9JQ46   G9JQ19   G9JQ08   G9JQ37   G9JQ38   G9JR85   D8VH19   G9JQ35   G9JQ33   G9JPZ2   G9JR79   G9JR88   G9JR94   G9JR63   G9JRB4   D8VH22   D8VH40   D8VH06   D8VH04   G9JR70   G9JRB7   G9JR74   G9JRB1   G9JR69   G9JR75   D8VH08   G9JRB5   G9JRA9   D8VH12   G9JRC1   G9JQ50   G9JR91   G9JQ10   G9JQ05   G9JQ34   G9JQ54   G9JQ58   G9JQ25   G9JQ64   G9JPZ3   G9JQ67   G9JQ44   G9JQ23   G9JQ20  

PDB

6CWZ     E-value=1.0583e-74,     Score=711

KEGG

733026    K10684 ubiquitin-like 1-activating enzyme E1 A [EC:6.2.1.45] | (RefSeq) SUMO-1 activating enzyme

PATHWAY

04120    Ubiquitin mediated proteolysis - Bombyx mori (domestic silkworm)

GO

GO:0008641   GO:0006464   GO:0003678   GO:0005524   GO:0006270   GO:0042555   GO:0006260   GO:0006811   GO:0005622   GO:0006810   GO:0003824  

Length:

339

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

14.98651

Exp number, first 60 AAs:

0.29665

Total prob of N-in:

0.02786

outside

1  -  339

 

 

Pi

66.941314

Theta

80.396937

Tajima's D

-1.367198

CLR

0.307916

CSRT

0.0813959302034898

Interpretation

Uncertain