Gene

KWMTBOMO09919

Pre Gene Modal

BGIBMGA012392

Annotation

hypothetical_protein_RR46_02347_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr16(+):12095174-12095702      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.221 Mitochondrial   Reliability : 1.029 Nuclear   Reliability : 1.678

CDS

ATGAATGTTAGAGGAAGTCTGAAAGTGGCACCTGTGACAGAGAAGCTGAGAAGTGCGCGTTTGGGATGGTATGGACATGTGATTAGACGAAATGAAAATGAGGTTGGTAAGAAAATGCTAACTATGAATGTGGAAGGATATAGAGGAAGAGGTAGACCTAAGAAGAAATGGGTGGATTGCGTGAAAGACGATATGGGTAAGAGGGGAGTGAGCGAAGGAATGGTATATGATAGAAGAGTATGGAAGGAGAAAACATGTTGCGCCGACCCCAGGTGA

Protein

MNVRGSLKVAPVTEKLRSARLGWYGHVIRRNENEVGKKMLTMNVEGYRGRGRPKKKWVDCVKDDMGKRGVSEGMVYDRRVWKEKTCCADPR

Uniprot

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A016SZZ3   A0A0C2FK24   A0A3Q0JQ03   A0A016SDN2   A0A2A2JK32   H3A9W7   A0A016VYQ7   A0A016UE98   A0A016WFX2   A0A016VQL7   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016VED9   A0A0N4YNB7   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A016VNT7   A0A016UG54   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A3Q0ISK7   A0A016SIC4   A0A016UBL7   A0A016S9A4   A0A016U5Z2   A0A016VD78   A0A0N4XHG6   A0A016S5Y5   A0A016VTA3   A0A016VFS4   A0A016VLS9   A0A016UAZ5   A0A016TQG5   A0A016SNX4   A0A016SZU3   A0A016WVF2   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A016VC06   A0A016WMJ7   A0A016SAA3   A0A016TN23   A0A016SZL8   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   H3AQJ4   W5NNY6   A0A016SBS5   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A016TSJ2   W5NL76   A0A016SQS9   A0A183FMV2   A0A3P7XT20   A0A0N4YLT6   A0A183GTU8   A0A3P8IKY2   A0A016UQR3   A0A183GD02   A0A3P8AUP2   A0A3P7Z886   A0A016TU56   A0A016WWY5   A0A016TV72   A0A183FY09   A0A3P8AX44   H3A990   A0A183GTH1   A0A3P8IIS2   A0A016TRL9   A0A016S2P3   A0A016X2X2   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A016X2P5   A0A016VL18   A0A016SNG4   A0A016RXP6   A0A183GT84   A0A3P8DS65   A0A016WLS1   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3  

Pubmed

28756777    26354079    25730766    9215903   

EMBL

NWSH01001232    PCG72026.1    KZ150002    PZC75290.1    NWSH01004369    PCG65177.1    + More
KZ150034    PZC74657.1    KZ150032    PZC74715.1    KQ459581    KPI99130.1    KZ150166    PZC72650.1    JARK01001491    EYB95904.1    KN768094    KIH47114.1    JARK01001582    EYB88451.1    LIAE01010387    PAV62045.1    AFYH01208402    JARK01001339    EYC31903.1    JARK01001380    EYC13251.1    JARK01000336    EYC38182.1    JARK01001342    EYC29596.1    UZAH01029847    VDP08183.1    JARK01001347    EYC26019.1    UYSL01023630    VDL82448.1    UZAH01031291    VDP14793.1    JARK01001343    EYC28702.1    JARK01001379    EYC13548.1    UZAH01032715    VDP23439.1    JARK01001560    EYB90061.1    JARK01001384    EYC12232.1    JARK01001602    EYB87210.1    JARK01001507    JARK01001392    JARK01001372    EYB94492.1    EYC10272.1    EYC15469.1    EYC25574.1    UYSL01001919    VDL65558.1    JARK01001630    EYB85649.1    JARK01001341    EYC29983.1    EYC25573.1    EYC28385.1    JARK01001383    EYC12479.1    JARK01001481    JARK01001420    EYB96960.1    EYC04966.1    JARK01001534    EYB92051.1    EYB95906.1    JARK01000107    EYC42998.1    UZAH01001522    VDO19785.1    JARK01001348    EYC24955.1    JARK01000211    EYC40482.1    JARK01001601    EYB87346.1    JARK01001494    JARK01001424    EYB95586.1    EYC04409.1    EYB95905.1    UZAH01025623    VDO67507.1    UZAH01031516    VDP15986.1    UZAH01027307    VDO90480.1    UZAH01036764    VDP46995.1    UZAH01004968    VDO28364.1    AFYH01190171    AHAT01020685    JARK01001594    EYB87754.1    UZAH01036784    VDP47042.1    JARK01001418    EYC05373.1    AHAT01025998    JARK01001524    EYB92930.1    UZAH01026244    VDO77671.1    UYSL01023169    VDL81812.1    UZAH01039226    VDP55766.1    JARK01001365    EYC17749.1    UZAH01031849    VDP18192.1    UZAH01027888    VDO95900.1    JARK01001413    EYC06291.1    JARK01000073    EYC44076.1    EYC06288.1    UZAH01027944    VDO96393.1    AFYH01230290    UZAH01038994    VDP55126.1    EYC05028.1    JARK01001646    EYB84786.1    JARK01000005    EYC46181.1    UZAH01001784    VDO19994.1    EYC46180.1    JARK01001345    EYC27463.1    JARK01001532    EYB92233.1    JARK01001678    EYB83113.1    UZAH01038793    VDP54537.1    JARK01000223    EYC40242.1    UZAH01027446    VDO91691.1   

Proteomes

UP000218220    UP000053268    UP000024635    UP000079169    UP000218231    UP000008672    + More
UP000050761    UP000038043    UP000271162    UP000018468   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A016SZZ3   A0A0C2FK24   A0A3Q0JQ03   A0A016SDN2   A0A2A2JK32   H3A9W7   A0A016VYQ7   A0A016UE98   A0A016WFX2   A0A016VQL7   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016VED9   A0A0N4YNB7   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A016VNT7   A0A016UG54   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A3Q0ISK7   A0A016SIC4   A0A016UBL7   A0A016S9A4   A0A016U5Z2   A0A016VD78   A0A0N4XHG6   A0A016S5Y5   A0A016VTA3   A0A016VFS4   A0A016VLS9   A0A016UAZ5   A0A016TQG5   A0A016SNX4   A0A016SZU3   A0A016WVF2   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A016VC06   A0A016WMJ7   A0A016SAA3   A0A016TN23   A0A016SZL8   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   H3AQJ4   W5NNY6   A0A016SBS5   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A016TSJ2   W5NL76   A0A016SQS9   A0A183FMV2   A0A3P7XT20   A0A0N4YLT6   A0A183GTU8   A0A3P8IKY2   A0A016UQR3   A0A183GD02   A0A3P8AUP2   A0A3P7Z886   A0A016TU56   A0A016WWY5   A0A016TV72   A0A183FY09   A0A3P8AX44   H3A990   A0A183GTH1   A0A3P8IIS2   A0A016TRL9   A0A016S2P3   A0A016X2X2   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A016X2P5   A0A016VL18   A0A016SNG4   A0A016RXP6   A0A183GT84   A0A3P8DS65   A0A016WLS1   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3  

KEGG

101740536    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101740536

GO

GO:0016021  

Length:

91

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.35513

outside

1  -  91

 

 

Pi

179.669457

Theta

140.497999

Tajima's D

0.844349

CLR

0.322774

CSRT

0.610269486525674

Interpretation

Uncertain