Gene

KWMTBOMO09700

Pre Gene Modal

BGIBMGA012884

Annotation

Alpha-tocopherol_transfer_protein_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr16(+):7516057-7517957      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.38

CDS

ATGAGAATTAAAGGTATTCATCTGATAACGACATCTAAATTGGTCGAAATCATAATTGGAATATTTAGAAAAGCATTGGGAACCAAAGTCGGAAATAGGATCCATGTGCACGCTGATTTGGAGTCTTTGCACAAACATGTATCAAAGGACGTTCTGCCTGTCGAATTAGGTGGCTCGGAAGGATCTTTGGTTAAATTGCATGATCAAAGGATTGAAGTATTCACATCCAAAGAAAACTTGGAATATTTCGAAAGAGTTTCTAAATTTGGCACAGAGGAGAAGTACCGACCGAAGGGACAGTTTAGCGAGCTGCACATGGGAATGACAGGGTCATTCAGAAATTTACGCGTCGACTGA

Protein

MRIKGIHLITTSKLVEIIIGIFRKALGTKVGNRIHVHADLESLHKHVSKDVLPVELGGSEGSLVKLHDQRIEVFTSKENLEYFERVSKFGTEEKYRPKGQFSELHMGMTGSFRNLRVD

Uniprot

H9JTM2   A0A194PZV1   A0A2H1UZW6   A0A194R1B9   A0A194PZV7   A0A2A4J6B5   + More
A0A194R247   A0A0S2Z393   A0A2W1BF53   A0A2H1VU69   A0A2H4RMT7   A0A2H1WD56   A0A2A4IUI0   A0A2W1BJJ9   A0A2W1BCD2   A0A212FN73   A0A2A4J610   A0A0S2Z358   A0A2H4RMT4   A0A2W1BCA0   A0A3S2L7M8   A0A0S2Z343   A0A437BAW6   A0A2H4RMP8   A0A0L7L2Y4   A0A3B0ENL0   A0A194R1M2   A0A2W1BGS3   A0A194Q0M6   A0A2H1V516   A0A2A4J4G2   A0A1E1VYT1   A0A2H4RMU5   A0A2A4JMX0   A0A2H4RMU0   A0A2H1W264   A0A0S2Z354   A0A2H4RMR6   A0A212FN16   A0A2A4JNW0   A0A3S2PCJ5   A0A2H1W3J3   A0A2H1WZK0   A0A0S2Z2V1   A0A0S2Z340   H9JKR6   A0A2H1W0Z0   A0A2H1WHW8   A0A2H4RMT2   A0A2H4RMS7   H9JKR5   A0A2A4JNK7   A0A0L7KIG8   A0A0L7KW07   A0A0L7L3C1   A0A194R2X0   A0A2H1V3H4   A0A023F5G9   A0A2H4RMR5   A0A2H4RMR2   A0A2W1BI70   A0A194Q621   A0A0L7K3G5   A0A224XW15   A0A212FN55   A0A3S2NCI1   A0A2H1W2K0   D2A5R3   A0A3S2NMH0   A0A2H4RMR8   A0A2H1VXT5   A0A2H4RMP7   A0A2H4RMV1   A0A1B0CUX6   A0A0N7EI05   A0A2H4RMS8   H9JTM4   T1I228   A0A0S2Z362   A0A3S2NSP3   A0A2H1VM17   A0A2H1WDV2   A0A2W1BJA3   W8C7Z2   A0A1B6L485   A0A0L7L2U1   A0A3S2LZD4   A0A2A4J2F6   A0A2H4RMS9   A0A2H1VYX3   A0A1B6GFR4   A0A212FN46   A0A336M9G9   A0A1B6CGR6   A0A1B6HJI9   A0A1B0GLZ3   A0A2H4RMS3   A0A336M2D4   A0A2S2R1Y2   B4LJA3  

Pubmed

19121390    26354079    25684408    28756777    29136137    22118469    + More
26227816    25474469    18362917    19820115    26371082    24495485    17994087    18057021   

EMBL

BABH01003546    KQ459582    KPI98857.1    ODYU01000041    SOQ34143.1    KQ460878    + More
KPJ11588.1    KPI98856.1    NWSH01003092    PCG66963.1    KPJ11589.1    KT943562    ALQ33320.1    KZ150143    PZC72921.1    ODYU01004475    SOQ44379.1    MG434643    ATY51949.1    ODYU01007545    SOQ50404.1    NWSH01006612    PCG63329.1    PZC72920.1    PZC72922.1    AGBW02007648    OWR55140.1    PCG66964.1    KT943545    ALQ33303.1    MG434630    ATY51936.1    PZC72919.1    RSAL01000100    RVE47537.1    KT943542    ALQ33300.1    RVE47538.1    MG434605    ATY51911.1    JTDY01003302    KOB69775.1    RBVL01000318    RKO09389.1    KPJ11587.1    PZC72915.1    KPI98858.1    ODYU01000690    SOQ35889.1    PCG66965.1    GDQN01011167    JAT79887.1    MG434650    ATY51956.1    NWSH01000951    PCG73397.1    MG434648    ATY51954.1    ODYU01005865    SOQ47185.1    KT943558    ALQ33316.1    MG434626    ATY51932.1    OWR55142.1    PCG73398.1    RVE47533.1    ODYU01006075    SOQ47608.1    ODYU01012268    SOQ58483.1    KT943555    ALQ33313.1    KT943544    ALQ33302.1    BABH01011650    BABH01011651    ODYU01005386    SOQ46174.1    ODYU01008754    SOQ52627.1    MG434631    ATY51937.1    MG434633    ATY51939.1    BABH01011652    PCG73399.1    JTDY01009789    KOB62679.1    JTDY01005025    KOB67462.1    KOB69774.1    KPJ11590.1    ODYU01000500    SOQ35381.1    GBBI01002319    JAC16393.1    MG434624    ATY51930.1    MG434625    ATY51931.1    PZC72917.1    KPI98855.1    JTDY01014419    KOB52032.1    GFTR01004285    JAW12141.1    OWR55139.1    RVE47534.1    SOQ47186.1    KQ971345    EFA05407.1    RSAL01009678    RVE39761.1    MG434628    ATY51934.1    ODYU01005115    SOQ45661.1    MG434603    ATY51909.1    MG434656    ATY51962.1    AJWK01029765    KT781079    MG434657    ALF12134.1    ATY51963.1    MG434632    ATY51938.1    BABH01003539    BABH01003540    ACPB03016282    KT943537    ALQ33295.1    RVE47536.1    ODYU01003303    SOQ41879.1    ODYU01008002    SOQ51248.1    PZC72916.1    GAMC01007758    GAMC01007756    JAB98799.1    GEBQ01021517    JAT18460.1    KOB69777.1    RVE47535.1    NWSH01003956    PCG65620.1    MG434629    ATY51935.1    ODYU01005307    SOQ46031.1    GECZ01008495    JAS61274.1    OWR55143.1    UFQT01000743    SSX26885.1    GEDC01024699    JAS12599.1    GECU01032846    JAS74860.1    AJVK01009188    MG434627    ATY51933.1    UFQS01000428    UFQT01000428    SSX03855.1    SSX24220.1    GGMS01014782    MBY83985.1    CH940648    EDW60483.1    KRF79434.1   

Proteomes

UP000005204    UP000053268    UP000053240    UP000218220    UP000007151    UP000283053    + More
UP000037510    UP000276569    UP000007266    UP000092461    UP000015103    UP000092462    UP000008792   

PRIDE

H9JTM2    H9JKR6    H9JKR5    H9JTM4   

Pfam

PF00650   CRAL_TRIO        + More
PF01359   Transposase_1

Interpro

IPR036865   CRAL-TRIO_dom_sf        + More
IPR001251   CRAL-TRIO_dom       
IPR036273   CRAL/TRIO_N_dom_sf       
IPR001888   Transposase_1       
IPR011074   CRAL/TRIO_N_dom       

SUPFAM

SSF52087   SSF52087        + More
SSF46938   SSF46938       

Gene 3D

3.40.525.10    

CDD

cd00170  SEC14

ProteinModelPortal

H9JTM2   A0A194PZV1   A0A2H1UZW6   A0A194R1B9   A0A194PZV7   A0A2A4J6B5   + More
A0A194R247   A0A0S2Z393   A0A2W1BF53   A0A2H1VU69   A0A2H4RMT7   A0A2H1WD56   A0A2A4IUI0   A0A2W1BJJ9   A0A2W1BCD2   A0A212FN73   A0A2A4J610   A0A0S2Z358   A0A2H4RMT4   A0A2W1BCA0   A0A3S2L7M8   A0A0S2Z343   A0A437BAW6   A0A2H4RMP8   A0A0L7L2Y4   A0A3B0ENL0   A0A194R1M2   A0A2W1BGS3   A0A194Q0M6   A0A2H1V516   A0A2A4J4G2   A0A1E1VYT1   A0A2H4RMU5   A0A2A4JMX0   A0A2H4RMU0   A0A2H1W264   A0A0S2Z354   A0A2H4RMR6   A0A212FN16   A0A2A4JNW0   A0A3S2PCJ5   A0A2H1W3J3   A0A2H1WZK0   A0A0S2Z2V1   A0A0S2Z340   H9JKR6   A0A2H1W0Z0   A0A2H1WHW8   A0A2H4RMT2   A0A2H4RMS7   H9JKR5   A0A2A4JNK7   A0A0L7KIG8   A0A0L7KW07   A0A0L7L3C1   A0A194R2X0   A0A2H1V3H4   A0A023F5G9   A0A2H4RMR5   A0A2H4RMR2   A0A2W1BI70   A0A194Q621   A0A0L7K3G5   A0A224XW15   A0A212FN55   A0A3S2NCI1   A0A2H1W2K0   D2A5R3   A0A3S2NMH0   A0A2H4RMR8   A0A2H1VXT5   A0A2H4RMP7   A0A2H4RMV1   A0A1B0CUX6   A0A0N7EI05   A0A2H4RMS8   H9JTM4   T1I228   A0A0S2Z362   A0A3S2NSP3   A0A2H1VM17   A0A2H1WDV2   A0A2W1BJA3   W8C7Z2   A0A1B6L485   A0A0L7L2U1   A0A3S2LZD4   A0A2A4J2F6   A0A2H4RMS9   A0A2H1VYX3   A0A1B6GFR4   A0A212FN46   A0A336M9G9   A0A1B6CGR6   A0A1B6HJI9   A0A1B0GLZ3   A0A2H4RMS3   A0A336M2D4   A0A2S2R1Y2   B4LJA3  

PDB

1OIZ     E-value=7.0308e-05,     Score=103

KEGG

101737403    no KO assigned | (RefSeq) alpha-tocopherol transfer protein-like

GO

Length:

118

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.42642

Exp number, first 60 AAs:

0.42642

Total prob of N-in:

0.27610

outside

1  -  118

 

 

Pi

251.625246

Theta

197.885746

Tajima's D

0.947573

CLR

0

CSRT

0.651067446627669

Interpretation

Uncertain