Gene

KWMTBOMO09568

Pre Gene Modal

BGIBMGA013012

Annotation

olfactory_receptor_2_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr16(-):4439483-4440301      View in EpiBrowser

Full name

Odorant receptor      

Location in the cell

PlasmaMembrane   Reliability : 3.052

CDS

ATGATGACCAAGGTCAAGACGCAGGGCCTGGTCACAGACCTGATGCCCTGCATAAGATTACTGCAAGCAGCGGGCCACTTCTTATTCAATTATCATGCCGATACCTCCGGAATGAATATGCTCCTACGGAAAATATATTCGAGTGCCCATGCCGTGCTCATTGTCGTCCACTACATCTGCATGGGCATCAACATGGCACAATACAAGGACGAAGTCAACGAGCTCACGGCAAATACCATTACGGTCCTGTTTTTCGCTCACAGCATCATTAAGTTGGCATTCTTTGCGTTCAACTCTAAAAGTTTTTACAGGTAA

Protein

MMTKVKTQGLVTDLMPCIRLLQAAGHFLFNYHADTSGMNMLLRKIYSSAHAVLIVVHYICMGINMAQYKDEVNELTANTITVLFFAHSIIKLAFFAFNSKSFYR

Similarity

Belongs to the insect chemoreceptor superfamily. Heteromeric odorant receptor channel (TC 1.A.69) family.

Uniprot

Q7YT34   H9JU00   A0A0S1U2I3   B5MEJ8   I3Y3I7   A0A0U2RFK0   + More
H9XFD5   A7UGE1   A0A1B3B711   B5MEJ5   B6C755   A0A146JVN3   A0A1U9W0P1   Q8MMI4   A0A0B5A1E6   A0A075TD45   I1V1V9   E5KJL4   E5KJL5   A0A2H1VPE2   Q0MUT5   Q5I2A3   B6VCU1   A0A0P0F2D8   R9QVV2   U5NFY8   Q5D7J6   Q5QHV7   J7KF99   C1PHA7   M4NL03   A0A0E4B591   A0A1S5XXL1   A0A0P1JD94   A0A223HDF7   E7E207   A0A3G6V705   J7G1V0   D3J5H5   A0A223HD99   Q7YT35   A0A2R4SBD4   G9BLV3   A0A2K8GKR9   A0A0B5CN11   G9BLV6   G9BLV5   A0A0B5GID1   A0A097ITX9   G9BLV4   G9BLV2   A0A097IYL2   U5KJY5   D0EZE1   A0A194R291   A0A223HD43   C4MX28   B5MEK1   H9A5M2   A0A076E9A8   C1PHA8   E2S067   A0A076E5W5   E2S069   A0A1B3P5R0   A0A386NB18   A0A386H9D4   A0A0K0KG02   E2S068   E2S071   E2S072   F5CJE4   A0A345BET1   A0A212EN65   A0A140YWR4   E2S070   A0A0L7LQN7   A0A220D5Z4   A0A3S7SGT1   A0A0K1W013   A0A2H4NT96   A0A2Z4EY25   B2ZDZ6   B9VH08   A0A3G2KX47   A0A2P1JH84   S5U415   A0A0B5ITU4   A0A0L7QV02   A0A0U4DIR1   E0VHN8   A0A0H3W578   A0A0N9JVJ7   C0Z3R3   A0A0S3J2L6   A0A0C9PWC1   A0A1S5VFJ4   V9MVU4   G9J1I3   A1YWY0  

Pubmed

12827420    15545611    19121390    22646846    26657286    18057325    + More
18828844    12270037    25027790    28756777    23195879    26812239    23894529    25039606    15723778    23950722    28150741    30465940    22911835    20084285    22701634    28736530    25252791    24130875    26354079    19293399    22363688    27006164    24998398    27538507    29727827    22118469    26729427    26227816    29126322    29894821    30319455    29497384    23964849    26494014    20566863    25938508    26164593    18362917    19820115    26626891    28187311   

EMBL

AB100454    AJ555487    BAD69585.1    CAD88206.1    BABH01003841    KT020861    + More
ALM30348.1    AB263114    BAG71418.1    JQ794817    AFL70822.1    KP975160    ALT31679.1    JN867062    AFG73001.1    EU057178    ABU45983.2    KT588097    AOE48007.1    AB263111    GENK01000117    BAG71415.1    JAV45796.1    EF395366    ABQ82137.1    KX084453    GEDO01000046    ARO76408.1    JAP88580.1    KY365529    AQY16483.1    AJ487477    NWSH01000897    CAD31851.1    PCG73648.1    KJ542658    AJD81542.1    KF768657    KZ150073    AIG51851.1    PZC74007.1    JQ394904    AFI25169.1    HQ186284    ADQ13177.1    HQ186285    ADQ13178.1    ODYU01003404    SOQ42114.1    DQ845292    JQ811935    ABH10019.1    AFN22085.1    AY862142    AAW52583.1    FJ374688    ACJ06648.1    KR632987    ALJ33155.1    JX101681    AGF29886.1    KC960454    AGY14565.1    AY843204    AAX14773.1    AY485222    AAS49925.1    JX390608    RSAL01000093    AFQ94048.1    RVE47931.1    AB467318    BAH57973.1    JX910526    AGG91643.1    LC002697    BAR43445.1    KY399256    AQQ73487.1    LN885133    CUQ99422.1    KY283761    AST36420.1    HQ596409    ADT82677.1    MH193973    AZB49419.1    JX173647    AFP54145.1    GQ844877    ADB89179.1    KY283682    AST36341.1    AJ555486    CAD88205.1    MG581972    AVZ44715.1    HQ619212    AET06156.1    KX585321    ARO70214.1    KM678337    AJE25910.1    HQ619215    AET06159.1    HQ619214    AET06158.1    KM892411    AJF23826.1    KM597236    AIT69913.1    HQ619213    AET06157.1    HQ619211    AET06155.1    KM655573    AIT72022.1    KC526964    AGS41440.1    GQ923610    ACX54944.1    KQ460878    KPJ11634.1    KY283633    AST36292.1    EU791887    ACJ12928.2    AB263117    BAG71421.2    JN836672    AFC91712.1    KF487681    AII01079.1    AB467319    BAH57974.1    AB595945    BAJ23260.1    KF487648    AII01046.1    AB595947    BAJ23262.1    KX655981    AOG12930.1    MG587081    AYE19959.1    MG546597    AYD42220.1    KF513149    AII15784.1    AB595946    BAJ23261.1    AB595949    BAJ23264.1    AB595950    BAJ23265.1    JF714981    AEA76288.1    MG816570    AXF48755.1    AGBW02013713    OWR42934.1    KJ592712    AJF20962.1    AB595948    BAJ23263.1    JTDY01000319    KOB77714.1    KX618692    ARQ32245.1    MF625584    AXY83411.1    KT373968    AKW50880.1    KY750554    ATV96621.1    MG913127    AWV67916.1    EU647221    ACD40044.1    FJ546087    ACM18060.1    MH723588    AYN64391.1    MG766143    AVN97813.1    KC778527    KB465818    AGS43074.1    RLZ02183.1    KM893996    AJF94638.2    KQ414731    KOC62379.1    KT369093    ALX17413.1    DS235171    EEB12924.1    KP736145    AKK25151.1    KP963696    ALG36144.1    AM689918    KQ971345    CAM84014.1    EFA05687.1    KT381541    ALR72547.1    GBYB01005773    GBYB01005774    GBYB01013276    JAG75540.1    JAG75541.1    JAG83043.1    KY445468    AQN78403.1    JX472452    AGI62937.2    JN792581    AET85154.2    EF141511    ABM05966.1   

Proteomes

UP000005204    UP000218220    UP000283053    UP000053240    UP000007151    UP000037510    + More
UP000053825    UP000009046    UP000007266   

PRIDE

Q7YT34    H9JU00   

Pfam

PF02949   7tm_6        + More
PF00071   Ras

Interpro

IPR004117   7tm6_olfct_rcpt        + More
IPR020849   Small_GTPase_Ras-type       
IPR027417   P-loop_NTPase       
IPR001806   Small_GTPase       

SUPFAM

SSF52540   SSF52540       

ProteinModelPortal

Q7YT34   H9JU00   A0A0S1U2I3   B5MEJ8   I3Y3I7   A0A0U2RFK0   + More
H9XFD5   A7UGE1   A0A1B3B711   B5MEJ5   B6C755   A0A146JVN3   A0A1U9W0P1   Q8MMI4   A0A0B5A1E6   A0A075TD45   I1V1V9   E5KJL4   E5KJL5   A0A2H1VPE2   Q0MUT5   Q5I2A3   B6VCU1   A0A0P0F2D8   R9QVV2   U5NFY8   Q5D7J6   Q5QHV7   J7KF99   C1PHA7   M4NL03   A0A0E4B591   A0A1S5XXL1   A0A0P1JD94   A0A223HDF7   E7E207   A0A3G6V705   J7G1V0   D3J5H5   A0A223HD99   Q7YT35   A0A2R4SBD4   G9BLV3   A0A2K8GKR9   A0A0B5CN11   G9BLV6   G9BLV5   A0A0B5GID1   A0A097ITX9   G9BLV4   G9BLV2   A0A097IYL2   U5KJY5   D0EZE1   A0A194R291   A0A223HD43   C4MX28   B5MEK1   H9A5M2   A0A076E9A8   C1PHA8   E2S067   A0A076E5W5   E2S069   A0A1B3P5R0   A0A386NB18   A0A386H9D4   A0A0K0KG02   E2S068   E2S071   E2S072   F5CJE4   A0A345BET1   A0A212EN65   A0A140YWR4   E2S070   A0A0L7LQN7   A0A220D5Z4   A0A3S7SGT1   A0A0K1W013   A0A2H4NT96   A0A2Z4EY25   B2ZDZ6   B9VH08   A0A3G2KX47   A0A2P1JH84   S5U415   A0A0B5ITU4   A0A0L7QV02   A0A0U4DIR1   E0VHN8   A0A0H3W578   A0A0N9JVJ7   C0Z3R3   A0A0S3J2L6   A0A0C9PWC1   A0A1S5VFJ4   V9MVU4   G9J1I3   A1YWY0  

PDB

6C70     E-value=1.86501e-17,     Score=211

KEGG

692613    K22984 odorant receptor | (RefSeq) Or-2, R2; olfactory receptor 2

GO

GO:0016021   GO:0007165   GO:0004984   GO:0005549   GO:0005886   GO:0007608   GO:0005525   GO:0003924   GO:0050911  

PANTHER

PTHR21137  

Subcellular location

Cell membrane  

Length:

104

Number of predicted TMHs:

2

Exp number of AAs in TMHs:

43.50017

Exp number, first 60 AAs:

15.86301

Total prob of N-in:

0.93336

POSSIBLE N-term signal

sequence

inside

1  -  45

TMhelix

46  -  65

outside

66  -  74

TMhelix

75  -  97

inside

98  -  104

 

 

Pi

55.384704

Theta

51.920488

Tajima's D

-0.694331

CLR

422.140802

CSRT

0.195990200489976

Interpretation

Uncertain