Gene

KWMTBOMO09554

Annotation

mariner_transposase_[Atteva_punctella]

Location

Bomo_Chr16(+):4087126-4087573      View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear   Reliability : 2.61

CDS

ATGAACAGTGTACTCATTTGTGATTCTTTATTACAATGTAATGAAACCGAACCATTTTTGAAGAAGCTGATAACTGGTGATGAAAAGTGGATCACGTACGACAAGAACGTGCGAAAAAGGTCGTGGTCAAAGGCCGGTCAGGCTTCACAGACTGTGGCGAAACCCGGGTTAACTCGCAACAAGGTGACGCTGTGTGTGTGGTGGGATTGGAAGGGAATTATACATTATGAGCTGTTACCACCAGGCAGGACCATCGATTCTGAACTCTACTGCGAACAACTGATGAGGCAAGAAAGCAAGAAGTTGAGAGAAAGCGGCCAGAATTAA

Protein

MNSVLICDSLLQCNETEPFLKKLITGDEKWITYDKNVRKRSWSKAGQASQTVAKPGLTRNKVTLCVWWDWKGIIHYELLPPGRTIDSELYCEQLMRQESKKLRESGQN

Uniprot

O18569   A0A1L5BY00   Q23827   Q23828   A0A1L5BY14   Q23826   + More
O18589   Q05406   W8AAZ1   A0A034VTH3   A0A0J7KUA3   I6R7K9   I6QUJ9   A0A0K8UDX9   O18571   Q6I944   D3TQL4   A0A1W4W231   A0A2G9TH46   A0A0K8U854   A0A158NK29   O18577   O18588   Q6XLA0   A0A0K8UBE7   V9GZA9   Q6XL90   Q6XL95   Q6XL91   Q6XL98   Q6XL89   Q6XL88   Q6XL85   Q6XL97   D3TLF6   Q6XL93   Q6XL83   Q6I945   Q8I8E7   Q6XL99   Q6XL87   Q6XL94   Q6XL96   Q6XL86   A0A087T1E1   Q8I8E8   A0A068PEV7   O18580   Q8I8E6   A0A068PBT8   A0A087SW41   Q8I8E9   Q05345   A0A068PC42   A0A3L8DAH9   W8AJZ1   A0A068PCF5   A0A088A948   A0A024FRG5   A0A024FS63   A0A024FSG6   A0A024FS46   A0A024FSG0   A0A024FS59   A0A088AV82   A0A024FRV0   A0A024FRE1   A0A024FRD4   A0A024FR73   A0A024FRV5   A0A024FRJ2   A0A024FR99   A0A024FSF1   A0A158N9V2   A0A024FRD9   A0A1I7X3J6   A0A034W5S7   A0A024FSE8   A0A068PC48   A0A024FRI8   O18576   A0A068PBQ6   A0A087UEA8   A0A068PBQ0   A0A0L7QYB3   A0A0J7KP80   A0A087TM48   A0A024FSG8   A0A088ANT3   O18570   A0A068PEV1   A0A068PBU3   A0A068PCF8   A0A087T663   A0A088AW98   S4PF96   T2MC65   A0A158NRL0   A0A088AEJ4  

Pubmed

25527032    8384700    24495485    25348373    9087550    20353571    + More
21347285    15020471    30249741    23874975    23622113    24065732   

EMBL

U91342    AAC28136.1    KX930992    APL98285.1    L10502    AAA74585.1    + More
L10503    AAA28277.1    KX931002    APL98295.1    L10500    AAA28276.1    U91381    AAC28156.1    L10470    AAA28278.1    GAMC01021560    JAB84995.1    GAKP01012337    GAKP01012336    JAC46616.1    LBMM01003166    KMQ93871.1    JX035907    JX035909    AFM44961.1    JX035910    AFM44962.1    GDHF01027465    JAI24849.1    U91344    AAC28138.1    U04457    AAC47445.1    EZ423716    ADD19992.1    KZ366441    PIO57294.1    GDHF01029475    JAI22839.1    ADTU01018450    U91354    AAC28144.1    U91377    AAC28155.1    AY226478    AAP51082.1    GDHF01028317    JAI23997.1    L10475    AAA29145.1    AY226488    AAP51092.1    AY226483    AAP51087.1    AY226487    AAP51091.1    AY226480    AAP51084.1    AY226489    AAP51093.1    AY226486    AY226490    AAP51094.1    AY226503    AAP51097.1    AY226481    AAP51085.1    EZ422258    ADD18534.1    AY226485    AAP51089.1    AY226504    AY226505    AY226506    AAP51099.1    U04456    AAN86603.1    AY155492    AAO12863.1    AY226479    AAP51083.1    AY226491    AAP51095.1    AY226484    AAP51088.1    AY226482    AAP51086.1    AY226501    AAP51096.1    KK112946    KFM58930.1    AY155491    AAO12862.1    AB917813    BAP05478.1    U91358    AAC28147.1    AY155493    AAO12864.1    AB917803    BAP05477.1    KK112216    KFM57080.1    AY155490    AAO12861.1    L10430    AAA27731.1    AB917799    BAP05476.1    QOIP01000011    RLU17152.1    GAMC01021538    GAMC01021537    JAB85018.1    AB917776    BAP05474.1    AB849173    BAO79486.1    AB849182    BAO79495.1    AB849179    BAO79492.1    AB849171    BAO79485.1    AB849174    BAO79487.1    AB849177    BAO79490.1    AB849176    BAO79489.1    AB849222    BAO79498.1    AB849175    BAO79488.1    AB849139    BAO79478.1    AB849181    BAO79494.1    AB849215    BAO79496.1    AB849140    AB849146    BAO79483.1    AB849145    BAO79482.1    ADTU01009654    AB849180    BAO79493.1    GAKP01008016    JAC50936.1    AB849137    BAO79477.1    AB917917    AB917922    BAP05481.1    AB849178    BAO79491.1    U91353    AAC28143.1    AB917916    BAP05480.1    KK119429    KFM75697.1    AB917778    BAP05475.1    KQ414692    KQ414609    KOC63610.1    KOC69253.1    LBMM01004714    KMQ92152.1    KK115851    KFM66187.1    AB849220    BAO79497.1    U91343    AAC28137.1    AB917772    BAP05473.1    AB917919    BAP05482.1    AB917817    BAP05479.1    KK113615    KFM60602.1    GAIX01004127    JAA88433.1    HAAD01003507    CDG69739.1    ADTU01024041   

Proteomes

UP000036403    UP000192221    UP000005205    UP000054359    UP000279307    UP000005203    + More
UP000095283    UP000053825   

Pfam

PF01359   Transposase_1        + More
PF17906   HTH_48
PF01498   HTH_Tnp_Tc3_2
PF04967   HTH_10

Interpro

IPR001888   Transposase_1        + More
IPR002492   Transposase_Tc1-like       
IPR041426   Mos1_HTH       
IPR007050   HTH_bacterioopsin       
IPR036388   WH-like_DNA-bd_sf       
IPR011991   ArsR-like_HTH       
IPR009057   Homeobox-like_sf       

SUPFAM

SSF46689   SSF46689       

Gene 3D

1.10.10.10    

CDD

cd00090  HTH_ARSR

ProteinModelPortal

O18569   A0A1L5BY00   Q23827   Q23828   A0A1L5BY14   Q23826   + More
O18589   Q05406   W8AAZ1   A0A034VTH3   A0A0J7KUA3   I6R7K9   I6QUJ9   A0A0K8UDX9   O18571   Q6I944   D3TQL4   A0A1W4W231   A0A2G9TH46   A0A0K8U854   A0A158NK29   O18577   O18588   Q6XLA0   A0A0K8UBE7   V9GZA9   Q6XL90   Q6XL95   Q6XL91   Q6XL98   Q6XL89   Q6XL88   Q6XL85   Q6XL97   D3TLF6   Q6XL93   Q6XL83   Q6I945   Q8I8E7   Q6XL99   Q6XL87   Q6XL94   Q6XL96   Q6XL86   A0A087T1E1   Q8I8E8   A0A068PEV7   O18580   Q8I8E6   A0A068PBT8   A0A087SW41   Q8I8E9   Q05345   A0A068PC42   A0A3L8DAH9   W8AJZ1   A0A068PCF5   A0A088A948   A0A024FRG5   A0A024FS63   A0A024FSG6   A0A024FS46   A0A024FSG0   A0A024FS59   A0A088AV82   A0A024FRV0   A0A024FRE1   A0A024FRD4   A0A024FR73   A0A024FRV5   A0A024FRJ2   A0A024FR99   A0A024FSF1   A0A158N9V2   A0A024FRD9   A0A1I7X3J6   A0A034W5S7   A0A024FSE8   A0A068PC48   A0A024FRI8   O18576   A0A068PBQ6   A0A087UEA8   A0A068PBQ0   A0A0L7QYB3   A0A0J7KP80   A0A087TM48   A0A024FSG8   A0A088ANT3   O18570   A0A068PEV1   A0A068PBU3   A0A068PCF8   A0A087T663   A0A088AW98   S4PF96   T2MC65   A0A158NRL0   A0A088AEJ4  

PDB

4U7B     E-value=1.5203e-16,     Score=204

KEGG

101738332    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101738332

GO

GO:0015074   GO:0003677   GO:0006313   GO:0008168  

Length:

108

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00019

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.12592

outside

1  -  108

 

 

Pi

234.257169

Theta

96.799368

Tajima's D

4.3227

CLR

0

CSRT

0.9998000099995

Interpretation

Uncertain