Pre Gene Modal
BGIBMGA007893
Annotation
PREDICTED:_glycine-rich_cell_wall_structural_protein_1.8-like_[Bombyx_mori]
Location in the cell
Nuclear Reliability : 2.121
Sequence
CDS
ATGGCTTTCAAAATTGCTTGCCTAATATTGGCAGTAGCCATAGCAGTACAAGGCTTACCTCATCTTGGACTCGATTTAAATATCGGCGCTGGCCTTGGTCTTGGTGGACGTGGACACGGACATAAGCACGGCGACGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGAAATGGAGACGATGACGGTGGACTGGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTGGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTAGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATCCATGGACGACATGGATATGGAAATCGAGACGGTGACGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGACATGGTGACGCTGGACTAGGACTAGATGCTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTGGGACTAGGTGTTGGTGCTAGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTAGGACTAGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATCCATGGACGACATGGATATGGAAATCGAGACGGTGACGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGACATAGTGACGCTGGACTAGGACTAGATGCTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTGGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAACGCAAACGGCGACGCTGGACTAGGACTAGGTGTTGGTGCTGGAATCCATGGACGACATGGATATGGAAATCGAGACGGTGACGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGACATGGAAATAGAGACGGTGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGCTTATGGACATGGACATGGAAATAGAGACGGTAACGCTGAGCTAGGAGTTGGTGCTGGAATTCATGGACATGGGAATGGAGACGGTAACGCTGGACTAGAAGTTGGTCCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGACACGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTAGGAGTCGGTGCTGGTATCGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGATGGTGACGCTGGACTAGGAGTCGGTGCTGGTGTCGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGAGACGCTGGACTAGGAGTCGGTGCTGGTGTCGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTTTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCAAGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGCTAATGGACATAGACATGGAAATGGAGACGGTAACGCTGAGCTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGTTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACAGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGATGCTGGAGTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGCTCATGGACATGGACACGGAAATGGAGATGGTGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGCTTATGGACATGAACATGGAAATGGAGACGGTAACGCTGAGCTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGGCTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGGCGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCCGGAATTCATGGACATGAACATGGAAATGGAGACGGTAACGCTGAGCTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGGCTAGGAGTTGGTGCTGTTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACAGTGACACTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGATGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGATGCTGGAGTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGCTCATGGACATGGACACGGAAATGGAGATGGTGACGCTGGACTAGGAGTTGGTGCTGGTATTGGAGTTCATGGACATGGGCATGGAAATGGAGACGGTGACGCTGGGCTAGGAGTTGGTGCTGGTGTTGGAGTTCATGGACATGGACATGGAAATGGAGACGGTGGCGCTGGACTAGGACTAGGTATTGGTGCCGGAATTCATGGACATGGCCATGGACATGGAGACAATGACGCGGGACTAGGACTAGGCGTTAGTGCTGGAATTCATGGACATGGTAATGGAAATGGAGACAATAATGCTGGACTAGGACTCGGTGTTGGTGTTGGAAGTTATGGCCATGGTAACGGATACAGAAATGGTGACGCTGGCCTAGGACTCGGTGTTGGTGTTGGAGCTCATGGCCATGGTAACGGATACGGACATGGTGACGCAGGGCTAGGACTCGGTGTCAGTGCCGAATCTCACGGACATGGTTACGGCCATGGTTATCACGATTTCGGACTCGGAGGTGGAGCCAATGTTGGTACTGGATTATACGGACGTGGTAGCACTGACGGCTACCGTCATGATGGAGCTAAGCTAGGTCTAGGAATAGGCGTCGGAGGTGGAGCAGGCGCTGGTTTATCTGACTTTGGATTTGGTGCCTTTAGCGGCTTAGGCAGACGCCACGATTATGGATTCGACAGATATGGCATTAACGGCTATAGAAACTATGGTTACCGAGACTTTGGCCACGGCAATTACCCTGGCTACAATAATATAATCTACAACACAATGTAA
Protein
MAFKIACLILAVAIAVQGLPHLGLDLNIGAGLGLGGRGHGHKHGDAGLGLGIGAGIHGHGNGDDDGGLGLGVGAGIHGHGHGNGDGDAGLGLGVGAGIHGHGHGNGDGDAGLGLGVGAGIHGRHGYGNRDGDAGLGLGIGAGIHGHGHGNGHGDAGLGLDAGAGIHGHGHGNGDGDAGLGLGVGARIHGHGHGNGDGDAGLGLGLGVGAGIHGRHGYGNRDGDAGLGLGIGAGIHGHGHGNGHSDAGLGLDAGAGIHGHGHGNGDGDAGLGLGVGAGIHGHGHGNANGDAGLGLGVGAGIHGRHGYGNRDGDAGLGLGIGAGIHGHGHGNRDGDAGLGVGAGVGAYGHGHGNRDGNAELGVGAGIHGHGNGDGNAGLEVGPGVGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGVHGHGHGNGDGDTGLGVGAGFGVHGHGHGNGDGDTGLGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAGIGVQGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGANGHRHGNGDGNAELGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAVIGVHGHGHGNGDGDTGLGVGAGVGVHGHGHGNGDSDTGLGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGVGVGAGVGAHGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGAYGHEHGNGDGNAELGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGVHGHGHGNGDGGAGLGLGIGAGIHGHEHGNGDGNAELGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAVIGVHGHGHGNGDGDTGLGVGAGVGVHGHGHGNGDSDTGLGVGAGVGVHGHGHGNGDDDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGVGVGAGVGAHGHGHGNGDGDAGLGVGAGIGVHGHGHGNGDGDAGLGVGAGVGVHGHGHGNGDGGAGLGLGIGAGIHGHGHGHGDNDAGLGLGVSAGIHGHGNGNGDNNAGLGLGVGVGSYGHGNGYRNGDAGLGLGVGVGAHGHGNGYGHGDAGLGLGVSAESHGHGYGHGYHDFGLGGGANVGTGLYGRGSTDGYRHDGAKLGLGIGVGGGAGAGLSDFGFGAFSGLGRRHDYGFDRYGINGYRNYGYRDFGHGNYPGYNNIIYNTM
Summary
Uniprot
ProteinModelPortal
Ontologies
GO
Topology
SignalP
Position: 1 - 18,
Likelihood: 0.987869
Length:
1194
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
15.2167
Exp number, first 60 AAs:
10.01503
Total prob of N-in:
0.49176
POSSIBLE N-term signal
sequence
outside
1 - 1194
Population Genetic Test Statistics
Pi
43.032243
Theta
53.390523
Tajima's D
-0.827986
CLR
113.3507
CSRT
0.172691365431728
Interpretation
Uncertain
