Gene

KWMTBOMO08784

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr15(+):5345138-5346087      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.144

CDS

ATGAAATTAATGGTGGTGGATCGTGCAAATGTTCTAAGATTGAATGGGGCGCTTGGATTAGAGGTTGTAGACGAATTCGTGTATCTCGGGTCCTGCATCAGCAACAAAGGCTCATGTGAAACTGACGTGCGCCGACGTATCGGAATGGCTAAAAGTGCGATGTCTCAGCTACAGAAGATCTGGAAGAATAGAGGGATAGGCCTGAAAACTAAAACCAGACTGGTGCGGACTCTTGTTTTCTCTATCTTCTTGTATGGAGCTGAGACATGGACGTTGAAAGCAGCAGACCGAATGCGCATCGATGCTTTCGAAATGTGGTGTTGGAGACGCATGCTAAGAATTCCGTGGACAGCCTTCCGGACTAACGTGTCGATATTGAAGCAACTGGGCATCAAAATCAGACTGTCTACTGTATGTCTGAAGCGGATCCTCGAATATTTTGGTCACATTGCGAGGAAAGACGGCGATAACCTGGAAAAACTTATGATCACAGGGAAAGTTGAAGGCAACAGATCTAGAGGCCGCAACCATACTCGTTGGTCCGATCAGATCCGCACCGCTTTGGACAGTACAGTGTACAGCGCGCTGCATGACGCCGTGGACAGAGGGAAAGTGGAAAAAGATCCTAAGATTGAAGCTCATGGGTGA

Protein

MKLMVVDRANVLRLNGALGLEVVDEFVYLGSCISNKGSCETDVRRRIGMAKSAMSQLQKIWKNRGIGLKTKTRLVRTLVFSIFLYGAETWTLKAADRMRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNVSILKQLGIKIRLSTVCLKRILEYFGHIARKDGDNLEKLMITGKVEGNRSRGRNHTRWSDQIRTALDSTVYSALHDAVDRGKVEKDPKIEAHG

Uniprot

D7F163   D7F172   A0A2H1VU13   D7F168   D7F161   D7F162   + More
A0A3S2L0R7   A0A2H1V742   A0A2W1BGD9   D5LB39   D7F175   A0A2H1VNK5   D7F167   A0A437AU38   A0A2G8JE23   A0A2G8JVI4   A0A402EVI9   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8L6P4   A0A2G8K796   A0A402EPS0   A0A402ELI2   A0A402F820   A0A402EUI3   A0A402EKM6   A0A402F7K5   A0A402EU36   A0A402EU18   A0A402F4B4   A0A402EZ91   A0A402EVB7   A0A402EX62   A0A402F218   A0A402FFT5   A0A402EL74   A0A402EKQ9   A0A402F0Z3   A0A402FRA5   A0A402E7Y2   A0A402EP91   A0A402EZQ5   A0A402EBN8   A0A402EL02   A0A402F9C0   A0A402EJN5   A0A402F3R2   A0A402F0P9   A0A402EJ80   A0A402EBI1   A0A402FA63   A0A402EKH9   A0A402F360   A0A402F6A8   A0A402EWU1   A0A402EZ24   A0A402EKQ0   A0A402EKS1   A0A402F524   A0A402EKM7   A0A402F166   A0A402FL85   A0A402ECE7   A0A402FDS4   A0A402FJR0   A0A402FWJ9   A0A402EZT0   A0A402ETF8   A0A402EH06   A0A402F0A9   A0A402EJ24   A0A402ECI4   A0A402FDL1   A0A402EBU4   A0A402F4P0   A0A402E850   A0A402EL56   A0A402FLC1   A0A402EBM0   A0A402ET00   A0A402F1V1   A0A402EYN6   A0A402FLP7   A0A402EQH3   A0A402EBL6   A0A402F241   A0A402EZ17   A0A402EKD3   A0A402E7Y8   A0A402EWI9   A0A402ECT4   A0A402EWP4   A0A402EZI8   A0A402FN33   A0A402EL71   A0A402EW85   A0A402FFD1   A0A402EBA1   A0A402FRC2   A0A402E6L1  

Pubmed

20470440    28756777    29023486   

EMBL

FJ265548    ADI61816.1    FJ265557    ADI61825.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    + More
FJ265553    ADI61821.1    FJ265546    ADI61814.1    FJ265547    ADI61815.1    RSAL01000289    RVE42931.1    ODYU01001007    SOQ36619.1    KZ150203    PZC72267.1    GU815090    ADF18553.1    FJ265560    ADI61828.1    ODYU01003523    SOQ42419.1    FJ265552    ADI61820.1    RSAL01000427    RVE41762.1    MRZV01002322    PIK33998.1    MRZV01001207    PIK39730.1    BDOT01000049    GCF48199.1    MRZV01001216    PIK39650.1    MRZV01000994    PIK41715.1    MRZV01000196    PIK55924.1    MRZV01000817    PIK43880.1    BDOT01000029    GCF46213.1    BDOT01000022    GCF45060.1    BDOT01000136    GCF52589.1    BDOT01000045    GCF47862.1    BDOT01000018    GCF44776.1    BDOT01000127    GCF52250.1    BDOT01000043    GCF47709.1    GCF47683.1    BDOT01000102    GCF51323.1    BDOT01000067    GCF49499.1    GCF48161.1    BDOT01000058    GCF48816.1    BDOT01000084    GCF50558.1    BDOT01000240    GCF55388.1    BDOT01000020    GCF44950.1    GCF44774.1    BDOT01000075    GCF50047.1    BDOT01000476    GCF58985.1    BDOT01000002    GCF40281.1    BDOT01000028    GCF46025.1    BDOT01000069    GCF49671.1    BDOT01000005    GCF41659.1    GCF44896.1    BDOT01000150    GCF53026.1    BDOT01000016    BDOT01001142    GCF44381.1    GCF61716.1    BDOT01000096    GCF51106.1    BDOT01000074    GCF50011.1    BDOT01000015    GCF44244.1    GCF41533.1    BDOT01000161    GCF53338.1    GCF44715.1    BDOT01000090    GCF50896.1    BDOT01000123    GCF52043.1    BDOT01000055    GCF48663.1    BDOT01000065    GCF49384.1    GCF44764.1    GCF44759.1    BDOT01000110    GCF47846.1    GCF51642.1    GCF44750.1    BDOT01000078    GCF50245.1    BDOT01000333    GCF57251.1    BDOT01000006    GCF41929.1    BDOT01000024    BDOT01000208    GCF45062.1    GCF45289.1    GCF54601.1    BDOT01000298    GCF56713.1    BDOT01000816    GCF60864.1    GCF49634.1    BDOT01000040    GCF47495.1    BDOT01000011    GCF43472.1    BDOT01000073    GCF49926.1    GCF44200.1    GCF41907.1    BDOT01000203    GCF54495.1    GCF41638.1    GCF49423.1    BDOT01000105    GCF51453.1    GCF40389.1    GCF44946.1    BDOT01000335    GCF57283.1    GCF41639.1    BDOT01000038    GCF47337.1    BDOT01000082    GCF50401.1    BDOT01000063    GCF49303.1    GCF57285.1    BDOT01000031    GCF46419.1    GCF41567.1    BDOT01000083    GCF50491.1    BDOT01000066    GCF49478.1    BDOT01000017    GCF44644.1    GCF40329.1    BDOT01000054    GCF48586.1    GCF41954.1    GCF48642.1    GCF49500.1    BDOT01000374    GCF57846.1    GCF44937.1    BDOT01000052    GCF48459.1    BDOT01000234    GCF55219.1    GCF41453.1    BDOT01000484    GCF59029.1    BDOT01000001    GCF39783.1   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000288954   

PRIDE

D7F163    D7F172    D7F168    D7F161    D7F162    D5LB39    + More
D7F175    D7F167   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2
PF02146   SIR2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       
IPR029035   DHS-like_NAD/FAD-binding_dom       
IPR003000   Sirtuin       
IPR026590   Ssirtuin_cat_dom       
IPR030431   FAM189       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219        + More
SSF52467   SSF52467       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F163   D7F172   A0A2H1VU13   D7F168   D7F161   D7F162   + More
A0A3S2L0R7   A0A2H1V742   A0A2W1BGD9   D5LB39   D7F175   A0A2H1VNK5   D7F167   A0A437AU38   A0A2G8JE23   A0A2G8JVI4   A0A402EVI9   A0A2G8JVA1   A0A2G8K183   A0A2G8L6P4   A0A2G8K796   A0A402EPS0   A0A402ELI2   A0A402F820   A0A402EUI3   A0A402EKM6   A0A402F7K5   A0A402EU36   A0A402EU18   A0A402F4B4   A0A402EZ91   A0A402EVB7   A0A402EX62   A0A402F218   A0A402FFT5   A0A402EL74   A0A402EKQ9   A0A402F0Z3   A0A402FRA5   A0A402E7Y2   A0A402EP91   A0A402EZQ5   A0A402EBN8   A0A402EL02   A0A402F9C0   A0A402EJN5   A0A402F3R2   A0A402F0P9   A0A402EJ80   A0A402EBI1   A0A402FA63   A0A402EKH9   A0A402F360   A0A402F6A8   A0A402EWU1   A0A402EZ24   A0A402EKQ0   A0A402EKS1   A0A402F524   A0A402EKM7   A0A402F166   A0A402FL85   A0A402ECE7   A0A402FDS4   A0A402FJR0   A0A402FWJ9   A0A402EZT0   A0A402ETF8   A0A402EH06   A0A402F0A9   A0A402EJ24   A0A402ECI4   A0A402FDL1   A0A402EBU4   A0A402F4P0   A0A402E850   A0A402EL56   A0A402FLC1   A0A402EBM0   A0A402ET00   A0A402F1V1   A0A402EYN6   A0A402FLP7   A0A402EQH3   A0A402EBL6   A0A402F241   A0A402EZ17   A0A402EKD3   A0A402E7Y8   A0A402EWI9   A0A402ECT4   A0A402EWP4   A0A402EZI8   A0A402FN33   A0A402EL71   A0A402EW85   A0A402FFD1   A0A402EBA1   A0A402FRC2   A0A402E6L1  

KEGG

105842916    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC105842916

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

PANTHER

PTHR17615  

Length:

215

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

7.07512

Exp number, first 60 AAs:

0.01651

Total prob of N-in:

0.44880

outside

1  -  215

 

 

Pi

243.964223

Theta

160.113104

Tajima's D

1.646816

CLR

0.000004

CSRT

0.814459277036148

Interpretation

Uncertain