Gene

KWMTBOMO08781

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr15(+):5232559-5233478      View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear   Reliability : 2.692

CDS

ATGCGCAAAACCCTAGAGGAGTGGGATGGTGGCGTCACAGTTGGGGGCGTAAAGATCTCGAACTTACGATACGCTGATGATACCACATTAGTGGCGTCATCAGAAGAGGAAATGGAGGAGCTGCTGCGACGTCTGGTTATAGTTAGCGAGGAAATGGGACTAAAGATCAACCAGTCCAAAACAAAGATCATGATCGTGGATAAATACGGCACCCTTAACGAGAATAATATTCTTGGCCAATACGACATCGTCAAGACTTTCGTGTACCTCGGCTCGATTATTTCCAATAGAGGTGGATCGGAAACCGAAATAAGGCGACGCATCGGAATGGCCAAATCCGCTATGAGCCAGCTAAACAAAATATGGAGAGATCGAAACATACTCAAGAAAACGAAAGTGCAAATTGTTGAGACGCTCGTTTTCTTAATCTTTTTGTATGGGGCTGAGACCTGGATCTTGAAAGAGTCTGACAGGCGACGCATAGACGCGTTTGAGATGTGGTGCTGGCGGCGCATGTTGCGCATCCCTTGGACGGCTTTCCGGACGAACGCTTCCATCCTCAACGAGCTAAAAGTTGACCAGAGGCTATCCACCAAATGTCTATATAGAGTGCTCCAATACTTTGGTCATATAGCAAGAAAACCCTCTGACAACCTGGAGAGACTCATAGTGACGGGTAAAGTGGATGGAAGACGATCCAGAGGTCGTAGCCGAAAAAGATGGAGTGACCAAGTGTCTGAGTGTCTGGACATGAGACTGAGCCACGCACTTCACTGTGCCACAGACCGACATAAGTGGCTACAAATTACAAAAAAAGGTCACAGGCGGGCGCATCACGATGCTCAGCAATGA

Protein

MRKTLEEWDGGVTVGGVKISNLRYADDTTLVASSEEEMEELLRRLVIVSEEMGLKINQSKTKIMIVDKYGTLNENNILGQYDIVKTFVYLGSIISNRGGSETEIRRRIGMAKSAMSQLNKIWRDRNILKKTKVQIVETLVFLIFLYGAETWILKESDRRRIDAFEMWCWRRMLRIPWTAFRTNASILNELKVDQRLSTKCLYRVLQYFGHIARKPSDNLERLIVTGKVDGRRSRGRSRKRWSDQVSECLDMRLSHALHCATDRHKWLQITKKGHRRAHHDAQQ

Uniprot

D7F172   D7F163   D7F161   D7F168   A0A2W1BGD9   D7F162   + More
D7F167   A0A2H1VU13   A0A3S2L0R7   D7F175   D5LB39   A0A2G8JE23   A0A402EP91   A0A402EBU4   A0A402ECI4   A0A402ETC5   A0A402EBA1   A0A402EL65   A0A402EG93   A0A402FAF7   A0A402EF46   A0A402F596   A0A402EZ17   A0A402EQH3   A0A402FUK3   A0A402EWP4   A0A402ETE3   A0A402FLP7   A0A402EKQ9   A0A402FAC1   A0A402F0A9   A0A402EK07   A0A402FRC2   A0A402FAJ9   A0A402F444   A0A402ELP1   A0A402E7T0   A0A402EU50   A0A402F4B4   A0A402FAR1   A0A402E714   A0A402F758   A0A402ETA8   A0A402EZI8   A0A402EWZ2   A0A402EZ20   A0A402F4J0   A0A402F3F5   A0A402F4H0   A0A402FRB1   A0A402EYG3   A0A402F8Q6   A0A402E7S7   A0A402EWW2   A0A402F6F8   A0A402EWK5   A0A402F9M2   A0A402E7N2   A0A402ECQ6   A0A402EPJ2   A0A3Q1M4E7   A0A402F7K5   A0A402EKM7   A0A402F5B4   A0A402EL16   A0A402EV46   A0A402EKN8   A0A402EL59   A0A402E871   A0A2G8L6P4   A0A402F971   A0A402F7I8   A0A402EQ09   A0A402ESY2   A0A402ELI2   A0A402F3K4   A0A3Q1MCX3   A0A402EWK9   A0A402F382   A0A402ET23   A0A402EK57   A0A402F3Q6   A0A402F4T1   A0A402E825   A0A402EUZ9   A0A402EBJ8   A0A402F693   A0A2G8JVI4   A0A402E7I9   A0A402F9T4   A0A402ET45   A0A402F218   A0A402FFI9   A0A402E7Z5   A0A402E5P7   A0A402F7K8   A0A402ETD7   A0A402EH83  

Pubmed

20470440    28756777    29023486    19393038   

EMBL

FJ265557    ADI61825.1    FJ265548    ADI61816.1    FJ265546    ADI61814.1    + More
FJ265553    ADI61821.1    KZ150203    PZC72267.1    FJ265547    ADI61815.1    FJ265552    ADI61820.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    RSAL01000289    RVE42931.1    FJ265560    ADI61828.1    GU815090    ADF18553.1    MRZV01002322    PIK33998.1    BDOT01000028    GCF46025.1    BDOT01000005    BDOT01000065    GCF41638.1    GCF49423.1    BDOT01000006    GCF41907.1    BDOT01000039    GCF47378.1    GCF41453.1    BDOT01000020    GCF44940.1    BDOT01000010    GCF43212.1    BDOT01000165    GCF53438.1    BDOT01000008    GCF42801.1    BDOT01000105    GCF51467.1    BDOT01000066    GCF49478.1    BDOT01000031    GCF46419.1    BDOT01000648    GCF60106.1    BDOT01000055    GCF48642.1    BDOT01000040    GCF47493.1    BDOT01000335    GCF57285.1    BDOT01000018    GCF44774.1    BDOT01000163    GCF53402.1    BDOT01000073    GCF49926.1    BDOT01000016    GCF44533.1    BDOT01000484    GCF59029.1    GCF53435.1    BDOT01000101    GCF51285.1    BDOT01000022    GCF45125.1    BDOT01000002    GCF40240.1    BDOT01000043    GCF47717.1    BDOT01000102    GCF51323.1    BDOT01000168    GCF53540.1    GCF39995.1    BDOT01000130    GCF52365.1    GCF47371.1    BDOT01000067    GCF49500.1    BDOT01000015    BDOT01000148    GCF44364.1    GCF48654.1    GCF52988.1    GCF49387.1    BDOT01000104    GCF51438.1    BDOT01000089    GCF50820.1    BDOT01000103    GCF51376.1    BDOT01000474    GCF58974.1    BDOT01000062    GCF49174.1    BDOT01000143    GCF52806.1    GCF40256.1    BDOT01000054    GCF48637.1    BDOT01000116    GCF51880.1    GCF48602.1    BDOT01000153    GCF53117.1    GCF40190.1    GCF41961.1    GCF46132.1    BDOT01000127    GCF52250.1    GCF44750.1    BDOT01000111    GCF51686.1    GCF44894.1    BDOT01000048    GCF48010.1    GCF44767.1    GCF44935.1    GCF40380.1    MRZV01000196    PIK55924.1    BDOT01000149    GCF53002.1    GCF52369.1    BDOT01000029    GCF46280.1    GCF47356.1    GCF45060.1    BDOT01000096    GCF51115.1    GCF48608.1    BDOT01000090    GCF50913.1    BDOT01000038    GCF47291.1    GCF44549.1    BDOT01000094    GCF51029.1    GCF51451.1    GCF40355.1    GCF48031.1    GCF41553.1    BDOT01000112    GCF51757.1    MRZV01001207    PIK39730.1    GCF40140.1    BDOT01000156    GCF53186.1    GCF47377.1    BDOT01000084    GCF50558.1    BDOT01000229    GCF55077.1    GCF40308.1    BDOT01000001    GCF39524.1    BDOT01000134    GCF52506.1    GCF47419.1    BDOT01000011    GCF43541.1   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000288954    UP000009136   

PRIDE

D7F172    D7F163    D7F161    D7F168    D7F162    D7F167    + More
D7F175    D5LB39   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2
PF13863   DUF4200

Interpro

IPR000477   RT_dom        + More
IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf       
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR002138   Pept_C14_p10       
IPR025252   DUF4200       
IPR039034   INPP4       
IPR035892   C2_domain_sf       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10     2.60.40.150    

ProteinModelPortal

D7F172   D7F163   D7F161   D7F168   A0A2W1BGD9   D7F162   + More
D7F167   A0A2H1VU13   A0A3S2L0R7   D7F175   D5LB39   A0A2G8JE23   A0A402EP91   A0A402EBU4   A0A402ECI4   A0A402ETC5   A0A402EBA1   A0A402EL65   A0A402EG93   A0A402FAF7   A0A402EF46   A0A402F596   A0A402EZ17   A0A402EQH3   A0A402FUK3   A0A402EWP4   A0A402ETE3   A0A402FLP7   A0A402EKQ9   A0A402FAC1   A0A402F0A9   A0A402EK07   A0A402FRC2   A0A402FAJ9   A0A402F444   A0A402ELP1   A0A402E7T0   A0A402EU50   A0A402F4B4   A0A402FAR1   A0A402E714   A0A402F758   A0A402ETA8   A0A402EZI8   A0A402EWZ2   A0A402EZ20   A0A402F4J0   A0A402F3F5   A0A402F4H0   A0A402FRB1   A0A402EYG3   A0A402F8Q6   A0A402E7S7   A0A402EWW2   A0A402F6F8   A0A402EWK5   A0A402F9M2   A0A402E7N2   A0A402ECQ6   A0A402EPJ2   A0A3Q1M4E7   A0A402F7K5   A0A402EKM7   A0A402F5B4   A0A402EL16   A0A402EV46   A0A402EKN8   A0A402EL59   A0A402E871   A0A2G8L6P4   A0A402F971   A0A402F7I8   A0A402EQ09   A0A402ESY2   A0A402ELI2   A0A402F3K4   A0A3Q1MCX3   A0A402EWK9   A0A402F382   A0A402ET23   A0A402EK57   A0A402F3Q6   A0A402F4T1   A0A402E825   A0A402EUZ9   A0A402EBJ8   A0A402F693   A0A2G8JVI4   A0A402E7I9   A0A402F9T4   A0A402ET45   A0A402F218   A0A402FFI9   A0A402E7Z5   A0A402E5P7   A0A402F7K8   A0A402ETD7   A0A402EH83  

KEGG

101741398    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101741398

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

PANTHER

PTHR12187  

Length:

283

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

10.31896

Exp number, first 60 AAs:

0.00053

Total prob of N-in:

0.45638

outside

1  -  283

 

 

Pi

313.859777

Theta

163.973672

Tajima's D

2.786395

CLR

177.538813

CSRT

0.968351582420879

Interpretation

Uncertain