SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO08392
Pre Gene Modal
BGIBMGA009292
Annotation
PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101737331_[Bombyx_mori]
Full name
General odorant-binding protein 19d      
Alternative Name
Odorant-binding protein 19d
Pheromone-binding protein-related protein 2
Location in the cell
Nuclear   Reliability : 1.996
 

Sequence

CDS
ATGGCGCAGTCGTGCGTGATAAAGGTTCGGGCAACTCCGAAAGACGTGAGGGCTTATTTCACGAACTCTTCACCCGTTTCAAGATCCGGACAGTGCTTCGCTACCTGCATGCTCGAACAAAGTGACATAATAAATCACGGAAAGGTCAACAGAGACCTTCTGGTACACCTGGCTGGTTTGGTGAACGGCAAGAATTCACGGGTTGTACGTAAGCTGAACAGTGTCTCCCGTCTCTGCTTGGACAGTATTAGTGGCATGACGGACAGATGTCAATTAGCTTCGACGTACAATGACTGTCTGAATGAAAACATGATAGAGTTCGCTTTTCCCCTCGACATTGCAGAGGAAGCCGTCAGGAAAATGCCGTTCCATCTAATACAGCCTAAGTGA
Protein
MAQSCVIKVRATPKDVRAYFTNSSPVSRSGQCFATCMLEQSDIINHGKVNRDLLVHLAGLVNGKNSRVVRKLNSVSRLCLDSISGMTDRCQLASTYNDCLNENMIEFAFPLDIAEEAVRKMPFHLIQPK

Summary

Similarity
Belongs to the PBP/GOBP family.
Keywords
Complete proteome   Disulfide bond   Reference proteome   Secreted   Signal  
Feature
chain  General odorant-binding protein 19d
EMBL
BABH01022419    NWSH01006551    PCG63367.1    ODYU01003942    SOQ43313.1    KX585305    + More
ARO70198.1    AGBW02009478    OWR50717.1    KQ459256    KPJ02097.1    RSAL01000133    RVE46336.1    MG546564    AYD42187.1    JTDY01001629    KOB73309.1    KQ459986    KPJ18860.1    KP082930    AKW47222.1    AGBW02012943    OWR44192.1    NWSH01000509    PCG75966.1    ODYU01000084    SOQ34239.1    ODYU01010420    SOQ55510.1    KP975120    ALT31639.1    ODYU01001596    SOQ38039.1    JTDY01000869    KOB75615.1    KQ459337    KPJ01416.1    AP017487    BBB06749.1    KQ460144    KPJ17462.1    KZ150210    PZC72199.1    KT070562    AMR99730.1    GEDC01026414    JAS10884.1    KP082905    AKW47197.1    JXUM01110425    KQ565410    KXJ71014.1    GEHC01000560    JAV47085.1    KX585303    ARO70196.1    KC492500    AGK24579.1    BABH01027061    FM876235    CAS90126.1    RSAL01000021    RVE52539.1    CH477186    EAT48964.1    KJ920206    AIL54057.1    KT875742    AOV87023.1    KF660219    AHB59654.1    KC516750    AGZ04925.1    GECZ01015789    JAS53980.1    CVRI01000052    CRK99702.1    CRK99701.1    KQ461193    KPJ07017.1    KC516730    AGZ04905.1    JN012602    AEQ19909.1    GECU01033988    JAS73718.1    CVRI01000047    CRK97188.1    JN012600    AEQ19907.1    FJ233076    ACO83218.1    AY146718    AAAB01008859    AAO12078.1    EAA07997.2    APCN01000586    KP071915    AJM71475.1    KJ186820    AIX97132.1    KQ459585    KPI98266.1    AXCM01004142    KR733561    AKI84373.1    CRK97183.1    CH940655    EDW66266.1    GQ920545    ACY93895.1    KT279201    ALP75946.1    GQ920533    ACY93883.1    DS497846    EFA12066.1    GQ920398    GQ920419    GQ920422    GQ920432    GQ920443    GQ920447    GQ920452    GQ920465    GQ920475    GQ920484    GQ920496    GQ920503    GQ920504    GQ920515    GQ920516    GQ920562    GQ920565    GQ920567    GQ920582    GQ920586    GQ920587    GQ920588    GQ920590    GQ920600    GQ920602    GQ920611    GQ920612    JN374907    ACY93748.1    ACY93769.1    ACY93772.1    ACY93782.1    ACY93793.1    ACY93797.1    ACY93802.1    ACY93815.1    ACY93825.1    ACY93834.1    ACY93846.1    ACY93853.1    ACY93854.1    ACY93865.1    ACY93866.1    ACY93912.1    ACY93915.1    ACY93917.1    ACY93932.1    ACY93936.1    ACY93937.1    ACY93938.1    ACY93940.1    ACY93950.1    ACY93952.1    ACY93961.1    ACY93962.1    AEO12004.1    MK252298    AZK90215.1    GQ920402    GQ920403    GQ920405    GQ920406    GQ920407    GQ920408    GQ920413    GQ920414    GQ920417    GQ920418    GQ920420    GQ920424    GQ920426    GQ920427    GQ920428    GQ920429    GQ920430    GQ920431    GQ920433    GQ920435    GQ920436    GQ920437    GQ920438    GQ920440    GQ920441    GQ920448    GQ920449    GQ920451    GQ920453    GQ920454    GQ920456    GQ920457    GQ920458    GQ920459    GQ920460    GQ920462    GQ920463    GQ920466    GQ920470    GQ920471    GQ920472    GQ920474    GQ920476    GQ920477    GQ920478    GQ920479    GQ920482    GQ920483    GQ920486    GQ920487    GQ920488    GQ920490    GQ920491    GQ920493    GQ920494    GQ920495    GQ920497    GQ920498    GQ920499    GQ920500    GQ920502    GQ920505    GQ920507    GQ920509    GQ920511    GQ920513    GQ920514    GQ920518    GQ920519    GQ920520    GQ920521    GQ920523    GQ920524    GQ920525    GQ920526    GQ920527    GQ920528    GQ920529    GQ920530    GQ920531    GQ920534    GQ920535    GQ920536    GQ920538    GQ920539    GQ920540    GQ920546    GQ920547    GQ920548    GQ920549    GQ920551    GQ920552    GQ920553    GQ920556    GQ920557    GQ920558    GQ920559    GQ920561    GQ920563    GQ920564    GQ920566    GQ920568    GQ920569    GQ920571    GQ920573    GQ920577    GQ920578    GQ920580    GQ920584    GQ920585    GQ920591    GQ920592    GQ920593    GQ920594    GQ920596    GQ920598    GQ920599    GQ920601    GQ920603    GQ920604    GQ920605    GQ920606    GQ920607    GQ920608    GQ920615    JN374903    JN374904    JN374905    JN374906    JN374908    JN374909    JN374910    JN374911    JN374913    JN374914    JN374915    JN374916    JN374917    JN374918    JN374919    JN374920    JN374921    JN374922    JN374923    JN374924    JN374925    KX532139    ACY93752.1    ACY93753.1    ACY93755.1    ACY93756.1    ACY93757.1    ACY93758.1    ACY93763.1    ACY93764.1    ACY93767.1    ACY93768.1    ACY93770.1    ACY93774.1    ACY93776.1    ACY93777.1    ACY93778.1    ACY93779.1    ACY93780.1    ACY93781.1    ACY93783.1    ACY93785.1    ACY93786.1    ACY93787.1    ACY93788.1    ACY93790.1    ACY93791.1    ACY93798.1    ACY93799.1    ACY93801.1    ACY93803.1    ACY93804.1    ACY93806.1    ACY93807.1    ACY93808.1    ACY93809.1    ACY93810.1    ACY93812.1    ACY93813.1    ACY93816.1    ACY93820.1    ACY93821.1    ACY93822.1    ACY93824.1    ACY93826.1    ACY93827.1    ACY93828.1    ACY93829.1    ACY93832.1    ACY93833.1    ACY93836.1    ACY93837.1    ACY93838.1    ACY93840.1    ACY93841.1    ACY93843.1    ACY93844.1    ACY93845.1    ACY93847.1    ACY93848.1    ACY93849.1    ACY93850.1    ACY93852.1    ACY93855.1    ACY93857.1    ACY93859.1    ACY93861.1    ACY93863.1    ACY93864.1    ACY93868.1    ACY93869.1    ACY93870.1    ACY93871.1    ACY93873.1    ACY93874.1    ACY93875.1    ACY93876.1    ACY93877.1    ACY93878.1    ACY93879.1    ACY93880.1    ACY93881.1    ACY93884.1    ACY93885.1    ACY93886.1    ACY93888.1    ACY93889.1    ACY93890.1    ACY93896.1    ACY93897.1    ACY93898.1    ACY93899.1    ACY93901.1    ACY93902.1    ACY93903.1    ACY93906.1    ACY93907.1    ACY93908.1    ACY93909.1    ACY93911.1    ACY93913.1    ACY93914.1    ACY93916.1    ACY93918.1    ACY93919.1    ACY93921.1    ACY93923.1    ACY93927.1    ACY93928.1    ACY93930.1    ACY93934.1    ACY93935.1    ACY93941.1    ACY93942.1    ACY93943.1    ACY93944.1    ACY93946.1    ACY93948.1    ACY93949.1    ACY93951.1    ACY93953.1    ACY93954.1    ACY93955.1    ACY93956.1    ACY93957.1    ACY93958.1    ACY93965.1    AEO12000.1    AEO12001.1    AEO12002.1    AEO12003.1    AEO12005.1    AEO12006.1    AEO12007.1    AEO12008.1    AEO12010.1    AEO12011.1    AEO12012.1    AEO12013.1    AEO12014.1    AEO12015.1    AEO12016.1    AEO12017.1    AEO12018.1    AEO12019.1    AEO12020.1    AEO12021.1    AEO12022.1    ANY27949.1    U05981    AE014298    AY113621    AY118484    BT032672    GQ920397    GQ920399    GQ920400    GQ920401    GQ920404    GQ920409    GQ920410    GQ920411    GQ920412    GQ920415    GQ920416    GQ920421    GQ920423    GQ920425    GQ920434    GQ920439    GQ920442    GQ920444    GQ920445    GQ920446    GQ920450    GQ920455    GQ920461    GQ920464    GQ920467    GQ920468    GQ920469    GQ920473    GQ920480    GQ920481    GQ920485    GQ920489    GQ920492    GQ920501    GQ920506    GQ920508    GQ920510    GQ920512    GQ920517    GQ920522    GQ920532    GQ920537    GQ920541    GQ920542    GQ920543    GQ920544    GQ920550    GQ920560    GQ920570    GQ920572    GQ920574    GQ920575    GQ920579    GQ920581    GQ920583    GQ920589    GQ920595    GQ920597    GQ920609    GQ920610    GQ920613    GQ920614    JN374912    ACY93747.1    ACY93749.1    ACY93750.1    ACY93751.1    ACY93754.1    ACY93759.1    ACY93760.1    ACY93761.1    ACY93762.1    ACY93765.1    ACY93766.1    ACY93771.1    ACY93773.1    ACY93775.1    ACY93784.1    ACY93789.1    ACY93792.1    ACY93794.1    ACY93795.1    ACY93796.1    ACY93800.1    ACY93805.1    ACY93811.1    ACY93814.1    ACY93817.1    ACY93818.1    ACY93819.1    ACY93823.1    ACY93830.1    ACY93831.1    ACY93835.1    ACY93839.1    ACY93842.1    ACY93851.1    ACY93856.1    ACY93858.1    ACY93860.1    ACY93862.1    ACY93867.1    ACY93872.1    ACY93882.1    ACY93887.1    ACY93891.1    ACY93892.1    ACY93893.1    ACY93894.1    ACY93900.1    ACY93910.1    ACY93920.1    ACY93922.1    ACY93924.1    ACY93925.1    ACY93929.1    ACY93931.1    ACY93933.1    ACY93939.1    ACY93945.1    ACY93947.1    ACY93959.1    ACY93960.1    ACY93963.1    ACY93964.1    AEO12009.1    GEDC01014247    JAS23051.1    ABLF02036879    AK342815    BAH72698.1    KP071919    AJM71479.1    GQ920554    GQ920555    GQ920576    ACY93904.1    ACY93905.1    ACY93926.1    FJ215308    MG356460    ACI30682.1    AWV63287.1    FM242534    CAR85635.1    KF923849    AHJ80894.1    FM242547    CAR85648.1    GQ888708    KU140612    ACX32010.2    APB03431.1    KC161561    AGE97638.1    MG596885    AXE72022.1    CH954180    EDV46814.1    KQS30133.1    GFXV01005986    MBW17791.1    MG719271    AYN07355.1    CH480823    EDW56285.1   
Pfam
PF01395   PBP_GOBP        + More
PF01424   R3H
PF14643   DUF4455
PF06602   Myotub-related
Interpro
IPR006170   PBP/GOBP        + More
IPR036728   PBP_GOBP_sf       
IPR012677   Nucleotide-bd_a/b_plait_sf       
IPR035979   RBD_domain_sf       
IPR039884   R3HC1/R3HCL       
IPR036867   R3H_dom_sf       
IPR001374   R3H_dom       
IPR011993   PH-like_dom_sf       
IPR028089   DUF4455       
IPR030591   MTMR8       
IPR003595   Tyr_Pase_cat       
IPR029021   Prot-tyrosine_phosphatase-like       
IPR010569   Myotubularin-like_Pase_dom       
IPR030564   Myotubularin_fam       
IPR016130   Tyr_Pase_AS       
SUPFAM
SSF47565   SSF47565        + More
SSF54928   SSF54928       
SSF82708   SSF82708       
SSF52799   SSF52799       
PDB
1ORG     E-value=0.00624878,     Score=86

Ontologies

Topology

Subcellular location
Secreted   Secreted in the lumen of olfactory hairs.   With evidence from 4 publications.
Length:
129
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
0.00034
Exp number, first 60 AAs:
8e-05
Total prob of N-in:
0.47820
outside
1  -  129
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
254.298242
Theta
166.344665
Tajima's D
1.703581
CLR
0.096016
CSRT
0.832858357082146
Interpretation
Uncertain
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号