Gene

KWMTBOMO08088

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_HmRTE-e01_[Danaus_plexippus]

Location

Bomo_Chr13(+):15381626-15382343      View in EpiBrowser

Location in the cell

Nuclear   Reliability : 2.032

CDS

ATGCGAATGTTGCGATGGATGTGTGGAGTAATGAGAATTGATAGAATACGGAATGAATATGCTAGAGGCAGTCTAAAAGTGGCACCTGTGACAGAGAAGCTGAGAAGTGCGCGTTTGGGATGGTATGGACATGTGATGAGACGAAATGAAAATGAGGTTGGTGAGAGAGTGTTAACTATGAATGTGGAAGGATATAGAGAAAAAGGTCGACCTAAGAAGAAATGGATAGATTGCGTGAAAGCCGATATAGATAAGAGGGGAGTGAGCGATGAAATGGTATATGATAGAAGAGTATGGGAGGAGAAAACATGTTGCGCCGACCCCAGGGGACTGGGAGAAGGACAGGATAATGATGATGATGATGCTTGCGTTTATAGATATCACGGGTAA

Protein

MRMLRWMCGVMRIDRIRNEYARGSLKVAPVTEKLRSARLGWYGHVMRRNENEVGERVLTMNVEGYREKGRPKKKWIDCVKADIDKRGVSDEMVYDRRVWEEKTCCADPRGLGEGQDNDDDDACVYRYHG

Uniprot

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BM48   A0A2W1BN03   A0A3Q0JQ03   + More
A0A0C2FK24   H3A9W7   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016WVF2   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A3Q0ISK7   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A016SZZ3   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A016TN23   A0A016U5Z2   A0A016VC06   A0A016SGK7   A0A016TKX6   A0A183GXF7   A0A3P8EGJ9   A0A016WMJ7   A0A0N4YNB7   A0A016TK27   A0A183FY09   A0A3P8AX44   H3AQJ4   A0A183G9B3   A0A3P8ADM1   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A016UAZ5   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A016UBD4   A0A016TLV5   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A016VVS4   A0A183FHA3   A0A3P8B2S9   A0A016X2P5   A0A183G741   A0A3P8A7C9   A0A016RXP6   A0A016VB36   A0A016X2X2   A0A183FXH7   A0A3P7Z2B4   A0A183G364   A0A3P8BB56   A0A016RVL3   A0A0N4YLT6   A0A016W910   A0A2A2JK32   A0A183GMR5   A0A3P8H639   A0A016SQS9   H2ZWM0   A0A016T5F5   A0A016U5W8   A0A016TSY7   A0A183GPJ0   A0A3P8EHQ4   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   W5NNY6   A0A183GNF5   A0A3P8DJA7   A0A016SDN2   A0A183GWJ2   A0A3P8G0W9   A0A183GTH1   A0A3P8IIS2   A0A2G9U478   A0A016WEW7   A0A016TH37   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A183GBJ6   A0A3P8F6B7   A0A0N4XHG6   A0A016VT97   A0A0N4YLP4   A0A016SA58   A0A016SDV3  

Pubmed

28756777    9215903    25730766   

EMBL

NWSH01001232    PCG72026.1    KZ150002    PZC75290.1    NWSH01004369    PCG65177.1    + More
KZ150032    PZC74715.1    KZ150034    PZC74657.1    KN768094    KIH47114.1    AFYH01208402    UZAH01029847    VDP08183.1    JARK01000107    EYC42998.1    UZAH01031291    VDP14793.1    UZAH01004968    VDO28364.1    JARK01001491    EYB95904.1    UZAH01027307    VDO90480.1    UZAH01032715    VDP23439.1    JARK01001494    JARK01001424    EYB95586.1    EYC04409.1    JARK01001507    JARK01001392    JARK01001372    EYB94492.1    EYC10272.1    EYC15469.1    JARK01001348    EYC24955.1    JARK01001567    EYB89507.1    JARK01001430    EYC03360.1    UZAH01043455    VDP63277.1    JARK01000211    EYC40482.1    UYSL01023630    VDL82448.1    EYC03359.1    UZAH01027944    VDO96393.1    AFYH01190171    UZAH01030740    VDP11902.1    UZAH01036784    VDP47042.1    UZAH01001522    VDO19785.1    UZAH01025623    VDO67507.1    JARK01001383    EYC12479.1    UZAH01036764    VDP46995.1    JARK01001382    EYC12609.1    JARK01001428    EYC03715.1    UZAH01001784    VDO19994.1    JARK01001340    EYC31495.1    UZAH01025600    VDO67005.1    JARK01000005    EYC46180.1    UZAH01030101    VDP09262.1    JARK01001678    EYB83113.1    JARK01001350    EYC23938.1    EYC46181.1    UZAH01027842    VDO95476.1    UZAH01029058    VDP04025.1    JARK01001702    EYB82127.1    UYSL01023169    VDL81812.1    JARK01000539    EYC36061.1    LIAE01010387    PAV62045.1    UZAH01035701    VDP42189.1    JARK01001524    EYB92930.1    AFYH01256541    JARK01001472    EYB97834.1    EYC10247.1    JARK01001415    EYC05905.1    UZAH01036580    VDP46188.1    UZAH01027446    VDO91691.1    UZAH01041723    VDP60601.1    AHAT01020685    UZAH01036021    VDP43600.1    JARK01001582    EYB88451.1    UZAH01041841    VDP60735.1    UZAH01038994    VDP55126.1    KZ350014    PIO64310.1    JARK01000337    EYC38175.1    JARK01001437    EYC02289.1    UZAH01031410    VDP15327.1    UZAH01031395    VDP15256.1    UYSL01001919    VDL65558.1    JARK01001341    EYC30277.1    UYSL01023141    VDL81764.1    JARK01001601    EYB87296.1    EYB88469.1   

Proteomes

UP000218220    UP000079169    UP000008672    UP000050761    UP000024635    UP000038043    + More
UP000271162    UP000218231    UP000018468   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR027124   Swc5/CFDP2       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BM48   A0A2W1BN03   A0A3Q0JQ03   + More
A0A0C2FK24   H3A9W7   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016WVF2   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A3Q0ISK7   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A016SZZ3   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A016TN23   A0A016U5Z2   A0A016VC06   A0A016SGK7   A0A016TKX6   A0A183GXF7   A0A3P8EGJ9   A0A016WMJ7   A0A0N4YNB7   A0A016TK27   A0A183FY09   A0A3P8AX44   H3AQJ4   A0A183G9B3   A0A3P8ADM1   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A016UAZ5   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A016UBD4   A0A016TLV5   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A016VVS4   A0A183FHA3   A0A3P8B2S9   A0A016X2P5   A0A183G741   A0A3P8A7C9   A0A016RXP6   A0A016VB36   A0A016X2X2   A0A183FXH7   A0A3P7Z2B4   A0A183G364   A0A3P8BB56   A0A016RVL3   A0A0N4YLT6   A0A016W910   A0A2A2JK32   A0A183GMR5   A0A3P8H639   A0A016SQS9   H2ZWM0   A0A016T5F5   A0A016U5W8   A0A016TSY7   A0A183GPJ0   A0A3P8EHQ4   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   W5NNY6   A0A183GNF5   A0A3P8DJA7   A0A016SDN2   A0A183GWJ2   A0A3P8G0W9   A0A183GTH1   A0A3P8IIS2   A0A2G9U478   A0A016WEW7   A0A016TH37   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A183GBJ6   A0A3P8F6B7   A0A0N4XHG6   A0A016VT97   A0A0N4YLP4   A0A016SA58   A0A016SDV3  

KEGG

101739415    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101739415

GO

PANTHER

PTHR23227  

Length:

129

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00021

Exp number, first 60 AAs:

0.00021

Total prob of N-in:

0.30135

outside

1  -  129

 

 

Pi

23.657148

Theta

19.16214

Tajima's D

0.780853

CLR

0.33991

CSRT

0.5997200139993

Interpretation

Uncertain