Gene
KWMTBOMO07839
Annotation
Fam-a_protein_[Operophtera_brumata]
Location in the cell
Nuclear Reliability : 1.914
Sequence
CDS
ATGAATAAAGTTCTTGTGATCTGCTTTATACTCACTGCAGTGGTCGTCGTAATAGAAAGCAGCCCATTCTTAAAACAAATAAAATCCCAAGGCGATTCTGATCTGGTACTAGATAAGAATGTTTGTGAACCCAGATTCAAGACAAATGCAGGGCAGAGTAAAGGAATTTTATCGCAGAACAATATTGCTCAAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGTGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGATACTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGTGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGATACTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATGGCGGCTCAGATGGTGGTTCTAAAAGCTCACAACATGATGACTCTAATCATGGCGGCTCAGATTGTGGTTCTGAAAAGAAAGCGAAAAAACATAAAAGCAAGCCGTGTAACTAAAGAAAATTTAGCAACACCATGTACTGTTCCTTATTTTAAACTTAATATAAATGTACTATCAATAATTCAACAAATAACTAGATTTGGATAG
Protein
MNKVLVICFILTAVVVVIESSPFLKQIKSQGDSDLVLDKNVCEPRFKTNAGQSKGILSQNNIAQKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMVAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVILKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMVAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVILKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLMMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQMAAQMVVLKAHNMMTLIMAAQIVVLKRKRKNIKASRVTKENLATPCTVPYFKLNINVLSIIQQITRFG
Summary
Uniprot
ProteinModelPortal
Ontologies
GO
Topology
SignalP
Position: 1 - 20,
Likelihood: 0.973746
Length:
1087
Number of predicted TMHs:
25
Exp number of AAs in TMHs:
546.73863
Exp number, first 60 AAs:
19.04998
Total prob of N-in:
0.76374
POSSIBLE N-term signal
sequence
outside
1 - 4
TMhelix
5 - 24
inside
25 - 78
TMhelix
79 - 101
outside
102 - 120
TMhelix
121 - 140
inside
141 - 159
TMhelix
160 - 182
outside
183 - 196
TMhelix
197 - 219
inside
220 - 251
TMhelix
252 - 274
outside
275 - 288
TMhelix
289 - 311
inside
312 - 322
TMhelix
323 - 342
outside
343 - 361
TMhelix
362 - 381
inside
382 - 412
TMhelix
413 - 435
outside
436 - 454
TMhelix
455 - 474
inside
475 - 493
TMhelix
494 - 516
outside
517 - 530
TMhelix
531 - 553
inside
554 - 572
TMhelix
573 - 592
outside
593 - 606
TMhelix
607 - 629
inside
630 - 649
TMhelix
650 - 667
outside
668 - 686
TMhelix
687 - 706
inside
707 - 737
TMhelix
738 - 760
outside
761 - 779
TMhelix
780 - 799
inside
800 - 818
TMhelix
819 - 841
outside
842 - 855
TMhelix
856 - 878
inside
879 - 897
TMhelix
898 - 917
outside
918 - 940
TMhelix
941 - 963
inside
964 - 983
TMhelix
984 - 1006
outside
1007 - 1020
TMhelix
1021 - 1043
inside
1044 - 1087
Population Genetic Test Statistics
Pi
410.810066
Theta
187.852798
Tajima's D
0.624572
CLR
188.881246
CSRT
0.549472526373681
Interpretation
Uncertain
