Gene

KWMTBOMO04320

Pre Gene Modal

BGIBMGA012392

Annotation

hypothetical_protein_RR46_02347_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr8(-):3189564-3189925      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.26 Nuclear   Reliability : 1.896

CDS

ATGGATAGAATACGGAATGAATATGTTAGAGGAAGTCTGAAAGTGGCACCTGTGACAGAGAAGCTGAGGAGTGCACGTTTGGGATGGTATGGACATGTGATGAGACGAAGTGAAGATGAGGTTGTTAAGAGAGTGTTAACTATGAATGTGGAAGGATTTAGAGGAAGAGGTAGACCTAAGAAGAAATGGATGGATTGTGTGAAAGACGATATGGGTAGGAGGGGAGTGAGCGAAGAAATGGTATATGATAGAAGAGTATGGAAGGAGAAAACATGTTGCGCCGACCCCAGGTGA

Protein

MDRIRNEYVRGSLKVAPVTEKLRSARLGWYGHVMRRSEDEVVKRVLTMNVEGFRGRGRPKKKWMDCVKDDMGRRGVSEEMVYDRRVWKEKTCCADPR

Uniprot

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A016SZZ3   A0A0C2FK24   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A016UE98   A0A016SDN2   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016WFX2   A0A016WVF2   A0A183GXF7   A0A3P8EGJ9   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A183GDA1   A0A3P8F3X7   A0A016VYQ7   A0A183GPJ0   A0A3P8EHQ4   A0A016TN23   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   A0A016VQL7   A0A183GT84   A0A3P8DS65   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A183GTC3   A0A3P8DT03   A0A183F3N4   A0A3P7TGE4   A0A183G9B3   A0A3P8ADM1   A0A183FY09   A0A3P8AX44   A0A0N4YNB7   A0A183FJ73   A0A3P7XZM2   A0A016VNT7   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A016UAZ5   A0A183FMV2   A0A3P7XT20   A0A016WLS1   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A016U5Z2   A0A016TQG5   A0A016VD78   A0A016VFS4   A0A016VLS9   A0A016VC06   A0A016TKX6   A0A3Q0ISK7   A0A183FB99   A0A3P7VL99   A0A016SIC4   A0A016S9A4   A0A183F3L1   A0A3P7U9P5   A0A016WMJ7   A0A016UG54   A0A183FT77   A0A3P8AAR6   A0A016TK27   A0A016UBL7   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3B3BCY6   A0A3B3HPR4   A0A183FJ84   A0A3P7YDN4   A0A183G528   A0A3P8E2T0   A0A3P9IVQ2   A0A3P9K1J1  

Pubmed

28756777    26354079    25730766    29451363    17554307   

EMBL

NWSH01001232    PCG72026.1    KZ150002    PZC75290.1    NWSH01004369    PCG65177.1    + More
KZ150034    PZC74657.1    KZ150032    PZC74715.1    KQ459581    KPI99130.1    KZ150166    PZC72650.1    JARK01001491    EYB95904.1    KN768094    KIH47114.1    UZAH01027307    VDO90480.1    UZAH01036764    VDP46995.1    UZAH01001522    VDO19785.1    UZAH01031516    VDP15986.1    UZAH01031291    VDP14793.1    JARK01001380    EYC13251.1    JARK01001582    EYB88451.1    UZAH01029847    VDP08183.1    JARK01000336    EYC38182.1    JARK01000107    EYC42998.1    UZAH01043455    VDP63277.1    UZAH01027446    VDO91691.1    UZAH01001784    VDO19994.1    UZAH01036784    VDP47042.1    UZAH01031956    VDP18789.1    JARK01001339    EYC31903.1    UZAH01036580    VDP46188.1    JARK01001494    JARK01001424    EYB95586.1    EYC04409.1    UZAH01041723    VDP60601.1    JARK01001342    EYC29596.1    UZAH01038793    VDP54537.1    UZAH01025623    VDO67507.1    UZAH01038885    VDP54822.1    UZAH01000669    VDO19159.1    UZAH01030740    VDP11902.1    UZAH01027944    VDO96393.1    UYSL01023630    VDL82448.1    UZAH01025799    VDO70679.1    JARK01001343    EYC28702.1    UZAH01031410    VDP15327.1    JARK01001383    EYC12479.1    UZAH01026244    VDO77671.1    JARK01000223    EYC40242.1    UZAH01004968    VDO28364.1    UZAH01032715    VDP23439.1    JARK01001507    JARK01001392    JARK01001372    EYB94492.1    EYC10272.1    EYC15469.1    JARK01001481    JARK01001420    EYB96960.1    EYC04966.1    JARK01001347    EYC25574.1    EYC25573.1    EYC28385.1    JARK01001348    EYC24955.1    JARK01001430    EYC03360.1    UZAH01009099    VDO35114.1    JARK01001560    EYB90061.1    JARK01001602    EYB87210.1    UZAH01000639    VDO19137.1    JARK01000211    EYC40482.1    JARK01001379    EYC13548.1    UZAH01027034    VDO87933.1    EYC03359.1    JARK01001384    EYC12232.1    UZAH01037041    VDP47936.1    UZAH01025803    VDO70747.1    UZAH01029552    VDP06679.1   

Proteomes

UP000218220    UP000053268    UP000079169    UP000024635    UP000050761    UP000038043    + More
UP000271162    UP000261560    UP000001038    UP000265200    UP000265180   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A016SZZ3   A0A0C2FK24   A0A183FUR9   A0A3P7YQT3   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183GBY9   A0A3P8F965   A0A183GB79   A0A3P8EZ99   A0A016UE98   A0A016SDN2   A0A183G681   A0A3P8EH61   A0A016WFX2   A0A016WVF2   A0A183GXF7   A0A3P8EGJ9   A0A183FVH1   A0A3P7YVX3   A0A183F5X8   A0A3P7U6S8   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A183GDA1   A0A3P8F3X7   A0A016VYQ7   A0A183GPJ0   A0A3P8EHQ4   A0A016TN23   A0A183GWH3   A0A3P8EUL0   A0A016VQL7   A0A183GT84   A0A3P8DS65   A0A183FHI6   A0A3P7Y445   A0A183GTC3   A0A3P8DT03   A0A183F3N4   A0A3P7TGE4   A0A183G9B3   A0A3P8ADM1   A0A183FY09   A0A3P8AX44   A0A0N4YNB7   A0A183FJ73   A0A3P7XZM2   A0A016VNT7   A0A183GBL6   A0A3P8AM59   A0A016UAZ5   A0A183FMV2   A0A3P7XT20   A0A016WLS1   A0A183F9F7   A0A3P7UZH7   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A016U5Z2   A0A016TQG5   A0A016VD78   A0A016VFS4   A0A016VLS9   A0A016VC06   A0A016TKX6   A0A3Q0ISK7   A0A183FB99   A0A3P7VL99   A0A016SIC4   A0A016S9A4   A0A183F3L1   A0A3P7U9P5   A0A016WMJ7   A0A016UG54   A0A183FT77   A0A3P8AAR6   A0A016TK27   A0A016UBL7   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3B3BCY6   A0A3B3HPR4   A0A183FJ84   A0A3P7YDN4   A0A183G528   A0A3P8E2T0   A0A3P9IVQ2   A0A3P9K1J1  

KEGG

101740536    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101740536

GO

GO:0016021  

Length:

97

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.73014

inside

1  -  97

 

 

Pi

246.039396

Theta

125.371698

Tajima's D

2.772133

CLR

0

CSRT

0.96395180240988

Interpretation

Uncertain