Gene

KWMTBOMO03838

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr7(+):3886400-3887512      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.011 Nuclear   Reliability : 1 PlasmaMembrane   Reliability : 1.059

CDS

ATGAGACGGACTTGTGAAGGCTGGGATGGTGGAGTTACCATTGGTGGAGTAAAATTGTCCAACCTCCGATACGCCGACGACACCACTCTTCTCGCGGCTAATGAAAGCGAGATGGCTGCTCTCATGAGCAAGCTTGAAAAAATTAGCCTCGAACTTGGTCTTGCCATTAACCGATCCAAAACAAAAGTGATGGTAATAGACCGCATGAACAAACTGGAGCACACGGGGTCACTGCATCTTGAAACAACAGAAAGATTCATATACCTGGGCTCCATGATTGCGAATACTGGATCGTGCGAGCCTGAGATTCGAAGACGTATCGGGATAGCAAAAACTGCCATGTCTCAGCTTGATAGCATCTGGTCCGATAGAAACATCTCCATAAAAACCAAGCGTAAACTTGTAACAAGTCTTGTGTTTTCTATTTTCTTATATGGGGCGGAGACATGGACTCTGAAGAAGGCTGATCGAAGTCGGATCGACGCGTTTGAGATGTGGTGCTGGAGGAAAATGCTGCGGATTCCCTGGACGGCGCATCGGACAAACGCATCAATCCTGGAAGAACTAGGCGTCTCCTTAAGACTCTCCACCATTTGCCTACGTAGGATTTTAGAGTTTTTCGGTCACGTTGCGAGAAAAAAGGGTGACAATCTCGAAAGACTTCTCATCACCGGCAAAGTGGAAGGAAAGAGACCTAGGGGGCGTAGTCCCATGCGCTGGTCCGATCAGATCAAGACGACTTTGGAATCCAGCATCAATGTCGCTATCCATTGCGCGGAGGACAGAAGTGAATGGAAGAACATAGTCCTGACAAAAGTGCTCAGTAAAGGTCACGACCCTCAGAACTGA

Protein

MRRTCEGWDGGVTIGGVKLSNLRYADDTTLLAANESEMAALMSKLEKISLELGLAINRSKTKVMVIDRMNKLEHTGSLHLETTERFIYLGSMIANTGSCEPEIRRRIGIAKTAMSQLDSIWSDRNISIKTKRKLVTSLVFSIFLYGAETWTLKKADRSRIDAFEMWCWRKMLRIPWTAHRTNASILEELGVSLRLSTICLRRILEFFGHVARKKGDNLERLLITGKVEGKRPRGRSPMRWSDQIKTTLESSINVAIHCAEDRSEWKNIVLTKVLSKGHDPQN

Uniprot

D7F163   A0A2H1VU13   D7F168   D7F172   D7F161   A0A2W1BGD9   + More
A0A3S2L0R7   D7F162   D7F167   D7F175   D5LB39   A0A2G8JE23   A0A402F7K5   A0A402F4B4   A0A402FFI9   A0A402EVI9   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A402F3K4   A0A402ELI2   A0A402F218   A0A402ECI4   A0A402F0A9   A0A402FLP7   A0A402EQH3   A0A402EBU4   A0A402EK07   A0A402F758   A0A402FBC6   A0A402FRC2   A0A402F596   A0A402FAF7   A0A402EG93   A0A402EZI8   A0A402FUK3   A0A402EF46   A0A402EL65   A0A402ETC5   A0A402EP91   A0A402FAC1   A0A402F9M2   A0A402F444   A0A402EBA1   A0A402EWP4   A0A402ETE3   A0A402EKC4   A0A402EWX2   A0A402EU50   A0A402EZ17   A0A402FAJ9   A0A402E714   A0A402EKQ9   A0A402E7I9   A0A402F4H0   A0A402F3F5   A0A402EWZ2   A0A402EKM7   A0A402FRB1   A0A402F4J0   A0A402EYG3   A0A402EL59   A0A402F5B4   A0A402EPJ2   A0A402EWK5   A0A402E7S7   A0A402EL16   A0A402F693   A0A402F971   A0A402ECQ6   A0A402F166   A0A402E7N2   A0A402F410   A0A402F9S0   A0A402EPU4   A0A402FAH6   A0A402EU36   A0A402ETA8   A0A402EQ09   A0A402E7T0   A0A402ESY2   A0A402EWW2   A0A402ETD7   A0A402E825   A0A402F7I8   A0A402EWV0   A0A402E871   A0A402F382   A0A402EWK9   A0A402E7Z5   A0A402EU18   A0A402F8Q6   A0A402EZ20   A0A402FVD1   A0A402EK57   A0A402EV46   A0A402EU33   A0A402EL35   A0A402ELP1  

Pubmed

20470440    28756777    29023486   

EMBL

FJ265548    ADI61816.1    ODYU01004401    SOQ44236.1    FJ265553    ADI61821.1    + More
FJ265557    ADI61825.1    FJ265546    ADI61814.1    KZ150203    PZC72267.1    RSAL01000289    RVE42931.1    FJ265547    ADI61815.1    FJ265552    ADI61820.1    FJ265560    ADI61828.1    GU815090    ADF18553.1    MRZV01002322    PIK33998.1    BDOT01000127    GCF52250.1    BDOT01000102    GCF51323.1    BDOT01000229    GCF55077.1    BDOT01000049    GCF48199.1    MRZV01001207    PIK39730.1    MRZV01000196    PIK55924.1    BDOT01000096    GCF51115.1    BDOT01000022    GCF45060.1    BDOT01000084    GCF50558.1    BDOT01000006    GCF41907.1    BDOT01000073    GCF49926.1    BDOT01000335    GCF57285.1    BDOT01000031    GCF46419.1    BDOT01000005    BDOT01000065    GCF41638.1    GCF49423.1    BDOT01000016    GCF44533.1    BDOT01000130    GCF52365.1    BDOT01000173    GCF53716.1    BDOT01000484    GCF59029.1    BDOT01000105    GCF51467.1    BDOT01000165    GCF53438.1    BDOT01000010    GCF43212.1    BDOT01000067    GCF49500.1    BDOT01000648    GCF60106.1    BDOT01000008    GCF42801.1    BDOT01000020    GCF44940.1    BDOT01000039    GCF47378.1    BDOT01000028    GCF46025.1    BDOT01000163    GCF53402.1    BDOT01000153    GCF53117.1    BDOT01000101    GCF51285.1    GCF41453.1    BDOT01000055    GCF48642.1    BDOT01000040    GCF47493.1    BDOT01000017    GCF44634.1    BDOT01000056    GCF48732.1    BDOT01000043    GCF47717.1    BDOT01000066    GCF49478.1    GCF53435.1    BDOT01000002    GCF39995.1    BDOT01000018    GCF44774.1    GCF40140.1    BDOT01000103    GCF51376.1    BDOT01000089    GCF50820.1    BDOT01000015    BDOT01000148    GCF44364.1    GCF48654.1    GCF52988.1    GCF44750.1    BDOT01000474    GCF58974.1    BDOT01000104    GCF51438.1    BDOT01000062    GCF49174.1    GCF44935.1    BDOT01000111    GCF51686.1    GCF46132.1    BDOT01000054    GCF48602.1    GCF40256.1    GCF44894.1    BDOT01000112    GCF51757.1    BDOT01000149    GCF53002.1    GCF41961.1    BDOT01000078    GCF50245.1    GCF40190.1    BDOT01000094    GCF51030.1    BDOT01000156    GCF53200.1    BDOT01000029    GCF46235.1    GCF53441.1    GCF47709.1    GCF47371.1    GCF46280.1    GCF40240.1    GCF47356.1    GCF48637.1    GCF47419.1    GCF40355.1    GCF52369.1    GCF48705.1    GCF40380.1    BDOT01000090    GCF50913.1    GCF48608.1    GCF40308.1    GCF47683.1    BDOT01000143    GCF52806.1    GCF49387.1    BDOT01000693    GCF60321.1    GCF44549.1    BDOT01000048    GCF48010.1    GCF47708.1    GCF44897.1    GCF45125.1   

Proteomes

UP000283053    UP000230750    UP000288954   

PRIDE

D7F163    D7F168    D7F172    D7F161    D7F162    D7F167    + More
D7F175    D5LB39   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       
IPR039034   INPP4       
IPR035892   C2_domain_sf       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10     2.60.40.150    

ProteinModelPortal

D7F163   A0A2H1VU13   D7F168   D7F172   D7F161   A0A2W1BGD9   + More
A0A3S2L0R7   D7F162   D7F167   D7F175   D5LB39   A0A2G8JE23   A0A402F7K5   A0A402F4B4   A0A402FFI9   A0A402EVI9   A0A2G8JVI4   A0A2G8L6P4   A0A402F3K4   A0A402ELI2   A0A402F218   A0A402ECI4   A0A402F0A9   A0A402FLP7   A0A402EQH3   A0A402EBU4   A0A402EK07   A0A402F758   A0A402FBC6   A0A402FRC2   A0A402F596   A0A402FAF7   A0A402EG93   A0A402EZI8   A0A402FUK3   A0A402EF46   A0A402EL65   A0A402ETC5   A0A402EP91   A0A402FAC1   A0A402F9M2   A0A402F444   A0A402EBA1   A0A402EWP4   A0A402ETE3   A0A402EKC4   A0A402EWX2   A0A402EU50   A0A402EZ17   A0A402FAJ9   A0A402E714   A0A402EKQ9   A0A402E7I9   A0A402F4H0   A0A402F3F5   A0A402EWZ2   A0A402EKM7   A0A402FRB1   A0A402F4J0   A0A402EYG3   A0A402EL59   A0A402F5B4   A0A402EPJ2   A0A402EWK5   A0A402E7S7   A0A402EL16   A0A402F693   A0A402F971   A0A402ECQ6   A0A402F166   A0A402E7N2   A0A402F410   A0A402F9S0   A0A402EPU4   A0A402FAH6   A0A402EU36   A0A402ETA8   A0A402EQ09   A0A402E7T0   A0A402ESY2   A0A402EWW2   A0A402ETD7   A0A402E825   A0A402F7I8   A0A402EWV0   A0A402E871   A0A402F382   A0A402EWK9   A0A402E7Z5   A0A402EU18   A0A402F8Q6   A0A402EZ20   A0A402FVD1   A0A402EK57   A0A402EV46   A0A402EU33   A0A402EL35   A0A402ELP1  

KEGG

105841345    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC105841345

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0004197   GO:0016021  

PANTHER

PTHR12187  

Length:

282

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

8.60729000000001

Exp number, first 60 AAs:

0.00172

Total prob of N-in:

0.50474

outside

1  -  282

 

 

Pi

181.861636

Theta

120.282701

Tajima's D

1.741501

CLR

0.407212

CSRT

0.834208289585521

Interpretation

Uncertain