Gene

KWMTBOMO03517

Pre Gene Modal

BGIBMGA009914

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr6(+):10365065-10366360      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.435 PlasmaMembrane   Reliability : 1.165

CDS

ATGCCAACATTCATTTGCTTTGTTGACTTTCAAAAAGCATTTGACTCTGTTAAATGGCCACAGTTATGGAAAACCCTCGAAAATATGGGAGTGCCAAAACATCTTATAAATGTCCTACGAACGCTTTATGAAAACAATACAGCTTCAGTAAAACTGGACAACGTTGCCTCAGAACCACTGCGTCCCAGCGCTGGAGTCCGGCAAGGGTGTATCTTGTCACCTCTCTTGTTTAACATTTACACGGAGGCAATTATGAGAAACGCTCTAGATGACTGGACTGATGGTGGCAAAAATATATGCAACCTTCGTTATGCTGACGATACTACTCTGCTGGCTACAAGCAAAGATCTGATTGCCGAATTGCTAAATCGCGTCGAAACAGTTGCCTTTGATTTTGGTCCCCGAATCAACAGGCACAAAACCAAAATGATGATAGTGGACAGAAGCAATAACAATACCCCGGAGATTACCGCGATTGCAAGCTGTGAGGTCGTTTTATCTTACGCCTACCTAGGTTCACTGGTTACTAACAGTGGTGGTTCGGAGGACGAAATTAAGCGGCGCATAATCATAACGCGATCGGCCATGAATAAACTCGGAAAAGTATGGAAGGACCGGAATATCACCAAGACTACCAAAGTCCCACTGGTAAGGGCACTGGTGTTCCCCATCTTTTTATATGGGGTTGAGACCTGGACTGTGAAAGAAAAAGAAAAAAGAAGGATCGATGCATTAGAAATGTGGTGCTGGAGAAGGATGCTCCGTATATCTTGGACTGAGCATCGCACCAACGCCTCGATCCTAAAAGAACTAAATATCTCTCACAGGTTATCGTCAACAGTGCAATCCAGGATTCTTCGATATTTTGGACACGTATCGCGTCGGCCAGCAGAGTCTATCGAGAAACTTGTTGTTCAGGGTAAGGTCAATGGTAAGAGATCTCGTGGACGAATCCCCATGCGTTGGACTGATCAGGTGAAAGACCTTACTGAAACCCCACTTAACGAGTGTGTGCGCCGGGCCCCGGTTCGCAAGCTGTGGAAAACATCTGTCAAGGCTTTAATGAGCAAGAATTCCACATGA

Protein

MPTFICFVDFQKAFDSVKWPQLWKTLENMGVPKHLINVLRTLYENNTASVKLDNVASEPLRPSAGVRQGCILSPLLFNIYTEAIMRNALDDWTDGGKNICNLRYADDTTLLATSKDLIAELLNRVETVAFDFGPRINRHKTKMMIVDRSNNNTPEITAIASCEVVLSYAYLGSLVTNSGGSEDEIKRRIIITRSAMNKLGKVWKDRNITKTTKVPLVRALVFPIFLYGVETWTVKEKEKRRIDALEMWCWRRMLRISWTEHRTNASILKELNISHRLSSTVQSRILRYFGHVSRRPAESIEKLVVQGKVNGKRSRGRIPMRWTDQVKDLTETPLNECVRRAPVRKLWKTSVKALMSKNST

Uniprot

D7F167   D7F175   D7F162   D7F161   D7F163   D7F172   + More
D7F168   A0A2W1BGD9   D5LB39   W5NMM5   A0A2H6KKM9   A0A2G8JE23   W4YPU3   A0A2A4J795   D5LB38   H3B2Y3   H2YWZ5   A0A2S2QAF2   W4XFH1   A0A2A4JBK9   A0A061BKJ9   A0A023G885   A0A0J7KRQ5   A0A0J7KZE8   W5PUC3   W4XIJ3   O97916   W5N9W4   W4YB77   A0A2S2PMS6   A0A0A9XCF5   H3J6U9   A0A0A9WMP5   W5MYT3   A0A1W7RAL1   A0A2J7RP34   A0A2J7Q7C4   A0A2J7PGM6   A0A2J7Q5G7   A0A2J7QQV1   A0A2J7RSR3   A0A2J7QJR1   A0A2J7PRL8   A0A2J7Q6A9   A0A2J7RQ44   A0A2J7PL44   A0A2J7RQF4   A0A2J7PIT8   A0A2G8KTM7   A0A2J7QD50   A0A2J7RIB8   A0A2J7RKX8   A0A2V9X8L4   A0A2J7R7G1   A0A2J7QTS6   A0A2J7QYR3   A0A076N1B6   A0A2J7QV96   A0A2J7PBA6   A0A2J7R6B0   A0A2J7PZ27   A0A2J7QCR2   A0A2J7PUJ0   A0A2J7RCA8   A0A2J7QTX6   A0A2J7QTA1   A0A2J7PLH7   A0A2J7QBX6   A0A2J7PS45   A0A2J7QSH1   A0A2J7PXL1   A0A2J7QCS7   A0A2J7R2Z0   A0A2J7PM48   A0A2J7RI73   A0A2J7PUR2   A0A2J7QGV0   A0A2J7PKG5   A0A2J7RAR3   A0A2J7PPW0   A0A2J7R0K9   A0A2J7R076   A0A076N3Z4   A0A2J7RLC6   A0A2J7Q5X4   A0A2J7QX53   A0A0P4W0B7   A0A2J7PHX7   A0A2J7Q6W4   A0A2J7PJ38   A0A2J7PTP5   A0A2J7PES2   A0A2J7PWV5   A0A2J7PW80   A0A2J7RL85  

Pubmed

20470440    28756777    29078748    29023486    9215903    20809919    + More
10555285    25401762   

EMBL

FJ265552    ADI61820.1    FJ265560    ADI61828.1    FJ265547    ADI61815.1    + More
FJ265546    ADI61814.1    FJ265548    ADI61816.1    FJ265557    ADI61825.1    FJ265553    ADI61821.1    KZ150203    PZC72267.1    GU815090    ADF18553.1    AHAT01022938    BDSA01000081    GBE63537.1    MRZV01002322    PIK33998.1    AAGJ04055194    NWSH01002736    PCG67606.1    GU815089    ADF18552.1    AFYH01119920    GGMS01004979    MBY74182.1    AAGJ04075245    NWSH01001998    PCG69477.1    LK055282    CDR71995.1    GBBM01006298    JAC29120.1    LBMM01003995    KMQ92919.1    LBMM01001656    KMQ95932.1    AMGL01091659    AMGL01091660    AMGL01091661    AMGL01091662    AMGL01091663    AMGL01091664    AMGL01091665    AMGL01091666    AMGL01091667    AMGL01091668    AAGJ04122993    AJ132772    CAA10770.1    AHAT01022314    AAGJ04093867    GGMR01018096    MBY30715.1    GBHO01028834    JAG14770.1    AAGJ04118689    AAGJ04161747    GBHO01034555    JAG09049.1    AHAT01017643    GFAH01000222    JAV48167.1    NEVH01002141    PNF42600.1    NEVH01017443    PNF24479.1    NEVH01025174    PNF15486.1    NEVH01017562    PNF23821.1    NEVH01012082    PNF30956.1    NEVH01000251    PNF43864.1    NEVH01013550    PNF28814.1    NEVH01021956    PNF18969.1    NEVH01017534    PNF24119.1    NEVH01001347    PNF42965.1    NEVH01024527    PNF17048.1    NEVH01001338    PNF43058.1    NEVH01024955    PNF16252.1    MRZV01000377    PIK51356.1    NEVH01015827    PNF26505.1    NEVH01003502    PNF40578.1    NEVH01002704    PNF41497.1    QIAP01000240    PYX61602.1    NEVH01006732    PNF36770.1    NEVH01011193    PNF31991.1    NEVH01009084    PNF33722.1    KF881087    AIJ27486.1    NEVH01010478    PNF32508.1    NEVH01027118    PNF13626.1    NEVH01006832    PNF36369.1    NEVH01020341    PNF21589.1    NEVH01015905    PNF26381.1    NEVH01021197    PNF19999.1    NEVH01005885    PNF38476.1    NEVH01011192    PNF32037.1    NEVH01011198    PNF31808.1    NEVH01024426    PNF17169.1    NEVH01021216    NEVH01021205    NEVH01018378    NEVH01016294    NEVH01013243    NEVH01011194    NEVH01011186    PNF19803.1    PNF19913.1    PNF23519.1    PNF26082.1    PNF29477.1    PNF31895.1    PNF32189.1    NEVH01021939    PNF19136.1    NEVH01011876    PNF31534.1    NEVH01020856    PNF21060.1    NEVH01015882    PNF26389.1    NEVH01007823    PNF35207.1    NEVH01024421    PNF17406.1    NEVH01003505    PNF40530.1    NEVH01021193    PNF20060.1    NEVH01014359    PNF27807.1    NEVH01024544    PNF16826.1    NEVH01006565    PNF37921.1    NEVH01022644    PNF18361.1    NEVH01008232    PNF34368.1    NEVH01008283    PNF34242.1    KF881086    AIJ27485.1    NEVH01002690    PNF41636.1    NEVH01017543    PNF23975.1    NEVH01009398    PNF33134.1    GDRN01098129    JAI59014.1    NEVH01025130    PNF15928.1    NEVH01017450    PNF24326.1    NEVH01024952    PNF16338.1    NEVH01021229    PNF19699.1    NEVH01026089    PNF14819.1    NEVH01020867    PNF20816.1    NEVH01020937    PNF20580.1    NEVH01002692    PNF41604.1   

Proteomes

UP000018468    UP000230750    UP000007110    UP000218220    UP000008672    UP000007875    + More
UP000036403    UP000002356    UP000235965    UP000247801   

PRIDE

D7F167    D7F175    D7F162    D7F161    D7F163    D7F172    + More
D7F168    D5LB39    D5LB38   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF14529   Exo_endo_phos_2

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       
IPR002138   Pept_C14_p10       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F167   D7F175   D7F162   D7F161   D7F163   D7F172   + More
D7F168   A0A2W1BGD9   D5LB39   W5NMM5   A0A2H6KKM9   A0A2G8JE23   W4YPU3   A0A2A4J795   D5LB38   H3B2Y3   H2YWZ5   A0A2S2QAF2   W4XFH1   A0A2A4JBK9   A0A061BKJ9   A0A023G885   A0A0J7KRQ5   A0A0J7KZE8   W5PUC3   W4XIJ3   O97916   W5N9W4   W4YB77   A0A2S2PMS6   A0A0A9XCF5   H3J6U9   A0A0A9WMP5   W5MYT3   A0A1W7RAL1   A0A2J7RP34   A0A2J7Q7C4   A0A2J7PGM6   A0A2J7Q5G7   A0A2J7QQV1   A0A2J7RSR3   A0A2J7QJR1   A0A2J7PRL8   A0A2J7Q6A9   A0A2J7RQ44   A0A2J7PL44   A0A2J7RQF4   A0A2J7PIT8   A0A2G8KTM7   A0A2J7QD50   A0A2J7RIB8   A0A2J7RKX8   A0A2V9X8L4   A0A2J7R7G1   A0A2J7QTS6   A0A2J7QYR3   A0A076N1B6   A0A2J7QV96   A0A2J7PBA6   A0A2J7R6B0   A0A2J7PZ27   A0A2J7QCR2   A0A2J7PUJ0   A0A2J7RCA8   A0A2J7QTX6   A0A2J7QTA1   A0A2J7PLH7   A0A2J7QBX6   A0A2J7PS45   A0A2J7QSH1   A0A2J7PXL1   A0A2J7QCS7   A0A2J7R2Z0   A0A2J7PM48   A0A2J7RI73   A0A2J7PUR2   A0A2J7QGV0   A0A2J7PKG5   A0A2J7RAR3   A0A2J7PPW0   A0A2J7R0K9   A0A2J7R076   A0A076N3Z4   A0A2J7RLC6   A0A2J7Q5X4   A0A2J7QX53   A0A0P4W0B7   A0A2J7PHX7   A0A2J7Q6W4   A0A2J7PJ38   A0A2J7PTP5   A0A2J7PES2   A0A2J7PWV5   A0A2J7PW80   A0A2J7RL85  

KEGG

101739744    K16308 citron Rho-interacting kinase [EC:2.7.11.1] | (RefSeq) citron Rho-interacting kinase

GO

GO:0004519   GO:0003964   GO:0004197  

Length:

360

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.73495

Exp number, first 60 AAs:

2e-05

Total prob of N-in:

0.01881

outside

1  -  360

 

 

Pi

31.88139

Theta

23.76255

Tajima's D

0.790918

CLR

0.439258

CSRT

0.607369631518424

Interpretation

Uncertain