Gene

KWMTBOMO03286

Annotation

Modifier_of_mdg4_[Operophtera_brumata]

Location

Bomo_Chr6(+):3300576-3303811      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.876

CDS

ATGCAAACTGTCCAATTTCTCACGGAATTACCGTACATCAAGATTCCGACAGCAAAAGGCAAACAGCTGCTAATGATAGATGGATATACATTTTCGGAGATGGGTGCGGCGGGCTTTTATTATTGTTCAAAGAAGGCTGCCGGCTGCAAAGCGCGGGTGAGGTTAGATCTGGACGGGCGTGTAATGCGATCGTCAACTGTCCACGATCATAAGCCACCTCAATATACCACAATCGCTGGAAAATACATTAAAATAAGCAATTGA

Protein

MQTVQFLTELPYIKIPTAKGKQLLMIDGYTFSEMGAAGFYYCSKKAAGCKARVRLDLDGRVMRSSTVHDHKPPQYTTIAGKYIKISN

Uniprot

A0A0L7KWL4   A0A0L7KW45   S4P8U3   A0A194Q270   A0A2H1WYP3   A0A2H1X1M4   + More
A0A2H1VPS2   A0A2H1X1I3   A0A194Q7N4   A0A2H1WCE9   A0A0L7KT96   A0A0L7K4H0   A0A212EXP7   A0A0L7LNM6   A0A0L7KTA2   A0A0N1IP98   S4P196   A0A2H1W246   A0A0L7KW02   A0A0L7KWG3   A0A2W1BPL9   A0A212ERP7   A0A194Q1I8   A0A2A4J3R2   A0A0L7KWM8   A0A0N0PC77   A0A2W1BL57   A0A2H1WAS9   A0A0L7LGL9   A0A2H1WUZ5   H9JAA8   A0A0L7LNU5   A0A212EXP1   A0A0L7LP89   A0A0L7L9W6   A0A212EXS1   A0A0L7LGJ4   A0A2H1WBD9   A0A2H1VRH9   A0A0L7LNV5   A0A212FGW6   A0A194Q260   A0A2H1VQT2   A0A212EXR9   A0A212EXN3   A0A0N0PC88   A0A2H1WAT1   A0A0L7LNC2   A0A2H1WB32   A0A0N0PCJ6   A0A2H1WAQ4   A0A2H1V080   A0A2H1WAU7   A0A0L7LGG4   A0A194Q363   A0A2W1BJB6   A0A0L7LGU5   A0A0N1PHV6   A0A0L7L2E6   A0A0L7L1S6   A0A0L7K3Z5   A0A2H1VAW6   A0A2H1VN56   A0A212EXN7   A0A0L7KX54   A0A2H1V8D5   A0A2W1BW34   H9JAA9   H9JAA7   A0A2H1V436   A0A2W1BRL7   A0A194Q280   H9JA92   A0A2H1VAW8   A0A0L7LD75   A0A2H1VN90   A0A212EXP0   A0A2H1VCM2   A0A0L7LEZ4   A0A0L7KR02   A0A2H1VGN2   S4NW90   A0A0L7LGB2   A0A0L7LD17   A0A2H1V1N9   A0A2H1WYC8   A0A2W1BNH1   A0A2W1BRN7   A0A0N0PAB3   A0A0N1PFZ2   A0A2H1V095   A0A2A4J2B5   A0A2H1WUX9   A0A212EXQ0  

Pubmed

26227816    23622113    26354079    22118469    28756777    19121390    + More

EMBL

JTDY01005028    KOB67456.1    KOB67458.1    GAIX01007132    JAA85428.1    KQ459579    + More
KPI99433.1    ODYU01012074    SOQ58181.1    ODYU01012746    SOQ59211.1    ODYU01003713    SOQ42833.1    SOQ59210.1    KPI99415.1    ODYU01007417    SOQ50164.1    JTDY01005897    KOB66503.1    JTDY01011842    KOB52377.1    AGBW02011698    OWR46255.1    JTDY01000469    KOB77035.1    KOB66502.1    KQ460650    KPJ13079.1    GAIX01010582    JAA81978.1    ODYU01005862    SOQ47165.1    KOB67457.1    KOB67460.1    KZ149939    PZC76982.1    AGBW02012958    OWR44157.1    KPI99416.1    NWSH01003394    PCG66376.1    KOB67459.1    KPJ13097.1    KZ150051    PZC74405.1    SOQ50163.1    JTDY01001207    KOB74539.1    ODYU01011255    SOQ56880.1    BABH01008942    KOB77034.1    OWR46260.1    KOB77036.1    JTDY01002124    KOB72051.1    OWR46257.1    KOB74540.1    SOQ50162.1    SOQ42834.1    KOB77044.1    AGBW02008587    OWR52986.1    KPI99423.1    SOQ42832.1    OWR46261.1    OWR46258.1    KPJ13084.1    SOQ50160.1    KOB77043.1    SOQ50166.1    KPJ13095.1    SOQ50161.1    ODYU01000089    SOQ34263.1    SOQ50167.1    KOB74542.1    KPI99444.1    PZC74401.1    JTDY01001243    KOB74426.1    KPJ13078.1    JTDY01003500    KOB69459.1    KOB69458.1    KOB52378.1    ODYU01001574    SOQ37985.1    ODYU01003460    SOQ42265.1    OWR46259.1    JTDY01004880    KOB67641.1    ODYU01001206    SOQ37110.1    PZC77000.1    ODYU01000374    SOQ35044.1    PZC74403.1    KPI99443.1    BABH01008977    ODYU01001575    SOQ37988.1    JTDY01001612    KOB73364.1    SOQ42266.1    OWR46262.1    SOQ37984.1    JTDY01001407    KOB73949.1    JTDY01006764    KOB65708.1    ODYU01002462    SOQ39977.1    GAIX01014715    JAA77845.1    KOB74424.1    KOB73362.1    SOQ34262.1    ODYU01012006    SOQ58069.1    PZC74416.1    PZC76981.1    KQ458718    KPJ05410.1    KPJ13106.1    SOQ34265.1    NWSH01004061    PCG65523.1    SOQ56879.1    OWR46272.1   

Proteomes

UP000037510    UP000053268    UP000007151    UP000053240    UP000218220    UP000005204    + More

PRIDE

H9JAA8    H9JAA9    H9JAA7    H9JA92   

Pfam

PF04500   FLYWCH        + More
PF02892   zf-BED
PF05225   HTH_psq

Interpro

IPR007588   Znf_FLYWCH        + More
IPR013087   Znf_C2H2_type       
IPR003656   Znf_BED       
IPR036236   Znf_C2H2_sf       
IPR009057   Homeobox-like_sf       
IPR007889   HTH_Psq       
IPR005137   BtpA       

SUPFAM

SSF57667   SSF57667        + More
SSF46689   SSF46689       

ProteinModelPortal

A0A0L7KWL4   A0A0L7KW45   S4P8U3   A0A194Q270   A0A2H1WYP3   A0A2H1X1M4   + More
A0A2H1VPS2   A0A2H1X1I3   A0A194Q7N4   A0A2H1WCE9   A0A0L7KT96   A0A0L7K4H0   A0A212EXP7   A0A0L7LNM6   A0A0L7KTA2   A0A0N1IP98   S4P196   A0A2H1W246   A0A0L7KW02   A0A0L7KWG3   A0A2W1BPL9   A0A212ERP7   A0A194Q1I8   A0A2A4J3R2   A0A0L7KWM8   A0A0N0PC77   A0A2W1BL57   A0A2H1WAS9   A0A0L7LGL9   A0A2H1WUZ5   H9JAA8   A0A0L7LNU5   A0A212EXP1   A0A0L7LP89   A0A0L7L9W6   A0A212EXS1   A0A0L7LGJ4   A0A2H1WBD9   A0A2H1VRH9   A0A0L7LNV5   A0A212FGW6   A0A194Q260   A0A2H1VQT2   A0A212EXR9   A0A212EXN3   A0A0N0PC88   A0A2H1WAT1   A0A0L7LNC2   A0A2H1WB32   A0A0N0PCJ6   A0A2H1WAQ4   A0A2H1V080   A0A2H1WAU7   A0A0L7LGG4   A0A194Q363   A0A2W1BJB6   A0A0L7LGU5   A0A0N1PHV6   A0A0L7L2E6   A0A0L7L1S6   A0A0L7K3Z5   A0A2H1VAW6   A0A2H1VN56   A0A212EXN7   A0A0L7KX54   A0A2H1V8D5   A0A2W1BW34   H9JAA9   H9JAA7   A0A2H1V436   A0A2W1BRL7   A0A194Q280   H9JA92   A0A2H1VAW8   A0A0L7LD75   A0A2H1VN90   A0A212EXP0   A0A2H1VCM2   A0A0L7LEZ4   A0A0L7KR02   A0A2H1VGN2   S4NW90   A0A0L7LGB2   A0A0L7LD17   A0A2H1V1N9   A0A2H1WYC8   A0A2W1BNH1   A0A2W1BRN7   A0A0N0PAB3   A0A0N1PFZ2   A0A2H1V095   A0A2A4J2B5   A0A2H1WUX9   A0A212EXQ0  

KEGG

NA   

GO

GO:0003677   GO:0016021  

Length:

87

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

1.4196

Exp number, first 60 AAs:

1.4196

Total prob of N-in:

0.17202

outside

1  -  87

 

 

Pi

206.76435

Theta

186.853671

Tajima's D

0.511135

CLR

0.196905

CSRT

0.51862406879656

Interpretation

Uncertain