SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO01512  Validated by peptides from experiments
Pre Gene Modal
BGIBMGA009104
Annotation
PREDICTED:_sepiapterin_reductase_[Bombyx_mori]
Location in the cell
Cytoplasmic   Reliability : 1.277
 

Sequence

CDS
ATGGCTATGTCGTCTAGCATCGATTTATCCGGCACCACGTACTGCGTCCTGTCCGGCGCCTCCCAGGGCATCGGGCGGGCCATTGCCGTGGAGGTTGCGAAACTTCTCGGTCCGAAATCCGTTATCCTGCTCCTGGCACGTAACAAAGATCAGCTCGCCATCACCGCCGCCCTCTGCGAGTCGGACAACGTGAGTGTTGTCTATGAATCGATAGACTTGAGTAAGGCATCGCCGAGACAGATGCACGACGTGATTGTTCGCTCTCTAAAAGGAAGGAGCGTATCCGATTTCGCGGCAAGTATTATATTCCACAACGTAGGCTCGTTAGGTAACTTGTCCATCGATACCGCACAAATGGAGAATGTTCCGGAATTAAGAGAGTACTACGATTTGAACGTTTTCAATGTGATCGCTTTGAATACGCAATTCCTTAAGATTTTTGATGAGATAGAGGATAGGCTCGTGATCGTTAACATAACGTCTCTCTGCGCCATCAAGCCTATGAGCGGAATGGCGTACTATTGCAGCGGTAAAGCCGCAAGGGAGATGTACTTCAAGGTCTTGGCCGAGGAGAAGAAGCACGTTCGCGTGCTCAACTACTCCCCGGGACCTGTCGAGACCGCCATGATCGACTACGTATTGGCGGAGGCGGTCAATGAGAATTTGCGCGAAGTTTTCACTTCTTTCAAGAATCAGGGGACCTTGCTCAAGCCTGAGGTAACTGCTCAGAAGTGCGTCCGAGTCCTCCAGGCCGGCAAGTTTAGTCCGGCAGAGCACGTCGACTATTTCGATGACGAATGA
Protein
MAMSSSIDLSGTTYCVLSGASQGIGRAIAVEVAKLLGPKSVILLLARNKDQLAITAALCESDNVSVVYESIDLSKASPRQMHDVIVRSLKGRSVSDFAASIIFHNVGSLGNLSIDTAQMENVPELREYYDLNVFNVIALNTQFLKIFDEIEDRLVIVNITSLCAIKPMSGMAYYCSGKAAREMYFKVLAEEKKHVRVLNYSPGPVETAMIDYVLAEAVNENLREVFTSFKNQGTLLKPEVTAQKCVRVLQAGKFSPAEHVDYFDDE

Summary

EMBL
BABH01029571    AB465548    BAH56565.1    AB465551    BAH56568.1    AB465549    + More
AB465550    BAH56566.1    BAH56567.1    JTDY01006616    KOB65833.1    KQ459562    KPI99784.1    ODYU01011355    SOQ57049.1    KQ460941    KPJ10588.1    AGBW02008911    OWR52209.1    NWSH01000043    PCG80323.1    NEVH01025651    PNF15152.1    KK852785    KDR16573.1    GAKP01022721    JAC36231.1    GBYB01008801    JAG78568.1    GDHF01028280    JAI24034.1    NNAY01003096    OXU19990.1    GAMC01018226    JAB88329.1    CH477229    EAT47019.1    GAPW01003343    JAC10255.1    JXUM01056297    KQ561904    KXJ77214.1    CCAG010002139    GGFM01004786    MBW25537.1    JXUM01042534    JXUM01042535    JXUM01042536    EZ422357    ADD18633.1    GGFK01006466    MBW39787.1    GBYB01004548    JAG74315.1    ADMH02002110    ETN58926.1    GAMD01003116    JAA98474.1    GFDF01000423    JAV13661.1    KQ971361    EFA08713.1    GGFJ01008301    MBW57442.1    JRES01000984    KNC26494.1    KQ434889    KZC10335.1    JXJN01021691    DS231817    EDS39686.1    AJVK01022698    GFDL01011365    JAV23680.1    DS235379    EEB15410.1    GFDL01011369    JAV23676.1    GFDF01000424    JAV13660.1    GEDC01018459    GEDC01017889    GEDC01012828    JAS18839.1    JAS19409.1    JAS24470.1    KQ978881    KYN27820.1    KZ288220    PBC32156.1    JR039286    AEY58615.1    KY204902    AUF40991.1    KY204898    AUF40987.1    KY204909    AUF40998.1    AXCM01003104    AXCN02000795    KQ981693    KYN37636.1    KY204901    AUF40990.1    KY204910    AUF40999.1    KK107105    EZA59592.1    LJIJ01001627    ODM91209.1    KY204899    AUF40988.1    KY204917    AUF41006.1    KY204914    KY204915    AUF41003.1    AUF41004.1    KY204894    AUF40983.1    KY204900    AUF40989.1    KY204907    AUF40996.1    KY204903    AUF40992.1    KY204891    KY204896    AUF40980.1    AUF40985.1    KQ982472    KYQ56090.1    KY204906    AUF40995.1    ATLV01022955    KE525338    KFB48178.1    KY204918    AUF41007.1    KY204911    KY204912    AUF41000.1    AUF41001.1    KY204892    AUF40981.1    KK117700    KFM71193.1    IAAA01038260    LAA09538.1    KY204904    AUF40993.1    KY204913    AUF41002.1    KY204916    AUF41005.1    KY204893    AUF40982.1    AJWK01028427    KY204897    AUF40986.1    GEZM01020005    JAV89466.1    KY204908    AUF40997.1    GEBQ01027962    GEBQ01013019    JAT12015.1    JAT26958.1    KY204895    AUF40984.1    JH432085    GL451091    EFN80099.1    AAAB01008964    EAA43917.3    KY204905    AUF40994.1    GFDF01000444    JAV13640.1    KQ976537    KYM81376.1   
Pfam
PF00106   adh_short
Interpro
IPR006393   Sepiapterin_red        + More
IPR036291   NAD(P)-bd_dom_sf       
IPR002347   SDR_fam       
SUPFAM
SSF51735   SSF51735       
PDB
1Z6Z     E-value=2.50703e-35,     Score=371

Ontologies

Topology

Length:
266
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
1.15588
Exp number, first 60 AAs:
0.10263
Total prob of N-in:
0.02543
outside
1  -  266
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
165.087103
Theta
163.57681
Tajima's D
-0.491495
CLR
0.012409
CSRT
0.244287785610719
Interpretation
Uncertain
Peptides ×
Source Sequence Identity Evalue
26822097 AAVSEASGFSHDAYGIR 100.00 4e-04
25044914 FSNWREPIPEAYFPK 100.00 4e-04
28467696 FSNWREPIPEAYFPK 100.00 4e-04
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号