SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO01471
Annotation
Ankyrin_repeat_domain_protein_[Wolbachia_endosymbiont_of_Culex_quinquefasciatus_JHB]
Location in the cell
Nuclear   Reliability : 3.358
 

Sequence

CDS
ATGATGGCCAATAATCTGATTGCAGCTTACCATGTTTATCTAAAAGAAAATGTCATAGAGATATCTGACACTGATGAATCATACACAACATTTAAATTTCGTGAGAGCTTCTTTACGTCTGATGATTATTTTATTAAGATAATAAGAGACGTTATGCTGAACTCTGTAACAGCAAAACAACTAAGTGTATCAAAGAAAATTTCTTTATTAAAAACTAAACCTAATAAATTACCGAAACAATTTGGTAATCTTGATATTTTTATTGCAGACAATAAAGATGGAGAAATCGAACACATTTGTAAGCAACTACTTAACTTGTTAGATTTAGCTGATCATTCTACATATGTTGTATATTTAGATGACAGTAAAATTGGTTCTTGTAAAGATATAAAACATAGTGATATGAAACCATCTAGAATTGGTGGTCTTGTTGGAAATCTTTTAATATTGGACACAGCCACAAATATGCTTAAAATCAACAATGAAAACCTACCCATCACAGCAAGAAAAATTTTGAAGGAACTCAAAAAGGCAAAAGGTAGAAATTTTGATTTTTCAAAATACCGATTTGACATTGATGTACGTAATTTCCCAAAATTTTCAATGATGCATCGTGCACATGATGTAAAATTTGTTAAAACTTATTTAGATAAGTTAACATTCTATTGTCATCAAGCTCAAGATACAGATCTAAATAGATTAGTGAAATATGAATTAAAGGATTTATATACAGGTAACAATGAGTATTTTCGAATTAAAATAGATATATTGTTTCAAAATTTTCACCACAGAATCCAGAAGTGGTGGAGAAGATTAAATCGTATGCCTTATTATACTAAATCCAAAACTAATAAGCTTTTGGAAAAATGTAAAACATCTATTCTTGAAAACCCTCTAATGTCATTGGCTAACTACTTATATATAAATTCCCTTGAAAAGTACTCTATTAAGTTCAATAGCAATGCAATCAATTCTTTAAAATACATAGACTTCACAAAAAATTACTTTATATCGACCAATTCCACATCATTTACCAGTATCAAATTACTTCAATACCTAAAAGAAAATCATAGTGGATCCTACATTTTCCTAGACCTGATTTACCTAATGACAGAAAATTATTATGAATGCATAGTAGAAAATGTCACAGAATCAAACTTAGACTTGTTGATATGTGTCATCAAAAAAACAGGAAATGAACAAATTTTGCAAGGAATTGAACAACTTTTGACAAAATTCAAAGGTAAAGTAATTGTAATATCAAATCTCGATTCACATTTCTCAAGACCCTGTGCTGATTTTATTGAAACTGAAGACAACAGAAATCAAATGAGTGATATTGAGTCATGTGAAGAAATTTCGCAGGATACAAACATATGCTTTCAAGGACAACAAATACCATTAGAAAAACTTTTAGGGAAGAACATAGATTATATAAGCGTTGGCATTCTTAAAAAAATATTAAATAAAGAAATTATTGATGTTGGTGAAAAGATCTCCTATAAAAATTACCTTCCGGTTCTTAATTGCTACCAAACTGCTCAAATAAATCGTTGTATTAAATTAGATACCAAAAAAACTTTGAATAATTTTAATATAATTGATATGACAAAAGATGTCAATTTAAAAGAAATTGATAGTGAAAAAGATAACTTGGTGTTCGTCTCCTCCAAAGAAGGCTCGAACGATACTACTTATAAACAAGACACAAACTGTAATATTCACGTCTTTATTAAAAATGAGAAGGATCATATTTGGGAAAAGAGTTATGGAAAACTGAATAAATTATTCAATATTATTGAGAGACTAAAACCACAGAATGACTCCTCAGAAATAAATAATTTAAAGGATTCAAATGAAAGAGTAAAGATAATTGCTGCTGAACCAGGAATGGGAAAATCTACACTACTCGAACATCTCAGCATGGCCACAAAGGCTAAATATGAGAATGAATTGATACTAAATATTGTATTGTACGATTACAAAACAAAATTTGATGCATGGGATAATTCAGAATTAAGCTTAGAAGAAGTTTTGATTTTTTTGTTTAACATATTTTCGACGCACTGGTCTCTTGATCAATCAGACATTCATACCAATAGCAAAGGATCGAATTTAGATACTAATTTAAAACTAGACCTGAATGGCGGCAAAGTGTTATTGAAATTCCAAAATGAAAATAAAAAAAATGAGCTTGCTCTTTTAGAGTTGCTGATTTTCAATCAATTCTACAATGACGGAAAACTTTCAGTTCTACTAGATGGATGTGATGAAATTTGTCCAACCTATTTAACTACACTCATAAGCCTAATAAAAATTCTTAATACAACAAAAATATCTCATTTATGGATCACTACTAGAAATTACAACAATGTGTTAAATAAATTAGAAGATACGCTATGTTTATTTTCTCATATGCTGTATGAATGGTCAGATACTGTACAATTGAAATTTTTGAAACAATATTTTTCGAAATCTTTTGATATAGATCCAACTGATTTAAAAAAATTCAAACATTTAGAAGGTTATGTTGAACAGTTTCAAAATGAAATTTCTCATAAAATAATGGACAACATACGCAATAATAAATTCACAAGTATACCATTACATATCAGCATGATCGCTAAAATTTACGAGGATTCATTGAAGAAGGATTTCAGAAAAGTAATCGAAACATGCCCAACTGTAAATAACATAAAGGACATTGTTGATATGTTAGATTTGACAAAACTATACAATAAATTCATAGATGTTAAATTTAATGAAATCATGTATGGTCAAAAGAGGCCTTGGATCGATCCCCATGATTCAGTCTTAAAAAATTTGAAGAATATAGATTATTCAATGTTTATAAAAATGCACCAAATATCTGCTGCAGTTGTTATTTTCAGGCAAACGTCCATAACATTTCTCACTGATCAAGAAGAATTATTATTTAAAAAATTCGCCATTGACATTGAATCTAGTGATGAGAAACACGGTATCGTCGATGAAATAGTGGACGGTAAACCAAAATTCGTACATTATAGCTTTGTCGAATATTTTGCAGCAGAGTTTTTGTGCCTCAAATTAAAATCAAAAACATGTTCGGAATCAATTTTGAAATTCCTAATGGACGTTGTTTTCGTGGAAACGGAGTACCAAGGTATCAGAAACTTTATAGATAGTAAACTTTATAACGACACTGAATCCAGTAATTCTTACTTATATTATAATGAACAAATTTGCGAACTTTTATCATTGAAATCGATGTATAATGACAATGCATTATACATAGCGATTGAAGAATCTTTGAAAAATATTATAGTATTCATATTGAAAGCAATAAAAAATAACGTAGTCGCATTAATAAAGATCGTAACTCATCGTAACTCCTGGAAATGTGTATTGTGTGCAGCAGCTGAAAAGGGATATCTGGATGTGATTAAAGAAATTAAGGACTCTGTACGCGAATTTGATGAAAATAAAGTTATTAAATTGTTTGATTGCGAAGATTCTCCAAACAATCCTTTCATAATCACACTTTATAACTGTAAAGATAATTTTGAACACACAAAAACTTTAGAGGCATTGTTACATAATTTACGTGATGATGATGTGGCCGAATTATTTTTAAAGCCCTACCCGCCTATAAATAGCATATGTGCCTTTATTACCATGGAACCAGAAACTGTTCATTTCTGTATGAAATATTTAAAGAGACTAAATCGACAACAACGATGGAACTTGTTATCGGCGCAAGACGTATGCGGCCGAACTGCGGCACATCACGCTATCGATATGTATAGATTTCCTTTCTTTTTAATAATGAAAGATTTATTAGATTCCGAACAAAGCAGGCGTATTTTCTCTACAAGAAACACGTTCGAAGAAACTGCACATGACATTTGGGAGAAAAAAGTCCGTGAATTCTCTTCTAAATGA
Protein
MMANNLIAAYHVYLKENVIEISDTDESYTTFKFRESFFTSDDYFIKIIRDVMLNSVTAKQLSVSKKISLLKTKPNKLPKQFGNLDIFIADNKDGEIEHICKQLLNLLDLADHSTYVVYLDDSKIGSCKDIKHSDMKPSRIGGLVGNLLILDTATNMLKINNENLPITARKILKELKKAKGRNFDFSKYRFDIDVRNFPKFSMMHRAHDVKFVKTYLDKLTFYCHQAQDTDLNRLVKYELKDLYTGNNEYFRIKIDILFQNFHHRIQKWWRRLNRMPYYTKSKTNKLLEKCKTSILENPLMSLANYLYINSLEKYSIKFNSNAINSLKYIDFTKNYFISTNSTSFTSIKLLQYLKENHSGSYIFLDLIYLMTENYYECIVENVTESNLDLLICVIKKTGNEQILQGIEQLLTKFKGKVIVISNLDSHFSRPCADFIETEDNRNQMSDIESCEEISQDTNICFQGQQIPLEKLLGKNIDYISVGILKKILNKEIIDVGEKISYKNYLPVLNCYQTAQINRCIKLDTKKTLNNFNIIDMTKDVNLKEIDSEKDNLVFVSSKEGSNDTTYKQDTNCNIHVFIKNEKDHIWEKSYGKLNKLFNIIERLKPQNDSSEINNLKDSNERVKIIAAEPGMGKSTLLEHLSMATKAKYENELILNIVLYDYKTKFDAWDNSELSLEEVLIFLFNIFSTHWSLDQSDIHTNSKGSNLDTNLKLDLNGGKVLLKFQNENKKNELALLELLIFNQFYNDGKLSVLLDGCDEICPTYLTTLISLIKILNTTKISHLWITTRNYNNVLNKLEDTLCLFSHMLYEWSDTVQLKFLKQYFSKSFDIDPTDLKKFKHLEGYVEQFQNEISHKIMDNIRNNKFTSIPLHISMIAKIYEDSLKKDFRKVIETCPTVNNIKDIVDMLDLTKLYNKFIDVKFNEIMYGQKRPWIDPHDSVLKNLKNIDYSMFIKMHQISAAVVIFRQTSITFLTDQEELLFKKFAIDIESSDEKHGIVDEIVDGKPKFVHYSFVEYFAAEFLCLKLKSKTCSESILKFLMDVVFVETEYQGIRNFIDSKLYNDTESSNSYLYYNEQICELLSLKSMYNDNALYIAIEESLKNIIVFILKAIKNNVVALIKIVTHRNSWKCVLCAAAEKGYLDVIKEIKDSVREFDENKVIKLFDCEDSPNNPFIITLYNCKDNFEHTKTLEALLHNLRDDDVAELFLKPYPPINSICAFITMEPETVHFCMKYLKRLNRQQRWNLLSAQDVCGRTAAHHAIDMYRFPFFLIMKDLLDSEQSRRIFSTRNTFEETAHDIWEKKVREFSSK

Summary

Pfam
PF12796   Ank_2        + More
PF05729   NACHT
PF15658   Latrotoxin_C
PF00023   Ank
PF13606   Ank_3
Interpro
IPR002110   Ankyrin_rpt        + More
IPR027417   P-loop_NTPase       
IPR036770   Ankyrin_rpt-contain_sf       
IPR020683   Ankyrin_rpt-contain_dom       
IPR007111   NACHT_NTPase       
IPR028047   Latrotoxin_C_dom       
SUPFAM
SSF52540   SSF52540        + More
SSF48403   SSF48403       
Gene 3D

Ontologies

Topology

Length:
1307
Number of predicted TMHs:
0
Exp number of AAs in TMHs:
0.03586
Exp number, first 60 AAs:
0
Total prob of N-in:
0.00098
outside
1  -  1307
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
206.750921
Theta
179.993985
Tajima's D
0.374451
CLR
0.271226
CSRT
0.483025848707565
Interpretation
Uncertain
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