Gene

KWMTBOMO01377

Annotation

endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr3(+):9315351-9315955      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 2.371

CDS

ATGTATGGCAGCGAAACATGGGCAGCAACCAAAAGGAACGTACATACCATTCAAGTTGCTGAAATGAAAATGCTGAGGTGGATGTGCGGCGTGACTAGGCTCGATAAAATCCGCAACGAGTACGTGCGTGGAAGTCTAGGTGTACGGGACATCGCCGACAAGATGCAGGAGAGTAGGCTGAGATGGTATGGTCACGTGAAAAGGAAGCCACCTGACTACGTCGGAAATTTGGCGCTACTGCTCGACCTCCCCGGTCGGAGACCTAGAGGCAGACCCAAGACAAGGTGGAGGGACGTAGTGCTGAAGGACAAGAGAGAATGCAATGTTGCTGACGAGAATGTCGAAGACAGAGCGAAGTGGAGGAGTAAAGTCAGGAAAGCTGACCCCACCACCATGTGGGATAAATAG

Protein

MYGSETWAATKRNVHTIQVAEMKMLRWMCGVTRLDKIRNEYVRGSLGVRDIADKMQESRLRWYGHVKRKPPDYVGNLALLLDLPGRRPRGRPKTRWRDVVLKDKRECNVADENVEDRAKWRSKVRKADPTTMWDK

Uniprot

D7F169   C6Y4D5   A0A183FXH7   A0A3P7Z2B4   K1KXQ8   A0A183G637   + More
A0A3P8A2N8   I7K8L3   A0A2I0B7E5   A0A016TSY7   A0A016TKX6   A0A0N4WFX2   A0A2I0A7U6   A0A016TK27   A0A2H9ZV89   A0A2I0A8C5   A0A016TQJ7   G0XZC9   A0A016W910   A0A2G9U5Q2   A0A016TLV5   A0A016T5F5   A0A016VVS4   A0A016WHD5   A0A2I0A7B2   A0A2I0BDY2   A0A2I0BFB2   A0A2H9ZWL9   A0A3B3HQB6   A0A3P9MAU2   A0A016VT97   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A3P9K1J1   A0A2I0A4R0   A0A3B3HF10   A0A2G9U478   A0A183GFD9   A0A3P8CQ14   A0A2I0A8G9   A0A3P9JDN6   A0A016V9U6   A0A3B3H8Q9   A0A3B3HJS0   A0A3P9JAC7   A0A016UI69   A0A3P9M3G7   H2MG20   A0A183FSE4   A0A3P7Z8X4   A0A3P9I3Z4   A0A3B3HFD6   A0A183FT77   A0A3P8AAR6   A0A016VCI1   A0A183GGD8   A0A3P8D1Q5   A0A183G8L9   A0A3P8BMV8   A0A3P9IJG8   W6NPY2   A0A183F4B8   A0A3P7UF10   A0A183F2R5   A0A3P7U320   A0A3B3HF03   A0A3B3IFI4   A0A016RVL3   A0A183G962   A0A3P8BZL1   A0A3B3I2L1   A0A183F3R1   A0A3P7TDA1   A0A3B3IMV3   A0A3B3IC01   A0A3P9HQ45   A0A3P9K727   A0A016SDV3   W6NHZ4   A0A3B3HGK1   A0A016VW07   A0A016V285   A0A016RTP4   A0A183FB99   A0A3P7VL99   W6NF39   A0A3P9HCZ5   A0A183GA74   A0A3P8F0W9   A0A2T7DJ34   A0A3P9HH58   A0A016THU0   A0A016SG79   A0A3B3H692   A0A3P9IV37   A0A183G741   A0A3P8A7C9   A0A016SBW0   A0A3P9K097   A0A3P9MDZ4  

Pubmed

20470440    23144386    28902843    25730766    21535354    17554307    + More

EMBL

FJ265554    ADI61822.1    CU462842    CBA11992.1    UZAH01027842    VDO95476.1    + More
AMGM01000184    EKB47241.1    UZAH01029822    VDP08057.1    HE805490    CCH50976.1    KZ451907    PKA63681.1    JARK01001415    EYC05905.1    JARK01001430    EYC03360.1    UZAF01001415    UZAF01017114    VDO08263.1    VDO38063.1    KZ452013    PKA51585.1    EYC03359.1    KZ453539    PKA47214.1    KZ452012    PKA51786.1    JARK01001422    EYC04723.1    HQ445899    AEJ72569.1    JARK01000539    EYC36061.1    KZ348915    PIO65553.1    JARK01001428    EYC03715.1    JARK01001472    EYB97834.1    JARK01001340    EYC31495.1    JARK01000281    EYC39011.1    PKA51430.1    KZ451888    PKA66013.1    KZ451885    PKA66495.1    KZ453102    PKA47709.1    JARK01001341    EYC30277.1    UZAH01036764    VDP46995.1    KZ452023    PKA50536.1    KZ350014    PIO64310.1    UZAH01032701    VDP23368.1    PKA51832.1    JARK01001350    EYC24439.1    JARK01001375    EYC14890.1    UZAH01026905    VDO86609.1    UZAH01027034    VDO87933.1    EYC24438.1    UZAH01033088    VDP26174.1    UZAH01030549    VDP10928.1    CAVP010057772    CDL94282.1    UZAH01000951    VDO19393.1    UZAH01000306    VDO18824.1    JARK01001702    EYB82127.1    UZAH01030698    VDP11665.1    UZAH01000694    VDO19186.1    JARK01001582    EYB88469.1    CAVP010062000    CDL96883.1    EYC31496.1    JARK01001356    EYC21107.1    JARK01001722    JARK01001346    EYB81349.1    EYC26203.1    UZAH01009099    VDO35114.1    CAVP010059598    CDL95931.1    UZAH01030983    VDP13266.1    CM009753    PUZ55583.1    JARK01001437    EYC02250.1    JARK01001564    EYB89718.1    UZAH01030101    VDP09262.1    JARK01001592    EYB87852.1   

Proteomes

UP000050761    UP000004478    UP000236161    UP000024635    UP000038042    UP000268014    + More
UP000001038    UP000265180    UP000265200    UP000025227    UP000244336   

PRIDE

D7F169   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR000477   RT_dom        + More
IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf       
IPR027124   Swc5/CFDP2       
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

D7F169   C6Y4D5   A0A183FXH7   A0A3P7Z2B4   K1KXQ8   A0A183G637   + More
A0A3P8A2N8   I7K8L3   A0A2I0B7E5   A0A016TSY7   A0A016TKX6   A0A0N4WFX2   A0A2I0A7U6   A0A016TK27   A0A2H9ZV89   A0A2I0A8C5   A0A016TQJ7   G0XZC9   A0A016W910   A0A2G9U5Q2   A0A016TLV5   A0A016T5F5   A0A016VVS4   A0A016WHD5   A0A2I0A7B2   A0A2I0BDY2   A0A2I0BFB2   A0A2H9ZWL9   A0A3B3HQB6   A0A3P9MAU2   A0A016VT97   A0A183GPW8   A0A3P8ETQ0   A0A3P9K1J1   A0A2I0A4R0   A0A3B3HF10   A0A2G9U478   A0A183GFD9   A0A3P8CQ14   A0A2I0A8G9   A0A3P9JDN6   A0A016V9U6   A0A3B3H8Q9   A0A3B3HJS0   A0A3P9JAC7   A0A016UI69   A0A3P9M3G7   H2MG20   A0A183FSE4   A0A3P7Z8X4   A0A3P9I3Z4   A0A3B3HFD6   A0A183FT77   A0A3P8AAR6   A0A016VCI1   A0A183GGD8   A0A3P8D1Q5   A0A183G8L9   A0A3P8BMV8   A0A3P9IJG8   W6NPY2   A0A183F4B8   A0A3P7UF10   A0A183F2R5   A0A3P7U320   A0A3B3HF03   A0A3B3IFI4   A0A016RVL3   A0A183G962   A0A3P8BZL1   A0A3B3I2L1   A0A183F3R1   A0A3P7TDA1   A0A3B3IMV3   A0A3B3IC01   A0A3P9HQ45   A0A3P9K727   A0A016SDV3   W6NHZ4   A0A3B3HGK1   A0A016VW07   A0A016V285   A0A016RTP4   A0A183FB99   A0A3P7VL99   W6NF39   A0A3P9HCZ5   A0A183GA74   A0A3P8F0W9   A0A2T7DJ34   A0A3P9HH58   A0A016THU0   A0A016SG79   A0A3B3H692   A0A3P9IV37   A0A183G741   A0A3P8A7C9   A0A016SBW0   A0A3P9K097   A0A3P9MDZ4  

KEGG

105842995    no KO assigned | (RefSeq) RNA-directed DNA polymerase from mobile element jockey-like

GO

GO:0003964   GO:0004519   GO:0016740   GO:0004527  

PANTHER

PTHR23227  

Length:

135

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00189

Exp number, first 60 AAs:

0.00154

Total prob of N-in:

0.29253

outside

1  -  135

 

 

Pi

243.572614

Theta

192.895349

Tajima's D

0.815471

CLR

0

CSRT

0.604319784010799

Interpretation

Uncertain