Gene

KWMTBOMO01066

Pre Gene Modal

BGIBMGA004435

Annotation

hypothetical_protein_RR46_02347_[Papilio_xuthus]

Location

Bomo_Chr3(+):1542596-1542962      View in EpiBrowser

Location in the cell

Cytoplasmic   Reliability : 1.377 Nuclear   Reliability : 1.826

CDS

ATGGATAGAATACGGAATGAATATGTTAGAGGAGGTCTGAAAGTGGCACATGTGACAGAGAAGCTGAGAAATGCCCGTTTGGGATGGTATGGACATGTGATGAGACGAAATGAAAATGAGGTTGGTAAGAGAATGTTAACTATGAATGTGGAAGGATATAGAGGAAGAGGTAGACCTAAGAAGAAATGGATGGATTGCGTGAAAGACGATATGCGTAAGAGGGGAGTGAGCGAAGAAATAGTATATGATAGAAGAGTATGGAAGGAGAAAACATGTTGCGCCGACCCCAGGTGA

Protein

MDRIRNEYVRGGLKVAHVTEKLRNARLGWYGHVMRRNENEVGKRMLTMNVEGYRGRGRPKKKWMDCVKDDMRKRGVSEEIVYDRRVWKEKTCCADPR

Uniprot

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A0C2FK24   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A3B3BCY6   A0A016UG54   A0A3B3HPR4   A0A016SZZ3   A0A3Q0ISK7   A0A3B3IC33   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A3P9IMA9   A0A016U5Z2   H3A9W7   A0A3B3HS69   A0A183FY09   A0A016WMJ7   A0A3B3HQB6   A0A3B3B9G5   A0A3B3CTC7   A0A3P9J281   A0A3B3BP31   A0A3B3BTI6   A0A3B3E183   A0A3B3BH81   A0A3B3CQH3   A0A3B3BT53   A0A3B3C7H7   A0A3B3CCF8   A0A3B3CPF5   A0A3B3BC11   H9JS82   A0A3B3D148   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3P9IVQ2   A0A3P9MAU2   A0A3P9K1J1   A0A3B3I8S7   A0A3P9LFI3   A0A3B3HB06   A0A3P9JDN6   A0A3P9JAC7   A0A3P9I3Z4   A0A3B3HQU7   A0A3P9K4Q4   A0A3B3HJS0   A0A3B3IP13   A0A3P9K727   A0A3B3IM62   A0A3B3HUR5   A0A3P9IV37   A0A3P9J399   A0A3B3I636   A0A3B3IM16   A0A3P9IJG8   H2MG20   A0A3P9K097   A0A3B3H692   A0A3B3HFD6   A0A3B3ILR3   A0A3B3IFA0   A0A3B3IFI4   A0A3B3HVS1   A0A3P9MDZ4   A0A3P9H8W7   A0A3P9H8X2   A0A3B3H6E8   A0A3B3H8Q9   A0A3B3I2L1   A0A3B3HF03   A0A3P9KEZ0   A0A3P9JLZ1   A0A3P9MI82   A0A3P9LF91   A0A3B3I294   A0A3P9K813   A0A3B3H3C9   A0A3B3I1I6   A0A3B3HTF4   A0A3P9L6C8   A0A3B3IC09   A0A3P9JZH0   A0A3P9HEJ6   A0A3B3HQW9   A0A3P9LFN7   A0A3B3HYL2   A0A3B3HE53   A0A3B3HU59   A0A3B3HKV3  

Pubmed

28756777    26354079    29451363    25730766    17554307    9215903    + More
19121390   

EMBL

NWSH01001232    PCG72026.1    KZ150002    PZC75290.1    NWSH01004369    PCG65177.1    + More
KZ150034    PZC74657.1    KZ150032    PZC74715.1    KQ459581    KPI99130.1    KZ150166    PZC72650.1    KN768094    KIH47114.1    UZAH01032715    VDP23439.1    JARK01001379    EYC13548.1    JARK01001491    EYB95904.1    UZAH01001522    VDO19785.1    UZAH01036784    VDP47042.1    JARK01001507    JARK01001392    JARK01001372    EYB94492.1    EYC10272.1    EYC15469.1    AFYH01208402    JARK01000211    EYC40482.1    BABH01033122    UZAH01037041    VDP47936.1   

Proteomes

UP000218220    UP000053268    UP000079169    UP000050761    UP000261560    UP000024635    + More
UP000001038    UP000265200    UP000008672    UP000005204    UP000265180   

PRIDE

H9JS82   

Pfam

PF00078   RVT_1        + More
PF03372   Exo_endo_phos

Interpro

IPR036691   Endo/exonu/phosph_ase_sf        + More
IPR005135   Endo/exonuclease/phosphatase       
IPR000477   RT_dom       

SUPFAM

SSF56219   SSF56219       

Gene 3D

3.60.10.10    

ProteinModelPortal

A0A2A4JJS9   A0A2W1BR99   A0A2A4IZ11   A0A2W1BN03   A0A2W1BM48   A0A194Q6W3   + More
A0A2W1BIS5   A0A3Q0JQ03   A0A0C2FK24   A0A183GFE8   A0A3P8FJ37   A0A3B3BCY6   A0A016UG54   A0A3B3HPR4   A0A016SZZ3   A0A3Q0ISK7   A0A3B3IC33   A0A183F5G0   A0A3P7X1W4   A0A183GPX7   A0A3P8D6Y9   A0A3P9IMA9   A0A016U5Z2   H3A9W7   A0A3B3HS69   A0A183FY09   A0A016WMJ7   A0A3B3HQB6   A0A3B3B9G5   A0A3B3CTC7   A0A3P9J281   A0A3B3BP31   A0A3B3BTI6   A0A3B3E183   A0A3B3BH81   A0A3B3CQH3   A0A3B3BT53   A0A3B3C7H7   A0A3B3CCF8   A0A3B3CPF5   A0A3B3BC11   H9JS82   A0A3B3D148   A0A183GQD2   A0A3P8HXE7   A0A3P9IVQ2   A0A3P9MAU2   A0A3P9K1J1   A0A3B3I8S7   A0A3P9LFI3   A0A3B3HB06   A0A3P9JDN6   A0A3P9JAC7   A0A3P9I3Z4   A0A3B3HQU7   A0A3P9K4Q4   A0A3B3HJS0   A0A3B3IP13   A0A3P9K727   A0A3B3IM62   A0A3B3HUR5   A0A3P9IV37   A0A3P9J399   A0A3B3I636   A0A3B3IM16   A0A3P9IJG8   H2MG20   A0A3P9K097   A0A3B3H692   A0A3B3HFD6   A0A3B3ILR3   A0A3B3IFA0   A0A3B3IFI4   A0A3B3HVS1   A0A3P9MDZ4   A0A3P9H8W7   A0A3P9H8X2   A0A3B3H6E8   A0A3B3H8Q9   A0A3B3I2L1   A0A3B3HF03   A0A3P9KEZ0   A0A3P9JLZ1   A0A3P9MI82   A0A3P9LF91   A0A3B3I294   A0A3P9K813   A0A3B3H3C9   A0A3B3I1I6   A0A3B3HTF4   A0A3P9L6C8   A0A3B3IC09   A0A3P9JZH0   A0A3P9HEJ6   A0A3B3HQW9   A0A3P9LFN7   A0A3B3HYL2   A0A3B3HE53   A0A3B3HU59   A0A3B3HKV3  

KEGG

101740536    no KO assigned | (RefSeq) uncharacterized LOC101740536

GO

GO:0016021  

Length:

97

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0

Exp number, first 60 AAs:

0

Total prob of N-in:

0.73014

inside

1  -  97

 

 

Pi

129.671291

Theta

139.533676

Tajima's D

-0.291575

CLR

0

CSRT

0.288935553222339

Interpretation

Uncertain