Gene

KWMTBOMO00563

Pre Gene Modal

BGIBMGA012246

Annotation

PREDICTED:_coiled-coil_domain-containing_protein_AGAP005037_isoform_X5_[Bombyx_mori]

Location

Bomo_Chr1(-):16627471-16696178      View in EpiBrowser

Location in the cell

Mitochondrial   Reliability : 1.817 Nuclear   Reliability : 1.418

CDS

ATGTCGGAGGTCGAGACGGCGTCCACTGGCTTCAGGAGGGGAGGAAAGCAGAGGTCCTCTTTACCTGTAGTCAGGACGCCGAGCAAGACGCTGGAGAGACCGCTCGGTTTGGTGTTCCTGCAGTACAGAAACGAAACCAAGCGTGCCCTCCTGCCAAATGAAATAACATCAATCGACACAGTTAAAGCTTTATTTGTTAGAAGTTTCCCAAAACAACTTACTATGCAATATATGGACAGCCCTATGGTTAAAATCTACATTCACGACTCATCCAAGGACATGTTTTACGAACTCGAAGACGAACGGGCTCATCTTCATGACATCCGGGACCGTTCTGTGCTGCGACTTTTTGAAGCAACCGACATAGGAGGAGGAGCATTCCCCGGTGTCGTCGGCGTGGGATCATTAGCTATGCCACCGCCTGCAGCCAATTGCTCAGGCCCTAGCAGCTGGGATCAGGACCAGAGCTACTTCAGCGAGCCTGAAATAGACTCCGAGTATCACCATCAGCATGTCCACAAAACTAAGGTGAGTTTTAAATAA

Protein

MSEVETASTGFRRGGKQRSSLPVVRTPSKTLERPLGLVFLQYRNETKRALLPNEITSIDTVKALFVRSFPKQLTMQYMDSPMVKIYIHDSSKDMFYELEDERAHLHDIRDRSVLRLFEATDIGGGAFPGVVGVGSLAMPPPAANCSGPSSWDQDQSYFSEPEIDSEYHHQHVHKTKVSFK

Uniprot

A0A2W1BY30   A0A2J7QG99   A0A1B6H4A5   A0A1B6IQI9   A0A1B6IW55   A0A1B6ELN1   + More
A0A1B6HHY5   A0A1B6JV44   A0A1B6IZB6   A0A1B6HUY2   A0A1B6IG74   A0A1B6D1N9   A0A182RUW1   A0A182X0Y5   A0A1B6D025   A0A310SK11   A0A1B6E4A8   A0A182WM97   A0A1B6CDW1   A0A1B6DJF2   A0A1B6CNA4   A0A194PLQ2   A0A1B6EDV0   A0A1B6DD15   A0A1B6D9B2   A0A1B6E0B6   A0A1B6DJK7   A0A2S2QLM5   A0A1B6DZ72   A0A2S2Q0U5   A0A1B6ECC6   A0A1B6D2T7   A0A1B6E4V6   A0A1B6C5T8   A0A0A9YJI6   A0A182PRF9   A0A0T6B8D8   A0A212EQM9   A0A336LB33   A0A087ZSV1   W5J699   A0A310SLC9   A0A1B6LE84   A0A1B6LPK3   A0A182LB45   A0A1B6LDR7   A0A1B6L2M6   R4WEJ4   A0A1B6MEN9   A0A1B6KK55   A0A1B6LU06   V9I7V2   V9I985   A0A1B6LDJ0   A0A1B6M365   A0A1B6KI07   A0A1B6KZ03   B4GTI9   A0A1B6KBF4   A0A1B6KQ65   A0A1B6LAY7   A0A1B6L046   A0A182UV79   E0VA26   A0A1B0ALF5   A0A1B6CRA5   A0A1B0FCR6   A0A1B6EC25   A0A1B6D3S4   A0A1B6E697   A0A1B6C3J8   A0A0M4EX18   A0A1B6CJF2   A0A1B6BZQ7   A0A1B6E1T9   A0A1A9VCP7   A0A1B6D0J6   A0A1B6D7B9   A0A1B6C9X4   A0A1B6DVV9   A0A1A9XBQ3   E2B5G7   V5GAM0   A0A0C9QJ89   A0A3B0KEK9   A0A3B0KNN2   A0A1B6LSN9   A0A151X935   J9K1N5   A0A195EY14   A0A0A9YL09   A0A0A9YHX3   A0A1B6LJT3   A0A1B6LXU0   B5DL35   A0A0A9YFE7   A0A0L7RA80   A0A1B6ML46   A0A1B6KD42   A0A195CJ64  

Pubmed

28756777    26354079    25401762    22118469    20920257    23761445    + More
20966253    23691247    17994087    20566863    20798317    15632085   

EMBL

KZ149925    PZC77596.1    NEVH01014835    PNF27601.1    GECZ01000292    JAS69477.1    + More
GECU01018510    JAS89196.1    GECU01016532    JAS91174.1    GECZ01030976    JAS38793.1    GECU01033521    JAS74185.1    GECU01004674    JAT03033.1    GECU01015450    JAS92256.1    GECU01029261    JAS78445.1    GECU01021788    JAS85918.1    GEDC01017732    JAS19566.1    GEDC01018258    JAS19040.1    KQ764286    OAD54536.1    GEDC01004528    JAS32770.1    GEDC01025733    JAS11565.1    GEDC01011550    JAS25748.1    GEDC01022341    JAS14957.1    KQ459605    KPI92035.1    GEDC01001193    JAS36105.1    GEDC01013714    JAS23584.1    GEDC01015020    JAS22278.1    GEDC01005930    JAS31368.1    GEDC01011483    JAS25815.1    GGMS01009453    MBY78656.1    GEDC01006316    JAS30982.1    GGMS01002182    MBY71385.1    GEDC01001702    JAS35596.1    GEDC01017304    JAS19994.1    GEDC01004364    JAS32934.1    GEDC01028427    JAS08871.1    GBHO01011813    JAG31791.1    LJIG01009189    KRT83577.1    AGBW02013269    OWR43761.1    UFQS01003000    UFQT01003000    SSX15028.1    SSX34414.1    ADMH02002077    ETN59526.1    OAD54537.1    GEBQ01017979    GEBQ01015322    JAT21998.1    JAT24655.1    GEBQ01014352    GEBQ01014251    JAT25625.1    JAT25726.1    GEBQ01018353    JAT21624.1    GEBQ01022082    JAT17895.1    AK418528    BAN21654.1    GEBQ01013047    GEBQ01005560    JAT26930.1    JAT34417.1    GEBQ01028144    GEBQ01026465    JAT11833.1    JAT13512.1    GEBQ01012815    GEBQ01012096    JAT27162.1    JAT27881.1    JR036527    AEY57198.1    JR036526    AEY57197.1    GEBQ01018214    GEBQ01012762    JAT21763.1    JAT27215.1    GEBQ01017080    GEBQ01009643    JAT22897.1    JAT30334.1    GEBQ01028887    JAT11090.1    GEBQ01023327    GEBQ01021481    JAT16650.1    JAT18496.1    CH479190    EDW25859.1    GEBQ01031463    GEBQ01029911    JAT08514.1    JAT10066.1    GEBQ01026394    GEBQ01014768    JAT13583.1    JAT25209.1    GEBQ01019114    GEBQ01008168    JAT20863.1    JAT31809.1    GEBQ01030043    GEBQ01023103    JAT09934.1    JAT16874.1    DS235004    EEB10232.1    JXJN01031006    GEDC01021350    GEDC01011161    JAS15948.1    JAS26137.1    CCAG010011293    CCAG010011294    CCAG010011295    GEDC01003548    GEDC01001809    JAS33750.1    JAS35489.1    GEDC01016949    JAS20349.1    GEDC01003863    JAS33435.1    GEDC01029216    GEDC01001395    JAS08082.1    JAS35903.1    CP012528    ALC48180.1    GEDC01027047    GEDC01023815    GEDC01001971    JAS10251.1    JAS13483.1    JAS35327.1    GEDC01030828    GEDC01024828    JAS06470.1    JAS12470.1    GEDC01014652    GEDC01005406    JAS22646.1    JAS31892.1    GEDC01018102    GEDC01018019    JAS19196.1    JAS19279.1    GEDC01017266    GEDC01015726    JAS20032.1    JAS21572.1    GEDC01027011    GEDC01014867    JAS10287.1    JAS22431.1    GEDC01024483    GEDC01017811    GEDC01007482    JAS12815.1    JAS19487.1    JAS29816.1    GL445827    EFN89053.1    GALX01007412    JAB61054.1    GBYB01000647    JAG70414.1    OUUW01000011    SPP86760.1    SPP86761.1    GEBQ01013291    JAT26686.1    KQ982409    KYQ56798.1    ABLF02030363    KQ981931    KYN32787.1    GBHO01011816    JAG31788.1    GBHO01011810    JAG31794.1    GEBQ01016015    JAT23962.1    GEBQ01011522    JAT28455.1    CH379063    EDY72235.2    GBHO01011817    JAG31787.1    KQ414619    KOC67749.1    GEBQ01003354    JAT36623.1    GEBQ01030599    JAT09378.1    KQ977649    KYN00758.1   

Proteomes

UP000235965    UP000075900    UP000076407    UP000075920    UP000053268    UP000075885    + More
UP000007151    UP000005203    UP000000673    UP000075882    UP000008744    UP000075903    UP000009046    UP000092460    UP000092444    UP000092553    UP000078200    UP000092443    UP000008237    UP000268350    UP000075809    UP000007819    UP000078541    UP000001819    UP000053825    UP000078542   

Pfam

PF03915   AIP3

Interpro

IPR022782   AIP3-like_C       

ProteinModelPortal

A0A2W1BY30   A0A2J7QG99   A0A1B6H4A5   A0A1B6IQI9   A0A1B6IW55   A0A1B6ELN1   + More
A0A1B6HHY5   A0A1B6JV44   A0A1B6IZB6   A0A1B6HUY2   A0A1B6IG74   A0A1B6D1N9   A0A182RUW1   A0A182X0Y5   A0A1B6D025   A0A310SK11   A0A1B6E4A8   A0A182WM97   A0A1B6CDW1   A0A1B6DJF2   A0A1B6CNA4   A0A194PLQ2   A0A1B6EDV0   A0A1B6DD15   A0A1B6D9B2   A0A1B6E0B6   A0A1B6DJK7   A0A2S2QLM5   A0A1B6DZ72   A0A2S2Q0U5   A0A1B6ECC6   A0A1B6D2T7   A0A1B6E4V6   A0A1B6C5T8   A0A0A9YJI6   A0A182PRF9   A0A0T6B8D8   A0A212EQM9   A0A336LB33   A0A087ZSV1   W5J699   A0A310SLC9   A0A1B6LE84   A0A1B6LPK3   A0A182LB45   A0A1B6LDR7   A0A1B6L2M6   R4WEJ4   A0A1B6MEN9   A0A1B6KK55   A0A1B6LU06   V9I7V2   V9I985   A0A1B6LDJ0   A0A1B6M365   A0A1B6KI07   A0A1B6KZ03   B4GTI9   A0A1B6KBF4   A0A1B6KQ65   A0A1B6LAY7   A0A1B6L046   A0A182UV79   E0VA26   A0A1B0ALF5   A0A1B6CRA5   A0A1B0FCR6   A0A1B6EC25   A0A1B6D3S4   A0A1B6E697   A0A1B6C3J8   A0A0M4EX18   A0A1B6CJF2   A0A1B6BZQ7   A0A1B6E1T9   A0A1A9VCP7   A0A1B6D0J6   A0A1B6D7B9   A0A1B6C9X4   A0A1B6DVV9   A0A1A9XBQ3   E2B5G7   V5GAM0   A0A0C9QJ89   A0A3B0KEK9   A0A3B0KNN2   A0A1B6LSN9   A0A151X935   J9K1N5   A0A195EY14   A0A0A9YL09   A0A0A9YHX3   A0A1B6LJT3   A0A1B6LXU0   B5DL35   A0A0A9YFE7   A0A0L7RA80   A0A1B6ML46   A0A1B6KD42   A0A195CJ64  

KEGG

101744007    K19930 SRC kinase signaling inhibitor 1 | (RefSeq) coiled-coil domain-containing protein CG32809

GO

GO:0016021  

Length:

180

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.30975

Exp number, first 60 AAs:

0.00223

Total prob of N-in:

0.13593

outside

1  -  180

 

 

Pi

20.150719

Theta

20.727695

Tajima's D

-1.356178

CLR

0.055695

CSRT

0.0771961401929904

Interpretation

Uncertain