SGID Silkworm Genome Informatics Database
Gene
KWMTBOMO00499
Annotation
PREDICTED:_prostatic_acid_phosphatase-like_[Bombyx_mori]
Location in the cell
PlasmaMembrane   Reliability : 2.902
 

Sequence

CDS
ATGATAAAATTAATGCTTTTGGCATTGTTCGCTACGACTTCCTTATGTGACGAAACTATAGAATTTGCTGTGGTAATTTACCGCCATGGCGATAGAACCCCAGTGAACCCCTACCCAACAGACCCTTGGAAGAATGAATCCCTGTGGCCCGTGAACTTTGGACAACTTACCAATATTGGCAAGAAGCGGCACTACCAGCTGGGACAATGGTTTCGGAAGCGATATTCGCACTTAATTTCAAAGCAGTACAATCCACAAGAGATATATGTAAGATCCACGGATGTTGATCGCACTCTTATGTCTGCTCAGGCCAATTTAGCTGGAATGTATCCTCCAAATGGAACTAGTGTGTGGAATCCAGATTTGATGTGGCAGCCAATACCTGTACATACAGTTCCTGAACATGATGACAACATTCTTGCAATGAAAAAGTCCTGTCCAGCCTATGATAAGGAGCATCTGAAATACACCCATTCAGTGGAATACCTGAATAAACTCCATAAATATGATGAACTAATGCATTACTTATCTTCGAACACTGGCACCAAAATTAAGAGCTTTGCCGATATTTTGGATATCTACACCACTTTGTACATTGAAGAATTTAATAATTTCACCTTACCGCAATGGACTCGCTCTGTCTACCCTGAAAAAATGAGGGAACCGGCTGGTTACAGCTTCAAGACGGAAACGGCGACACCGCTATTGGCCCGTCTTAAAGTTGGGCCTTTGATGAAAATCATTGTAACATCAATACAAGAGGTCATATCGAATAAGACTACTGGAAAAAGTAAAAAGCACAAAAAACTGTTAATCTATAGCGCCCATGACTTGACGATCGGAAACATTCTCAACTCGTTGGATATGTACGACGGAAAATGTCCCGCTTTCACATCTACGATCTTGATAGAATTAATACATGATGATTACACTCAGGATTATTACATTAGAATCTTGTACCGGAACTCGACTGAAATTATAGAACCCAGCATTTTAAATATACCTTGCTGCGGTGCGAAGTGTCCATTTGAACGCTTCAAGACCATCTATGACAATCTGATTTCCGTTAAATGGGACTATGAATGCAGGCAATCTCAGTTCGTGGCGATTCTTGTTATGTCTTTCATAGTTGGAATGGGACTTTTTGCTACTATCTACATGACTCATAAAGTACTTTTCATGCACTGGTCGAAAGAGATAGACCAGGTCTAA
Protein
MIKLMLLALFATTSLCDETIEFAVVIYRHGDRTPVNPYPTDPWKNESLWPVNFGQLTNIGKKRHYQLGQWFRKRYSHLISKQYNPQEIYVRSTDVDRTLMSAQANLAGMYPPNGTSVWNPDLMWQPIPVHTVPEHDDNILAMKKSCPAYDKEHLKYTHSVEYLNKLHKYDELMHYLSSNTGTKIKSFADILDIYTTLYIEEFNNFTLPQWTRSVYPEKMREPAGYSFKTETATPLLARLKVGPLMKIIVTSIQEVISNKTTGKSKKHKKLLIYSAHDLTIGNILNSLDMYDGKCPAFTSTILIELIHDDYTQDYYIRILYRNSTEIIEPSILNIPCCGAKCPFERFKTIYDNLISVKWDYECRQSQFVAILVMSFIVGMGLFATIYMTHKVLFMHWSKEIDQV

Summary

Similarity
Belongs to the histidine acid phosphatase family.
EMBL
ODYU01000621    SOQ35723.1    NWSH01004173    PCG65401.1    AGBW02014676    OWR41231.1    + More
KQ461196    KPJ06317.1    KQ459605    KPI91984.1    JTDY01001550    KOB73561.1    GAPW01001494    JAC12104.1    CH477285    EAT44755.1    NEVH01016344    PNF25316.1    DS232634    EDS44283.1    DS231869    EDS40884.1    GEBQ01027828    JAT12149.1    UFQT01000309    SSX23087.1    GEBQ01010860    JAT29117.1    GANO01002707    JAB57164.1    GGFJ01005459    MBW54600.1    KQ971348    EFA05605.1    KK853123    KDR11060.1    ADMH02000650    ETN65450.1    AJ389431    CAB59929.1    AXCM01000651    GAMD01000781    JAB00810.1    AJ389440    CAB59938.1    AJ389446    AJ389447    CAB59944.1    CAB59945.1    AJ389444    CAB59942.1    AJ389429    CAB59927.1    AJ389428    AJ389435    AJ389436    AJ389442    AJ563970    AJ563999    CAB59926.1    CAB59933.1    CAB59934.1    CAB59940.1    CAD91656.1    CAD91685.1    AJ389448    CAB59946.1    AJ389434    CAB59932.1    AJ563992    CAD91678.1    AJ563995    CAD91681.1    AJ389437    CAB59935.1    PCG65402.1    AJ563966    CAD91652.1    AJ563973    CAD91659.1    GFDL01013022    JAV22023.1    AJ389441    CAB59939.1    AJ389455    AJ389465    CAB59953.1    CAB59963.1    Y18841    CAB38563.1    GDHF01005811    JAI46503.1    OUUW01000005    SPP80924.1    AJ389427    CAB59925.1    AJ563964    CAD91650.1    AJ563969    CAD91655.1    GDHF01002816    JAI49498.1    AJ389459    CAB59957.1    AJ564005    CAD91691.1    AJ389424    CAB59922.1    AJ564007    CAD91693.1    AJ389463    CAB59961.1    AJ389443    CAB59941.1    AJ389466    CAB59964.1    AJ563982    CAD91668.1    AJ563990    CAD91676.1    APCN01000422    AJ563981    CAD91667.1    AJ563977    CAD91663.1    AJ389433    AJ389439    AJ389451    AJ389452    AJ389456    AJ389462    AJ389464    AJ389467    AJ563965    AJ563967    AJ563971    AJ563972    AJ563974    AJ563975    AJ563978    AJ563979    AJ563980    AJ563984    AJ563985    AJ563986    AJ563991    AJ563993    AJ563994    AJ563996    AJ563997    AJ563998    AJ564000    AJ564001    AJ564002    AJ564004    AJ564006    AJ564008    CAB59931.1    CAB59937.1    CAB59949.1    CAB59950.1    CAB59954.1    CAB59960.1    CAB59962.1    CAB59965.1    CAD91651.1    CAD91653.1    CAD91657.1    CAD91658.1    CAD91660.1    CAD91661.1    CAD91664.1    CAD91665.1    CAD91666.1    CAD91670.1    CAD91671.1    CAD91672.1    CAD91677.1    CAD91679.1    CAD91680.1    CAD91682.1    CAD91683.1    CAD91684.1    CAD91686.1    CAD91687.1    CAD91688.1    CAD91690.1    CAD91692.1    CAD91694.1    AJ564003    CAD91689.1    AJ563989    CAD91675.1    AJ563988    CAD91674.1    GECZ01012583    JAS57186.1    CCAG010006358    GBXI01010525    JAD03767.1    AJ389445    CAB59943.1    AJ389472    AJ389473    AJ389474    AJ389476    AJ563987    CAB59970.1    CAB59971.1    CAB59972.1    CAB60674.1    CAD91673.1    AJ563968    CAD91654.1    Y18839    AJ389425    AJ389426    CAB38565.1    CAB59923.1    CAB59924.1    AJ389438    CAB59936.1    AJ389469    CAB59967.1    AJ389458    CAB59956.1    AJ389432    CAB59930.1    AAAB01008859    EAA08086.5    AJ389449    CAB59947.1    AJ389457    CAB59955.1    AJ389450    AJ389453    AJ389454    AJ389460    AJ389461    CAB59948.1    CAB59951.1    CAB59952.1    CAB59958.1    CAB59959.1    AJ389470    AJ389471    CAB59968.1    CAB59969.1    AJ389468    AJ563976    CAB59966.1    CAD91662.1    KA648074    AFP62703.1    KA649157    AFP63786.1    GAKP01017496    GAKP01017495    JAC41457.1    Y18840    CAB38564.1    ATLV01019399    KE525269    KFB44128.1   
Pfam
PF00328   His_Phos_2
Interpro
IPR029033   His_PPase_superfam        + More
IPR029630   Api_m_3       
IPR000560   His_Pase_clade-2       
IPR033379   Acid_Pase_AS       
SUPFAM
SSF53254   SSF53254       
Gene 3D
PDB
1ND6     E-value=1.85542e-63,     Score=615

Ontologies

Topology

SignalP
Position:   1 - 16,         Likelihood:  0.998120
 
 
Length:
403
Number of predicted TMHs:
1
Exp number of AAs in TMHs:
23.45284
Exp number, first 60 AAs:
1.26153
Total prob of N-in:
0.19524
outside
1  -  366
TMhelix
367  -  389
inside
390  -  403
 
 

Population Genetic Test Statistics

Pi
13.817904
Theta
17.231
Tajima's D
-1.957449
CLR
0
CSRT
0.015749212539373
Interpretation
Uncertain
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:zhuzl@cqu.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号